Colius striatus (speckled mousebird): 104557981
Help
Entry
104557981 CDS
T08355
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
csti
Colius striatus (speckled mousebird)
Pathway
csti04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csti00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
104557981
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
csti00536
]
104557981
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
csti00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
104557981
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
hEGF
FXa_inhibition
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104557981
NCBI-ProteinID:
XP_010200706
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1693 aa
AA seq
DB search
QRASTCFSNIVNGRCAQEVPGRLTKRQCCCEAGRCWAIGSVPEMCPVRGSDEHRRLCVDG
AATGGGPRGGGTGGNGFHPGGNGNGYGPGGAGFIPIPGSNGFSPGVGGAGTGGQSPTGNG
PIITGLTILNQTIDICKHQSNLCLNGRCIPALSSYRCECNMGYKQDENGDCIDVDECTSN
PCSNGDCVNTPGSYYCKCHAGFQRTPTRQACIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTDGSFQCIC
NAGFELTTDGKNCVDHDECTTSNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLAPNGRFCTDIDEC
QTQGICMNGHCINTEGSFHCECPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGAIKTGACVRPFPGA
VTKSECCCANPDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGIGITVDGRDINECALDPDICSNG
ICENSRGSYRCNCNSGYEPDASGRNCVDIDECSVNGLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPKGYV
FSSETDTCEDINECESSPCVNAACRNNLGSFSCECSPGSKLDSTGLICIDSLKGTCWLNI
QDSRCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACSRGFARVKGVTCEDVNECDVF
PGVCPNGRCINSRGSFRCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKWDEDECIQSVPGKFRM
DACCCAVGAAWGSDCEECPKPGTKEYEALCPRGPGFSNRGDILTGRPFYKDINECKVFPG
MCMNGKCRNTIGSFKCRCNNGFTLDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTPGSFECEC
FDGYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFQCDCPLGHELSPSREECIDVN
ECSLSDSLCRNGMCVNMIGTYQCSCNSGYQATTDRQGCIDIDECIIMNGGCDTHCTNSEG
SYECSCSDGYALTPDIRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCFDGFMASMDMKT
CIDVNECDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGSTGCTDVDECEIGAHNCDMHA
SCVNLPGSFKCSCREGWVGNGIKCIDLDECSNGTHQCSVNAQCVNTPGSYRCACAEGFTG
DGFTCSDIDECAENVNLCENGQCLNVPGAYRCECEMGFTPALDSKSCQDIDECSFQNICV
FGTCNNLPGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDF
HLNPTGVGCVDNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGTPCETCP
PVNSTEYNTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPKGYY
LSEKTRICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYR
SYNGTSCENELPFNVTKRMCCCTYNIGKAWNKPCEPCPTPGTAEFKDICGNIPGFTFDIH
TGKAVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQ
RNADCINSPGSYRCECAAGFKLSPNGACVDRNECLEIPNVCSHGLCVDMQGSYQCVCHNG
FKASQDQTMCMDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCIDIDECSSFFG
QVCRNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTLDGKNCIDTNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCI
CPPGYEVKSESCI
NT seq
5082 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atcagagggcaagtacgtgtttctccaacatagtaaatggccgctgtgcacaggaggttc
ctggtaggttgaccaaaaggcaatgctgctgcgaggctggccggtgctgggccattggat
ctgttccagagatgtgtcctgtcagaggatctgatgagcaccgtagactttgtgtggatg
gtgctgcaactggaggtggtcccagaggtggtgggacgggaggaaatgggttccatcctg
gtggaaatggcaatggctatggcccaggaggagcaggattcattcccatccctggtagca
atggtttctcccctggtgtaggcggagcagggacaggtggtcaaagtcccactggaaatg
gcccaataattacagggctaacaatactcaaccagacaatagacatctgtaagcaccagt
ccaacctttgtttaaatggacgttgtataccagccctttctagttaccgatgtgagtgca
acatgggatataagcaggatgaaaatggggattgtattgatgttgatgaatgcacatcaa
atccatgctctaatggagactgtgtcaacacacctggttcctattactgcaagtgccatg
caggtttccaaagaactcctaccagacaggcttgcatcgatatagatgagtgcatccaga
atggtgttctttgtaaaaatggacggtgtgtaaacactgatggaagtttccaatgtatat
gcaatgctgggtttgaactgactactgatggaaaaaattgtgtggaccatgatgagtgta
ccacttcaaatatgtgtttaaatgggatgtgcataaatgaagatgggagttttaaatgca
tctgcaaaccaggatttgttctggctccaaatgggcgtttttgtactgatattgatgaat
gtcagacacaaggaatttgcatgaatggtcattgcataaatactgagggatcctttcatt
gtgagtgtccacctggcttggctgttggagttgatggtcgtgtgtgtgtagacactcaca
tgcgtagcacatgttacggagccatcaaaacaggagcgtgtgttcgtcctttccctgggg
ctgtgacaaaatctgagtgttgctgtgccaatcccgactatggttttggagagccatgtc
acccctgccctgctaaaaactcagcagaattccatggcctgtgtagcagtggaataggta
ttactgtggatggacgagatattaatgagtgtgcattggatcctgacatttgctccaatg
gaatttgtgaaaactcacggggcagttatcgttgtaactgtaacagtggttatgagcccg
atgcatctgggaggaactgtgtggacattgatgaatgttcagtgaatggactgctgtgtg
ataacgggctctgtcgaaatacccctggaagttacagctgcacgtgtccaaagggttatg
tgttcagcagtgagacagacacatgtgaagatataaatgaatgtgaaagcagtccatgtg
tcaatgctgcctgcaggaacaatcttggatctttcagttgtgaatgttcacctggcagca
agctggactctacaggactcatatgtattgatagcctaaaggggacttgctggcttaata
tccaagacagtcgctgtgaagtcaacatcaatggtgctacactgaaatctgaatgctgtg
ctaccttaggagcagcttggggcagcccatgcgagcgatgtgaattagacacagcttgct
caagaggatttgccagagtgaagggtgttacctgtgaagatgtaaatgagtgtgatgttt
tccctggagtttgtcccaatgggaggtgcattaacagcagaggttcatttcgctgcgaat
gccctgaaggtctgacactggacggaacagggcgagtatgtttagatattcgcatggagc
aatgctacctgaaatgggatgaagatgagtgcattcaatctgtgcctggcaagtttcgta
tggatgcctgctgctgtgctgtgggggctgcctggggctctgactgtgaggagtgtccta
agcctggcaccaaggaatatgaggccctatgccccagaggtcctggtttttccaacagag
gagacattctaactggcaggccattttataaagatatcaatgaatgtaaagtgttccctg
gtatgtgcatgaatggtaaatgcagaaacacaattggaagtttcaaatgtagatgtaaca
atgggtttactttagatatggaggaaagaaactgtacagacattgatgagtgccggatct
ccccagacttatgtggaagtggtacttgtgtcaacactcctggaagctttgagtgtgagt
gctttgatggttatgaaagtggatttatgatgatgaagaactgtatggatattgatgaat
gtgaacgcaatcctctgctgtgtagaggtggcacgtgtgtgaacaccgaagggagttttc
