Cytobacillus spongiae: LS684_19045
Help
Entry
LS684_19045 CDS
T09119
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
cspg
Cytobacillus spongiae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
DUF3670
Helicase_C
ResIII
DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII55697
LinkDB
All DBs
Position
3801225..3804044
Genome browser
AA seq
939 aa
AA seq
DB search
MLKTRYLKIKIEQLSYGRYFLTAFNDQARPVEISRWQTLLLNRHEESYFGTLVDKAFHEG
NEGIVLNGWQLVTLFANEGFNRLIDWDWDETAEVCLSSAHAVYDAILEQDWHPDFSSMQD
DTFRWSLPENVLEEFDDSFWERPLLNSTVQSFVRQLFNDALDEYLVHDSATRKLFGERLE
ALRKLELPPQQLMNFFDEEKWLEWMGLKEDDTPFTIGLRLQEPEEVFEEWELDVFLRGKQ
NPDFFVEAKDLTSYPNEWLPFTSKVEKELDRWVRLFPWMNGKNGLSDRLTEDEAWTFLTE
TSETLLALGVEILLPSWWLAMKNANLKVKARVKGANSGYRPSFVGLQAMLDYNWRFSMNG
VDLSEDEFNKLVEEKRKLVYIKGRWIKLDPGFVRQIQDLMKKAEKEGLHVRDLIEQELVR
SDEDDDDSLENPKAFAKIQIELNRQWKQMVKQLRDVKDLPLEDVPESFQGELRPYQQLGM
SWLLFLRSYRFGACLADDMGLGKTIQLISYLLTVKEREEAGPALIICPTSVLGNWQKEIE
RFAPSLEVYVHYGTNRLKETAFTDRVAQADIVLTSYGLTHIDHEDFAPITWSTIAIDEAQ
NIKNAGTKQSRAVRKLTGMHHIALTGTPMENRLTELWSIFDFTNHGYLGSLGQYQKRFVL
PIEKEEETEKIKQLQALIRPFLLRRTKKDEEVALNLPDKLEQKEYCPLTAEQASLYEQLV
QDTFASIEQLTGMERKGLILQMLSRLKQLCNHPALYLKEQKPVHVVDRSTKLEKLVELVD
AVLDQNESCLIFTQYIEMGHIMKRLIEKRFDTEVPFLNGSVPKQKRDDMIARFQNREFPV
FLLSLKAGGTGLNLTAANHVIHYDRWWNPAVENQATDRAYRIGQDRFVHVHKLICTGTLE
EKIDQMLEKKQSLNDQIITSENWITELSTDELRSLVHLT
NT seq
2820 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgaaaactcggtatcttaagattaaaatcgaacaactatcatatggccgctatttt
ctaactgcatttaatgaccaagctcgccctgtcgagatttcccgctggcaaacgttgctt
cttaatcggcatgaggagagctattttgggacgttagtagacaaggcttttcatgaaggg
aatgaagggatcgttctgaacgggtggcagcttgtcacgctctttgcaaatgagggattt
aatcggctcattgattgggactgggatgagactgcagaggtttgtctttcctccgcacat
gccgtgtatgatgctatccttgagcaggactggcaccctgacttttcctccatgcaggat
gacacctttcgctggtctcttcctgaaaatgtgctagaagaatttgatgactctttttgg
gagagaccgcttttgaacagtaccgttcaaagctttgttcgtcaactatttaatgatgcg
cttgatgagtatttagtacacgattctgcaacacgcaagctatttggagaaagactcgaa
gctttgcgaaagctagagcttccccctcagcagctaatgaatttttttgatgaggaaaaa
tggcttgagtggatgggcttgaaagaggatgacaccccttttacgattggtctacgatta
caggagcctgaagaagtgtttgaagagtgggagcttgatgtgtttttacgcggaaagcag
aatcccgatttctttgtggaagctaaggatctaacgagctatccgaatgagtggcttcct
tttacgagcaaggttgaaaaagaattagatcgctgggtgcgattatttccgtggatgaat
gggaaaaatggcttgtctgaccgactgacagaggatgaagcatggacgtttctaacagaa
acaagtgagactttgcttgctcttggagtagaaattctcctcccttcgtggtggctagcg
atgaaaaatgccaaccttaaggtgaaagccagagtaaaaggggcaaattcaggatatcgt
ccttcctttgttggactgcaggccatgctcgattataattggcgattctctatgaatggt
gtggacttgtcagaagatgaattcaacaagctcgtcgaggagaaacgaaagcttgtctac
atcaaagggcgttggattaagctagacccaggttttgtacggcaaattcaggatctaatg
aagaaggcggaaaaagaaggacttcacgttcgagatcttattgagcaggagctcgttcga
tcagatgaggacgacgatgattcacttgagaacccgaaagcatttgcaaagattcaaatt
gaactaaaccgccaatggaaacagatggttaagcagctgcgggatgtgaaagaccttcca
cttgaagacgtaccagagagctttcaaggagaactccgcccctatcagcaattgggaatg
agctggctattatttctacgaagctaccgattcggtgcctgcttagcagatgatatgggt
cttgggaaaaccattcagcttatttcatatttattaactgtaaaggaacgagaagaggca
ggccccgctctgattatctgtccaacttctgttcttggaaactggcagaaggaaatcgag
cggtttgctccgagcttagaggtctacgttcattatggtacaaaccgcttaaaggagacg
gcctttacagaccgagtagcacaagcggatattgtgttaacctcctatggcttaacacat
attgaccacgaggattttgcgccgattacatggagtacgatcgcgattgatgaggcccag
aacattaaaaatgcaggtacgaagcaatcccgagccgttcgcaagttaactggtatgcac
catatcgcgttaaccggaactccgatggaaaatcgcttaactgaattgtggtcgattttt
gattttacgaatcatgggtatttaggaagcttaggtcagtatcagaagcgctttgttctt
cctattgaaaaagaggaagaaacagaaaagattaagcagcttcaagcactgattcgaccg
tttctattaaggagaacgaagaaggatgaagaagtcgctttaaaccttccagataagctg
gagcaaaaggaatattgtccgcttaccgcagaacaggcatccttatatgaacagcttgtt
caagatacctttgctagcattgagcagttaaccggtatggaacgaaaagggctgatcctg
caaatgttaagccgtttaaagcagctttgtaatcatcctgctctctatcttaaggaacaa
aagcctgtccatgttgtcgatcgatcaaccaagcttgagaagctggtcgagctggtcgat
gcagttcttgatcaaaacgaaagctgcctcatctttacccaatatattgaaatgggccat
atcatgaagaggctgattgaaaaacgcttcgatacagaggttccattcttaaatggaagt
gtaccaaagcagaagcgcgatgacatgattgctcgctttcaaaatcgagaattccctgtt
ttccttctctccctgaaggcgggcggaacaggcttaaatttaactgcagccaatcatgtt
attcactatgaccgctggtggaacccagccgttgaaaaccaagcgaccgacagagcttat
cgaattgggcaggaccgctttgtccatgttcataagctaatctgtacgggaacgctagaa
gagaaaattgatcaaatgctagagaagaaacaatcgttaaacgatcaaatcattacaagt
gaaaactggataacagagctatcaacggatgagcttcgaagcctcgtccatttaacctga
DBGET
integrated database retrieval system
