Chryseobacterium shandongense: EG350_13655
Help
Entry
EG350_13655 CDS
T05920
Name
(GenBank) T9SS C-terminal target domain-containing protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
csha
Chryseobacterium shandongense
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csha00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
csha02000
]
EG350_13655
Transporters [BR:
csha02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EG350_13655
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_7
Por_Secre_tail
fn3
Pur_ac_phosph_N
Ig_J_second
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZA58167
LinkDB
All DBs
Position
complement(3070643..3073735)
Genome browser
AA seq
1030 aa
AA seq
DB search
MKKLSFVKEKLKRHGRDFLSTCLLLASFAGLKAQLVSSYSFSQSSGTYTPISGGTNMVLS
STATSAWDSQFFHNGSGGINGTTTSGTYAAFPIGFNFTYNGTVYDGFYMSTDGALRLATT
AASSLGSLGGSSPISATTATSINLISAFGVDLIGGIRAASLTRTNGSPTLNLTGTSTAVA
GMITPGMRVVGASIPAGATVVSVSGSDVTISSNATASSTTGTATFVDVDNISYVTTGTPG
SQTLTVQWKNVSRFSGSGDRLNFQIKLYEGTNVIEAVYDATASTQVTTASTVQVGLKGAS
NADFNNRLGTGTSAWSASALGTANNSTIAFSGIAATAGEIIPPSGLTFTWTPPAICTGTP
TAGTVSPTMQTLLSGQTPANLVVSGYSPGVSGLAFQWEQSSDNTNWTNAVGGSGATNFIY
TPPAYAGTTIYYRCKVTCTNSAIDAFTPSVILDSCPAVTSYSNDFESTTGSELPQCWMKV
GTTGSANTQASTGITGARNLYMYSTSASAIAYVMMPTVSNLQAGTHKLKFKARSNVTVGG
KIEVGYFAIPGDVSSFTQVGSSYTTTSITVADNFDTGGLTLPAGVTNLVFRHNPSPSNSV
LIDDVIYEQLPSCIEPTAINASGITSSGAIINWTAPSIVPGSGYEYYYSTSNTAPTAGTT
PSGTSVTTSASLSGLSPLTTYYVWIRSVCSGSDKSIWTTVSSFVTLCQPPAILSVNGATV
CGASGSATISATADSGATITWYDAPTGGNELTTGGSYTTPVISSNTTYYVSAKSGSNPPN
AGLANAISTSGYTLEAGLFFDATSSFTINGVYVYPIGTGPGTVVIALQDGSVSPAVTLQT
ITVNLTGTTAPYVKTYVPLNFSVTPGSNYKLMMMSRSGGVSSLVRESGTSWGAYPLSVPG
VMNITNGNCCSGNTTSTSYYYFYDWQLTAGCESARQPVNVVVNSSCLGTSETSALKDNIK
VYPNPFTDVLNISQAENVKSISVTDLAGRLLKTIEKPSSAINLSDLKSGMYLVTFYLKDG
TQKTVKSIKK
NT seq
3093 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaactttcttttgttaaagaaaagttaaagcgacacggaagagattttttatca
acgtgtttgcttttggcttcttttgcgggcttaaaggctcagcttgtatctagttatagt
ttttcacagtcgagcggaacttataccccgatttctggaggaactaatatggtgctgtca
tctactgctaccagtgcgtgggattctcaattttttcataacggctctggtgggatcaat
ggtacaacaaccagcggaacctacgccgcattcccaatcgggtttaattttacttataac
ggtacagtttatgatggcttttacatgagtactgatggcgctctcagattagccactacg
gcagcaagttctctaggatctttgggaggaagtagtccaatcagcgctacgacagctaca
tctattaatttgatatcagcttttggtgtggatctaataggaggaataagagcagccagt
ttaacgagaacaaatggctctccaacccttaatctaacaggcacaagtaccgctgtagca
ggtatgatcacaccaggtatgcgggtagttggggcgagtattcctgctggtgcaactgtt
gtgtctgtaagtggatcagatgtaacgatatcttcaaatgctactgcaagttctactact
