Cylindrospermum stagnale: Cylst_2398
Help
Entry
Cylst_2398 CDS
T02398
Name
(GenBank) PAS domain S-box
Organism
csg
Cylindrospermum stagnale
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_16
Pkinase
AAA_35
PK_Tyr_Ser-Thr
GAF
GAF_2
PAS_4
PAS_9
PAS
AAA_22
AAA
GAF_3
nSTAND6
PAS_8
Pkinase_fungal
DUF8739
nSTAND1
H1_KCTD8_12_16
NB-ARC
APH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ24617
UniProt:
K9WYP7
LinkDB
All DBs
Position
complement(2814122..2820334)
Genome browser
AA seq
2070 aa
AA seq
DB search
MINIPGYEILEKIHEGTGTVVYRGKKKQKQQPVIIKLLNCEYPTLEKITNLRHEYKILKD
LTSNGVVKLYKLEKYQNSFALILEDFGGQALSQIIISRQLTISECLQIVIALAETLIDLE
QAAIIHKDIKPSNIIINIETGQVKLIDFGLSSRLFLEKQTISNPNLLEGTLAYIAPEQTG
RMNRSIDYRTDFYSLGVTLYEMLTGTLPFPTHDPLELIHCHIAKQPVPPYLHKQIPKAVS
DIVMKLLAKNAEERYQSAGGLKFDLETCLIQIQTTGEIIDFIPGRRDRGSQLLIPQKLYG
REKEVTTLMDAFWRVSQGATEMMLVSGYSGIGKTSIVNEVHKPMVAARGYFITGKFDQLK
RDIPYAALTQAFQELIRQLLTENEKQITIWKHKLLEVLGSNAQILIEVIPEVELIIGLQP
DVPQLGAAESENRFNRVFQEFVNVFCQPEHPLVIFLDDLQWADSASLKLIRLLITDNSSR
YLFFIGAYRDNEVNHTHRLIQTLQKIRQTNTVVHNITVEPLLLTHVQQLLADTLSCASDI
KKVELLAELVFNKTQGNPFFLTQLLKSLYSENLLIYQVGTDSWNWNIQQIQAVGITDYNI
VELIARNIRKLPPETQKILQLAACMGNQFNLEILATVNETSDIITATHLWNALQAGLILP
LSSNYKIPLAFCETKSDVLKASNVKINYKFLHDRVQQAAYSLIPETNKKSTHLKIGQILL
RNNTPEIQKDNIFVLANQLNFGIELLTTQVEKDELAQFNLIAGQKAKAAIAYEAAVKYLN
IGLQLLNYQSWTHKYILTLNLYIETAEAEYLNSNLEQALSLCKLVTKEISNVLDLVKFQK
LKIKIYLARNQVNTVLDIGLDILEMLGVSLVELPPKNLDIEQLYSLPLMTDQYKLAAMET
LILIWPPACFAKNTIARPILYTMVELSRQYGNSPLSTYAYVVYGQVIASSMADINLSYHL
GQLALKLIDQLNDKQVKAKVILIVYISFIHYKKHIQETLNPIHEAIESGLEVGDIEYACH
AASFYCSHIFFVGKDLDFIANMQADYIDFVGKFEQQHQLGLIKICAQTVENLINPSVAKI
QLTGDILNEEEFVNSVIINNSTLSLFDVYSYKTWLCYLFEEYEECLKFVRLASNYSLFKQ
TGILFIYNNLFYSLALLAEYSRKFLFTKSSRIDELEIYLKQVDENQEFMKYWAENAPMNY
QHKYELVEAEKARALGNILAAMELYERAIAGARENEYIQDEALAYELAAKFYLALGRQEI
ARTYMTKAHYSYICWGAIAKVKHLELKYSEIIINSTRDSTLAKNNISYSSTTSSNSQILD
ATTIIKASQTLASEIILDNLLEKLMNIVIENAGAQTGFLILKQQKQLFIAAKGAVDTTSE
VMLCKSVLVETSQQLPNSLINYVVRTRENVILCDATHEGRFTKDVYVIDHQPKSILCTPI
IHQGELFGLLYLENNLAVGTFTAERLEVLKILSSQAAISIKNAQLYENLKQEIKERQQAE
EALRESEKKLTQILEAVPIGIFVIDDKGQPYYANLTARKILGKGIVDNSTNTQLAEIYQA
YVQGTEKHYPTEKQPIIRALNGESIVIDDMELHLGNKIIPLEVLATPIFDNKGQIIYAIA
AFQDITQRQQAEAERAKFTQELALKHTALQQATDQLAESNRNLEAKVQERTKELSQTLEI
LKATQAELVIENALLRSAEKTLTYEYQVGGSLPIDAPTYVVRQADRHLYKALKQGEFCYI
