Caldimicrobium thiodismutans: THC_0316
Help
Entry
THC_0316 CDS
T04224
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cthi
Caldimicrobium thiodismutans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AsmA_1
DUF3971
AsmA_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAU22714
UniProt:
A0A0U4W0L0
LinkDB
All DBs
Position
315632..319318
Genome browser
AA seq
1228 aa
AA seq
DB search
MKRLFLLFFAAFILIFLVIGIIGFNLDFLLNHKYFKNKLRGFLSERAQLDLDYKKVHVNL
YKYYLEFEDLRITNPDLELNFPKGRLTFSPQKLIRLNYYPSGLYLKNPYLRIRETKEEKP
LETETLYQFLEKVSPFSGNIVNGTLEWVQENNRKLKFSSINLIFRDKSPQLLFTGNLTTS
FAQTLDLKGRFDYQKRFLESSLRIKKLDLSKISLLESSMLTKTEFDISLEISLEKGIWNL
SFTGSAPCIAFKNQEKPLVCGIFQGFLIGNAETYALELNPIQMKYPEINGEIAFGKKEKA
YYFKSSIKTLSLTDLKEIISPHLTVSEKEELFGILRGGKFKDLKFLAQARDLKGLFALEN
IQLSGEVEKGTVTIPEPSLSFSDINGKIRFEDKKLGFQGEAVVEDEIPSKIEDFKLDLLS
KNPGLEIKGFFEGRAKRILEIGRSLTKDPTLLSDVTELKGDLKGALELKGPFNNLSLQLR
IWPNDLEFKTIHLKDWIALQEGEIAYRNNLIQLKNLSFFYKENLFRGVDGNIFLDSEILQ
LKASSALLKESLVQELLKDSPDLKKEFEKYKLSFSEVKLKEITYEGNLRDFEKKEGAQIL
KGIKFSGTIFDLRGASPWETFHAPIYIPMATFSWKFPFVDLQEASIFSENSTLSVRGLFN
SETKEISLTGSGELSPEFLGRMEEFLKLKNSIYSLKKEPIQIEDFSLNFKSDEVSYKGRQ
RFKNLNIEVEGNYAQGFEIKAKIYSAKNDFLLGLRDTGGNLTIEFKGKGDIEELFSVFER
PSAREGEIAGEVTLKVNLLGLKTLEGLNNEKTLPEFLKAYLKELPVEGVGRLSLRRLKLT
DTLDFIFSGDLDLERHKVMAKNLSLQINKAEVKGDLEIEPTPNWFEVKGNLLAKEVNLKD
YMQKVSERVSERIPREETTIEERISQLPAKGSINFEIENLVLPTSHKVNSLKVIISKKEE
KVFRLEIPQINLCNLNFYAEYESNPEFKYFFVDLHPAKGDLLDLFSCLYPEEMPKIIFEG
PFEMQGFFYTEGVKKFFENTYGKLEMRSKRGYIYRAPLLARVLGFLSPIDLFRGKIPNLE
KNLLPYEEIDFTGDFKNSSLRVDTFFLSAPGFRLFGNGPVSLSDKKLSLTFLVSPFKTVD
VILEHIPFVSQWALGKERMLIYLPLEVVGTYDNPIIVPLHPASIGKGLFRFIFKFFGIQE
EFFKKPESFEGFKKPELLKDKGGDSLRR
NT seq
3687 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacgccttttccttcttttttttgctgcttttattctcatctttctggttattgga
attattggctttaatctggatttcttattgaaccataaatactttaaaaacaaattaaga
ggctttctttcagaaagagctcaacttgatctggattacaaaaaggttcatgtcaacctc
tataaatattatcttgagtttgaagacttaaggattacaaatcctgatttggaactgaat
tttcccaagggtagattgaccttttcacctcaaaaactgattcgcctaaactattatcca
tcagggctttatcttaaaaatccctatttaagaataagggagaccaaggaggaaaaacct
cttgaaacagagactctctatcagtttttagaaaaagtctctcccttttcaggtaatatt
gtgaatgggactttagagtgggttcaagaaaacaatagaaaactcaagttttcttctata
aatcttatttttagagataaaagcccccagttactttttacaggaaatcttactacttcc
tttgcgcaaaccttagatttaaagggtagatttgactatcaaaaaagattcttggaaagt
tctctccgaattaaaaaacttgatttaagcaagatttctcttttagaaagctccatgtta
acaaagactgaatttgatatctccttagagatctctcttgaaaagggtatttggaatcta
agttttacaggttctgctccatgcatagcctttaaaaatcaagaaaagccccttgtatgt
ggaatttttcagggttttttgataggaaatgcggagacctatgccttagagttaaatcct
atccagatgaagtatcctgagataaatggggaaattgcctttggcaaaaaagaaaaggcc
tattatttcaaaagctctattaagactctaagccttacagatctgaaagagattatctct
cctcaccttacagtctctgaaaaagaagagctctttgggattttaaggggtggaaagttt
