Cyanobacterium stanieri: Cyast_0384
Help
Entry
Cyast_0384 CDS
T02377
Name
(GenBank) multi-sensor hybrid histidine kinase
Organism
csn
Cyanobacterium stanieri
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
PAS_9
PAS
CBS
PAS_4
GAF
GAF_2
Response_reg
PAS_8
HATPase_c
HisKA
GAF_3
PAS_11
VpsR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ46364
UniProt:
K9YHP6
LinkDB
All DBs
Position
complement(426254..432838)
Genome browser
AA seq
2194 aa
AA seq
DB search
MLNYTPLTIEQLQKGIIRHPLTVSPQATVQDAIALMSGIRSSCETPYHQDNNKKSLEIEA
RSSCVIVVDGEKVIGILTERDIVRLTINNQSLSNIIIGEVMVSPVITFPENQFTDIFSVI
NLLYQHNIRHLPILDDQEHLIGLITHESLRQLSRPIDLLKLRQVKEVMIPEVICDDEKAS
LINIARKMNHHQVSCIVITREKKIEAQIKQLPIGIVSERDLVQFQALNLDFNNYKAKDVM
SSPPITVGLDESLLTVQHLMEKHLIRRLLVIGEQQEIRGIVTQTNILKALNPIEIYGMAT
MLEKRVKQLEQEKYALLQNRNRELEKTVTQRTKELQNRIKREQLIADISDHIRESLQLDN
ILNTCVEELRTFSKCDRVLVYQFNQDWSGVIVAESVGKGLLQSIGNIVQDSCFQESLAHN
RIFTTTEVIAINNIYNHGYPDCYIQLVEKYHIKANLIVPIRIQGKLWGLLIGHQCQDFRQ
WQEEDTSLFKEIASALAIAIKQSINYHNLENELKERKKAEELLKESENRFRQLAENIDQV
FYLIDREEEQMLYVSPNYELIWGKSCQSLYDDPQSYLNIIHPEDRHLLIQAKELREQGFQ
TTSEFRIIRPDGEIRWILNRTFPIKNSINNIHERTCGIAEDITEGKLNEIELTKSQQQIE
TTSFRLKEAQRIAKLGHWEYNHLQNTLYWSKQCYSIFGISSSEFTPSYEGFLQLIHHEDR
TLVNHYYNDHLENQTDYNICHRIIRTDGQIKYVQEQCETEYDEDGTPLISRGTVQDITKL
KEAELKLAQLNQELETKVAERTQELWNINHLQAMILDGTDYAIISIDCNGYIKTFNQGAE
NMLGYKADEVINQVSPLQFVDQQEAENHITKISQELGQETPFDINAFTIKSRLDMVNEFT
ITHIHKDGTRFPVQMRINPLKNEQGEIVGFLGIGKDITKEEQARSDRKRHEIERQQLLQE
LSAFKLGLDESAIVAITDSEGIISYVNGKFVNVSGYSENELIGKTHKIVNSGYHPRSFFK
NLWDTLKKGEIWRGEICNRSKLGSLYWVESTIVPFLDREGNPFQYLAIRFDITARKLGEI
RIRKENTFRQQILEQMGDGLSISYAVSEHPFIRFTVWNPKMEIITGYTLEEINNHGWYRI
LCPHSENQTEAIQRIKTMGQGSNLIGMVEEWEIITKTGDKRTITISTSVLAQEDNHNFVL
AVIQDITDRKAKEKENILLKEQLEFVLSSSPAIIYNCEVNPPNYHPKFLSPNVQSILKHD
HQKFLSGSLAWHEFIHPDDVSMVFPEMEKQLFTNDHYRCEYRFLTGDNEYVWLQDEMILL
RDEYGNPLEIVGYTSNINERKQAQIELKNKTEELDQFFSLAIDLLCIANTDGYFIRLNKE
WEKLLGYPLKQLEGSLFLDYIHPDDLSLTLEAIKEIQQGLEIASFTNRYRCADGSYRWLE
WRCAPKQNYIYAAARDITDRKKNEEDINRHLAAIEAAMNGIAILQGDNFLYANKAHHEMF
GYQQGELIGKNWRILYHPKKIKLIEQDIFPVLMTDGAWYGEIEAKKKDGSIFDEGLSLTV
TDNNLLICICQDVTLRKQYEAEKLTLIDTIQRNNQLLSIISKAESKFITAENRLTIFEQL
LSDLLELTNSEYGFIGEVLFREDGSAFMEENFIKIKGVPYLQTHSITNIAWNEETQKFYD
ENYQAGMQFTNMNTLFGAVIMTGKPVIANSPSTDPRRGGIPSEHPPLNAFLGLPFFSDNK
LIGIVGIANAPGGYDNSVVEYLQPFLMTCSILIEGYRLDAGQKLAEKELFKSNQQLMKAN
RLKDEFLANMSHELRTPLNAILGMTEGLSEQIFGEINNKQLKALETIERSGTHLLELIND
