Chryseobacterium shandongense: EG350_16900
Help
Entry
EG350_16900 CDS
T05920
Symbol
sprA
Name
(GenBank) cell surface protein SprA
Organism
csha
Chryseobacterium shandongense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SprA_N
Sgo0707_N2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZA58756
LinkDB
All DBs
Position
complement(3759153..3766226)
Genome browser
AA seq
2357 aa
AA seq
DB search
MSVMTFAQQRPAVGDTAIIKKDYQLADPTQYEAYYDIKTGMYYVYPKIGNTITGPPTAMS
PEDYKEFMMAEQTRAYYKEKSDRYSLMFRKDKSDAARKGLIPSLTINNRLFETLFGSNKI
EIIPSGYVSFDFAGLYQKIDNPLILPQNRTSFTFDIDQRIQLGLLGKVGENLQLKANYDT
QSGFAFENRMNLVWQAKGSWKDLQQKGLNDVDKPSAGGEDKIIKRVEFGNVNMPLSTSLI
RGSQSLFGVKTEFQLGKTYGTVVLSQQQGEARNITVQGGGVMNTFKLNAIDYEDNQHYFI
GHYFLDNYDNALLNYPQINSKISITRMEVWVLDQGNSNLQYQKSIVGIRDLGDAPGVLPN
NDQPGFNLYSAVNALPGLRDASTAYNAIKGANLPVASGGTATYQDGEEFIFNRKARRLNT
NEYILQPQLGYISLNQRLNDNQLLAVSFSYTVNGSNQVYKVGEFSEESTVLMAKLLKPNT
TVKTSSPMWNLMMKNIYSLDAGQVSQDGFILNVLYRDPQSGGKLNYLPVANNPQVNNVPL
IKLLNWDRLNANGDLQISGNTTGDGIFDFVNGITIRPETGRVIFTKVQPFGSYIQSVIGS
NDPQYVYNDLYTLQKTGSNSAEASNLSQRYTIEGRYKGTQGQGISLGAVNVPQGSVKVSA
NGVQLTEGVDYTVDYMLGTVTIINEQVKQSGQAINISLENQLTFNTQRKRFLGLNLERRF
NENFILGGTVVNYSESPLTQKVNYGQEAVNNTMAGINLMYNSQLPFLTRLTDKIPFVNTE
APSNLNFKMETAYLLPGLNKGINDQSYIDDFEQTTSRITLKEPTAWSLASKPEKNQSDPL
FAGAGKNNDITEGYGRGLLSWYNIDPRFWGVGGRAPNGITPQSVSNHASRRVQFSEIFNN
RDFVAGEQTYTNTFDISYYPTEKGPYNSNAATESTSQRWAGIMRPISVSNFVTSNIEYVE
FWMMDPYADGNALGTNPKLLLQLGNVSEDILKDGQMQYENGLPTPSVPSTTTSSNWGTQP
KQPPILYAFSSEGADRTAQDVGYDGLSSDQEAALFGNTFVNPVTNVSDPAVDDFVFYMSN
SFTGNQASSLVQRYKYFRGPEGNSQSNSLEVSTQTPDSEDINKDYNLDQSENYNEYIVNL
DQASLAAGTDNYIVDQKIVQATFQNGQTDDVKWYLFRIPVSDFNNPDKPDLGGDKDDAIL
NNVRFARLILKGFDQTSTLRFGTMDLVRSDWRKYPRNIAQYGSTVPDPATDEGSLVTDNN
ILEVGSVNIEENALNQPPYVLPPGIDRQILSGNAGAQRQNEASLYMNIKNLPNAQARGVF
KNTSLDMRRYKKLKLFVHTHDPLNRDANIGQIDPKTKFFIRFGSDATDNYYEYEASLKIT
PTTATAPMEIWPMENDVDLDIQDFVDAKLRRDKNSPNNITTRVRDDVYDEGINNKRIYIK
GRPSLGNITTIMIGVRNGADRAAPGFNLERILWVNEIRLSEIENDGGYAGNASLNFNLGD
FATVNTSASYTSVGFGNIDSKPAERTQSTQSAFSINTAVNVDKLLPEKSGVKIPLNYSYS
QTIEDPKYNPLDTDVEFKKAANREELKKVARTYTQQRSIGVVNMRKERMNQNRKPKFYDV
ENLSVTAVYNDDFYRDIYTKRNYRQYLRGYVDYNYTFKPWVIRPFNKMISDTAKSTKYLK
WVKEFNFNPVPTRFSFRTEVDRNYNELEFRNIDAILSGNYADDFGAIKNRNFYFGWQYGI
GFNFTKSLKLEINSATRTLNDNVDVNTMDNQSIFGNVLRAGRPVLYNHRVQLNYQLPFKY
LPYLDFIDAEIGYGFAYNWNARSTVLLASPDGSLGSIGQNTNVIQATGSADFTKFFGQFS
YFKNISAKLQKRKQEIDSLNNAYTQAWEKNRYAYKKYKFKNRLTPFQSMAYLLTSIKQLD
VNYSENNGTVLPGLLSAPNWYGYGQTLGGPTIGFLLGSQADIRRTVMENGWVSDSEFMTD
PYIRMSTRELRANLQVMPMNDLRIDINALHNYNRNFTHTGFNYRDPDTGIANPDYTFAND
MVTYSNSVVLLKTAFKDGTAIYQAIRENARALSQQMPGALEPNGFKDGYGISNAYILIPA
