Cylindrospermum stagnale: Cylst_3751
Help
Entry
Cylst_3751 CDS
T02398
Name
(GenBank) DNA polymerase I
Organism
csg
Cylindrospermum stagnale
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
DNA_pol_A_exo1
DNA_polI_exo1
HHH_5
HHH_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ25873
UniProt:
K9X080
LinkDB
All DBs
Position
complement(4249803..4252742)
Genome browser
AA seq
979 aa
AA seq
DB search
MSENFANHLTNDSATTTRPTFILVDGHSLAYRSYFAFAKGRDGGLRTKAGVPTSICFGFL
KSLLEVMATQQPQAMAIAFDLGDTTFRHQADDTYKAGRPETPEDFIPDLANLQELLSGFN
LPVLTASGYEADDILGTLAQRTAAAGYRVKILTGDRDLFQLIDTDKQITVLYFSPDAWKR
STSSITEFSAEQVKEKLGVFPSQVVDFKALCGDKSDNIPGVRGIGEKTAVQLLNAYNSLE
NIYAVLDQIKGATQKKLAEGKEDAKISRFLAKIVLDVPLELDLEDCKLTGFDASILTPIL
EKLELNKFLGKINEIQQQFGGKVAETPAVETAATLNADEDDDLSFYSASETAEVQRQTAL
PIQPQIINTEAKLNELVKILEKFTNSETPVAWDTETTALEPRDATLVGIGCCWGTEPDEV
AYIPLNHKMGENLNQDLALTALRPILESADYPKTLQNAKFDRLILRCQGINLAGVVFDPM
LASYVLNPDTTHNLTDLSQRYLGLTAKSYLELVPKGKTIADISIPAVADYCGMDVYTTFR
LVPKLREELEKIPTLHKLLLEVEQPLEVVLAEMEYTGVRINSAYLQELSQHLETELAKLE
EKATEIAGEKFNLGSPKQLSQILFEKLGLSNKHSRKIQSGYSTDAATLERLQEVDQTGFV
EAIIEYRTLSKLKSTYVDALPALVRADTQRVHTDFNQAATSTGRLSSSNPNLQNIPIRTA
FSRQIRKAFLPEPGCLMVAADYSQIELRILAHLSQEPILVQAYQQNEDIHTVTARLVFEK
EDITSDERRLAKTINFGVIYGMGSLRFARSTGVDKNNANEFIKRFNERYPKVFAYLEKVK
KEAIAQGYVETILGRRRYFDFTSNSLRQLKNSNLEEINLSKLKNLGAYDAGLLRSAANAP
IQGSSADIIKIAMVRLHEVLKKYQARLLLQVHDELVFEVPPQEWEELQPQIKSVMENAVS
LSVPLVVDVRAGENWMEMT
NT seq
2940 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccgaaaattttgctaaccacttgacgaacgattctgcaaccacaacaaggcccacg
ttcatcctcgtagatggacattccctcgcttatcgttcatacttcgcttttgccaaaggc
agagacggaggactgcggacaaaggcgggggttcctaccagtatatgttttggctttctg
aagtcactgctggaggtaatggccacacaacagccacaagcaatggcgatcgcctttgat
ttgggtgatacaaccttccgccatcaagctgatgatacctataaagcaggtcgtccggaa
acaccagaagactttattcccgacttggcaaacttgcaagagttgctgagtggcttcaac
ttgcctgtattaacggcttcaggttacgaagcagacgatatcttgggaaccttagcacaa
agaactgctgcggctgggtatagagtcaagattctcacaggcgatcgcgatttatttcaa
ctgatcgacactgacaaacaaatcaccgtcctgtattttagtccagatgcctggaagcgt
tccacatctagcattactgaatttagtgcagaacaagtaaaagaaaaattaggcgtcttt
ccttcgcaagttgtcgatttcaaagctctgtgcggtgataaatctgataatattcctgga
gtcagaggcattggcgaaaaaacagcagtacagctgcttaatgcctacaattccctagaa
aatatttatgctgtattagaccaaattaaaggcgctactcagaaaaaactggcagaaggt
aaagaagatgccaaaatatcccgttttttagcaaaaatagttcttgatgtgccgctagaa
cttgatttagaagattgtaaattaacagggtttgatgccagcatcctgacaccaatttta
gaaaaattagaattaaataaattcttaggcaaaattaacgaaatccagcagcaatttggt
ggcaaagttgcagaaactccagccgtagaaacagcagcaacactcaacgctgatgaagat
gatgatttgtcgttttacagtgctagcgagacagcagaagttcaacgacaaacagcttta
ccaattcaaccacaaatcatcaacactgaagccaaactaaatgaattggtaaaaattcta
gaaaaatttaccaattcagaaacacccgttgcttgggatactgaaaccactgctttagaa
ccaagagatgctactttagtgggaattggctgctgctggggaaccgaaccagatgaagtt
gcctatattcccttaaatcacaaaatgggggaaaatctcaatcaagatttagcattgaca
gcactacgtccaattcttgaaagtgctgattatcccaaaactttacaaaatgcgaaattt
gaccgtttaatcctccggtgtcaaggaattaatttggcaggagtagtgtttgatcccatg
ctggcgagttatgtgttaaatccagatactacccataatttgactgatttgtcgcagaga
tacttgggattaactgctaaaagttatttagagttagttcctaaaggcaaaaccatcgct
gatatcagcattcctgctgtagcagattactgcggtatggatgtttatacgacatttaga
ttagtaccaaaactgcgagaggaactagagaaaattcctactttacacaagctattacta
gaggtagaacaaccgctagaagtggttttagcggaaatggaatatacaggagttcggatt
aattcagcttatctccaagaactttcccagcatttagaaacagagttagccaagttagaa
gagaaagctactgaaattgctggagaaaaatttaatttgggttcccccaaacagttgagc
cagattttatttgaaaaattgggattaagcaacaagcattctcggaaaatccaaagtggt
tattctacggatgcagcgacattggaaagactccaagaagttgatcaaactggttttgtt
gaagccatcattgagtaccgcactctatcgaaattaaaatctacttacgtggatgcacta
ccagcattagtacgtgcagatacccagagagtgcatacggattttaatcaagctgcgaca
tcaacaggtaggctatcttcttctaatcccaatttgcaaaatatcccgattcgcactgct
tttagtcgccaaattcgcaaggcgtttttgccagaaccaggttgtttaatggtagcggct
gattactcacaaattgaattgcgaattttggctcatttgagtcaagaacctatattagtg
caagcatatcaacagaatgaagatattcacaccgtaacagcacggttggtatttgaaaaa
gaagatattacgtcagatgaacgaagattagcgaaaaccattaacttcggtgtaatttat
ggaatgggttctctaaggtttgcgcgttcaacaggtgtagataaaaataatgcgaatgag
tttattaagcgatttaacgaacgataccccaaagtttttgcctatttggagaaagtaaaa
aaagaagcgattgctcaaggttatgtagaaactattcttggtagaaggcgttattttgat
tttactagcaatagtttacgccagttaaaaaatagcaatctagaagagattaatttaagt
aaattaaagaatttgggtgcttatgatgcagggttactgcgttctgctgctaatgcacca
attcaaggttccagcgctgatattatcaaaattgccatggtgagattgcatgaggtttta
aagaaatatcaagcgcgtttgttgttgcaagttcacgatgaattggtgtttgaagttcct
cctcaagagtgggaagaattacaaccacaaattaagtcggtgatggaaaatgctgtttct
ttaagtgtaccgctggtggtagatgtgcgtgccggtgagaattggatggagatgacgtag
DBGET
integrated database retrieval system