ILDLAKIEAGQLELQLSNVSLDSLSESSLTFIKQLAFKKRIKLNTEIPTNVPCLMIDERK
IRQVLINLLNNAVKFTPEGGNISIKISNATPGEIPNFVTKVFKNSENTSLNNVYISVVDT
GIGIPPNKFNSLFEPFVQVDSALNRQYSGTGLGLSLVKRIVELHGGFVILSSRVGFGSSF
TIALPYNSSACEISQSWNNDNPQIISSNSIQPSSNALILLAEDNEANISTISSYLKAKGY
RVIIAKNGEEAVSFSQTEKPDLILMDIQMPKMSGFDAIVQIRQNSETTNIPIIALTALAM
KDDQNKCLEIGVNDYFSKPLKLRALTNKIQELLS
NT seq
6585 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaattatactcctctgaccattgagcaattacaaaaagggattattcgtcatccc
ctcactgtatcgcctcaagcgacagtccaagatgcgatcgcccttatgagcggcattcgt
tcttcttgtgaaacaccctatcaccaagataataataaaaaatccttggagatagaagct
agatcaagctgtgttatcgtcgtggacggtgaaaaagtcattggtattctcaccgagaga
gatatagttcgtttaacgatcaataatcaaagtctaagtaatataatcattggggaagtc
atggtgagtcccgtgattaccttccccgaaaatcaatttacggatatattctcagttatt
aatttactgtaccaacataacattcgtcacctgcccattttggatgatcaagagcacctt
atcggtttgattacccacgaaagtttgagacaactatctcgccccattgacttactcaaa
ttacggcaagtcaaagaagttatgattcccgaggttatttgtgatgacgaaaaagcatcc
ctgatcaacatcgcccgaaaaatgaaccaccatcaggtaagttgtattgtcattacaaga
gaaaaaaaaatagaagcacaaattaagcaattacctattggcattgtcagtgaacgagat
ttagtacaatttcaagccctaaaccttgactttaacaactataaggcaaaagatgtcatg
agttctccccctattaccgtgggattggatgaatccttgctgacagttcaacacttgatg
gaaaaacatttaattcgtcgattattagtcatcggagaacaacaagaaataaggggtatc
gttacccagacgaatatcttaaaagctcttaatcctatcgaaatatatggcatggctacc
atgctagaaaaaagagtcaaacaattagagcaagaaaaatatgctcttttacaaaatcgc
aatcgagaattagaaaaaactgttacacaaagaacaaaagaattacaaaatagaatcaaa
cgtgaacaattaatcgccgacattagcgatcatatcagagaatctttgcaacttgacaac
attctaaatacctgtgtagaagaactaagaaccttttcaaagtgtgatcgagtcttagta
tatcagtttaaccaagattggagtggtgttatcgttgccgaatccgttggtaaaggttta
ctccaatccattggaaatatagtacaagactcttgctttcaagaatccctagcgcataat
agaatattcactacaactgaagtcattgctattaataatatttataatcatggttatccc
gactgttatatacaattagttgaaaaatatcacataaaagcgaatctaatcgtaccaatt
cgcatacaaggaaaactatggggattattaattggtcatcaatgccaagactttcgacaa
tggcaagaagaagatactagcctctttaaagaaattgctagtgctctagccatcgccatt
aaacaatctattaattatcacaacctagagaatgaattaaaagaaagaaaaaaagcagaa
gaattactaaaagaaagtgaaaatcgctttcgtcaattggctgaaaatatagatcaagtt
ttttatttaatagatcgagaagaagagcaaatgctctatgtcagtcctaattatgaattg
atttggggtaaatcttgtcagagtttgtatgatgaccctcaatcatacctgaatataata
catccagaagatcgacatttattgattcaagccaaagaacttcgagaacaaggcttccaa
accacatcagaatttcgtatcattcggcccgatggagaaattcgctggattttaaatcgt
acctttcctatcaaaaattcaattaataacatccatgagcgaacttgtggcattgccgaa
gatattactgaaggcaaactaaatgagatcgaactaacgaaatctcaacaacaaatagaa
