KEGG   Caldicellulosiruptor saccharolyticus: Csac_0020
Entry
Csac_0020         CDS       T00506                                 
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)
Organism
csc  Caldicellulosiruptor saccharolyticus
SSDB
Motif
Pfam: EAL GGDEF PAS_3 SBP_bac_3 PAS_9 PAS PAS_4 PAS_11 PAS_8 Cas10-Cmr2_palm2 Diguanyl_cycl_sensor Lig_chan-Glu_bd DUF1398
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABP65681
UniProt: A4XFJ6
LinkDB
Position
26442..29489
AA seq 1015 aa
MKRTLKVIIISILLFFLTSQVAYCYHKTIKFQVDKQYPPFSYVINGRVYGFSGDLANLIF
EPDKYFLSVSSDTWENVYKRLVSGEIDITGPIVILEERKKDVYFTDPIFTRHVGIYTRKD
FNKVITVNNLASFKIGVMKSDYTETLLKERLKIKNYLTFQTIEDEFVALLEGKVDAVIIS
QEIANYFLVKNNYADQVEIKLKDIFILESGFGISKRRPELVGYVNARLKELIKNGIFDQL
YYNYFSTYSSYYYEKKNREVVFSILYILFIIIFASSITIFVMRGINKKLQQGKEAYEKYA
ELLASNANVIVLTLNLKGEIIFFNRFAEEVTGYKKEEVVGKRWVDLFVPEFRREDAEKLF
SEIAEKKVLNNYESEIITKNGDTCWIIWNNVVVENSYLNEPLIISTGLDITPIKKNQRLL
EESYEELEETNQELVNTLEILNKQTELLKEEEERYKFIVENISDCIWEFDVAEKRIEFYG
NLKDYFETDKINPKIDYYAWLELYHPDDIKAVMEKIQRAFELRDEKIEYEARIKDKNGNY
KWVSVHIKVFYDNRGKPEKLIGINIDYSAKKEYEDRIKYLAYYDDLTNLPNRKLFENKLS
ELIKKAAQTGKIGAVILIDIDNFKDINDLYGHEVGDECLRTISQKIAEYLKGLEVQNYFS
RVGGDEFAIILNGLEKKDFVIEVCTEIQKIFENEIFLEKIERGLYTTISMGISFYPDDGR
DTKEILRNVDMALSLAKENGKNDFQIFMPFLLLKNLNKIEIEKNLRKAIENDEFVLYYQP
VVNLENMEIHSVEALIRWFLPHKGMVSPLEFIPVAEESGLIVRIGEMVIEKALKDLKDWE
RKGINDIHIAINLSARQFKTKYFENTVAKLLEKYSVDPVKVSFEITETGAVENFDVSLKI
LGFLCQMGIKFLIDDFGTGYSSLIYLRKLPISGVKIDKSFISELMFSKESRAIVEGIILM
AHKLGLKVVAEGIENNKQLEILKEIGCDFGQGYLFSKPVPKEEVEKFLLQKKVLI
NT seq 3048 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaggactttaaaggttattataatatcaatcctgttattttttcttacaagccag
gttgcatattgctatcacaaaacaataaagtttcaagtagataaacaatatccacctttt
tcgtatgttataaatggacgagtgtatggattttcaggcgatttggcaaacttgattttt
gagccagataaatattttttgagtgtgagtagcgatacatgggaaaatgtctataaaaga
cttgtaagtggcgagattgacatcactggccctattgtaatattagaggagagaaaaaaa
gatgtctatttcacagatccaatttttacaagacatgttgggatttatacaagaaaagat
tttaacaaagttataacggtgaataatttagcttcttttaagataggtgtaatgaaaagt
gattatacagaaacactgctaaaagaaagattgaaaattaagaactatcttacctttcaa
accattgaggatgagtttgtagcacttttagaaggcaaagtagatgcagttataatctct
caagaaattgctaattactttttagtgaagaacaattatgcagaccaagttgagatcaag
ttgaaggacatttttatacttgagagtggctttggtataagcaaaagacgtccggagctt
gttggttatgtgaatgcaagactaaaagagcttattaaaaatggtatatttgatcagctt
tattacaactacttttctacatactcttcgtactattatgagaaaaagaacagagaagta