FRAAVEGKSPKMMTNPKKAGLPIPNWKITYSGLRNIPIINGQFSKFDILHAYQATYTATG
VQSSIDYFNTLNNLSATQRDINDDYINPFTFAQVGYVENFSPLIGVDVTMRNNMQFGIQY
NRLRTLLLGLVNHTLTEDSNSEYIVRVGYIIRNFRLGMANTGRGKAKGSDLNIRGDFSLR
DSRTSITNILLDDSQVTGGQRLLNIKVAADYNVSENLNLRVFYEQMTSKYKISTAFPLST
IRAGISATFTFGDSGGF
NT seq
7074 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagtaatgacatttgcgcagcaaagaccggcagtcggggacacggcaataataaaa
aaagactatcagcttgcagatcctacgcagtatgaagcttattacgatataaaaaccgga
atgtattacgtatatccgaagatcggaaataccattaccggccctccaactgcgatgtct
cccgaagattataaagaatttatgatggcggagcaaacaagggcttattacaaagaaaaa
tcagatcgctacagtctcatgttccgaaaggataaaagtgatgcagccagaaaaggtttg
attccatcattaacgatcaacaaccgtctttttgaaactcttttcggaagcaataaaatt
gaaattattccttcgggatatgtttccttcgactttgcgggactttaccagaagattgac
aaccctttgatcttacctcagaacagaaccagctttacctttgatattgatcagagaatt
cagctcggtttattagggaaagttggggaaaatcttcagttgaaagccaactatgatacc
caaagcggtttcgctttcgagaataggatgaatcttgtatggcaggccaagggaagttgg
aaagaccttcaacaaaaaggattgaatgatgttgacaagccaagtgcaggaggtgaagat
aaaatcattaaaagagtagaattcggtaatgtaaatatgccgctgtcgaccagtttgata
cgcggctcacaatcattattcggggtgaaaaccgagtttcagctaggaaaaacatacgga
actgtagttctttcccaacaacagggagaagcaagaaatattaccgttcagggcggtggc
gttatgaatacatttaaactcaacgccattgattacgaagataatcaacactattttatc
ggacattatttcctggataattatgataatgctctgttaaactatccacagattaactct
aagatcagcataacgagaatggaagtgtgggtgctcgatcagggaaacagcaatctgcag
tatcagaaaagtattgtagggataagagatcttggtgatgctcccggcgtactcccgaat
aacgaccagcctggtttcaatctttattcagcggtaaatgcattacccggattaagagat
gcaagtacagcttacaatgccattaagggagcgaatcttccggtggcttccggtgggaca
gcaacgtatcaggacggagaagagtttatctttaatagaaaagcaagaagattaaatacc
aatgagtatattttacagccgcaattaggatacatttcattaaaccagagattaaatgac
aaccagcttttggctgtgtcattctcgtatacggtaaatggaagtaatcaggtgtacaaa
gtaggggaattctctgaagaaagcacggtgttaatggcaaaacttttaaagccgaacact
accgttaaaacatcatccccgatgtggaacctaatgatgaaaaacatttattctctggat
gcaggacaggtaagccaggacggatttattctgaatgttttgtatagggatccccagtct
ggagggaagctaaattaccttcctgttgccaataatccgcaggtaaataatgttcctttg
atcaaattgctcaattgggacaggctcaatgcaaatggtgatctccagattagtggaaat
acaaccggtgacggaattttcgactttgtcaacggaattaccataaggccggaaacggga
agggtaatctttactaaggtgcagccatttggtagttacatacagtcggttatcggaagt
aatgatccgcagtatgtgtacaacgatctttataccttgcagaaaacaggatccaatagt
gccgaagcaagcaacttatctcaacgatacactattgaaggacgttataaagggacacag
gggcagggaatttctctaggcgccgtgaatgttccgcaaggttctgtaaaagtttctgca
aatggtgttcagcttaccgaaggtgtagactacactgttgactatatgttgggtacggta
accattatcaatgagcaggtgaagcaatccggtcaggcaatcaatatatcattagaaaat
cagcttacttttaatacccagagaaaacgtttcttaggattaaatttagaaagaaggttt