FNTRQMGKSSLRVQIMKRLQAEGFACAAIDISEIGNRQLTMEQWYAGFIYILGSSLNLLN
KVNISTWWREHKFLSPVQRLSNFIDQIVLENLRQNNIVIFIDEIDSVINLNFDIDDFFVL
LRNFYNKRADIPKYKRLTFVFLGVANPSQLIQDKKRTPFNIGQAIQLSGFQLHEAQPLLQ
GLAERVGNAQNVLKEVLAWTGGQPFLTQKLCKLIRNSSVNIPKDSEADWINNLVQTQVIE
NWETQDEPEHLKTIRDRLVNMESHVVEILKLYQAIWHQGEVVAVDSPQEKELLLSGLVVK
QQGNLRVHNRIYELVFNGDWIKQLLCKNYG
NT seq
6213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaatataccaggatatgaaattttagaaaaaattcatgaaggtacaggaacagtt
gtttatcgaggcaagaaaaaacagaaacagcagccagtaattattaaactgctcaactgt
gagtatcctacattagaaaaaattactaatttacggcatgagtataaaattctcaaagat
ttgacgagtaatggagttgttaaactttataaattagaaaaatatcagaatagttttgca
ctgattttagaagattttggtggacaagctttaagtcaaattatcatatctaggcaatta
acgatttcagagtgtttgcaaatagtgatcgcacttgcagaaacattaattgatttagag
caagctgcaattattcataaagatattaagcctagtaatatcattatcaatattgaaact
ggacaagtaaaattaattgattttggtctgtcatcacggctttttttagaaaaacaaact
atcagtaatcctaatttattagaagggactttagcttatatagcacctgagcaaacaggg
aggatgaatcgctcgattgattatcgcactgatttctattctttgggagtgactttgtat
gaaatgttgacaggaacactgccatttcctacccacgatccgctagagttgattcactgt
cacattgccaaacaaccagtaccaccttacctgcacaagcagattcctaaagcagtttca
gatattgtgatgaaacttttagctaaaaatgctgaggaacgatatcaaagtgcaggtgga
cttaaattcgatttagaaacttgcctaatacaaatccaaactaccggagagattatagat
tttatccctggcaggcgcgatcgcggtagtcaacttttaataccacaaaagctttatggt
agagaaaaagaagttacaacactaatggatgctttctggcgagtcagccagggagcaaca
gaaatgatgttagtttctggttattcaggtattggtaaaacttcaattgtcaatgaagtt
cacaaaccaatggttgccgccagaggatattttattacaggtaaatttgaccagttaaag
cgggacattccctatgctgctttaactcaagctttccaagaattgattcgtcagctatta
acagaaaatgagaagcagattacgatttggaaacacaaactactagaggtattaggttct
aacgctcaaatcctgattgaagtgattccagaagtagagttaattattggcttacagcct
gatgttccccagctaggtgctgctgaatctgaaaatcgatttaaccgtgtttttcaagaa
tttgtcaatgttttttgtcaacctgagcatccattggtcatttttttagatgatttacaa
tgggcagattctgcatctttgaaattaattagattgttgattacagataatagtagccga
tatttattctttattggtgcttaccgagataacgaagttaaccatactcatcgattaata
caaactctacaaaaaatacgtcaaacaaacactgtggtgcataacatcactgtagaacct
ttgttactcactcatgttcaacaactattagcagatacactatcttgtgcgagtgatatt
aaaaaagttgagttattagcagagttagtttttaataaaacccaaggtaatccatttttc
ttaactcagttactcaaaagcttatatagcgaaaatctcttaatttatcaggtaggtaca
gatagctggaattggaacattcagcaaattcaagccgttggtattactgactataatatt
