Cyanobacterium stanieri: Cyast_0190
Help
Entry
Cyast_0190 CDS
T02377
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin family outer membrane protein
Organism
csn
Cyanobacterium stanieri
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHAT
TPS
Trypan_PARP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ46172
UniProt:
K9YI81
LinkDB
All DBs
Position
199023..203255
Genome browser
AA seq
1410 aa
AA seq
DB search
MMVKTWGLMVSLLSGLVIFHPRLVYSQEIIIDRTTDTNITVDGNNILINGQTLSGDGKNL
FHSFQEFGLTNEQIATFLTNPNIQNILTRITGGNPSQINGLLQVVGGNSNLFLMNPAGII
FGQGASLNVPADFSATTATGIGFGNGIFSAVGANEYQNLWGNPHSFIFNQDNIGSIINQG
DLTLGAGQNLSLMGGNVINAGVIETAGGRINIQAVEGTSRIKITPEGSFLSLELDLPTDE
RGNLLGFSPQDLPSLLTGKDVDGVRVDNGQVRVNESLIPQGQGSAIASGTISTNNSEGMG
GDITILGKNVGAIASTITADGQTGGGNIRIGGDMMGQGTIPNASVTYISPDSNISANATT
QGDGGKIIIFAQEFARIHGNLSATGGTMAGDGGFIETSGLRSFSITSVPNIRAFNGQGGE
WLIDPFDITITNDADSDVSGINPFNPFVAEDDNAVLPVTLIQTALSDGDVTISTGIGGSQ
TGNITWNDDAILFYSLSASRTLTLNAAGNINFNGGIEPFSVSEPLSLIFNSNTNNNGIGN
ININTGSSLALSGGSITLDGVNVTSKIDLFTDGGDITIKATKQINTQILDTSGSQFAGDI
KLSAGGNITTLDVVADTPSFQSNAGNISLNSGNDIKTGNISTQQTDGLGNSGTITLQGFR
NIQTGDILSSTFDGNAGGITIKASQGTISTATILSSGSESSGNINLNANNAVTTSSIASN
ASGNTGNININSQNSINVGDLSSVSFGGGKAGNITLNAPDGIVVDAIDASSFDGVAGNIA
VTTGSTFRVLETTSFDPDSSIRTVGVSGTGGNISIKWSNPVPEDFSFDVNVGALIADSSN
GTRGTINAGLARIPEVGNSPEIITEPIIVVGIAGGSIDVSFDIEIPEPEPEPEPEPEPEP
EPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPIPLDPRDELLSFVLQSNDPDPINN
QTSYNPTIGENIPIDGQESLLILSIDQAKDILSTIENRTGVKSGFIYVSFTPPNYQPSSL
DEDMARREAQKTNEFGRVVDDIPNVSPVVGLDRVEDTQLDILIITAEGEPLRVVVPITRE
EVTNSVNNLWSNVADIFNLSDDYRADATQIYQWLIEPLEGLLVEREIENLVFMLPNEMRF
LPLAVLYDQKSEEYLVEKYSLSLTPSINLNDNEYSPVGDRSLLAMGASTFEDQSITPLPA
AGVELPTISRVWQGDDNLRQDLFASDSFTLDNIRRNLNENTHGIVHFGTHGEFNTREIDS
SFIQLYNDRLNLKELRNLGLKNLGVELLVLSACNTAFGNEMAELGFAGLAVQAGVKTALG
SVWQVSDTGTLALMTNFYSQLRNHTIKAEALRQAQLSLLKGETRKSDDGDTIITPNLDIS
LMELPEISRKSEDFSHPFYWAPFTMIGSPW
NT seq
4233 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggtaaaaacatggggtttgatggtttctctgttgtcaggattggtaatcttccat
cctcgtctggtttatagtcaagaaataataatcgatcgcaccacagacactaatattacg
gtagatggtaacaatatcttgatcaatggtcaaaccctgtcgggggatggcaaaaattta
tttcatagcttccaagaatttggcttaactaacgagcaaatcgccacctttctcaccaac
cccaacattcaaaatatcctcacccgcattacggggggtaatccttcgcaaataaatggt
ttgttgcaggtagtggggggcaactctaacctgtttttgatgaatcctgcggggattatt
tttgggcagggggcaagtttgaatgtacctgcggactttagcgctaccaccgccacgggt
atcggttttggcaatgggatttttagtgctgtgggtgccaatgagtatcaaaatttgtgg
ggtaatccccatagttttattttcaatcaagataacatcggtagtattatcaatcaggga
gatttaacccttggggccgggcaaaatctgagcctgatggggggcaatgtcattaatgca
ggtgtcatagaaaccgcagggggcagaattaatatacaggcggtggaaggcacttcgagg
ataaaaataacccctgaaggtagtttcttgagtttagagcttgatttacctaccgatgag
agaggaaatttgttagggttcagtccccaagatttgccctctttgctcacaggaaaagat
gtggatggggtgagggtagataatggacaagtgagggtaaatgagagtttaattccccaa
gggcaaggaagtgcgatcgcctcgggaaccatctccaccaacaacagtgaaggtatgggg
ggagatataaccatcttaggaaaaaatgtaggggcgatcgcctctaccataaccgccgac
ggacaaacagggggcggtaacatcagaatagggggagatatgatggggcaaggtactatc
cccaacgcctccgttacctacatcagcccagattcaaacatctctgccaatgccaccacc
caaggagatgggggtaaaattatcatctttgcccaagagttcgcccgtatccatggcaac
ctcagcgccacaggaggcaccatggcaggggatgggggattcattgaaaccagcggtttg