aatgaaaattttatcctgggaggaaccgttgtaaattattccgagtcaccgcttacccaa
aaagtaaattacggccaggaagccgtaaacaacacgatggcgggaatcaacctaatgtac
aacagccagcttccattccttacgagattaacagataaaattccgtttgtaaatacagaa
gccccgtctaatcttaactttaaaatggagacggcatatttacttccgggtttaaataaa
ggaattaatgatcagtcttatatcgacgattttgaacagaccacatccagaattacctta
aaagaacctaccgcatggagtcttgcttcaaaaccggaaaagaatcagtctgatcctctt
tttgcaggagcgggtaaaaataatgacattacagaaggatatggaagaggtttgttatca
tggtataatattgatccgcgattctggggtgtaggaggaagagctccgaatggtattaca
ccacagtcggtttcaaaccacgcatccagaagagttcagttttccgaaatttttaacaac
agggatttcgttgccggagagcagacctataccaatacgtttgatatttcatattatcct
acggaaaaagggccttacaattccaatgcagccacagaaagtacatcacagcgatgggcg
ggtatcatgagaccaatatcggtatccaatttcgtaacctcaaatatagaatatgtagaa
ttttggatgatggacccttatgcagatggaaacgcattaggaaccaatcctaaactttta
ttacagttaggaaatgtttcagaggacatccttaaagacggtcaaatgcagtacgaaaac
ggattgccgaccccttcggttccgtccaccaccacaagctcaaactggggaacccagcct
aaacagccgcctatcttatatgctttctcaagtgagggtgcagacagaacggctcaggat
gtaggatacgacggtctaagctcagatcaggaagcggcattgttcggaaatacttttgtt
aaccccgttaccaatgtgtcagatcctgctgtagatgatttcgtattctatatgtcaaat
agcttcacgggaaatcaggcgtcatcgttggtacaacgttataaatacttcagaggcccg
gaaggtaattctcagagcaactctctggaagtttctactcagactccggattctgaagat
atcaataaagattacaacctggatcaaagcgagaattataatgaatatattgtaaatctg
gatcaggcaagtttagctgcgggaacagacaattatattgtagatcagaaaattgttcag
gcaactttccaaaacggacaaaccgatgatgtgaaatggtatttatttagaattcctgtt
tcagattttaataatcctgacaaaccggatcttggcggtgataaagacgatgcaattctc
aataatgtaagattcgcaagattaatattaaaaggttttgatcagacatcaacattaagg
ttcggaacaatggatctggtaagatcagactggagaaagtatcccagaaatatcgcgcag
tatggttctaccgttccggatccggcaacagatgaaggaagcttggttactgataacaat
attcttgaagtaggaagtgtaaacattgaggaaaatgctttaaaccagccaccttacgta
ttgcctccgggaatagacagacaaattcttagcggaaatgccggagcgcagagacaaaac
gaggcatcattatatatgaatattaaaaatcttccaaatgcacaagcgagaggtgtattc
aaaaatacctcgctggatatgagaagatataagaaattaaaacttttcgttcatacacat
gatcctcttaacagagatgcgaatatcggacagattgaccctaaaacaaaattcttcatc
cgtttcggaagtgatgccactgataactattatgaatacgaagcgtcgttgaaaataact
cctactactgcaacagctccaatggaaatatggccaatggaaaatgatgtagatctggat
atccaggattttgtcgatgctaaactaaggagagataaaaacagccccaataatattaca
acaagggtaagagatgatgtatatgatgaaggaatcaacaataaaagaatttatattaaa
ggacgtcctagtttaggaaatattaccaccatcatgatcggtgtaagaaatggagcagac
agagctgctccgggatttaatcttgaaagaattctgtgggttaatgaaatccgtctttca
gaaattgaaaatgatggcggttatgcaggaaatgcaagtcttaactttaaccttggtgat
tttgcaactgtgaacacaagtgcttcctatacctcggtagggttcggaaatatagattct
aaaccggcagaaagaacacagtctacacaatctgcattcagtataaatacggctgtgaat
