Clostridium taeniosporum: BGI42_00115
Help
Entry
BGI42_00115 CDS
T04957
Symbol
addB
Name
(GenBank) helicase-exonuclease AddAB subunit AddB
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
ctae
Clostridium taeniosporum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctae00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ctae03400
]
BGI42_00115 (addB)
Enzymes [BR:
ctae01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
BGI42_00115 (addB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
ctae03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
BGI42_00115 (addB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
UvrD-helicase
SLFN-g3_helicase
ENT
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOR22236
UniProt:
A0A1D7XFV4
LinkDB
All DBs
Position
20943..24395
Genome browser
AA seq
1150 aa
AA seq
DB search
MSIRFIYGRAGSGKSLFCINQIKKLIDSHEESNIILLVPEQYTFTTENKVLKNIGERAFL
NTQVLSFKSMCQKVFEECGGRVRQIIKDTGKHMLINKVLNEKLDDLIYFRKMSKEQGFNK
IISELITEFKKYNINIESLRELIDKIDDNELIEKIKELSLIYEEFNVKMHNSYIDTDDEL
TLLAKKLLVNNIYAGSEIWIDEFTTFTPQQLEIIRILSKSSVVNITLCMDKTSNSDVEDI
TNVFSSIESTENRILKLMEENNIGYLNPINLNSKLPYRFKNSEELAHIEKYCITYPFKSY
KGKNKDIKLYKANNTYDEIERVAQDIIRLVRDKNYRFRHISVVCRNIEDYNKIISVIFKD
YEIPFFMDKKIKLLNNPLIVLITSAFEILLKNWSYESVFKYLKSGLTGFGTYDIDRLENF
VLEHGIKGYKWNKEEIKKLKDISIKNEATEEELSIFDVMEEVKNSLLQFHKSIEGKHNVG
EVCKALYEFLLKIKAFERIDEWITRFEELKLEDKVKEYKQVESIVIDMLDQAVEVMGSDI
VDTFEFFKILNSGFENEEIGVIPVALDQVNVGDIARIKGREVKALYIVGINDGVLPAAHK
DEGILSDRDRIELKELGVLLAADGRSKAFEEQFVVYTALTIASEYLMLSYPMADFEGKSL
RPSIIISRIKKILPNLIEESSLYNLSKRKDHLNKVISPIPTFNELIFALRRELENEEIDE
EYWAEVYNWFKENEDFKWKIENTFKGFKYSNTGEKVSRKKLLSLYKNDFGKLSFSVSRLE
KYAECPFSYFIQYGLKAKNRKVYEFTPPDLGSFVHDILDSFTNTVKKEGIDWSDLDIQKC
KKIVSELIDIKLKEDSGSILNSTNKYKYFSKRFKRVISKSVSIISEQMRRGEFEVFNNEF
SFGSYNEGEAIVLNLPSDEKVYLKGRIDRIDTLDLDGNTYLRIVDYKTGNKHFDLTEFYY
GLQMQLLVYLDALLKNSEYILKKQALPGAVLYFRVDDPIIKTKGSITTEELEKEVLSNLK
MNGLILKDAKVVKSMDKGIETTGYSLVIPAAFKKDGDFKAGSEVVTEEQFKLLRDYVNKK
MIDLCEDMLCGDIKIQPTKDSNGTYCEFCDYSSICQFDSCIEDNKYKIIMKKSKDEIWNN
IRAELSNDEK
NT seq
3453 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtataagatttatttatggaagagcaggaagtggaaagagcttattttgtataaat
caaataaagaagttaatcgattcacatgaagagagcaatataattttattagtacctgaa
caatatacttttactactgaaaataaagttttaaagaatattggagaaagagcattttta
aatactcaggtattaagctttaaaagcatgtgccaaaaagtatttgaagaatgtggcgga
cgagtaagacagattataaaagatactggtaagcacatgctaattaataaggtattaaat
gagaaattggatgatttaatttactttaggaaaatgtcaaaagaacaaggatttaataaa
ataatttctgaattaattacagagtttaaaaaatataatattaatatagaatctttaaga
gagttaatagacaagatagatgataatgaattaatagaaaagataaaagagttatcttta
atatatgaagaatttaatgtaaaaatgcataattcgtatatagatactgatgatgagctt
actttattagcaaaaaaactattagttaataatatttatgcaggtagtgaaatttggata
gatgaatttactacatttactcctcaacagttagaaattataagaattctttctaaatca
tctgtagttaacataactctttgtatggataaaacttcaaatagtgatgttgaagatata