gttgaattaattgctaggaatattcgtaaattgccaccagaaacgcagaaaattttacag
ttggcagcatgtatgggcaaccaatttaacctagaaattttagcaactgtcaatgaaacc
tcagacattatcacagcaactcatttgtggaatgctttgcaagctggtctaattctacct
ttatcgtcaaattacaaaattcctctggcattttgtgagacaaaatcagacgttttgaaa
gctagtaatgtcaaaattaactataagtttttacatgaccgagtacaacaagcagcttac
tccttgattcccgaaactaataaaaaaagtactcatttgaaaataggtcaaatcctactc
aggaataatacaccagaaattcaaaaagataatatttttgtcttagctaatcaattaaat
tttggcattgaattactaacaacccaagttgaaaaggatgagttagcccaatttaatctt
attgctggtcaaaaagcaaaagctgctatagcttacgaagctgctgttaaatacttgaac
ataggtctacaattactaaattatcagagttggacacataaatatatattgactttgaat
ttatatatagagacagcagaagcagaatatctaaattctaatttagaacaagcattatct
ttatgcaaactagttacaaaagaaattagtaatgttttagatttagtaaaatttcaaaaa
ttaaaaataaaaatttatttagctagaaatcaagttaacacagttttagatattggtctg
gatattttggaaatgctaggtgtttctttagtagaattgccaccaaaaaatcttgatatt
gagcagttatatagcctaccgcttatgactgatcaatataaactagcagcaatggaaact
ttaattcttatttggcctcctgcttgttttgcaaaaaatactatagcaagaccaattttg
tacacaatggttgagctttctagacaatacggaaattccccattatctacttatgcttat
gtagtttatggtcaggtcatagcgtcatcaatggcagatattaatttaagttatcatctg
ggtcagttagctcttaaactaatagatcaattaaatgataaacaagttaaagctaaagtt
attttgatagtgtatataagttttattcactataaaaagcacattcaagaaactctaaat
cctatacatgaagcaattgaaagtggcttagaagttggagatattgagtatgcttgtcat
gcagctagcttttattgttctcatattttttttgtgggtaaagatttagattttattgct
aatatgcaagctgattatatagattttgttggcaaatttgaacaacaacatcaactagga
ttgattaaaatatgcgctcagacagtagagaatttaatcaatccctctgtagctaaaatt
caattaactggtgatattttaaatgaagaggaatttgttaattctgtaattataaataat
agcacgttatcattatttgatgtttattcttataaaacatggctttgttatctttttgaa
gaatatgaagaatgcttgaaatttgtaaggcttgcctcaaattacagtctcttcaagcaa
actggaatattatttatatataataatttattttattctttagcattacttgctgagtat
tctcgtaaatttctatttactaaatcatcaagaatagatgaattagaaatttacttaaag
caagtagatgaaaatcaggaatttatgaaatactgggctgaaaatgctcctatgaattat
caacataaatacgaattagtggaggcagaaaaggctagagcgttgggaaatatacttgca
gctatggaactatatgagcgcgctatagctggagctagagaaaatgaatatattcaagat
gaagcactagcttatgaattagcggcaaagttttatttagctttaggacggcaagaaatt
gcgcgaacttatatgactaaggcacactatagttatatctgctggggagctattgctaaa
gtcaaacatttagaattaaaatattcagaaataattattaactcgactagggattcaaca
ttagctaaaaataatatttcttattcttctactaccagcagtaattcacaaatattagat
gccacaacaattattaaagcttctcaaactctcgctagtgaaattattttagataatttg
