Clostridium saccharoperbutylacetonicum: Cspa_c17590
Help
Entry
Cspa_c17590 CDS
T02467
Symbol
licR2
Name
(GenBank) putative licABCH operon regulator
KO
K03491
probable licABCH operon transcriptional regulator
Organism
csr
Clostridium saccharoperbutylacetonicum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
csr03000
]
Cspa_c17590 (licR2)
Transcription factors [BR:
csr03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
BglG family
Cspa_c17590 (licR2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PRD
PTS_EIIA_2
HTH_11
Mga
HTH_Mga
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGF55529
UniProt:
M1MC76
LinkDB
All DBs
Position
complement(1942534..1944447)
Genome browser
AA seq
637 aa
AA seq
DB search
MVNSKSLKLLSYLQNQDDWTTALQLSLKLNVSLRSVKNYISEIKKVNNNLIISSRNGYKV
NKPEVQRFLKMSDSLIPQTPEERIDYIIIKLINNTEKIIDIYDLSQEIYISEATLKGDLN
KVKKKCYKFDLTLYIKGNNISLDGLEKNKRKIMNSILYEKLNENPLDINTIQAAFVDYDI
EEIESIIVNAFKKYHYFINGYSLMNLVLHITITIDRIKNNNIYDYTEASKELLIKNHEYG
IAQEIVKKLQDVFDINYNENEIYELTLLIISNATNVDYKDVNKINLEQFVGKECMNIVND
LIKEINTQYYIDFNEPEFLVRFALHIKNLLTRIKSRNFSKNPLTDSIKSNCPLIYDCAVT
ISYKIKNYTNCEINEDEIAYIALHIGANLVNQKNMHTKITCAILFPKHYDLDIKLAESIA
SAFGDSLLVKNIVTKEKELEDLQVDFVISTIKFVNFKSFPFIIVNTFLTEKDRKLIANKI
EEVKKNKQKSEFLENLHSIFNESLFFKDKYFENENQAIEFMCDEMQKKGYIKPDFKQEVF
EREAMSSTAFNGIAIPHSMHMNAIKTGMFTLVNKKPLNWGNQQVSIIFLLTINKSERKVF
NDMFDALTNILSDEINLDKLIRCNSFEEFINMLVECI
NT seq
1914 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaattcaaaatcattgaaattattaagttatttacaaaatcaagacgattggacc
acagctttacaattatcattaaaattgaatgtttctttgaggagtgtaaagaattatatt
tcagaaataaaaaaagtcaataataacttaattatttcatcaagaaatggatataaagta
aataagcctgaagttcaaaggtttttaaaaatgtcagattctttgattcctcaaacccct
gaagaacgaatcgattatattattataaagctaattaataatactgagaaaatcattgac
atatatgatcttagtcaagaaatttatatcagtgaagctacattaaaaggagatttaaat
aaggttaagaaaaaatgttataaatttgatttaactttatatattaaggggaataatatt
tctttagatggattagaaaagaataaacgaaaaattatgaactcaattttatatgaaaag
cttaatgaaaatccattagatattaatacaatacaagctgcctttgtggactatgacatt
gaagaaattgaatcaataattgtaaatgcatttaagaaatatcattattttattaatgga
tattctttaatgaatttagttttacatattactattactattgatagaattaaaaataat
aacatttatgattatacagaagcaagtaaagaattattaattaaaaaccatgaatatgga
atagcgcaagagatagtaaaaaagcttcaagatgtttttgatattaattataatgaaaat
gaaatttatgaattaaccttgctaattatcagtaatgcaactaatgtggattataaagat
gtcaataaaattaatttggaacaatttgttggaaaagaatgcatgaatatagtaaacgat
ttaattaaagaaattaacactcaatattatattgattttaatgaacccgaatttttagta
cgctttgctctacatataaaaaatctacttactcgaattaaaagtagaaactttagtaaa
aatcccttaactgactctattaaaagtaattgtccattaatttatgattgtgctgttact
atttcatacaaaattaaaaattacacaaattgtgaaattaatgaagatgaaattgcttat
atagctttgcatattggcgctaatttagttaatcaaaaaaatatgcatactaaaattact
tgtgcaattctttttcctaagcattatgatttagatataaaattggcagaaagcatagct
tcagcttttggtgattctctattagttaaaaatatcgttacaaaggaaaaagaattagaa
gatctacaagttgattttgttatttctacaattaaatttgttaattttaaatccttcccc
tttattattgtaaatacctttttgacagaaaaagatcgcaaacttatagctaacaaaatt
gaggaagtaaagaaaaataaacaaaaatcagaatttttagagaatttacattcaattttt
aatgaatccttattttttaaagataaatattttgaaaatgaaaatcaagcaattgaattt
atgtgcgatgaaatgcagaaaaaaggctatataaagcctgattttaaacaagaagtattt
gaacgtgaagctatgtcctctacagcctttaatggtatagccatcccacattctatgcat
atgaatgccataaaaacaggtatgtttacacttgtaaataaaaaacctttaaactgggga
aatcagcaagtaagcattatttttttattaactataaataaaagcgaaagaaaggtattt
aacgatatgtttgatgcattaacaaacattttatctgatgaaattaatttagataaattg
attcgatgtaattcatttgaagaatttataaatatgttagttgaatgtatataa
DBGET
integrated database retrieval system
