Clostridium taeniosporum: BGI42_11835
Help
Entry
BGI42_11835 CDS
T04957
Name
(GenBank) exonuclease SbcC
KO
K03546
DNA repair protein SbcC/Rad50
Organism
ctae
Clostridium taeniosporum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctae00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ctae03400
]
BGI42_11835
DNA repair and recombination proteins [BR:
ctae03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
BGI42_11835
Archaeal homologous recombinant proteins
BGI42_11835
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SbcC_Walker_B
AAA_23
AAA_29
AAA_27
SMC_N
AAA_21
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOR24382
UniProt:
A0A1D7XM17
LinkDB
All DBs
Position
complement(2590791..2594333)
Genome browser
AA seq
1180 aa
AA seq
DB search
MRPIELKVKGLNSFIEEQTVDFTKLTERGLFGIFGPTGSGKSTILDGITLALYGQVSRKS
SNYININCNSLNVSFKFQISGAYGKTYVVSREFKRDNKTGNPRTSRAKIIDTTNGLDDVL
ADKVQKVTEKCEEIIGLGIDDFTRTVVLPQGKFSEFLKLEGRNRREMLERLFNLKKYGDE
LSIKLSKSIKEEKIKSNLLTGELKGYEDVSSEKLNLKNEELELAKKQLDYKVREFRDIEK
TYKSSEEIWNLQLELESYKEREEILNYRANEIEEDKVKLKFGESALKVNPYLVCYENTLN
ESCEIKKQKEKLEIDFREIKLEKENSERQLLQITEKKDKEIPELKLREQKIKDAMEEKDK
LDILEKEIGDISYKVETLREQYKKENNKLGIVSESIKNTDTSIKKLEEEFESLKLDDEFK
SKIQEGLLISEKYNLFEKNIAINKKKLDNLNNDKEKLNLDISNLKKLYSEKYELLNESKE
NLEQLIKNSPGKQEDLLDFQKRLTDCNEKWSDFNQYSEEIKKSKLLIGEYQELLKLENEK
TDTLSEKILLLKEKYRDYEIENLSLKIRKNLEQGESCPVCGSTEHKINFKDDVACDIDDE
KINELNDKISENEKRLKKLENEITIYNTKINAEEERIKEKNLQIKALGEEFKKLEPKNIQ
EEFNNLKNSINNYESKKEFLEKELEKLKEENYKLENHINEISTVLKEKENQINLITEELN
FSIKDFSELKEKLDDIKEETKVTNFHEKNKEIIEIEKNRNKVSIKIKELRNDFENLIKEK
DILQDNLKLIMEKGTDARTSLNEKIKNREEKINIIKDKLKNEFNKVEEFKNIDKEKLIYL
LNEIKEKINFVEEKFKSFNEIKDKIYLKYEKCNEEYISLVTRENELIKRCKVEKEKLSEI
LKEEKFKSIEELKENIISQSEIERLKEKIEKYKEELSKIKGAIESSLKKLNGREITKERW
ESIQNNIEEKKNEVENLTEIKIKLEEEYKFLNNKLKELKELLTKKERIDHKLALLDDLDK
LFKGKKFVEFVAITQLKYISLEASKKLREITNGNYGLEVDENGKFIIRDYKNGGAERDPS
TLSGGETFLASLSLALALSSQIQLKGTAPLELFFLDEGFGTLDDNLLEVVMNSLERLHNE
KLKIGIISHVEAIKNRVPVKLILTPAECGRGGSKVRLEKS
NT seq
3543 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagacccattgaacttaaagttaagggattaaatagttttatagaagagcaaactgta
gattttactaaattaactgaaagaggtttatttggaatatttggtccaactggcagtgga
aaatcaactatattagatggaattacattagctttgtatggacaggtttcaagaaaaagt
tctaattatataaatattaattgtaattcattaaatgtaagttttaaatttcaaatatca
ggtgcttatgggaaaacttatgttgtaagtagggagtttaaacgtgataataaaactgga
aatcctagaacttcaagagctaaaatcattgatacaactaatggattagatgatgtctta
gctgataaggttcaaaaggttacagaaaagtgtgaagaaataataggacttggaatagat
gatttcactagaactgttgtattaccacaaggaaaattcagtgaatttttaaagttagaa
ggaagaaatagaagagaaatgcttgaaagattatttaatcttaaaaagtatggagatgaa
ctttctataaaattatctaagagcataaaagaagaaaaaattaagagtaaccttttaact
ggagaattgaaaggttatgaagatgttagcagtgaaaagcttaatttaaaaaacgaagaa
ttagaacttgctaaaaaacaattagattataaggttagagaatttagagatatagaaaaa
acttataaatctagtgaagaaatttggaatttgcaacttgaattagagtcctataaagaa
