Clostridium septicum: CP523_09995
Help
Entry
CP523_09995 CDS
T06069
Name
(GenBank) LysR family transcriptional regulator
Organism
csep
Clostridium septicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_1
LysR_substrate
HTH_10
Vps55
HTH_34
SwrA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYE34706
UniProt:
A0A9N7PJE2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2189402..2190280)
Genome browser
AA seq
292 aa
AA seq
DB search
MNIDSLKYFLEVAKSKSITTVAKNSHISQSALSQQLFKLESKLNVKLLNRSNKGVSLTPE
GEILFKHSKNILNIYNKMLEEIYTCALEKNYISIEAVDSLNSTILPNVICNLKSTFSQYS
INLTSIENSTNSNLSNNICDIYINYEKPNSKIGLSIKDLGCDELIVISNNDFPKNKISKS
ELINLPIILNLKDNYFNNKIQEILLCNIKDLNIVYNTSSYLSLLKGLCCSNSISFIPRIL
FNSYKNEFNIKEIKIDDFNLNANLYLCYLDSFYKNHSDFIKTLINMIKGFLE
NT seq
879 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatattgatagtttaaaatacttcttagaagttgctaaatccaaaagcataacaact
gtagctaagaattcccatatatctcaatcggcattaagtcagcaattatttaaactagaa
tcaaaacttaacgtaaaacttcttaatagaagcaataaaggtgtgtctcttacacctgaa
ggggaaattttatttaagcattctaaaaatattttaaatatatacaataaaatgcttgaa
gaaatatatacttgtgctttagaaaaaaattatatttcaattgaagcagttgatagttta
aattctactatacttcctaatgttatatgcaacttaaaatcaactttttcacaatattca
ataaatttaacttcaattgaaaattcaacaaatagtaatttgtcaaataatatatgtgat
atttatattaactatgaaaaacctaattcaaaaataggattatcaataaaagatcttgga
tgtgatgaattgatagttatttcaaataatgattttcctaaaaataaaatatctaaaagt
gaacttattaatttacctataatcttaaatcttaaagataattatttcaataataagatt
caagaaatcttactctgtaatataaaagacttaaatatagtatataatacaagttcatat
ttatcacttttaaaaggtttatgttgttcaaattctatttcctttattcctagaatctta
tttaactcgtataaaaatgaatttaatataaaagaaataaaaattgatgattttaacctt
aacgcaaatttatatttatgttatttagattcattttataaaaaccattccgactttata
aaaactttgataaatatgataaagggtttcttagaataa
DBGET
integrated database retrieval system