ggtactgctacctttgttgatgttgataatatttcttatgtaactacaggaactccgggc
tctcagacactcactgttcaatggaaaaatgtaagccgtttctcaggaagcggagacaga
ttaaattttcagataaaactatatgaaggaacgaatgttatagaagcagtttatgatgct
actgcatccacgcaagttacaacggcttcaacagtacaggttggtctgaaaggtgcttct
aatgctgacttcaacaatagattaggtacgggaacttctgcatggtctgcatctgctctt
ggtaccgcaaataattccacgatagccttttcaggtattgctgctaccgcaggagagatt
attcctccaagcggattaacctttacctggactccgcccgcgatatgtacaggtactcct
actgcaggcactgtttcaccaacaatgcaaacattattatcgggacaaacaccggcaaat
ttggtggtttcaggctacagtccaggcgtttcaggtttagcttttcaatgggaacaatct
tcggataacacaaactggactaatgctgttggaggttccggagctactaactttatttat
acacctcctgcatatgctggaactacaatttactacagatgtaaagttacctgtactaat
tctgctatagatgcattcactccttctgtaatattggattcttgtcctgctgtgacttct
tattcaaatgattttgagagtactacaggatctgagcttcctcaatgctggatgaaagtt
ggaactactggttcagccaatacacaagcgagtacagggattacgggagccaggaacctt
tatatgtactctacatctgcttcggcaatcgcttatgtgatgatgcctactgtaagtaat
ttacaggcgggaacgcataaattgaaatttaaagctcgttcgaatgtaacggtaggaggc
aagatagaggttggatattttgcaatacccggagacgttagttcctttactcaggtaggt
tcttcttatacaacaactagtataacggttgcagataactttgatacaggaggtctcact
ttacctgctggagttaccaatcttgttttccgccacaatccttcaccttcaaattcagta
ttgattgatgatgtaatatatgagcagctgccaagttgtatcgaacctactgctattaat
gcttcaggtattacgagttctggtgcaataataaactggacggctccttctatagttcct
ggaagtggatatgagtattattattctacgagcaatactgctcctactgcaggaacaact
ccatcaggaactagtgttacaacatccgcctctttaagtggcttgagtccactaaccaca
tactatgtatggataagatcagtatgttcaggatcagataaaagtatttggacgacggtt
tcttcatttgttacattatgtcagcctccggctattttaagtgttaatggagcaactgtt
tgtggagcttcaggttcagcaacaatatcggctacggcagattcaggagctactattact
tggtatgatgctcctaccggagggaatgaacttactaccggaggttcttatacaacacct
gtgatttcgtctaatactacatattatgtttccgcgaaatcaggaagtaatccgccaaat
gcaggattagcaaatgcaatatctaccagtggatatactttagaagcagggctgtttttt
gatgccacttccagttttacaattaacggagtttatgtttatccgataggaacaggaccc
ggaacggttgtaatcgctttacaggatggaagtgtaagtcctgcagttacattacagacg
attacagtaaatctcacaggaactactgcaccttatgtaaagacatatgttccgttgaac
ttttccgtaacaccgggaagtaattataaattaatgatgatgagcagaagtgggggagtt
agtagtttagttagagagtcgggaactagttggggagcttatccgctgtcggttcctgga
gtaatgaatatcaccaatggcaactgctgttctggaaacacaacttctacttcatattat
tatttttatgactggcagctaactgctggttgcgaaagtgcaagacagccggtaaatgta
gttgtaaattcttcttgccttggaacttcagaaacgtcagccttaaaagataatattaaa
gtgtatccaaatcctttcacagatgtacttaatatttcacaggccgaaaatgtaaaatcg
atttctgttacagatcttgccggaaggttgttaaagactattgaaaaaccttcatctgct
attaatttgtcagatttaaaatcaggaatgtatttggtgacattctatttaaaagatgga
actcaaaaaacagtaaaatcaattaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system