Clostridium saccharoperbutylacetonicum: Cspa_c21640
Help
Entry
Cspa_c21640 CDS
T02467
Name
(GenBank) putative efflux protein, MATE family
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
csr
Clostridium saccharoperbutylacetonicum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
csr02000
]
Cspa_c21640
Transporters [BR:
csr02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
Cspa_c21640
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGF55930
UniProt:
M1LSH4
LinkDB
All DBs
Position
2386322..2387707
Genome browser
AA seq
461 aa
AA seq
DB search
MIEKFFKKSPYLSAMLAIAIPVSIQSLFQASLSVIDQAMVGQLGENAIAAVGLGSRFPNI
FIITLNAIGASTSIMVSQFWGKKDKENIARSFGGNLFIGLLITLIFSLLSFGFPNQVLSW
YTKDAKVIELGSEYLKTIAVGYIPILLITMYSSILRSTEHVKLPMFAGIFGILMNTLLNY
ILIFGKFGFGAMGLQGTAYATTITRLLEALILFTCIYAKKYPGAFKIKEIFNLSAEFIKK
IIIISTPILINEFLWAVGETMYSIVYGRMGTDEVAAMTLTFPIQSLSIGLFSGVSVAAGI
MIGNKLGKNENEEAFKYSRKFIKLGIVGAAIFGIVLIMLSKLYVVIFNISNDLKDCTIKI
LIMFALVLWIKVSNMIIGGGILRSGGQTKYTLYLDMFGTWGIGVPFGFISAFIFKLPIEW
VYLIISSEELARLIIGLKLMYSKKWMANITENNTGECSINK
NT seq
1386 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgaaaaattttttaaaaagagcccatatttaagcgcgatgttagcaatagcaata
ccggtgtccattcaaagcttgtttcaggcttctttaagtgttattgaccaagctatggta
ggacaactgggagaaaatgcaattgcagctgttgggttaggatcgagatttcctaatatt
tttattataactttgaatgcaattggtgcttcaacctctattatggtatctcaattttgg
ggtaaaaaagacaaagaaaatatagcacgctcatttggtgggaatttatttattggactt
cttataactttaatattttctctactttcgtttggatttccaaatcaagtattaagctgg
tatacaaaagatgccaaagtaattgaattaggaagtgaatatcttaagactattgcagtt
ggatatataccaatacttttaataactatgtattcatcgattttaagaagtacagaacat
gttaaactacctatgtttgcaggaatatttggtattctaatgaacactttattaaattat
attcttatatttggtaagtttggatttggagcaatgggattacaaggtacggcttatgct
acaactataactagacttttagaagctttaattctttttacatgcatatatgcaaaaaaa
tatccaggagcatttaaaataaaggaaatatttaacttatcagctgagtttattaagaaa
attataattatatctactccaatactaataaatgaatttttatgggcagtaggggaaaca
atgtattctattgtatatgggagaatgggaacagatgaagttgcagcaatgacattaaca
tttccaatacaaagtttaagcattggtttattttcaggtgttagcgttgcagctgggatt
atgataggaaataaacttggtaagaatgaaaatgaagaggcttttaaatattcaagaaag
tttattaaattaggtattgtaggtgcagcaatatttggaattgtgttaattatgttatca
aaattatatgtagttatatttaatatctctaatgatttaaaggattgtacaatcaagata
ttaattatgtttgcattagtattatggattaaagtttcaaatatgataataggaggtgga
attttaagaagtggtggacaaactaagtatacattatatttagatatgtttggaacatgg
ggaataggagttccatttggatttatttcagcatttattttcaagcttcctattgaatgg
gtttatttgataatttctagtgaggaactagctagattaattattggacttaaattgatg
tattcaaaaaaatggatggcaaatattactgaaaacaatacaggagaatgtagtataaat
aaatag
DBGET
integrated database retrieval system
