Cetobacterium somerae: MKD34_10385
Help
Entry
MKD34_10385 CDS
T08261
Name
(GenBank) ABC transporter substrate-binding protein
KO
K02035
peptide/nickel transport system substrate-binding protein
Organism
csom
Cetobacterium somerae
Pathway
csom02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csom00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
MKD34_10385
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
csom02000
]
MKD34_10385
Transporters [BR:
csom02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Peptide and nickel transporters
Peptides/nickel transporter
MKD34_10385
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPO98678
LinkDB
All DBs
Position
unnamed1:300033..301553
Genome browser
AA seq
506 aa
AA seq
DB search
MKKKIMAALIAISLLSLSGCKEEKVEDKTKIIIPIKVGFNSIAPDTDVSAATKEVIRNMN
TGLIKFDPDSKTLVPALAKSYEIKNNGRTYIFKLRDDIFFHNNKKITPEDVKYSFERVSG
INTGKVIVGEWNKKLESINVLDENTIEINIKDSEHSSSDIYNITDVSIIPKGISENELEK
NPIGAGPYKFVEYIPGQKIVLEAFENYYLGVPEIEEVEFKIYKEGASRLLSFKNGEIDFL
PLNLESLKEVTKDKNIEVISSLGNDVNILYLNNSFKAFQNKKVRQAIWEAIDMDRIIENL
ALPKAEKLYTHMSPYLKEFYKNGLEKNYPYNPEKAKELLKEAGYSNLSFTLTTISENTFE
NDLALFIKEDLAKIGVNVSINPIPWGQYLPEVYKAHRYEAALLRVAGYPDPQRILQRYET
NYSSNMGNYSNQKVDLLLKEATETYDTSRRIDIYKEIQTLLNEDIASIYLMDQGVAIALS
SKYTGYKTYPFAFIDVSTIKLKKNSK
NT seq
1521 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagaaaattatggctgctttaatagcaatatcactactttctttaagtggatgt
aaggaggaaaaagttgaagacaaaacaaaaataataattcctattaaagtaggttttaac
tctatcgctcctgatactgatgtttctgcagctactaaagaggttattagaaatatgaac
acaggattaattaaatttgatcccgactctaaaactcttgttcctgctttagctaaatct
tatgaaataaaaaataatggaagaacttatatttttaaactaagagatgatattttcttc
cataataataaaaaaattactcctgaagatgttaaatactcttttgaaagagtttctgga
attaatacaggtaaagttattgttggtgaatggaataaaaaattagaaagtatcaatgtt
ttagatgagaatactatcgaaataaatataaaagatagtgaacatagtagttctgatata
tataacattaccgatgtttctattattccaaaaggaatatctgaaaatgaacttgagaaa
aatcctattggtgcagggccttataaatttgttgaatatattcctgggcaaaaaattgta
ttagaagcctttgaaaactattatttaggtgtgcctgaaatagaagaagtagaattcaaa
atttataaagaaggggcaagtagacttctttcgtttaaaaacggtgaaattgactttctt
cctttaaatttagaatctttaaaagaagtaacaaaagataaaaatatagaggtcatatct
tctttaggaaatgatgttaacattttatatttaaataactcttttaaagcttttcaaaat
aaaaaagttagacaagctatttgggaagctattgacatggatcgaattattgaaaattta
gctttacctaaagcagaaaaattatatacacatatgtctccttatttaaaggaattttat
aagaatggtttagaaaaaaattacccttataatcctgaaaaagctaaagaacttttaaaa
gaagctggttattccaatttaagttttactttaacaactatttcagaaaatacttttgaa
aatgaccttgctctttttattaaagaggatttagccaaaattggtgttaatgtaagtatt
aacccaattccatggggacaatatcttccagaagtttataaagctcatagatatgaagct
gcacttttaagagttgctggatatcctgaccctcaaagaattcttcaaagatacgaaaca
aattactcttcaaacatggggaattattcaaatcaaaaagttgatcttcttttaaaagag
gctactgaaacttatgatactagtagacgaattgatatttataaagaaattcaaacctta
ttaaatgaggatattgcatctatttatttaatggatcaaggagtagctatagctctttca
tctaaatatactggatataaaacatatccttttgcttttatcgatgtttcaactataaaa
ttaaaaaagaatagtaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