agtgtgattgtcctttggggcacgagctgtcaccatcacgtgaggaatgcatagatgtaa
atgagtgctcgttaagtgatagtctgtgcagaaatggcatgtgtgtgaacatgattggaa
cataccagtgttcctgtaactctggataccaagccaccactgacagacaaggctgcatag
atattgatgaatgtataataatgaatggaggctgtgacacccactgcactaactcagaag
gcagctatgaatgtagctgcagtgatggctatgcactaacaccagatatcaggacatgtg
cagatattgatgaatgtgaaaacaatccagatatctgtgatggtgggcaatgtactaata
ttccaggggaatatcgttgtctctgttttgatggatttatggcttctatggacatgaaaa
cttgtattgatgtgaatgaatgtgatttgaattccaacatctgtatgtttggggaatgtg
aaaacactaaaggttccttcatttgtcactgtcagctaggatattcagtcaagaaaggga
gcactggatgcacagatgtggatgaatgcgaaattggtgctcacaactgtgacatgcatg
cctcgtgtgtcaacttaccaggaagttttaaatgtagctgcagagaagggtgggttggaa
atggcattaaatgtattgatcttgatgaatgttctaatggtacccaccagtgcagtgtga
acgcacaatgtgtgaacacaccggggtcatatcgctgtgcctgtgcagagggattcactg
gggatggatttacttgttccgatattgatgagtgtgcagaaaatgttaatctgtgtgaaa
atggacagtgtttgaatgtccctggtgcctaccgttgcgagtgtgagatgggatttactc
ctgccttggacagcaagtcatgccaagatatcgatgaatgctccttccagaacatatgtg
tatttggtacctgtaataatctaccaggaatgtttcattgtatctgcgatgatggctatg
aactagatagaactggaggaaactgtacagatattgatgagtgtgctgaccccattaatt
gtgttaatggtctttgtgtaaatactcctggaagatacgagtgtaactgccctccagact
tccacttgaatcctactggagtgggttgtgtggataaccgtgttggtaattgctacctca
aatatggaccacgaggggatggaagcctgtcctgcaacaccgaaattggggttggagtca
gtcgttcctcatgctgctgctctttgggaaaggcttggggaaccccttgtgagacatgcc
cccctgtaaacagcacggaatataacactctctgtccagggggagagggattcagaccaa
atcccatcactattattttagaagacattgatgaatgtcaggaactgccaggtctctgcc
aaggtggaaactgcatcaatacttttggcagcttccagtgtgaatgtccaaaaggctact
acctcagtgaaaagacaagaatctgtgaagatattgatgagtgtgttgcacatcctggcg
tctgtggccctggcacctgctacaataccttggggaactacacctgcatttgcccacctg
aatatatgcaggtgaacggaggacataactgcatggacatgaggaagagcttttgctaca
gaagctataatggaacctcctgtgagaatgaactgcccttcaatgtgaccaaaaggatgt
gttgctgcacatacaacattgggaaagcctggaacaaaccctgtgagccgtgcccaactc
caggaacagctgaattcaaggatatatgtgggaatattcctggcttcacttttgacattc
atactgggaaagctgttgacattgatgaatgtaaggaaatcccgggaatctgtgcaaatg
gtgtttgcatcaatcagattggcagcttccgctgtgaatgccccactggattcagctaca
atgacctactcttggtctgtgaagatattgatgaatgcagcaatggagacaatctctgtc
agagaaatgcagactgtataaacagtcctggaagttaccgctgtgaatgtgctgctggtt
ttaaactttcacccaatggcgcctgtgttgatcgcaatgaatgtctggaaattccaaatg
tttgcagtcatggtttatgtgtggacatgcaaggaagttaccagtgcgtatgtcacaatg
gttttaaggcatctcaagaccagactatgtgcatggatgttgatgaatgtgaacgccatc
catgtggaaatggaacttgtaaaaacacagttggatcatataactgcctgtgttacccag
gatttgaattaactcataataatgattgtatagatatcgatgagtgcagttcgttctttg
gtcaggtgtgcagaaacggacggtgtttcaatgaaattggttccttcaaatgtttatgta
atgaaggatatgaacttactctagatggcaagaattgcattgatactaacgagtgtgtgg
cactacccggttcatgctcacctgggacctgtcaaaatttggaaggatcattcagatgta
tctgtccaccaggatatgaagtaaaaagtgaaagttgtattg
DBGET
integrated database retrieval system