Chlamydia trachomatis Sweden2: SW2_6301
Help
Entry
SW2_6301 CDS
T01966
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
Organism
csw
Chlamydia trachomatis Sweden2
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Effector_1
YkyA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBJ15143
LinkDB
All DBs
Position
complement(699882..702509)
Genome browser
AA seq
875 aa
AA seq
DB search
MSSYYLNFRPTTVSGEGLFKIKLANPGSDFKNQARPAIDMEELNSGLYVLRRLAVALEAG
YLGVGSVVNPSNRVFPGGDWGVRRAAGGSTPAAGTISGSTIADIKQSTAKVLVTTITDSL
NALIEDVPELPMTQVAGVSAALVLMESYQQKDSLNDTEQAGVFASAYAPSDESIKTVIKK
EQEKELQEGKDRVTAQLTAQGASDQVIEKSLADYEKYYVDEYFDTHVKEALWKHRASIGE
NIQEMLDQCLNLGLDVPDSLTEENINDANAKLVLQAWMEAFNNAMEVEPALGGSKEVIDS
VLKMIPFAKPDANLSAEDISSIYTQAALPSPEVMDYYLTRQDAGVCKGEVVKAFQQATQN
LQSVRSNVEEQIKELEVKKTSFLQAQASLESMLEGVKRLNDNQKFTSVRLTSVMECYAGL
IALSQITDVLDSAGISLITQYVDKFLKLNNANTAQTLAHVISYMAAYCEVAECTMVSTIV
SEDTVLQKVKDKWNELKKEKFFESFTLPDDNELKTNYITSTNNVCRANFSNFVNTVITEK
MDLTAAVTEAQSLLTEFRGKATEYLSKFQQEINELNRTYDTLDPAKASFNTSTGSTPSLR
AQAVDSWIDSTSLGSAFIHLILNTQIPKQENFLNPLIQEVNFNNVAANAVNDLLSITNNF
STSSVYYNLSSYLVESKEGKDLFCGDFFEFIGALAKEHEYIVRDINSCYRAEAFGEALLA
RVEALAQGHKVTDAQANSMRTQANLYLSFIRIIVEQLAVLDSLLRSLNYEVEKKDNNYDK
DKYKITGPTDWISTLASLEGYAANGFDNASPSGGLGPMHTLVQTDQHDYLTQSQTQQLNL
QNQMTNIQQEWTLVSTSMQVLNGILSHLAAEIYSN
NT seq
2628 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttcttactatttaaattttaggccaactactgtatctggagagggtttatttaag
attaaactcgccaatcctggctcggattttaaaaaccaagcacggccagccattgatatg
gaggagttaaactcaggactttatgtactaagacgtttagctgtagctttggaagctgga
tatttgggagttggttctgtggtcaatccctctaacagagtatttcctggaggagactgg
ggggtaagaagagccgcaggaggcagcactccggcagcaggtactatttctggtagtact
attgcagatattaagcagagtaccgctaaagtattagtgactaccattacagatagtttg
aatgctctgatagaagacgtgccagagttacctatgactcaagtagctggtgtatcagca
gcacttgttttaatggagtcgtatcagcagaaggattctcttaatgatacggagcaggcc
ggcgtttttgctagtgcttatgctccttcagatgaatctatcaagactgttatcaagaaa
gaacaagaaaaagagcttcaagaaggtaaagatcgtgttacagctcagctaacagctcaa
ggtgcttctgatcaggtcatagagaagtctttggctgattatgagaagtattatgttgat
gagtactttgacacacatgtaaaggaagctttgtggaaacatcgagcaagcataggagaa
aatatccaggagatgctggaccagtgtttgaatttaggtctggatgttccagattccttg
acggaagagaacataaacgatgctaacgcaaagttagtgcttcaagcttggatggaagct
ttcaataatgctatggaggttgaacccgctttaggtggatctaaagaagtcattgattct
gtgttgaaaatgattccttttgcgaagccggatgctaatttaagcgcggaggatattagt
agtatttacacacaagctgccttaccttctccagaggtgatggattactatctgactaga
caagatgcaggagtttgtaagggagaggtggttaaagcctttcagcaagccacgcagaat
ctccaatctgtacgttctaatgtagaagagcaaattaaagagttagaagttaaaaagaca
tccttcttacaagcacaagcatcgttagagagtatgctggaaggggtaaagcgcctcaat
gacaaccagaaatttacttctgtacgcttgacatctgttatggagtgttatgctgggctt
atagcactctcgcagataactgatgttttagatagtgcggggattagtcttataacgcaa
tatgtggataaatttttaaaacttaacaatgccaatacagcacaaacattagcccacgtt
atatcttacatggcagcttattgcgaagtggctgaatgtacgatggttagtacgatcgtg
agcgaagatactgtactccagaaagtcaaagataaatggaacgaacttaaaaaagagaag
ttttttgaatcttttacgctgcctgatgataacgaacttaaaactaactatattacaagt
accaacaatgtttgccgagctaattttagtaactttgtcaacactgtaattacagaaaaa
atggatcttactgctgctgttacagaagcacaaagtctacttacagaatttcgagggaaa
gctacagaatacctgagcaaattccaacaagagataaatgaactcaatcggacttacgac
acattagatccagctaaggcttcttttaatacttctacagggagtacaccttctttacgt
gcacaggctgtagatagctggatcgactctacgagtttaggttctgcttttatccatctc
attttaaatacacaaattcctaagcaggagaatttcctgaatcctttgattcaagaagtg
aacttcaacaatgtcgctgctaacgctgttaacgacctcctgtccattactaataacttc
tctacctcatccgtttactacaatctttcttcctatcttgtagaaagcaaggaaggaaaa
gatttattctgtggggatttctttgagttcataggggctttagctaaggaacacgaatat
attgttagggatattaatagttgttatcgcgccgaggcttttggagaagctttactagct
agagtggaagctttagcgcaagggcataaagtaacggatgcacaagcgaacagcatgcgc
acgcaagccaatctgtatttatcttttattcgtattatcgtggagcagttagcagtctta
gactctctgttaagaagtcttaattatgaggttgagaagaaagataacaattatgacaag
gataaatataagataactggacctacagattggatttcgacattggcaagtttagaaggg
tatgcagcaaacggatttgataatgccagtccttcaggaggattggggcccatgcatacg
ctagtacaaacggatcagcacgattatctaacacagagccaaacgcaacaattaaacttg
caaaaccaaatgacgaacattcaacaggaatggacgttagtttctacctccatgcaagtt
ctcaatgggattttgtctcatttagcagcggaaatttactctaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
