Chryseobacterium scophthalmum: ACLB9Y_02940
Help
Entry
ACLB9Y_02940 CDS
T11109
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
csco Chryseobacterium scophthalmum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SprB
Por_Secre_tail
Ig_3
I-set
Ig_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XMO02585
LinkDB
All DBs
Position
669632..675976
Genome browser
AA seq
2114 aa
AA seq
DB search
MKNFYSKIKTLTKAVLIAGSSLLGFTANAQTTLLAGDIAFTSYDSTPLTGVGDKFSFVLL
TNISAGTIISFTDRGYQGSGTWQAAGGSESAITWISSTAIPMGTEVHIVGLVASTYNPVT
STSTTNGTVTVTDGSSLNGLSLANTGDQIIAFQGGNGSISASGAYCIAGINYLYYPGGGT
TTAGWNVGVPTGPNSSLMPPGLVGGTSAFYTGAQSGNIVAQSGKFNCTGTPTTTAASVRS
AVMTMGNWSLLASAGTTAYSGCQFIGSNPVITGNPPNRTICSGGNTTFSITATGATSYQW
YQNTGSGFIALANGAPFSGVTTSTLTITGATGTMSGYQYRCVATNSSGSATSNSATLTVS
SISATTTKTNVSCNGGNNGTATVTASGGIAPYTYSWSPSGGTAATATGLGVGVYTVTVTD
NLGCSTTATATITQPTAISGTTVVTNIACNGSSTGAINLTPTGGTAPYTFNWGGGITTED
RTGLSAGTYTVTITDANGCTGTVSATVTQPTAMSATTSQTNISCNGGTNGTASIVVTGGT
APYTYSWSPSGGTAATASGLAAGAYTVTVTDANACTITRTVTITQPTAISGTTVVTNIAC
NGSSTGAINLTPTGGVAPYTFNWGGGITTEDRTGLSAGTYTVTITDANGCTGTVSATVTQ
PTAMSATTSQTNISCNGGTNGTASIVVTGGTAPYTYSWSPSGGTAATASGLAAGAYTVTV
TDANACTITRTVTITQPTAISGTTVVTNIACNGGSTGAINLTPTGGTAPYTFNWGGGITT
EDRTGLAAGTYTVTITDANGCTGTVSATVTQPTAMSATTSQTNISCNGGTNGTASIVVTG
GTAPYTYSWSPSGGTAATASGLSAGTYTVTVTDANACTITRTVTITQPTAISGTTVVTNI
ACNGGSTGAINLTPTGGAAPYTFNWGGGITTEDRTGLAAGTYTVTITDANGCTGTVSATV
TQPTAMSATTSQTNISCNGGTNGTASIVVTGGTAPYTYSWSPSGGTAATASGLSAGVYTV
TVTDANACTITRTVTITQPTAISGTTVVTNIACNGGSTGAINLTPTGGAAPYTFNWGGGI
TTEDRTGLSAGTYTVTITDANGCTGTVSATVTQPTAMSATTSQTNISCNGGTNGTASIVV
TGGTAPYTYSWSPSGGTAATASGLAAGAYTVTVTDANACTITRTVTITQPTAMSATTSQT
NISCNGGSNGTASIVVTGGTAPYTYSWSPTGGTAATASGLAAGTYTVTVTDANACTITRT
VTITQPTAMSATTSQTNISCNGGSNGTASIVVTGGTAPYTYSWSPSGGTAATATGLSAGT
YTVTVTDANACTITRTITITQPTAMSATTSQTNISCNGGTNGTASIVVTGGTAPYTYSWS
PSGGTAATATGLSAGAYTVTVTDANLCTIIRTVTITQPTAISGTTVVTNIACNGGSTGAI
NLTPTGGTAPYTFNWGGGITTEDRTGLSAGTYTVTITDANGCTGTVSTTVTQPTAMSATT
SQTNISCNGGTNGTASIVVTGGTAPYTYSWSPSGGTAATATGLTAGAYTVTVTDANLCTI
TRTVTITQPTAISGTTVVTNIACNGSSTGAINLTPTGGAAPYTFNWGGGITTEDRTGLSA
GTYTVTITDANGCTGTVSATVTQPTAMSATTSQTNILCNGGTNGTASIVVTGGTAPYTYS
WSPSGGTAAIASGLSAGTYTVTVTDANACTITRTVTITQPTAMSATTSQTNISCNGGSNG
TASIVVTGGTAPYTYSWSPSGGTAATASGLSAGTYTVTVTDANACTITRTVTITQPTAMS
ATTSQTNISCNGGSNGTASIVVTGGTAPYTYSWSPSGGTAATASGLSAGTYTVTVTDANA
