Acetivibrio thermocellus ATCC 27405: Cthe_3050
Help
Entry
Cthe_3050 CDS
T00474
Name
(GenBank) Fibronectin type III domain protein
Organism
cth
Acetivibrio thermocellus ATCC 27405
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
RGI_lyase
DUF1093
Big_13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABN54246
UniProt:
A3DJW7
LinkDB
All DBs
Position
3577303..3579306
Genome browser
AA seq
667 aa
AA seq
DB search
MNKWEIIKKTVSVCLLLSITFSIFINSDVVLALSQKVENINFGENINFYGVVQDSAIRLV
TPTVGVEPTPIGSLTPAVTETPLATPTQETLPSPSPSEFSTPTPSFTPDASPESTSTPFP
SPLPFPMPDSTSTPTPDPDSTSTPTPTPTPIPTPSVSPSPSDTEAPSRPECLVTTDRTDT
MISLSWSASTDNVGVKGYYIYRDGVKLDVSVTEPCFTDEGLTENTTYRYYVTAYDEAGNE
SERSTELVVMTLANNITGLNAVVNVDGSILVSWNQVARAAAYELMIDEYESVCIYDTSYL
HTGLLPNTRHTYRVRVRYAGNDYGAWSEKKVVFSFPGKPLDVGADIIDDNSVRIFWNQVQ
GISKYNVYRDGELIAAEVKAVEFTDTGLTAGRDYEYEVRAVSGDSESVENQRVIVNTGTG
SISANTVLNENRVYKSFNLKSRIINLNGYRFKVEGDLVQSGGTLDVNGGRLEVTGNYTIS
GSSYLEMTEEEDYVLVRGDFETRSDNNHENKLTAGTLEVKGNFTRKAGVSANFKASGTHR
VVLSGEKQQTIDFSSTNIQQFNILENKNTSGKELIFKNSYNAKIFINNTSGLSPMTVEYH
DWNLTGNEVINGDLYIKGKTLNLAGKTLKVNGNLIQTGGYIGCKWRKIRGRGKLHNKRVF
IFEDDGR
NT seq
2004 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaataagtgggaaattatcaagaaaacagtctcagtttgtcttttattatccataacg
ttttcaatttttattaattcggatgttgttttggcattaagtcaaaaagtagagaatata
aattttggagagaatataaatttctatggagtagtacaagattcagcaattagattggtt
acacctaccgtgggtgttgaaccgacccctattgggagcttgacgccggcagtcacagaa
acacctttggcaacacctactcaagagacgttgccgtcaccgtctccatcagagttttct
actcctacgccatcatttactcctgatgcatcaccggaatctacttctacgccatttccg
tcgccgttaccattccctatgccggattcaacttctactccaacaccggatccggattca
acttcgacgccaacgccaactccgaccccaattccgactccgtcagtttcaccttcacca
tcggatacggaggcaccgtcaagaccggaatgtttagttactacggacagaactgacaca
atgatttctttgtcgtggagtgcttcaactgacaatgttggagtaaagggttactatata
tacagagacggagtaaaactggatgttagtgtgacagaaccatgttttactgatgaaggg
ttaacagagaacaccacatacagatattatgtaacagcttacgatgaagcgggcaatgaa
tcggaaagaagtacggaacttgtagttatgacccttgctaataatattacggggctgaat
gctgttgtaaatgtggatggaagtatattggtttcgtggaatcaagttgcaagagccgcg
gcatatgaattaatgatagatgaatatgaatccgtatgtatctatgatacaagttatttg
catacaggtcttctgccgaatacgcgtcatacatacagagtcagggttagatatgccggt
aacgactatggggcatggagcgagaaaaaggtagttttcagctttccgggcaaacccttg
gatgtgggtgctgatataattgatgataattctgtgaggatattctggaaccaagttcag
gggataagtaagtataacgtgtatagagacggtgagttgatagctgctgaagtcaaagcg
gttgagtttacggatacgggtttgactgcaggtagagattatgaatatgaggtaagagca
gtttcaggggacagtgagtctgtagaaaaccaaagggtaattgttaataccgggacagga
agtatatctgcaaatacggtgttgaatgaaaatagggtatataagagttttaatttgaaa
agcaggattattaatttgaatggttataggtttaaagttgagggggatcttgtacagtcc
ggagggacattggatgtaaacggaggaaggttggaggtaacaggaaactatacaataagt
gggtcctcatatttggagatgacggaagaggaagattatgtattagtaagaggggatttt
gagacaagaagcgataataatcacgaaaacaagttgacagcaggtacattagaggtgaaa
gggaattttacgaggaaggctggtgtgagtgctaattttaaagcaagtggaacccatagg
gttgtattaagtggagaaaagcagcagacaatagacttttcgagcacgaatatacaacaa
tttaacatattagagaataaaaatacatcagggaaagagttaatatttaaaaattcatat
aatgcgaagatatttataaacaacacatcaggtttatcaccgatgacagtagagtatcat
gattggaatttgacaggtaacgaagtgataaatggagacttgtatataaagggtaaaaca
ttaaatcttgcaggaaaaacattaaaagtaaatgggaacttaatccagaccggggggtac
attggatgtaaatggaggaagattagaggtagagggaaactacacaataagcgggtcttc
atatttgaagatgacggaagatga
DBGET
integrated database retrieval system