agaagttttagtattacctcagttcccaatattcgagctttcaacggacaagggggagaa
tggttaatagatccctttgatattaccatcactaacgatgccgattccgacgtttcaggc
atcaatccttttaatccctttgtcgccgaggatgataatgccgttttacccgtcacacta
attcaaactgccttgagtgacggcgatgtcaccatttccacaggtataggaggaagtcag
acagggaatatcacttggaatgatgatgccattctcttttattctctttcagcaagtaga
acccttaccctcaacgccgcagggaatataaattttaatgggggaattgagccattttcc
gtatcagaacccttgagtttaatctttaatagcaacaccaacaataacggtatcggcaac
attaatattaatactggttcatcccttgccctcagcggtggttccataactttggacggt
gtcaatgtcactagcaagatagatttatttaccgatgggggagacattaccatcaaagct
accaaacaaattaatacccaaatccttgatacttcaggaagtcaatttgcaggggatata
aaactaagtgcagggggcaatatcaccaccttggatgtggtggcagatactccttctttt
caaagtaatgcaggtaatatttccctgaattctggtaatgacataaagacgggcaatatt
agcactcaacaaacggatggattgggtaattctggcacaatcactcttcagggatttaga
aacattcaaacaggagatattttatccagtacatttgatggcaatgcaggaggaataacc
atcaaagcatcccaaggcaccatttccaccgcaactatcttatcctctggttccgagagt
tcaggtaatatcaacttaaacgccaataatgccgttaccaccagttccatcgcatccaat
gccagtggcaatacgggtaacattaatatcaatagtcaaaatagtattaacgttggtgat
ttatcctccgtttcctttgggggagggaaggcaggaaatataactctcaatgcacctgat
ggtattgtggttgatgccattgatgctagttcctttgatggtgttgcaggaaatatcgca
gttaccacaggctctaccttcagagtattagaaaccaccagctttgatcctgatagtagt
attagaaccgttggggtaagtggtactgggggaaatatttccattaaatggagtaatcca
gtaccagaagattttagttttgatgtgaatgtcggtgctttaattgcggattcaagcaat
ggcacaaggggaactattaatgcaggattggcaaggattccagaagttggcaactcccct
gagattattactgaacctatcattgtggtaggaattgcagggggttcgatagatgtttct
tttgatattgaaatacctgaacctgagcctgaacctgagcctgaaccggaaccggaacct
gaacctgagcctgagcctgaacccgaacctgaacctgagcctgagcctgaacccgaaccc
gaacctgagcctgaaccggaaccggaacccgaacctgagcctgaacccatacctcttgat
cctcgggatgagttactttcctttgtattacaatccaatgatcctgatccgattaataat
caaacttcctataatccaaccatcggcgaaaacatacccattgatgggcaagagagttta
ttaattctcagtattgatcaagccaaggatatattaagcaccattgaaaataggacgggg
gtaaaaagtggatttatttatgtcagttttactcctcccaattatcaaccctctagtttg
gatgaggatatggcaagacgggaagctcaaaaaaccaatgagtttggcagggtggttgat
gacattcccaatgtctctcctgtggtaggactagatagggtagaagatactcaattggat
attttaattattaccgcagagggtgagcctttacgggtggtggtgcctataactcgggag
gaggttactaattcggttaataatttatggtcaaatgttgctgatatttttaatttgagt
gacgactacagggcggatgctacccagatttatcaatggttgatagagcctttggagggg
ttattggttgagcgagaaattgaaaatttagttttcatgttgcccaatgagatgcgtttt
ttgcctttagcggttttatatgatcaaaaaagtgaggaatatctagtcgaaaagtatagt
ctttcccttactcctagtattaatcttaatgataatgaatatagtcctgtaggcgatcgc
agcttattagccatgggtgcatcaacctttgaagatcaatccattacccccctacctgcg
gcaggagtagaattaccaaccatctcaagggtatggcagggagatgataatctcagacag
gatttatttgccagtgatagctttaccctcgataatattcgccgaaatttaaacgaaaac
acccatggtatcgtccactttggcacccatggagaatttaacaccagagaaatcgatagt
agttttattcaactctataatgatcgcctcaacttgaaggaattacgcaatttaggactc
aaaaatttgggagtagaattattagtcctcagtgcctgtaatacagcctttggcaatgaa
atggcggaactaggattcgcaggtttagcagtacaagcaggggtaaaaacagccttgggt
agtgtatggcaagtgagcgatacaggtacccttgccttaatgactaatttttatagtcaa
ttaagaaaccacaccatcaaagccgaagccttacgtcaagcacaattgagtttactaaag
ggagaaaccagaaaaagtgatgatggagatacaattatcactcccaatcttgatatttcc
ctaatggaattacccgaaatatctcgtaagtctgaggacttttcccatcctttttattgg
gcaccttttacaatgatcggtagtccttggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