CTITRTVTITQPSSAVSGTTVITNIACNGGSTGAINLTPTGGTAPYTFNWGGGITTEDRT
GLAAGTYTVTITDANGCTGTVSATVTQSSAVAAPTGAAVQSFNLGNTLSALVVTGQNIKW
YASATDAANHTGSLPITTVIVNNTTYYATQTVGVCESTASLAVLAYNASLSVGNAIKPNS
DMQIYPNPVIDILNISGEEKIIKLAIYAADGRKVTEKTLSKNERSINVHSLVQGVYLIQV
FTKDDVKTFKFIKR
NT seq
6345 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatttttattcaaaaatcaaaacgctgacaaaggcggtcctcatagcaggatcg
tcattgttgggctttacagctaatgcgcaaacaaccctcttagcaggggatattgcgttt
acaagctatgattctactcctttaacaggagtgggagacaagttttcttttgttctgctt
acaaatatttcggcaggaacaattattagctttaccgataggggatatcaaggctctgga
acatggcaagctgccggaggatcagaatccgccattacttggataagtagtacggcaatt
cccatgggaacagaagtacatatagtaggacttgtagcttccacttataacccggtaacc
agcacatcaaccacaaatggtactgttacagttactgatggttcatccctcaatggtctt
tcattagccaatacgggggatcagattattgcatttcagggaggtaacggatctatttca
gcaagcggagcttactgtattgcaggaattaactacttgtattatccaggaggaggaact
acaactgcaggatggaatgtgggagttccaacaggtcctaattcttcattaatgcctccc
ggacttgttggaggaacaagtgcattttatacaggggcgcaatcaggaaatattgttgct
caatcaggaaagtttaactgtacaggtacaccaactactacagcagcttcagtacgttcg
gcggtaatgactatggggaactggtcgcttttagcttctgcaggtacaacggcatattca
ggatgccagtttataggtagtaacccagtaattacaggaaacccaccaaatagaacaatc
tgttctggcggaaatacaacgttttctattactgcaacaggtgccacttcttatcaatgg
taccaaaatacaggtagtggttttattgctttagccaatggagcaccattttcgggagtt
acaacaagtactttaacgataacaggagcaacaggaacaatgagcggatatcaatatcgt
tgtgttgcaactaattcttcaggttcggcaacttcaaatagcgcaacattaacggtttca
tctatttctgcaacaacaactaaaacaaatgtatcatgtaatggaggtaacaatggtact
gccacggttactgcatctggaggaattgccccttacacttactcatggtcaccaagtggt
ggaaccgcagcaacagcaacaggattaggtgtaggagtttatacagtaacagttactgat
aatcttggatgttctactactgcaactgctacgataactcagccaaccgcaatttcggga
acaacagttgttactaatattgcatgtaatggcagttctacaggagctattaatttaact
ccaacgggaggaacagcaccttatactttcaactggggaggaggaatcactacagaagat
cgtacaggattatctgcaggaacttatacagtaactattactgatgctaacggatgtacc
ggaacagtaagtgctactgtaactcagccaacagcaatgagtgcaacgacttctcaaacg
aatatttcatgtaacggaggaactaacggaacagcaagtattgttgtaacgggaggaacc
gctccatacacttactcatggtctccaagcggtggaactgcagcaacagcttcaggttta
gcagcaggagcttatacagtaactgtaacggatgccaatgcatgtacaattacaagaaca
gtaacaatcactcaacctacagcaatttcaggaacaacagttgttactaatattgcatgt
aatggcagttctacaggagctattaatttaactccaacaggaggagtagcaccttatact
ttcaactggggaggaggaatcactacagaagatcgtacaggattatctgcaggaacttac
