Caldimicrobium thiodismutans: THC_0625
Help
Entry
THC_0625 CDS
T04224
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cthi
Caldimicrobium thiodismutans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_3
PAS_9
PAS
PAS_4
GAF_2
PAS_8
GAF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAU23018
UniProt:
A0A0U4W1L1
LinkDB
All DBs
Position
complement(623927..626971)
Genome browser
AA seq
1014 aa
AA seq
DB search
MQEKEPDLYLASPDVAILLMEKDYIPLFRLAGEEDKLILVCLKNFRKGKKVFKVGLPELN
FFYLGILLSSLPIENIDIVFVKCFKEGLEKLYNKEIDFLFLYERFFNDLPQNQKEFLKIE
ETISVPFYHFLMFKKAFYQKYKDFIDKIENIDHFEKASKEEVQRLNRILKKILFLSIFFR
NKSILENLLDHPGLIIAAYQDRFIFSNKGGLEVTGYTLEEILNMSPLDLVYEEDRPLAEK
ILKRRLKGQKFPFFYPDLRIKHKSGKIIHLFCYTQTIHYNNKPTGLIIGIDITREKQLET
FNKILKKINEIIIKSNQEKEIFENLCKTLTETFHLELTWIGKIEKEDPIITFIYSYGKEI
DFPKKLCIPYLQNLKETHPALIALKKGEITINEYTPKFPFPEDFKEEMLKRNFLSCVAIP
FFKYGKSYGVLSLISSVPYFFTEEIREILVEIQKDISFALEKIELQKEHQLLFHVIEQSK
EWVVITDQNGTILYGSPFVSEISGYSPDEIRGKNPRIFKSGLHSQEFYKKLWDTILSGKT
FSTVIINRTKDGSLFKLEEAIHPIKLPDGEIRFIAIGKDVTKEEYLIKEIEYFKFYDPLT
GLYNFPTFSFKVNEKIAEDKNRLSALLLLDIQNLSWINYTYGVTGGDEVIKEVAKRLKSI
LSEKDIIGRAGGDEFALWIFDLPRIEIINKIVEKIKFSFQKPIIFENNFIKLEYNLGLVL
YPRDGSSFEELYEKATLTLNTAKKENITFKFYNSELGKQFEKFIKTEEIIQKAFKKNLFI
FYYQPYIELSNYKIAGVEALVRIKEDEKLYPPSEFIDYLENSPYLRLFEDWVLQKASEQI
KKWNFNFSINISARTFFEENFIYRIKKLPKDNYPYLCLEITERTVIRDINKAKEILTILK
DTENSIKIALDDFGTGYSSLIHLKELPVDIIKIDRSFISDMMFDKKVMSLVKGLIDLAHS
FGIKVCAEGVETKEQLQALDIMGCDYAMGFYISKPLPEEEIERLLFSKERLKLL
NT seq
3045 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgcaagaaaaagagcctgatctttatcttgcctctccagatgtagctatccttttaatg
gaaaaggattacatccccctttttcggttggcaggtgaagaggataagctaattcttgta
tgcctcaaaaattttcgtaaaggtaaaaaagtctttaaagttggtcttcctgagcttaat
ttcttttatcttggaattctgctttcttctttacccattgaaaatattgatatagtcttt
gtcaaatgttttaaggaaggacttgaaaaactctataataaggagattgactttttattt
ttgtatgagcgcttttttaatgatcttcctcagaatcaaaaagaatttcttaaaatagag
gaaacaatctccgttcccttttaccattttcttatgtttaaaaaggctttctatcaaaaa
tataaagattttatagataaaattgaaaatatagaccattttgaaaaggcctctaaagag
gaagttcaaagacttaataggatcttaaaaaaaattctttttttatccattttcttcaga
aataaatctatacttgaaaatcttttagatcaccctggacttataatagcagcctatcaa
gatcgattcatcttcagtaataagggtggccttgaagttactggctatacccttgaagag
atattaaacatgagcccccttgatcttgtctatgaagaggataggcctttagctgaaaaa
atactcaaaagaagacttaaaggtcaaaaatttccttttttctatccagatttaagaata