actactagctttcgcctcaaagaagctcaacgaatagctaaattaggtcattgggaatat
aatcacctgcaaaataccctgtactggtcaaaacaatgctactccatttttggtatttcc
tcttcagaatttactcccagctacgaaggatttctacaattaatacaccatgaagatcgc
accttagttaatcactactataacgatcatttagaaaatcaaaccgattataatatttgc
caccgcataattcgtactgatggtcaaattaaatacgtacaagagcaatgcgaaacagaa
tacgatgaagatggtacacccttaatttctaggggtacagtacaagatattaccaaactc
aaagaagcagaactaaaactagctcaattaaaccaagaactagaaacaaaagtagccgag
cgtactcaagaactatggaatatcaaccacctccaagcaatgattcttgacggcaccgat
tacgccattatttccatcgattgtaatggatacataaaaaccttcaatcaaggtgcagag
aatatgttgggttataaagctgatgaagttattaatcaagtttcccccttacaatttgtg
gatcaacaagaagccgaaaatcatataacaaaaatatcccaggaattaggacaagaaact
cccttcgatattaacgctttcaccatcaaatcaagactagatatggttaatgaatttacc
attacccacatccacaaagacggtacccgttttcctgttcagatgagaattaatccttta
aaaaatgaacaaggggaaatcgtcggttttctaggcatcggtaaagacattaccaaagaa
gaacaagccagaagcgatcgcaaacgtcacgaaatcgaaagacaacaattattacaagaa
ctatccgcctttaaactaggcttagatgaatctgccatcgttgccattaccgacagcgaa
ggaataatctcttacgttaacggtaaatttgtcaacgtgtcaggctatagtgaaaatgaa
ttgataggtaaaacccacaaaatagttaactcaggttatcatccccgtagcttcttcaag
aatctgtgggacacccttaaaaaaggggaaatttggcgtggagaaatttgtaatcgtagt
aaattaggctcgttatattgggtcgaaagtaccatcgtacctttcctagaccgagaaggt
aatccctttcaatatctagccattcgctttgatattacagctcgaaaacttggagaaatt
agaattcggaaggaaaataccttcaggcaacagattctcgaacaaatgggcgacggacta
tctatttcttacgcagtcagtgaacatccttttatccgctttactgtgtggaatcctaaa
atggaaatcattacaggttatacccttgaagaaataaataaccatggttggtatcgcatt
ctatgtccacattctgaaaatcaaaccgaagccatccagagaatcaaaaccatggggcaa
ggaagtaaccttataggtatggttgaagagtgggaaatcataaccaaaactggtgataag
cgtaccattaccatttccacttctgttcttgcccaagaagataatcataattttgttcta
gcggttatccaagatattactgataggaaagcaaaagaaaaagaaaatatccttttaaaa
gagcagttagaatttgtcttatcctctagtcccgccattatatataattgtgaagttaat
ccccctaattatcaccccaaatttctgagtcccaatgttcaaagtatcctaaaacatgat
catcagaaatttctatcgggttcattagcctggcatgaatttattcacccagatgacgta
tcaatggtattcccagaaatggaaaaacaactattcaccaatgatcattatcgttgtgaa
tatcgctttttgacaggagataacgaatatgtctggttacaagatgaaatgatattattg
cgtgatgaatatggtaatcctctagaaattgtaggttatacaagtaacatcaatgaacgt
aaacaagcccaaatagaattaaaaaacaaaacagaagaactagatcaatttttttccctc
gccattgacttactctgtattgccaatacagatggttattttattcgacttaataaggaa
tgggaaaaacttctcggttatcctcttaaacaattagaaggctcattatttttggactac
attcatcctgatgatttatctcttacccttgaagccatcaaagaaatacaacaggggtta
gagattgcctcttttactaatcgttatcgttgtgccgatggtagctatcgttggttggag