acagtaaccattactgatgcaaacggatgtacaggaacagtaagtgctactgtaactcag
ccaacagcaatgagtgcaacgacttctcaaacgaatatttcatgtaacggaggaactaac
ggaacagcaagtattgttgtaacgggaggaaccgctccatacacttactcatggtctcca
agcggtggaactgcagcaacagcttcaggtttagcagcaggagcttatacagtaactgta
acggatgccaatgcatgtacaattacaagaacagtaacaataactcaacctacagcaatc
tcaggaacaacggttgttactaatattgcatgtaacggaggttcaaccggagctattaac
ttaacaccaaccggaggaacagcaccttatactttcaactggggaggaggaatcactaca
gaagaccgtacaggtttagcagcaggaacttacacagtaaccattactgatgctaacgga
tgtacgggaacagtaagtgctactgtaactcagcccacagcaatgagtgcaacgacttct
caaacaaatatttcatgtaacggaggaactaacggaacagcaagtattgttgtaacggga
ggaacagcaccttatacttactcatggtcaccgagcggtggaactgcagcaacagcttca
ggattatctgcaggaacttatacagtaacagtaacggatgcaaatgcatgtacaatcaca
agaacagtaacaataactcaacctacagcaatctcaggaacaacagtagttactaatatt
gcatgtaatggaggttcaacaggagctattaatttaacaccaacaggaggagcagcacct
tatactttcaactggggaggtggaatcaccacagaagatcgtacaggattagcagcagga
acttatacagtaaccattactgatgctaacggatgtacaggaacagtaagtgctactgta
actcagccaacagcaatgagtgcaacgacttctcaaacgaatatttcatgtaatggagga
actaacggaacagcaagcattgttgtaacgggaggaacagcaccttacacttactcatgg
tctccgagtggtggaactgcagcaacagcttcaggattatcagcaggagtttatacagta
acagtaacggatgcaaatgcttgtacaattacgagaacagtaacaataactcaacctaca
gcaatctcaggaacaacagtagttacaaatattgcatgtaacggaggttctacgggagct
attaatttaactccaacaggaggagcagcaccttatactttcaactggggaggtggaatc
actacagaagatcgtacaggattatctgcaggaacttacacagtaaccattactgatgca
aacggatgtacaggaacagtaagtgctactgtaactcagcctacagcaatgagtgcaacg
acttctcaaacgaatatttcatgtaacggaggaactaacggaacagcaagtattgtcgta
actggaggaactgctccttatacttattcatggtcaccgagcggtggaactgcagcaaca
gcttcaggtttagcagcaggagcttatacagtaacagtaacggatgcaaatgcttgtaca
attacgagaacagtaacaatcactcagccaacagcaatgagtgctacaacttctcaaaca
aacatttcatgtaacggaggatctaacggaacagcaagtattgttgtaacaggaggaaca
gcaccttacacttattcatggtctccaacaggaggaactgcagcaacagcttcaggttta
gcagcaggaacttacacagtaacagtaacggatgcaaatgcatgtacaattacgagaacg
gtaacaatcactcagccaacagcaatgagtgcaacgacttctcaaacaaacatttcatgt
aacggaggatctaacggaacagcaagtattgttgtaacaggaggaaccgcaccttacact
tattcatggtctccaagcggtggaactgcagcaacagcaacaggattatctgcaggaact
tatacagtaacagtaacggatgctaatgcttgtacaattacgagaacaataacaatcact
cagccaacagcaatgagtgcaacaacttctcaaacaaacatttcatgtaacggaggaact
aacggaacagcaagtattgtcgtaactggaggaaccgcaccttacacttactcatggtca