actaatgtatttagtagtattgaaagtacagaaaatagaattttaaaattaatggaagag
aataatattgggtatttaaatcctattaatttaaattctaaattgccatatagatttaaa
aatagtgaagagcttgctcatatagaaaaatactgtataacttatccttttaaatcttat
aaaggaaaaaataaggatataaagttatataaagcaaataatacttatgatgaaattgag
agagtggctcaagatataattagattagttagagataaaaattatagatttagacacata
tctgtggtttgtagaaatatagaagattataataaaataatttctgttattttcaaagat
tatgaaataccattttttatggataaaaaaataaagttattgaataatccattaattgtt
ttaataacttctgcatttgagattttattaaaaaattggtcatatgaaagtgtatttaaa
tatttaaaaagtggattaacaggatttggtacttatgatattgacaggttagaaaatttt
gtattagagcacgggataaagggctataaatggaataaagaagagattaaaaaacttaaa
gatataagcataaaaaatgaagcaacagaagaagaacttagtatattcgatgtaatggaa
gaagtaaaaaattctcttttgcaatttcacaaatctatagaaggtaaacataatgttgga
gaagtatgtaaagcattatatgaatttttattaaagattaaagcttttgaaagaatagat
gaatggattactagatttgaagagttaaagcttgaagataaggtaaaagaatataaacaa
gtagaatctattgtaatagatatgttagatcaagctgtagaagttatgggatctgatata
gtagatacatttgagttttttaagatattgaattcaggttttgaaaatgaggaaataggt
gttattccagtagctttagatcaggttaatgttggagatatagctagaataaaaggtaga
gaagttaaggcattatatatagttggaattaatgatggagtattgccagcagcacataag
gatgaaggaattttatctgatagagatagaattgaacttaaagaacttggggtgttatta
gctgctgatggtagaagtaaggcttttgaagaacaatttgtagtatatacagcattaact
atagctagtgaatatttaatgttatcatatcctatggcagattttgaaggtaagtcatta
agaccctcgataataatatctaggataaaaaagatattacctaatttgattgaagaaagt
tctttatataatttgagtaaaagaaaagatcatttaaataaagttatttcaccaatacct
acttttaatgaattaatatttgcacttagaagagaattggaaaatgaagaaatagatgag
gagtattgggcagaagtatataattggtttaaggaaaatgaagattttaagtggaaaata
gaaaatacatttaagggatttaaatattctaatacaggagaaaaagtatctaggaaaaaa
ttactttctctttataaaaatgattttggaaaattatcatttagtgtatctagactagaa
aaatatgcagaatgtccattttcatattttattcaatatggtctaaaggctaaaaatcgt
aaagtgtatgaatttactcctcctgatttaggctcgtttgtacatgacattttagattca
ttcacaaatactgtaaaaaaagaaggcattgattggtctgatcttgatattcaaaagtgt
aaaaagattgtatctgaattaattgatattaagttaaaagaagatagtggttcaatatta
aatagtactaataaatataaatatttttcaaaaaggtttaaaagagttatatcaaaatca
gtatcaattatatctgagcagatgagaagaggagaatttgaggtatttaataatgaattt
tcttttggaagttataatgaaggagaagctatagtattaaatttaccatctgatgaaaaa
gtttatttaaaaggaagaattgatagaatagatactctagatttagatgggaatacttat
ttgagaatagtagattataaaacaggaaataagcattttgatttaactgaattttattat
ggacttcaaatgcagttattagtttatttagatgctttattaaaaaattctgaatatata
ttaaaaaagcaagctttacctggagcggtattatattttagagttgatgatcctataatt
aaaactaaaggtagtataaccactgaagaattagaaaaagaagttttaagtaatttaaag
atgaatggattgatattaaaggatgctaaagtagttaagtctatggataaaggtattgaa
accacaggatattcactagttattccagctgcatttaaaaaggatggagattttaaagca
ggcagtgaagttgtaactgaagagcaatttaaattgcttagagattatgtaaataagaaa
atgattgatctatgtgaagatatgttatgtggagatataaaaatacagcccactaaggat
tctaatggtacttattgtgaattttgtgattattcatctatatgtcaatttgacagctgt
atagaagataataaatataaaatcataatgaagaaatcaaaagatgagatttggaataat
ataagggctgaattgagtaacgatgagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system