tggcgctgcgcacctaaacaaaattatatatacgccgccgccagagacattaccgacagg
aaaaaaaatgaggaagacattaacagacatttagccgccatcgaagcagccatgaatggt
attgccattttacagggggataattttctttatgccaataaagcccaccatgaaatgttt
ggttatcagcaaggcgaattaattggcaaaaattggcgtattctctatcatcctaaaaaa
ataaaactgatcgaacaagacattttccctgtattaatgacagatggtgcatggtatgga
gaaatagaagccaaaaagaaagatggttctatttttgatgagggtttatctttgacagtc
actgacaataatttattaatctgtatctgtcaagatgttaccctgagaaaacaatacgaa
gccgagaaattaaccttaattgatactatccaaagaaataatcagttgctctctattata
agtaaagctgagtctaaatttatcaccgcagaaaatcgtttaactatttttgaacaatta
ttatcagatttactggagttaaccaatagtgagtatggttttatcggtgaggttttattt
cgagaggacggtagtgccttcatggaagaaaacttcatcaaaattaagggtgtcccctat
ttacaaacccacagcattactaatattgcttggaatgaagaaactcaaaagttctatgac
gaaaattatcaagcaggtatgcaatttacaaatatgaacactttatttggggcggtaatt
atgacaggaaaacctgtgattgccaatagtcctagtacagatcctcgccggggcggcatt
cctagtgaacatccgccgttgaatgcgtttttgggtttacccttttttagtgataataaa
ttaattggtattgtgggtattgctaatgctcctggcggttatgataattctgtagtggaa
tatctacaaccatttttaatgacctgtagtattttaattgaaggttatcgtctcgatgca
ggacaaaaattagctgaaaaagaattgtttaagagtaaccaacagttaatgaaggctaat
cgcctcaaagatgaatttttggcaaatatgagccatgaattgcgaactcctcttaacgcc
attctgggtatgacagaaggtttatcagaacaaatatttggtgaaattaacaacaaacaa
ttaaaagccttagaaaccattgagcgtagtggaacacatttactcgaattaattaatgat
attcttgatttagccaaaatagaagcaggacaactggagttacagttaagcaatgtttct
ttggatagtttgtctgaatctagtttaacctttataaaacaattagcatttaaaaagaga
ataaaactaaacactgaaatacctactaatgtaccctgcttgatgattgatgaaagaaaa
atccgacaggtgttaattaatttgctcaataatgctgttaaatttaccccagagggaggt
aatatttctataaaaattagtaatgctactcctggtgaaatacctaattttgtcaccaaa
gtttttaaaaactcagaaaacactagcttaaataatgtttatatttccgtagttgatacg
ggcatcggtatcccacccaacaagtttaattctttatttgagccttttgtacaagtcgat
agcgctcttaatcgccaatattcagggactggtttaggtttatctttggttaaaagaatt
gtagaattacacggcggttttgtaatccttagtagtcgggtaggatttggaagtagtttt
actattgccttgccttataattcctctgcctgtgaaattagtcagtcatggaataatgac
aatccacaaataatctcatccaatagcatccaacctagctcaaacgctttaattttattg
gctgaagataatgaggctaatatcagcactatttctagttatttaaaagccaagggttat
cgtgtgattatcgccaaaaatggtgaggaggcggtatcttttagccaaacagaaaaacca
gatttaattttaatggatattcaaatgcctaaaatgagcggttttgatgctatcgtacaa
atacgccaaaattctgaaaccactaatattcccattattgctttaactgcacttgctatg
aaggatgaccagaataaatgtttggaaataggggttaatgattattttagtaagccttta
aaacttagagcattaacaaataaaattcaagagttgttgtcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system