Ceratosolen solmsi marchali (fig wasp): 105360846
Help
Entry
105360846 CDS
T06056
Name
(RefSeq) protein RRP5 homolog
KO
K14792
rRNA biogenesis protein RRP5
Organism
csol
Ceratosolen solmsi marchali (fig wasp)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csol00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
csol03009
]
105360846
Ribosome biogenesis [BR:
csol03009
]
Eukaryotic type
90S particles
Other 90S particles
105360846
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_Syf1_CNRKL1_C
S1
HAT_Syf1_CNRKL1_N
HAT_PRP39_C
HAT_PRP39_N
Suf
TPR_14
TPR_19
HAT_Syf1_M
S1CSD-TOTE-1
NRDE-2
TPR_15
ARM_TT21_5th
TPR_CcmH_CycH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105360846
NCBI-ProteinID:
XP_011496148
UniProt:
A0AAJ6YDN5
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1390 aa
AA seq
DB search
MVLKHFPREGKSRNIKSSQTSLSKLTKCKLKKYKYKDKIKEKLSIQGESITLNLAQNLKY
STLNKEMIILGRIFKVLDIYIIVSLPGQIKGKIQVVDISESYTNLLKNITNNKKVINELI
PLTNLYKKGDYVICYVKDIDSKKIYLSLQPYLINQNLNPKMLTKGSKIILSVKSIEDHGY
ILETGLKNLRAFLCIEDVECKVNFYPGKQIVCIIKDVEVEENIFTIKVSVKSKHLDNVET
NVSCLDHLIPGTQYSLKIKKITKNGLQIYYSGKYIGYINQFYLQHSLLSFKEEQEIVGRL
LYIIPLIKIAYFSLLSLEQETKLLKIGDIINKAKVVSYDSKGIFVKIKGLRGYIPLQHNK
PYFKKIESIFSINSVHKCKVITYDLIAKLYICTIEKKLIEYINHSDLELGNRTEVIITSI
NEKKKYINVVTGKIFGIVPFDQISDSGLINELNVGQRFTARVLKLSKNIIFTLKKSLVES
KLPILCKIEDAKINSVYDGSIIKIINEGIIVSFFGNVKGWIPKHFLNHQTTLQKQSQNWN
FVIGQTIKTVVKSINIHENKIILALSNSKIKNYKYKIGDTIEGIVIDSSIAGIHVRIINK
NRESIIAFLPTGHMSPCYEIGKMLATKIVTGDILSATIFSTYPKLILSSTFAPEIAYKMS
TLNPGDSILCSVSKIFKESIKVLLPIAKFYKYVTVPINEVGNFEYLYENQIVFGKILRLD
KETQSINLTIKLNKIWENVTECENKMTAINVLSCYLNKILELSKNIFYASKSISKIYIGE
RVNGTVENIMDYGLTLKLKKNIKGIVSTGNFFGNYKQGDQIEGLVLWINYPQEYVEITMI
HNDVNSIQVKQNNLSKIPIGTELRGKIVLVTNWFILAILKGQAKGTLVTLPVRRHLNDTI
PDINLYQIGIKIRCFTILNKKEADLLLPICMLKSAFKTHKIEQQKPFHSSLKLKRKMETT
DENKNTTVVEKLYKMNYNDNIKREINQMTNKGVINKDIEIIKLKSQKRNENIQNDSDKNS
NKPKKKDKQCTYNINCITKETPKVFTNFSLNLNIAKCRFKWNSLLNERVDIETSSDDEVN
DSTKKLKKKKLSTSEKNALERQKEKEIREREEVLASTLLPQTVDQFDKLVLSNPNSSLIW
IQYIAHYLQTTEIEKARAIAKRALKVINFREENEKLNIWQALLNLESRFGSSESLTEVFQ
EAIKANDVKKIYEHMLTIYTITGKQSELENIIKTMINKFKQHPETWISCGAIFLKIGMKN
KSRDIMQRALQSLPKNKHVNLMIQFAQLENKLGDKERTQTLFEQILSSYSKRTNVWLSYV
DSLVKSGEIEIARKILDRAISQDLSTKKMKILFEKYINFEEKYGTKENILRIQALAVKYV
EEQCKKVDYI
NT seq
4173 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtattaaaacattttcctagagaaggtaaatcacgtaatattaaatcttcacaaacg
tcactttctaaattaacaaaatgtaaactcaaaaaatataaatataaagataaaattaaa
gaaaaattatcaatacaaggtgaatcaataactttgaatctagctcaaaatttaaaatat
tcaactttaaataaagaaatgattattttgggtagaattttcaaagttctagatatttat
ataattgtgtcattacctggacaaataaaagggaaaatacaagtagtagatattagtgaa
agttatactaatttattaaaaaatataacaaataataaaaaagtaataaatgaattaata
ccattaacaaatttatataagaaaggagactatgtgatttgttatgtaaaagatattgac
tctaaaaaaatatatttatctttacaaccatatttaattaatcagaatttaaatccaaaa
atgttaacaaaaggttcaaaaattattctgagtgtaaaaagtattgaagaccatggatat
attttggaaactggattaaaaaatttaagagcatttttatgtatagaagatgtagaatgt
aaagttaatttttatcccggtaaacaaattgtatgtattataaaagatgttgaagtggaa
gagaatatttttaccatcaaagtttcagttaaatcaaaacatttagataatgtagaaaca
aatgtttcatgtttagatcatttaattcctggaacacaatattctcttaaaataaaaaaa
ataacaaaaaatggcttacaaatatattatagtggaaaatatattggttacattaatcaa
ttttatttacaacattctctattatcatttaaagaagagcaagagatagttggtagactt
ctttacattataccattaataaaaatagcttattttagtcttttatctttagaacaagaa