ctagaaaagttaatgaatattgtaattgaaaatgctggcgctcaaactggttttttaatt
ttaaagcagcaaaaacagctatttattgcagctaagggtgctgtagatactacttcggag
gtaatgctatgtaaatcggtgttagttgaaactagccaacagttacccaattctttaatt
aactatgtcgtcagaactagagagaacgtaattttatgtgatgcaacccatgagggaaga
tttaccaaagatgtgtatgtgattgaccaccaacctaagtctatattgtgtacaccgatt
attcaccaaggtgagctttttggtttactttatttagaaaataatctggctgttggtact
ttcacagcagagagattagaagtcttgaaaattttatcttctcaagctgcaatttcaatt
aagaatgctcaactttatgaaaatctgaagcaagaaattaaagagcgccaacaagcagaa
gaagcattacgagagagtgaaaaaaagttaacacagattctcgaagctgtaccaataggt
atatttgtgatcgatgacaaaggacaaccctactatgctaatctaactgcacgaaaaatt
ttaggcaaagggattgttgataactctacaaatactcaattagctgaaatataccaagct
tacgtgcagggaacagaaaagcattatcctactgaaaagcagccaattatcagagctttg
aatggcgaaagtatcgttattgatgatatggaactgcatctagggaataaaattattcct
ttggaggtgttagcaacacccattttcgataataaaggtcaaattatttatgcgatcgca
gcttttcaagatattacacagcgtcagcaggcagaagcagagcgagctaagtttacccaa
gaacttgccctcaaacatacagctttgcagcaagcaacagaccaattagctgagtctaac
cgcaacttagaagctaaagttcaggagcgaaccaaagagctaagtcaaactttagagatc
ctcaaagcaactcaagctgaattagtgattgagaacgctttattaagaagcgcagaaaaa
accctaacttatgaatatcaagtcgggggaagtttaccaatagatgcacctacttatgtg
gtacgtcaggcagatagacatctttacaaggctttgaagcagggagagttttgttacatt
ttcaatactcggcagatgggcaagtctagcttgcgagtgcaaatcatgaaaaggttacaa
gccgagggctttgcctgtgcagctatcgatatttcagaaattggtaatcggcagctgact
atggaacagtggtatgcaggtttcatttatatattaggcagtagtttaaatcttttaaat
aaagttaatattagtacttggtggcgtgagcataaatttttatccccagtgcaacgtctc
agtaattttatagaccaaatagtattagaaaatcttcggcaaaataatattgttattttt
atagacgaaattgacagtgttatcaatcttaattttgacatagatgacttctttgtacta
ctacgaaatttttataacaaacgggctgacatcccaaaatataaacgtctcacttttgtt
tttttgggagtagctaatccttctcaattaattcaagacaaaaaacgaacgccttttaac
attggtcaagctattcaactgagtggctttcaattgcatgaagcccaaccgttactacaa
ggactagctgaacgagtaggtaatgctcagaatgtccttaaggaagtgttagcctggacc
ggtggacagccttttctaacccaaaaactttgtaagcttatccggaattcatcagtaaac
attcccaaggatagtgaagccgattggataaataacttagtccaaacacaggtgattgag
aattgggaaactcaagacgaacctgagcatttaaaaactatacgcgatcgcctcgtcaat
atggagtctcatgttgttgagatattaaagctatatcaagcaatttggcatcaaggagag
gttgttgcggttgatagtccacaagaaaaggaattactattatcaggtttggtggtcaag
caacaaggaaatctaagagttcataaccgtatttacgaattggtatttaatggcgattgg
attaagcaactgctgtgcaaaaactatgggtag
DBGET
integrated database retrieval system