Clostridium scatologenes: CSCA_3802
Help
Entry
CSCA_3802 CDS
T03803
Name
(GenBank) transcription antiterminator
Organism
csq
Clostridium scatologenes
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PTS_EIIA_2
PRD
Mga
HTH_11
PTS_IIB
HTH_DeoR
PuR_N
RT_RNaseH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKA70927
UniProt:
A0A0E3K2M3
LinkDB
All DBs
Position
complement(4104757..4107150)
Genome browser
AA seq
797 aa
AA seq
DB search
MDNLNGRQIEFTNLLLDSEQFKTIKYYSEVLNVSEKTIKKDLIAVEQYLNKFKVQLEKKH
SMGIMIKDVRKAKLLLHNNLQIQELKDKKISINERRIEIIKEMLIKSNSSTSIQKLSEKY
YVSKTSIINDFKYIEKWLSLFKLRLEKTVEGTQVKGLEVNIRRAISSLLFEYSNGTKNEN
TIEELAARLDVVTLNGLSELFEKDKIVYVNRLLLDLEKKYNCKIDEPYYTNLLTHILISM
ERGSKGKSILKKEKIGDFKSEKDYKEAVLCINKINNDFGMKLDESEVYYLYQYFVSFGLI
KEVMESQDKVLNKLDSISIEFRNMMTKCIEEILQINITNDQDIMYKLLLHIRPMLNRMEY
DIQISNPLINEIREQYPILLNVCKAAALMASYQLKQKVIPMDEIGYLAVYYQLGLENSYI
KKRILVVCHSGYGTSQLLRTKLNRYFPELEIVDNVSASIIKNRNVDDIDFVVTTVPLEFQ
SKPYILVSTFLNEYDIKNISDFLVSNKNKNEKKKITTKLIGKYLKEELVYFNMSESDMKK
EINENYKTCIDFNEINIDRNVKIQLGFHKSECILGLSINDIENNEKQLTFYIAVGDIELM
TNMFKEIINFDMKENYANYLRKCTKKKDVKQYFALNSKGGGEMDINLAKVIKKETIKLNM
EATTKDEALKELTELLYEAGVLSDKEAFLKDVYYRETLGSTGIGNKIAIPHGKSKFVNKT
SIAFGKAKADIEWESLDDKPVHFIILFAVTESDKDSVHVRLLSKVAGKLGDDEVCESLLN
ATTPEEVYEIFTREEEL
NT seq
2394 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataacttaaatggaaggcaaattgaatttacaaatttattattagatagtgaacaa
tttaaaacaattaaatattatagtgaagttttaaacgtatctgaaaagacaatcaaaaag
gatttgatagcagttgaacaatatttaaataagtttaaagttcaattggagaaaaagcac
agtatgggaataatgataaaagatgttagaaaagctaaattgcttttgcataataatctt
caaatacaggaattgaaggataagaagatttcaataaatgagagaagaattgaaattatt
aaggaaatgcttattaaatccaatagtagtacttctatacaaaaactttctgaaaaatat
tatgtaagtaaaactagtataataaatgattttaagtatatagaaaaatggctttcctta
tttaagttaagattagaaaaaactgtagaaggaactcaagtaaaaggattggaagttaat
atacgtagagctatttcttctttattgtttgaatattcaaacggtacaaagaatgaaaat
actattgaagaattggcagcacggttagacgtagttactttaaatgggttatcagagctt
tttgaaaaagataaaattgtatatgttaatagactattgcttgatttagaaaaaaaatat
aattgtaaaatagatgaaccatattacaccaatttattgactcatattctgatttcaatg
gaaagaggctcaaaaggaaaatctatattgaaaaaagaaaaaattggagattttaaatca
gaaaaagattataaagaagctgttttgtgtattaacaaaattaataatgattttggaatg
aaattagatgaatcagaagtttattatttgtatcagtattttgtatcatttggattgatt
aaggaagtaatggaaagtcaagataaagtattaaacaaattagattctatatctatagag
tttagaaatatgatgactaaatgtatagaagaaattttgcaaataaatattacaaatgat
caagatataatgtataaattattgcttcatataagaccaatgctaaatcgtatggaatat
gatatccaaatatcaaatcctcttattaatgaaataagagaacaatatcctattctttta
aacgtatgtaaagctgctgcgcttatggcatcctatcagctaaaacaaaaagtaatccct
atggatgaaattgggtatttagcagtatattatcagttgggactagagaattcttatata
aagaaaagaatcttagtagtttgtcacagtggttatggaacatcacaactattaaggaca
aagctcaacaggtacttcccagagcttgaaattgtagataatgtttcagctagtataatc
aagaacagaaatgttgatgatattgattttgtagttacaacagttccattggagtttcaa
agtaagccatatatattagtatcaacatttttaaatgagtatgatattaaaaatatatct
gattttctagttagtaacaaaaataaaaatgaaaagaaaaaaatcacaacaaaacttatt
ggaaagtatttaaaggaagaactagtatatttcaacatgtcagaaagtgatatgaaaaaa
gaaattaatgaaaattataaaacctgtattgactttaatgaaataaatattgatagaaat
gtaaaaatacaattagggtttcataaaagtgaatgtatacttggactttctataaatgat
atagagaacaatgaaaaacagttaactttttatattgctgtgggagacattgagttaatg
actaacatgtttaaggaaattataaattttgatatgaaagaaaactatgcaaactattta
agaaaatgtactaagaaaaaagacgtaaagcaatattttgcattaaatagcaaaggtggg
ggagaaatggatataaatttagctaaagtaataaagaaggaaacaataaagttaaatatg
gaagcaactacaaaagatgaagcattaaaagaacttacagaattgttatatgaggctgga
gttctctctgacaaagaagcatttttgaaagacgtatactatagagaaactttaggctca
acaggaattggaaataaaatagcaattcctcatggaaaatctaaattcgttaacaaaaca
tctatagcttttggaaaagcaaaagctgatattgaatgggaaagcttggatgacaagcca
gtacattttattattctatttgctgtgactgaatctgataaggatagtgttcatgttaga
ttgctttcaaaagtagcaggaaaattaggagatgatgaggtgtgcgaaagcttactaaat
gcaacaactccagaagaagtttatgaaatattcacaagagaagaagaactttaa
DBGET
integrated database retrieval system
