Cetobacterium somerae: MKD34_12120
Help
Entry
MKD34_12120 CDS
T08261
Name
(GenBank) glycosyl hydrolase family 18 protein
KO
K01183
chitinase [EC:
3.2.1.14
]
Organism
csom
Cetobacterium somerae
Pathway
csom00520
Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
csom01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csom00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00520 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
MKD34_12120
Enzymes [BR:
csom01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.14 chitinase
MKD34_12120
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_18
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPO98373
LinkDB
All DBs
Position
unnamed1:656081..658786
Genome browser
AA seq
901 aa
AA seq
DB search
MKRTNNDLFPVVDKEQEFQKIYNNTIEKVNFINSKYSTIHNGVACEELDPMIEKMNNFVL
NLSRVTKLEEYLSFKLLVQNILKLLGECDHEGTLPPIPELEPTVLSAILKNINKNLTGEL
TLGENAHLITSVEYELYKNNTRVEKITTNSGSQIANFASNTPGTYQFIAKYYWADKFKQI
TSNTVIVEEDVVIPPPVEGDFPATLPYSNLWAHTVNTNGNYEITLNNTWGVIDSKLAVYL
DGELTEVLATNFTAGNKGSAKNTVSASKYPSNKDLKFVYRVTYVRDEKTNDKVVVYYKST
TGTIEVATPDGGVKYCKYPEWSPEIEYGSPTNKIVFYQGFHFKHTGWATTGESPKLNGDW
SPWTKLSVAEESSIACPGNHLMDSAGTKPNAHLEPMNISEVEGLGSPMEKMHITYTPEWG
KWGGRKYTPKITPWNKISHMQYAFVDVIPDYTGKFFTDKDDISHLAQSARDAVNGAGNLN
VSPNIFDPGAAFSAYGGTNAFMTEYNEMCKKYPYVKPIASLGGWSRSAFFRDAAQSNKID
YFVKRCIDFIREFNFAGIDIDWEFPCSRRDADLVDNKNDLGTPRAADDEEVLFTNLMKAL
RGALDKAGQEDGKYYFLSCAIVSGKTHIKKSGIGVWHPTCDFISYMTYDVHGAFDPISNH
QSYLFQNTSEPLVETNPQDNAMSIKDLIDYVTTTYGVPANKLTVGAPFYSRGWSGIFMPS
SGWPTNMPGLYVRTTIDPAASETKGCSAPGTMDGGRGAGVLPLHHLNKLIKGENVSVRTL
DMNGPANPHAGTILKGSDFQYYYDEAAQAPYLYNQTAGIFYTFEDERSVETKCQWIVDNN
LAGLISWDIAMDDYGIDMHSSEATSAYPTLYQAEHLLTSVIFDKFKANSLRLNYLNKIAR
R
NT seq
2706 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaacaaataatgacttatttcctgttgtagataaagaacaagagttccaaaag
atatataacaacacaatagaaaaagttaattttataaatagcaagtattcaactattcat
aatggagtagcttgtgaagagctagatccaatgattgaaaaaatgaataacttcgtatta
aatcttagtagagtaacaaaattagaagagtacctttcttttaagttgttagtacaaaat
attttaaaacttcttggagagtgtgatcacgaaggaacattaccacctattccagagcta
gaacctacagttttaagtgctattttaaaaaatataaataaaaatttaacaggagaatta
actttaggtgaaaatgcacatctaataacttctgttgagtatgagttatataaaaataat
acaagagtagagaaaattacaactaattcaggatctcaaattgcaaactttgcatcaaat
acacctggaacatatcaatttatagcaaaatattattgggctgataaatttaaacagatt
acatcaaatacagttatagttgaagaggatgtagtaatacctccaccagttgaaggagat
ttcccagcaacattaccatattcaaatttgtgggcacatacagttaatacaaatggaaat
tacgagataacacttaataatacttggggagttattgatagtaaattggctgtttactta
gatggagagttaacagaagtattagcgacaaactttacagcaggaaacaaaggttcggct
aaaaatacagtgtcagcttctaaatatccttcaaacaaagatttaaaatttgtttacaga
gttacatatgtaagagatgaaaaaacaaatgataaagttgtagtttattataagagtaca
acaggtacaattgaagtagctactccagatggaggagtaaaatattgtaaatatccagag
tggagtccagaaatcgagtacggatcacctacaaataaaatagtgttttatcaaggattc
cattttaagcatacagggtgggcaacaacaggagaatcaccaaaattaaatggagactgg
tcaccatggacaaagttgtcagtggcagaagagagttcaattgcttgtcctggaaatcac
ttaatggattcagcaggaacaaaaccaaatgctcatttagagccaatgaatatctcagaa
gttgaaggtttaggatctccaatggaaaagatgcatataacttatactccagagtggggg
aaatggggaggaagaaagtatactccaaaaataactccatggaataaaatatctcatatg
caatatgcattcgtagatgtaattcctgattatacaggaaagttctttacagacaaagat
gatatatctcatttagctcaatcagcaagagatgcggttaatggtgcaggaaacttaaat
gtttctccaaatatatttgatccaggtgcagcattctcagcttacggtggaacaaatgca
tttatgacagagtataacgaaatgtgtaaaaaatatccatatgtaaaaccaattgcatca
ctaggtggatggtcaagatcagcattctttagagatgcagctcaatcaaataaaatagat
tacttcgttaagagatgtattgattttataagagagtttaactttgctggaatagatatt
gactgggaattcccttgttcaagaagagatgcagacttagttgataataaaaatgactta
ggaacaccaagagcagctgacgatgaggaagtactattcactaacttaatgaaagcatta
agaggagctttagataaagcaggacaagaggatggaaaatactatttcttatcatgtgct
atagtatcaggaaaaactcatattaaaaagagtggaattggagtgtggcatccaacttgt
gactttattagttacatgacttacgatgtacatggagcatttgatccaatatcaaatcac
caatcatatttattccaaaatacaagtgagccattagtagagacaaatccacaagataac
gcaatgtcgattaaggatttaattgattatgtaacaacaacttatggagtaccagcaaat
aaattaacagttggagcaccgttttactcaagaggatggtcaggaatatttatgccaagt
tcaggttggcctacaaatatgccaggattatatgtaagaacaactattgatccagctgca
agtgaaacaaaaggatgttcagctccaggaacaatggacggaggaagaggagcaggagtt
ttacctctacatcatttaaataaattaattaaaggggaaaatgtatcagtaagaacttta
gatatgaatggtccagctaacccacacgcaggaactattttaaagggatcagatttccaa
tactattatgatgaggccgctcaagcaccttatttatataatcaaactgcaggaattttc
tatacatttgaagacgaaagatcagttgaaacaaagtgtcaatggattgtagataataac
ttagcaggattaatttcatgggatattgcaatggatgattatggtattgatatgcatagt
tcagaagcaacatcagcttatccaacattataccaagcagagcacttattaacatcagta
atatttgataagttcaaagcaaactcattaagattaaactatttaaataaaatagctaga
agataa
DBGET
integrated database retrieval system