ccgagcggtggaactgcagcaacagcaacaggattatcagcaggagcttatacagtgaca
gtaacagatgcgaatctatgtacaatcataagaacagtaacaattactcagcctacagca
atttcaggaacaacagtagttacgaatattgcatgtaacggaggttcaaccggagctatt
aacttaactccaaccggaggaacagcaccttatactttcaactggggaggaggaatcact
acagaagatcgtacaggattatcagcaggaacttataccgtaaccattactgatgctaac
ggatgtacaggaacagtaagtactactgtaactcagccaacagcaatgagtgcaacgact
tctcaaacgaatatttcatgtaacggaggaactaacggaacagcaagtattgttgtaacg
ggaggaaccgctccatacacttactcatggtcaccaagcggtggaactgcagcaacagca
acaggattaactgccggagcttatacagtgacagtaacagatgcgaatctatgtacaatc
acaagaacagtaacaatcactcaacctacagcaatttcaggaacaacagttgttacaaac
attgcatgtaatggaagttctacaggagctattaatttaacaccaacaggaggagcagca
ccttatactttcaactggggaggtggaatcactacagaagatcgtacaggattatctgca
ggaacttacacagtaaccattactgatgctaacggatgtacaggaacagtaagtgctact
gtaactcagccaacagcaatgagtgcaacgacttctcaaacgaatattttatgtaacgga
ggaactaacggaacagcaagtattgttgtaacgggaggaacagcaccttatacatactca
tggtcaccaagcggtggaactgcagcaatagcttcaggattatctgcaggaacttataca
gtaacagtaacggatgcaaatgcttgtacaattacgagaacggtaacaatcactcagcca
acagcaatgagtgcaacgacttctcaaacaaacatttcatgtaacggaggatctaacgga
acagcaagtattgttgtaacaggaggaacagcaccttacacttattcatggtcaccgagc
ggtggaactgcagcaacagcttcaggattatcagcaggaacttacacagtaacagtaacg
gatgcaaatgcatgtacaattacgagaacggtaacaatcactcagccaacagcaatgagt
gcaaccacttctcaaacaaacatttcttgtaacggaggatctaacggaacagcaagtatt
gttgtaacgggaggaacagcaccttacacttactcatggtcaccgagcggtggaactgca
gcaacagcttcaggattatcagcaggaacttacacagtaactgtaacggatgcaaatgca
tgtacaatcacaagaacagtaacaattactcaaccttcatcagcggtttcaggaacaaca
gttattacaaacattgcatgtaacggaggttctacaggagctattaacttaactccaacc
ggaggaacagcaccttatactttcaactggggaggaggaatcactacagaagaccgtaca
ggtttagcagcaggaacttacacagtaaccattactgatgcaaacggatgtacaggaaca
gtaagtgcgacagtaactcaatcaagtgcagtagcagctcctactggagcggcagtacaa
agctttaatttaggaaatactttaagtgctttagtagttaccgggcagaatatcaaatgg
tatgcttctgctacagatgcggcaaatcatacgggaagtttaccaatcaccacagtgatt
gtaaataacacaacgtattatgcaacccaaacagtgggagtttgtgagtctacagcttca
ttggctgttcttgcttacaatgcgagtttaagtgtaggtaacgctatcaaaccaaactca
gatatgcaaatttatcctaatccggtaatagatatccttaacataagtggagaggagaaa
attataaaattagcgatttatgcagctgacggtagaaaagttaccgagaaaacattatct
aaaaatgaaagaagcattaatgttcattcattagttcagggagtttacttgattcaggta
ttcactaaagatgatgtaaaaacatttaagtttatcaaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