acaaagttattaaaaattggagacataattaacaaggcaaaagtagtatcttatgactca
aaaggaatttttgtgaaaattaaaggtttgcgaggatatatccctttacaacataataaa
ccatattttaaaaaaattgaatctatatttagtataaattctgttcataaatgtaaagta
attacttatgatttaattgcaaaattatatatatgcacaatagaaaaaaaattaatcgaa
tatatcaatcatagtgatttagaactaggcaataggacagaagtaattatcacttctatt
aatgaaaagaaaaaatatattaatgttgtaactggtaaaatttttggaattgttcccttt
gatcaaatttcagattcaggtttaataaatgaattaaatgttggacaacgttttactgcg
agagttttaaaattatcaaaaaatattatttttactttaaaaaaatcgcttgtagaaagc
aaattaccaattttatgtaaaatagaagatgctaaaattaattcagtttatgatggttcc
attattaaaattataaatgaaggaataattgttagtttttttggtaatgtaaaaggttgg
ataccaaaacattttcttaatcatcaaacaacattacaaaaacaatcacaaaattggaat
tttgttattgggcaaactattaaaacagtagttaaaagtataaatattcatgaaaataaa
ataatattagcactttcaaatagcaaaattaagaattacaaatataaaattggtgataca
attgaaggtattgtgatagattcttcaattgctggaatacatgttagaattataaataaa
aatagagaaagtataatagcatttcttcctacgggtcatatgtcaccttgttatgaaatt
ggtaaaatgcttgcaacaaaaatagtaactggagatatattatctgctactatattttct
acataccctaaattaattttaagttcaacatttgctcctgaaatagcttataaaatgagt
actttaaatcctggggatagtatattatgttctgtatcaaagatatttaaagaatcgata
aaagttttattaccaattgcaaaattttataaatatgttacagttcctataaacgaagta
ggaaactttgagtatttatacgaaaaccaaatcgtatttggtaaaattttaagacttgac
aaagaaacacaaagcatcaatttaactattaaattaaataaaatatgggaaaatgtaaca
gaatgtgaaaataaaatgacagctatcaatgttttaagctgttatttaaataaaatattg
gaattgtcaaaaaatattttttacgctagtaaatcaatttcaaaaatttatataggtgaa
cgagttaatggaactgtagaaaacataatggattatggacttacacttaaattaaaaaaa
aatataaaaggtattgttagcactggtaatttttttgggaattacaagcaaggagatcaa
atagaaggtttagttttatggatcaattatcctcaagaatatgtggaaataacaatgatt
cataatgatgtaaatagcatacaggttaaacaaaataatttatccaagataccaataggt
actgaattaagaggaaaaatagtgttggttacaaattggtttatattagctattctcaaa
ggtcaagcaaaaggaactttagttactttacctgttagaagacatttaaatgacactatt
ccagatattaacctttatcaaattggaattaagataagatgtttcactattttaaataaa
aaagaagctgatttattattgcctatatgtatgcttaagtcagcatttaaaacccataaa
attgaacaacaaaaaccatttcattcttcacttaaactaaaacgtaaaatggaaactaca
gatgaaaataaaaatacaactgtggtagaaaaattatacaaaatgaattataatgataat
attaaaagagaaattaatcaaatgacaaataaaggagtaataaataaagatattgaaata
attaaattaaaaagtcaaaaaagaaatgaaaatatacaaaacgatagtgacaaaaattca
aataaaccaaaaaaaaaagataaacaatgtacctacaatattaattgtataacaaaggag
actccaaaagttttcacaaatttttcacttaacttaaatattgcgaagtgtagatttaaa
tggaatagcttattaaatgaacgagtggatatagaaacttcaagtgatgatgaagttaat
gattctacaaagaaattaaaaaaaaaaaaattgtcaacatcagagaaaaatgcacttgaa
cgacaaaaagaaaaagaaattcgtgaacgtgaggaagttttggcaagtactttgttacct
caaacagtagatcaatttgataaattagttttatctaatccaaatagttcattaatttgg
atacagtatatagcacattatttgcaaacaactgaaattgagaaagcaagagctatagca
aaacgtgctttaaaagttataaattttcgggaagaaaatgagaaattgaacatttggcaa
gctttattgaatttagaatcaagatttggatcttcagaatcactaactgaagtttttcaa
gaagctataaaagcaaatgatgttaaaaaaatttatgaacatatgcttactatttataca
attactggtaaacaatctgaacttgaaaatattattaaaactatgattaataaattcaaa
cagcatccagaaacatggataagctgtggagctattttcttaaaaataggaatgaagaat
aaatcaagagatattatgcaaagagctttgcaatcattgccaaaaaataagcatgtaaat
ctcatgattcagtttgcccaattagagaataaattaggtgacaaggaacgaactcaaaca
ttatttgaacaaattttgtcatcttattcgaaaagaacaaatgtttggctttcctacgta
gactcattagttaagtcaggtgaaatagaaattgcaagaaaaatattagatcgtgcaatt
tcacaagatctttctacaaaaaaaatgaaaattcttttcgagaaatatataaactttgaa
gaaaaatatggaactaaagagaacattcttcgtatacaggcacttgctgtaaaatatgtt
gaagagcagtgtaaaaaagttgattatatttaa
DBGET
integrated database retrieval system