aaagatctcaaatttttagctcaggccagggatttaaaaggtctttttgccttagaaaat
attcaattatcaggagaggttgaaaagggaacagtaaccattcctgaaccctctttgtct
ttctcagatattaatggaaaaatcaggtttgaagataaaaaattgggttttcagggtgaa
gcggtagttgaggatgagatcccatctaagattgaagatttcaaactggatttgctgagt
aaaaatcccggtcttgaaattaaaggtttttttgaaggtagggctaaaaggatccttgaa
ataggaaggagccttacaaaagatcctacccttctttcagatgtaaccgagcttaaagga
gatttgaaaggagctctggaactaaaaggtccttttaataatttatctcttcagctcaga
atttggccaaatgatcttgaatttaagaccatacatttaaaggattggatcgccttgcaa
gaaggggaaattgcttatagaaataatttaattcagttgaaaaatcttagctttttttat
aaagaaaacctttttaggggtgtagatggcaatatttttcttgatagtgaaatccttcag
cttaaggcctcatcagcccttttaaaagaatctctggttcaggagcttttgaaagactcc
ccagatttaaaaaaagagtttgaaaaatataagctttcctttagtgaagttaaattaaaa
gagataacctatgagggaaatttaagggattttgagaaaaaagagggtgctcaaatttta
aaaggaatcaagtttagtggaactatctttgatttaaggggtgcttccccctgggagact
tttcatgcacctatttatatcccgatggcaacttttagctggaagttcccctttgtagat
ctacaggaagcaagcattttttctgaaaattcaaccctttcagtaagaggacttttcaat
tctgaaacaaaggaaatctccttaacgggatcaggagaattatctccagagtttcttgga
agaatggaagaatttttaaaacttaaaaattctatttattctcttaaaaaagaacctatc
caaattgaagacttttctctaaatttcaaatctgatgaggtgagttacaaaggaagacaa
agatttaaaaatttaaatatagaagttgagggtaattatgctcagggttttgagattaag
gctaaaatttattcagccaaaaatgattttctcctcggactcagagatacaggtggaaat
ctaactatagagtttaaggggaaaggggatatagaggagcttttttctgtctttgaaaga
ccctctgccagggaaggagagattgcaggtgaagttactttaaaggtcaatttattagga
ttaaaaactttagaggggctcaataatgaaaagaccttacctgagtttttaaaggcctat
ctcaaagagcttcctgtagagggagtaggtagactctctttaaggaggttaaagcttact
gatactctggattttattttttcaggggatctggatttagaaaggcataaagtaatggct
aaaaatctttctttgcagataaataaggctgaagtaaaaggagatttggaaattgaacca
actcctaactggtttgaagtaaagggaaatcttttggcaaaagaggtgaatttaaaggat
tatatgcaaaaagtttctgagagggtttcagaaagaattccccgggaagaaacaaccatt
gaagagagaataagtcaacttcctgcaaaagggagtattaattttgagatcgaaaacttg
gttttacctacctctcataaggttaatagtctcaaggttataatttcaaaaaaggaggaa
aaggtttttcgccttgagatcccgcagattaatctttgtaatctgaatttttatgctgaa
tatgaaagtaatccagaatttaaatatttttttgtggacttacatccagccaaaggagat
cttctggatcttttttcttgtttgtatcctgaagagatgcccaaaattatctttgagggc
ccctttgaaatgcaaggctttttttatactgaaggggtaaaaaaattctttgaaaacacc
tatgggaaacttgaaatgaggtctaaaaggggctatatatatagagctccccttttagca
agagtccttggatttttaagccctattgatctttttaggggtaaaatacccaatcttgag
aaaaatctcttaccctatgaggagattgacttcacaggagactttaaaaattcttccctc
cgggtggatacttttttcctttctgcccctggttttaggctttttgggaacggtcctgtt
tctctttctgacaaaaaattgagtcttacctttcttgtttctccttttaaaacagtagat
gtaatcttagaacatatcccctttgttagccagtgggccctgggaaaggaaagaatgctt
atttatttgccccttgaggtggtaggaacctatgataatcctatcattgtgccccttcat
ccagcaagtattggaaagggtcttttcagatttatttttaaattctttggaattcaagag
gaattctttaaaaaacccgagagctttgagggtttcaaaaaaccggagttattaaaggat
aaaggtggagattctctacgaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