gttgataagctactaccggagaaaagtggtgttaaaattccattaaattactcgtattca
caaacaattgaagatcctaaatataatcctctggacaccgatgtcgaatttaaaaaagcg
gccaaccgggaggaactgaaaaaagtagcaagaacatatactcagcaaagaagcattggt
gttgtaaatatgcgcaaagaaagaatgaatcagaacagaaaaccaaaattctatgatgtt
gaaaacctttccgtaaccgccgtttataatgatgatttctatagggatatctatacgaag
agaaattacagacaatacttaagaggatatgttgattacaactataccttcaaaccgtgg
gtaatccgtccatttaacaaaatgatcagtgatacggcaaaatccacaaaatacctgaaa
tgggtaaaagaatttaatttcaaccctgtacctacgagattctctttcagaaccgaagtc
gacagaaattacaacgagttggagttccgtaatattgatgccattttaagcggaaactat
gctgatgatttcggagccatcaaaaacaggaacttctatttcggttggcagtatggtatc
ggatttaatttcacaaaatctttaaagcttgaaattaattccgccaccagaacattgaat
gataatgtagatgtaaatacaatggacaatcaatccatctttggaaatgtcttaagagca
ggaagaccagtattatacaaccatagagttcagctgaattaccaactgcctttcaagtat
cttccgtatctggatttcattgatgctgaaattggatatggatttgcctacaactggaat
gcaagatccacagttcttctggcgagtcctgatggaagtcttggatcaattggccaaaat
acaaatgtaattcaggcaacgggttctgcagacttcacaaagttcttcggacagtttagc
tattttaaaaatatttctgcaaaacttcagaaacgcaagcaggaaattgattccttaaat
aatgcttacacgcaggcctgggagaaaaacagatatgcgtataaaaaatataaattcaaa
aacagattgactccattccagagcatggcctatttattaacatcaataaaacagctggat
gttaattattccgaaaataatggtactgttttaccgggattattgtcggctcctaattgg
tatggatatgggcagactttaggtggtcctaccatcggattccttctgggttcgcaggct
gatatccgaagaaccgttatggaaaacggctgggtaagtgattcagaattcatgacagat
ccatacatacggatgtctacaagagagcttcgggccaatttgcaggttatgccgatgaac
gacctcagaattgatatcaatgccctgcacaattacaacagaaactttacccataccgga
tttaattacagagatccggatacgggaattgcaaatcctgattatacatttgctaatgat
atggtgacctattcgaattcagttgtactgttaaaaactgccttcaaggatggtaccgca
atttatcaggcaatcagggaaaacgcaagagctttatctcagcaaatgccgggagcgctc
gagccaaacggattcaaagacggatacggaatatcaaatgcctatattcttatccctgca
ttcagggcagcagtggaaggtaaaagcccgaaaatgatgaccaatcctaaaaaagcagga
cttccgattccgaactggaaaattacctattccggactaagaaatatcccgatcattaac
gggcagttctccaagttcgatattctgcatgcttaccaggcaacttatactgcaactggt
gtgcagtcaagtattgattattttaatacactcaataatcttagtgcaacccagagagat
attaatgacgattatattaacccattcacatttgctcaggtaggctacgtagaaaacttc
tcaccattgattggggtagatgtaaccatgagaaacaatatgcagttcggtatccagtat
aaccgattaagaacgctcttattaggattagtgaatcatacgttaacggaagattcaaac
agcgaatatatcgtgagagttgggtatattatcagaaattttagattgggaatggcaaat
acaggaagaggaaaagccaaaggaagtgatcttaacatcagaggtgatttctccttgaga
gacagcagaaccagcatcaccaatattctgttggacgattcgcaggtgacaggcggacaa
aggttactgaatattaaagttgctgccgactacaacgtttcggaaaatctgaacctgaga
gtattctatgaacagatgacttcaaaatataaaatctcaacagcattcccgctgtcaacc
ataagagccgggatttctgcaacatttacattcggagattcaggtggtttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
