Clostridium saccharoperbutylacetonicum: Cspa_c48190
Help
Entry
Cspa_c48190 CDS
T02467
Name
(GenBank) superfamily II DNA/RNA helicase SNF2 family
Organism
csr
Clostridium saccharoperbutylacetonicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
SNF2_assoc
Helicase_C
ResIII
DEAD
ERCC3_RAD25_C
SWI2_SNF2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGF58572
UniProt:
M1N549
LinkDB
All DBs
Position
complement(5291510..5294449)
Genome browser
AA seq
979 aa
AA seq
DB search
MKLNELKAIIFKSASNAMKNEGEELFNRGLVTYFKGKKIGDIYHVYGKVTDKNKIKEFNT
HIKIDLQKKKLEGAKCSCDEFKEFASNGYTLMCSHITATSNKLFSLLSKSHNETREDSEK
SIVDKYKIWGNTETTKLIRKTEKESEYYEVLTASRNEKLILKPNELRIFLEGIENRKIKF
KFEHIEFTVPILHKDMPITFNLKDDKERIILSTHKQLPVSLNSSNEVYYFKNELYLPSKS
QSDNYVKLHEKLKAYGEIVYSKNIKTYIELISILSSITENINISESLRNLVANSLKVEFL
VFEDEGRIYCDSILNYGGKRVNILNKNSREDNFIRDNIKEEKVLLEMEKRNFIKMKNKFM
FTGGDEELFDLLKGVGDSIEGLGKITLGNGISDRKIYTSEFIKANLFENSGEYNFSYNIG
NLELKELNRAFEAYRSKNRFYKTRNNDFLDFEDDNVRGFFKLLEALNIDQNLVDGSVKVE
KSKALYLYENIVNKGLGSIKGTNELNDIEKKLANINSRKIFLPDDFVGELREYQMRGFKW
FKTISELGFGGILADEMGLGKTIQTIAFLLSEKSKRSLIVCPTSLIYNWKEEFQKFAPSL
NILIVHGAQRIEEISNSSNYDVILTTYGTLRSDINYYEDISFDYCIIDEGQNIKNASAQN
TKVIKEIKAKIKFALTGTPIENNLTELWSIFDFVMPGYLYSKEVFQEKFISKGEENLESL
KLLIKPFILRRTKNEVMKELPDKVEKKLLVEMTAAQKGLYSNYVKRVKAKMKDNNDKRIE
ILSYLTKLRQICLDPSLILEDYDGGSGKLEVVIELIKEHIETGSKVLLFSQFTSALDKIG
ERLNKEEINFFHLQGKTKPKDRIKLVKEFNSSEVVKVFLISLKAGGTGLNLTSANLVIHF
DPWWNPAVEDQATDRAHRIGQEKEVEVIRLVAKGTIEEKIILLQEDKKELINDILTGGLQ
NSSLLSSLSKDDLMQLFDR
NT seq
2940 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaactaaatgaattaaaagcaataatatttaagtctgcatctaatgctatgaaaaat
gaaggggaagagctttttaatagaggcttagtgacatattttaaaggtaagaagatagga
gatatttaccatgtatatggtaaagtaacagataaaaataaaattaaagagtttaatact
cacattaaaattgatcttcaaaagaaaaagctagagggagcaaaatgttcatgcgatgaa
ttcaaagaatttgcttcaaatggatataccttaatgtgtagtcatataactgctactagc
aacaaacttttcagtctattatcaaagagtcataatgaaactagagaagattcagaaaaa
agcattgtagataagtataaaatatgggggaatactgaaactactaagcttattcgaaaa
acagaaaaagagtctgagtattatgaagtgcttacagcttcaagaaatgaaaagcttata
cttaagcctaatgaactcagaatatttttagaaggaatagaaaatagaaaaatcaaattt
aagtttgagcatatagaatttactgtaccgatccttcataaggatatgccaataactttt
aatttaaaggatgataaagagcggataattttatcgactcataagcagctgcctgtatcg
ctaaattcaagcaacgaagtttattactttaaaaatgaactttaccttccttcaaaaagt
caaagtgataattatgtaaaattacatgaaaaactcaaggcttacggagaaattgtttat
agtaaaaatataaaaacttatattgaactaatttcaatcttaagcagtataactgaaaat
attaatatttcagaaagcctaagaaaccttgtagctaactcattaaaagttgaatttttg
gtatttgaggatgaggggagaatatattgtgattcaatcctaaattatggtggtaaaaga
gttaatatattaaataaaaatagcagagaagataattttataagagataatataaaagaa
gagaaagtactcttagaaatggaaaaaagaaattttataaaaatgaaaaataaattcatg
ttcacaggtggagatgaggaattatttgatttattaaaaggtgtaggagatagcattgaa
gggttaggaaagatcactttaggaaatggaataagtgatagaaaaatttacacttcagaa
ttcattaaagctaatttatttgagaattctggagaatataatttttcttataatattgga
aatctagaattaaaggagctaaacagggcctttgaagcttatagaagcaagaataggttc
tataaaacaagaaataatgattttttagattttgaagatgataatgtacgtggatttttt
aagcttttggaagctttaaacattgatcagaacctagtagatggaagtgttaaagtagaa
aaaagtaaagcattatatttatatgaaaatatagtgaataagggattaggcagcattaaa
ggaactaatgagttaaatgatatagaaaaaaaattagccaatataaatagcaggaaaata
tttttaccagatgactttgtaggagaacttagagaatatcagatgaggggctttaaatgg
tttaaaaccataagtgaattaggctttggtggaatattagcagatgaaatggggctagga
aaaacaattcaaacaattgcatttttgctttcagaaaaaagtaaaagaagccttatagtt
tgtcctacttctctaatctataattggaaagaagaatttcaaaaatttgctccgagtcta
aacatactaattgtacatggagcacaaagaattgaagaaataagtaatagtagtaattat
gacgtaatcttaacaacttatggaactttgagatcagatataaattactatgaagatatt
agctttgactattgtatcattgatgaaggccaaaacataaagaatgcttctgctcaaaat
acaaaggttataaaagagatcaaagctaaaataaagtttgcattaaccgggacacctatt
gaaaataacttgactgagctttggtctatatttgattttgtaatgcctggatacttatat
tctaaggaagtatttcaagaaaaatttatttcaaaaggagaagagaatttagaaagtctt
aaacttttaataaaaccatttattttgagaaggactaaaaatgaagtaatgaaggaactg
ccagataaggtagaaaagaagcttttagttgaaatgacggcagctcaaaaaggtttatat
agtaattatgtcaaaagagttaaggcaaaaatgaaggataataacgataaaagaattgag
attctttcatatttaactaagcttaggcagatatgtttagatccttcacttatattagag
gattatgatggtggaagtggaaaattagaagtggtcattgaacttatcaaagaacatatt
gagactggaagtaaagttcttttattttcacagtttacttcagctttagataaaattgga
gaacgcttaaataaagaagaaattaacttttttcatttacaaggaaagacaaaaccaaag
gatagaattaaactagttaaggaatttaatagcagtgaagtggttaaagtgtttttaatt
tctttaaaagctggaggtactggacttaatttaacttcagcaaatctagtcatacatttt
gatccctggtggaatccagcagttgaagatcaagcaacggatagagctcatagaattggc
caagaaaaggaagtagaagtaattagattagttgccaaaggtacaatagaagaaaaaatt
attttgcttcaggaagataagaaagagcttattaatgatattttgactggagggcttcaa
aacagcagcttacttagcagtctgtcaaaggacgatttaatgcagttgtttgatagatag
DBGET
integrated database retrieval system
