Litchfieldia suaedae: IM538_17880
Help
Entry
IM538_17880 CDS
T08143
Symbol
secDF
Name
(GenBank) protein translocase subunit SecDF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
csua
Litchfieldia suaedae
Pathway
csua02024
Quorum sensing
csua03060
Protein export
csua03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csua00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
IM538_17880 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
IM538_17880 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
IM538_17880 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
csua02044
]
IM538_17880 (secDF)
Secretion system [BR:
csua02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
IM538_17880 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecD_1st
SecDF_P1_head
Sec_GG
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOR65659
LinkDB
All DBs
Position
complement(3347412..3349667)
Genome browser
AA seq
751 aa
AA seq
DB search
MVKRGRIIAFFLLVLLFGSLMGTTLNGIVNNIKLGLDLQGGFEILYEVKPAKKGDVIDRE
VLVSTIEALDRRVNVLGVSEPNIQIEGEDRIRVQLAGVDDQNTVREILSTQAKLTFRDVN
DKIMLDGTDLVEGGAKQSFAEQNQPIVSLKLKDANLFKEVTEDILAMGPPNNLLVIWLDF
EEGVDSYAAEALKAEPKFISAPRVSQILNTSDVQIEGNFTVESADQLADLLNAGSLPVDL
EEIYSTSVGAKFGETALQKTVFAGIIGIAIIFLFMLYYYRFPGVIAVVTLSIYIYLILQI
FDWMNAVLTLPGIAALLLGVGMAVDANIITYERIKEELRLGKSVMSAFKSGNRNSLSTIF
DANITTLLAAVVLFSFGTSSVKGFATMLIVSILVSFITAVYGSRLLLGLWVNSRIFNNKP
GFFGVKQSEIADIATVTDDTEIVTRYDRFDFVKHRKKFFIASGVMFVLGIGLLLTLKLNL
GIDFASGTRVEILAEKSLTAEEVTEEFKELGYEPKDVILSGDNREIGVARFIGVLSKDEI
AEVKTHFQNLYGAEPSVSTVSPTVGKELARNAFIAVMIASVGIIIYVTIRFEMIMAIAAI
IALLHDAFFIIMLFSLTRLEVDITFIAAILTIVGYSINDTIVTFDRIRELMNKSKRVKTF
EDLSDIVNKALRQTLGRSVSTVITVVFVVLALLFLGAESITNFSFALLVGLISGTYSSLF
LASQIWLVWKHKQLEKKRYAKVEETEPEPEV
NT seq
2256 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaaaagaggtcggataatagctttttttctgcttgtacttcttttcggaagttta
atgggtacaacgctaaatggaattgtaaataatataaaacttgggcttgaccttcaaggc
ggttttgaaattctttatgaagttaaacctgccaaaaaaggtgatgtcattgaccgagag
gtactagtaagtacaattgaagcactggatcgacgtgtaaacgtgcttggggtaagtgaa
cctaatatccagattgaaggtgaagaccgtattcgtgttcagttagccggagttgatgac
cagaacacggttcgtgaaattttatcaacgcaagcaaagctaaccttccgtgatgtaaat
gataaaatcatgttggatggtactgacctggttgagggtggagcgaaacaaagctttgct
gagcaaaaccaaccgattgttagcttaaagttaaaagatgctaatttgtttaaagaggta
actgaggatattttagctatgggtcctcctaataatcttcttgtcatttggttagatttt
gaagaaggtgtggactcttatgctgcagaagcacttaaggctgaacctaaattcatttca
gcaccaagagtttcacaaattttaaacacttcggacgttcaaattgaaggtaattttaca
gtagaaagtgcagatcaattagctgacctacttaatgcaggttcacttcctgtagacctt
gaagaaatttactcaacatctgttggggcaaaattcggtgaaacagcattgcaaaaaaca
gtctttgctgggattatcggtattgcaattatcttcctatttatgctttattattaccgc
tttccaggtgttattgcggttgtaacacttagtatttacatttatttaattttacaaata
tttgattggatgaatgctgtattaacattgccaggtattgcggctttactacttggggtt
ggtatggcagttgatgcaaatatcattacgtatgagcggataaaggaagaattaagatta
ggaaaatctgttatgtctgcctttaaatccggtaatcgaaattccttgtcaacaatcttt
gatgcgaacattacgactcttttagcggcagttgtattgtttagttttggtacaagctct
gttaaaggttttgcgaccatgctaattgtaagtatattagtcagctttataacagctgta
tatggatcgcgtttactccttgggctatgggttaatagtcgaatctttaataataaacct
ggtttcttcggagttaaacaaagtgagattgctgacatagcaacagtaacagatgacaca
gaaatagtaactagatatgatcgatttgatttcgtaaagcatcgtaaaaaattctttatt
gcttcaggagttatgtttgttttaggtattggtttattattaacgttaaagttgaattta
gggattgactttgctagtggtacacgtgtagaaatcctagctgagaaatctctaactgct
gaagaggtaactgaagaatttaaagaacttggttatgaaccaaaagatgttattttatca
ggggataatagagaaatcggagttgctcgatttattggagtattatctaaagatgaaatc
gcagaggttaaaacacattttcaaaacctttatggcgcagaaccaagtgtaagtacggta
tctccaacagtaggtaaagaacttgcaagaaatgcttttattgcagttatgatagcatcc
gtaggaattatcatctatgtaactattcgctttgaaatgattatggcgattgcagcgatt
atagcgttacttcatgatgctttctttatcattatgttgtttagcttaacacgtttggaa
gttgatattacatttatagcggcgatattaacaattgtcggttattctattaatgataca
atagtaaccttcgaccgaattcgagagctaatgaataagtcgaagagagtaaaaacgttc
gaggatctctccgatattgttaacaaagcattacgccagacacttggaagatccgtaagt
actgtaataacagtggtgtttgttgtactagcattattattccttggggcagaatctatc
actaatttctcgtttgcattactagtgggattaatttctggtacgtattcatcactattc
cttgcatcacaaatttggcttgtatggaaacataagcagcttgagaaaaaacgctatgct
aaggttgaagagacagagcctgagccagaagtataa
DBGET
integrated database retrieval system