agagaagaaatcttaaattatagagctaatgaaatagaagaggataaagttaaacttaaa
tttggagaatcagcattaaaagttaatccttacttagtatgttatgaaaatactttaaat
gaaagttgtgaaataaaaaaacaaaaggaaaaattagaaatagattttagagaaattaaa
ttagaaaaagaaaattcagaaagacagttattacaaataacagaaaaaaaggataaagag
ataccagaattaaaactaagagaacaaaaaataaaagatgcaatggaagaaaaagataag
ttagatatattagaaaaagaaataggggatatttcttataaagttgaaacacttagagaa
cagtataaaaaagaaaataataaacttggtattgtaagtgaaagtattaaaaatacagat
actagtattaaaaagttggaagaagaatttgaaagtttaaaattagatgatgagtttaaa
tctaagatacaagagggtcttttaattagtgaaaaatataatttatttgaaaagaatata
gcaattaataaaaagaaattagataatttaaataatgataaagaaaagttaaatttagat
attagtaacttaaaaaaattatatagtgaaaaatatgaattactaaatgaaagcaaagaa
aatttagaacaacttattaaaaattcaccaggtaagcaagaagatttattagattttcaa
aaacgattaactgattgtaatgaaaaatggagcgatttcaatcagtattcagaagaaatt
aaaaagtctaaattattaattggggaataccaagagttattaaaattagaaaatgaaaag
acagatactcttagtgaaaagatattattattaaaagaaaaatatagagattatgaaata
gaaaatttatctttaaaaataagaaaaaatttggaacagggggaatcgtgtccggtatgt
ggatctacagaacataaaataaattttaaagatgatgtagcttgtgatatagatgatgaa
aagataaatgaattaaacgataaaataagtgaaaatgaaaaaaggttaaagaaattagaa
aatgaaataactatatacaatactaaaattaatgcagaagaagaaagaatcaaagaaaaa
aatcttcaaataaaagcattaggagaagaatttaaaaagttagaacctaaaaatattcag
gaagaatttaataatttaaaaaattccattaataattatgaaagtaaaaaagaattttta
gaaaaagaactagagaagttaaaagaagaaaattataaattggaaaatcatataaacgaa
atatcaactgtattaaaggaaaaagaaaatcaaataaatttaataacagaggaattgaat
tttagtataaaagattttagtgaattaaaagaaaaattagatgatataaaagaagaaact
aaggttactaattttcatgaaaaaaataaagagattattgaaatagaaaaaaataggaat
aaggtatcaattaaaataaaagaacttagaaatgattttgaaaatttaataaaagaaaaa
gatatattacaagataatttaaagttaattatggaaaaaggtacagatgcacgtacttca
ttaaacgaaaaaattaaaaacagagaagaaaagatcaatataataaaagataaattaaaa
aatgaatttaataaagtagaggagtttaaaaatattgataaagaaaaattaatttactta
ttaaatgaaataaaggaaaaaataaattttgtggaagaaaagtttaaatcatttaatgaa
ataaaagataagatttatttaaaatatgaaaaatgtaatgaagaatatatatctttagta
actagggaaaatgaacttataaaaaggtgtaaagttgaaaaagagaagttaagtgaaatt
ttaaaagaagagaaatttaaatctatagaggaacttaaagaaaatattatcagtcaaagt
gaaattgaaagattaaaagagaaaatagagaagtataaagaagaattatctaaaattaaa
ggagcaatagaaagctcattaaaaaaattaaatggcagagagattacaaaagagcgatgg
gaaagtatacagaataacatagaggaaaagaaaaatgaagtagaaaatttaactgaaata
aagattaaattagaggaagaatataaatttttaaataataaacttaaagaacttaaagaa
ctattaactaaaaaggaaaggatagatcataaattagctttactagatgatttagataag
ttatttaaaggcaagaagtttgtagagtttgtggctataactcaattaaaatatatatca
ttagaagcatctaaaaaattaagagaaataactaatggaaattatggtttagaagtagat
gaaaatgggaaattcataataagagattataaaaatggtggcgctgaaagagacccatct
acattatcaggtggagaaacattcttggcatctctatcattagcattagctttatcatca
caaatacagcttaaaggaacagcaccattagaattatttttcttagatgagggttttgga
actttagatgacaatttattagaagtagttatgaattcattagaaagattgcataatgaa
aaattaaaaattggaataattagtcatgttgaagctattaaaaatagggtccccgtaaaa
ttaatacttactcctgctgaatgtgggagaggagggagtaaggtaaggttagagaaaagt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