aaacacaaatctgggaaaataattcaccttttttgttatacccaaacgatacattataac
aataaacccacaggtcttatcatcggaattgatattactcgtgagaaacagcttgagacc
tttaataaaattctcaaaaaaattaacgaaattattataaaatctaatcaggaaaaagag
atttttgaaaatttatgtaagacccttactgagacctttcatcttgagcttacctggatt
ggaaaaatagaaaaggaagaccctattattacttttatttactcttatggtaaagaaata
gactttccaaaaaaattatgtattccttacttacaaaacttaaaagaaactcatccagct
cttattgccttaaaaaaaggagaaataactattaatgaatatacacctaaatttccattt
cctgaagattttaaagaggaaatgcttaaaagaaattttctttcttgtgtagctatcccc
tttttcaaatatggaaaatcctatggtgtattaagcctcatttcttctgttccttatttt
tttaccgaagaaataagagagattttagtggaaatccaaaaagatatatcctttgccctc
gaaaagattgaattacaaaaggaacatcaacttctttttcatgtaattgaacaaagtaaa
gaatgggttgttataactgaccaaaatggaactattttatatggtagcccctttgtttca
gaaatttcaggctattctcccgatgaaatccgcggaaaaaatcctcgtatttttaaatca
ggacttcacagtcaggaattttataaaaaattatgggatactattctttctggtaagacc
ttttcaactgttattatcaatcgaactaaagatgggagccttttcaaacttgaagaggct
atccatcccattaaattaccggatggagaaatcagattcattgccataggcaaagatgta
acaaaggaagaatatcttatcaaagaaattgaatacttcaaattctatgacccattaaca
ggactttataactttcccacctttagctttaaagtaaatgaaaaaatagcagaggataaa
aatcgtctatctgctcttcttttattagatatacaaaatctctcctggatcaattatacc
tatggagttactggaggggatgaggttataaaagaagttgcaaagcgtttaaaaagtatc
ttatcagaaaaagatattataggaagagcaggaggtgatgaatttgccctatggattttt
gatcttccaagaatagaaattattaataaaatagttgaaaaaatcaaattttcttttcaa
aaaccaataatttttgaaaataattttataaaacttgagtataatcttggtcttgttctt
tatccaagagatggctcatcttttgaagaactttatgaaaaggcaacccttactttaaat
acagctaaaaaagaaaatataacctttaagttctataattctgaacttggtaaacaattt
gaaaaatttattaagactgaagaaattattcaaaaagcatttaaaaagaatctttttatt
ttttactatcaaccctatatagaactttcaaactataaaattgctggagttgaggcctta
gtgcgcattaaagaagatgaaaagctttatcctccatcagaatttattgattaccttgaa
aattccccttatttaaggctctttgaagattgggttcttcaaaaagcctctgagcaaatt
aaaaaatggaattttaatttttctataaatatctctgccagaaccttttttgaagaaaac
tttatttatcgcataaaaaaattacccaaagataattatccttatttgtgtcttgaaatt
acagaaagaacggtaattagagatataaataaagctaaagaaatattaacaattcttaaa
gatacagaaaattctataaaaattgctttagatgattttgggacaggttattcttctctt
attcatctaaaggaacttcctgttgatattataaaaattgatcgttcctttatttcagat
atgatgtttgataaaaaagtgatgtctttagtaaagggacttattgatcttgcccattcc
tttggaataaaggtctgtgcagaaggagttgaaactaaagaacagcttcaggcccttgat
attatgggatgtgattacgctatgggtttttatatcagtaaaccccttcctgaggaagag
atagaaaggttgcttttttctaaagagagattaaaattattgtag
DBGET
integrated database retrieval system