gtgttttcaatactttatattctttttataattatctttgcctccagcattacaatattt
gtaatgagaggcataaacaagaagcttcagcagggaaaagaagcttatgaaaaatatgca
gagcttttagcatctaacgcaaatgtaatagtacttactctcaatctaaaaggtgagatt
atcttcttcaacagatttgcagaggaggtcacagggtataagaaggaagaggtagtaggg
aaaaggtgggttgatttattcgttccagagttcaggcgtgaggatgctgagaaactattt
tcagaaattgccgaaaaaaaggttttgaataactatgagagtgaaattattaccaaaaat
ggggatacatgctggataatttggaacaatgtggttgttgaaaattcatatctaaatgaa
ccgttgattatttcaactgggcttgacattacgcctattaaaaagaatcagcgtcttttg
gaagaaagctatgaagagcttgaggagacaaatcaggagctggtaaataccttagaaatt
ctaaataaacagacagagcttttgaaagaagaggaagagaggtataaattcatagttgaa
aacatttcagattgtatttgggagtttgatgttgctgaaaaaaggattgagttttatggg
aatctcaaggactattttgaaacagataagattaacccaaaaattgactattacgcatgg
cttgagctttaccatccagatgacataaaagctgtgatggaaaagattcaaagagctttt
gagctaagagacgagaaaatagagtacgaagcgcggataaaagacaaaaatggaaattat
aagtgggtctcagtacatataaaggtattctatgataatagaggaaagccagaaaaatta
atagggattaatattgattattcagccaaaaaagagtatgaagacaggataaagtatctt
gcgtattatgatgatcttacaaatctacctaatagaaaactttttgaaaataaattaagc
gagttaatcaaaaaagcagctcaaacaggtaaaattggagctgttatattaattgacatt
gacaatttcaaggatataaatgacttgtatggtcatgaagttggcgatgaatgcctaaga
acaatttcccagaaaatagctgagtatctgaaaggcttggaagttcagaactactttagc
agagttggtggtgatgagtttgctataattctaaatggtcttgaaaagaaagactttgtc
atagaggtttgcacagagattcaaaaaatttttgaaaatgagatatttttagaaaaaata
gaaagaggtctttacacaacaatcagtatggggatatcattctaccctgatgatggaagg
gatacaaaagagattcttcgaaatgtagatatggcactctctcttgctaaggaaaatgga
aaaaacgattttcagatttttatgccatttttgctattgaaaaatctaaataagatagag
atagaaaagaatttaagaaaagcaatagaaaatgatgagtttgtactttactatcagcca
gttgtaaaccttgaaaatatggagatacacagtgttgaggcgctgataaggtggtttttg
ccacataaaggaatggtatcaccacttgaatttataccagttgcagaggaaagcggactt
attgtaagaattggagagatggtaattgaaaaagccttgaaagacctcaaagattgggag
cgaaaaggtataaatgatattcatatagcaataaatctttctgcccgccagtttaaaaca
aaatattttgaaaacacggttgcaaaactcttagaaaaatactctgttgacccagttaag
gtgtcctttgaaattaccgaaactggtgctgttgaaaactttgatgtgtctttaaagatt
ttgggctttttatgccagatggggataaaatttttaattgatgactttgggacagggtat
tcatcgcttatatacttaaggaagcttccaattagtggtgtgaaaattgacaaaagtttt
atatctgagcttatgttctcaaaggagagcagggcaattgtagagggaattatcctgatg
gcgcacaagcttggtttaaaagttgttgcagagggaatagagaacaataaacagcttgag
attttaaaagagattggctgtgattttggacaaggatatctttttagcaagccagttccc
aaagaagaagttgaaaagtttcttttacaaaagaaagttttaatataa

DBGET integrated database retrieval system