Litchfieldia suaedae: IM538_04685
Help
Entry
IM538_04685 CDS
T08143
Name
(GenBank) alanine:cation symporter family protein
KO
K03310
alanine or glycine:cation symporter, AGCS family
Organism
csua
Litchfieldia suaedae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csua00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
IM538_04685
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Na_Ala_symp
DUF6479
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOR67441
LinkDB
All DBs
Position
885210..886703
Genome browser
AA seq
497 aa
AA seq
DB search
MEQVVNWLNGIVWSQALIYLCLGVGLYFTLATRFMQVRHIGDMVKLLFAGGKSPAGISSF
QALTLSLSGRVGTGNIAGVATAIAFGGPGAVFWMWLIAFLGAGSAFIESALGQVYKTKKD
GQYRGGPAFYIEKGLGIKWYAVLFAIVTVFATGALLPGVQANSIALGMDTAFGIAPWITG
LVIVLFLALIIFGGVKRIARTAEFVVPFMAIGYIIVALIVIFFNLSEIPAVLSLIFSSAF
GADAAFGGILGAAISWGVKRGIYSNEAGQGTGPHAAAAAEVSHPAKQGLVQAFSVYIDTW
FVCSATAFMILFTGMYNVTPEGQDAIVNNLADVEPGPGYTQNAVESVLPGFGAPFVAIAL
LFFAFTTIMAYYYMAETNLAYINGKVRRVWTEHLLKLVLLGMVFYGSIKTAGLAWSLGDL
GVGSMAWLNIIAIVLLSKPALKILKDYEAQRKEGKDPVFDPVKLGIKNADFWEKEYKYDS
TGSIGEVPTSGTTVDKN
NT seq
1494 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacaggtagtaaattggcttaatggtatcgtctggagtcaggcacttatttattta
tgcttaggagtagggctatacttcacgttagcaacgcgatttatgcaagttaggcacata
ggagatatggtaaaattgctatttgctggtggtaagtcacctgctggaatttcttcgttt
caagcactaactctttctttatctggaagggtaggaacaggtaatatcgctggtgttgcg
acagcgatcgcctttggtggacctggagccgtattttggatgtggttaattgccttccta
ggagcgggttcagcgtttattgagtcagcattaggtcaggtttataaaaccaaaaaggat
ggacagtatcgcggaggtcctgcattctacatagaaaagggcttaggaattaagtggtat
gcggtattgtttgcaattgttacagtgtttgctacaggagcacttttacctggagttcaa
gcaaacagtattgccttaggaatggacactgcttttggcattgctccatggataacaggt
cttgtaattgtacttttcttagcacttattatcttcggtggagttaagcgtatagcacgt
actgctgaatttgttgtaccattcatggctattggatacattattgttgcactaattgtt
attttctttaacctatctgaaattcctgctgtactttcacttatcttctcaagtgctttt
ggtgcagatgctgcctttggtggtatactaggtgcggcgatttcttggggagtaaagcgt
ggaatttattcaaacgaagctggtcaaggaactggtccacatgcagcagcagcagctgaa
gtttctcaccctgctaaacaaggacttgttcaagcattttctgtttatattgacacatgg
tttgtatgttcagctacagccttcatgattctatttactggaatgtacaatgttacacca
gaaggacaagacgcaattgtaaataaccttgcagatgttgaaccaggacctggttataca
caaaatgctgttgagtcagttctaccagggtttggagctccattcgtagcgattgcatta
ttattctttgcttttactactattatggcttattactatatggcagaaacaaatcttgca
tatattaatggtaaggtaagacgtgtatggacagagcatctattaaaacttgttctgtta
gggatggtattttacggaagcattaagactgcaggacttgcatggtcattaggtgaccta
ggagtaggaagtatggcatggctaaatattatcgcaatcgtcctactatctaagcctgca
ttgaaaatccttaaagactatgaagctcagcgtaaggaaggtaaagacccagtgtttgac
ccagttaaactaggtattaagaatgccgacttctgggaaaaagaatataaatatgattca
acaggatctatcggagaagtacctacatctggtacaactgttgataaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
