Caldimicrobium thiodismutans: THC_1728
Help
Entry
THC_1728 CDS
T04224
Name
(GenBank) fimbrial protein
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
cthi
Caldimicrobium thiodismutans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cthi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
cthi02044
]
THC_1728
02035 Bacterial motility proteins [BR:
cthi02035
]
THC_1728
Secretion system [BR:
cthi02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
THC_1728
Bacterial motility proteins [BR:
cthi02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
THC_1728
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PD_1611-like_2nd
PilY1_homolog_dom
PilY1_beta-sandw
T4P_PilY1
Beta-prop_ACSF4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAU24088
UniProt:
A0A0U5AXG1
LinkDB
All DBs
Position
1712186..1717036
Genome browser
AA seq
1616 aa
AA seq
DB search
MPEKAPLLWIKRILFVISVIFLSFIFRDTKPVTGGMSDYCYAPPIISETVPPLVMLVSGK
DHKLYYEAYNDASDLDEDGKIDVGYKHSIDYYGYFDPYKCYKYEGSSAKFVPVRYTSNKY
CGGADEWSGNFLNWLTMARIDVLRKVLYGGYRSTDSASETVLEATFIPQDAHSWGKEYSG
SDTRQLTPFDPPGSGQRHLFCITSLSNGETRRIRVLLNKTNRIWEWASKERPVCDNSLGT
PNYEYYVRVKVCDPAVGLEPNCKRYPAGAETYKPIGLLQKYGDGDGTKWCSKSLKPCNTD
SDCNPAATHGLCVDKAKMYFGLITGSYEKNFSGGVLRKNIWSFLDEINSNTGIFQTSENT
PGNIVLTFDRLRIIDFRYSDYSYEPGWQGAWVTTRPPNEGEFKNWGNPIAEMMYEAIRYF
AGKTSPTGDFTYSKSQDGGLNLPKPEWGKFKSGRSTYRLYDVFPICAKPFIVVLSDIYNS
YDSDKVPGSSFGSFSGDISGLNVSTLADLISSIEFIPGSYFIGQSGTNYDFICSAKDISS
FSNIRGLCPEEPTKQGSYYPASIAYYGNKKSGGWRDNFSDQKPYTIKTLAVALSSPVPDI
VFKVGDKTVRITPLGKSVSGELNVYQYCYQKCTFQRDANGNLRISNCQDGSYCPTNQIVD
FYVDTINYDASGNLVYAKFRINFEDVEQGADHDMDAIVEYEIQPISSNQIRVKLTSNYAA
GGIDQVLGFTISGTTEDGTWLVVKDKDVPDTADGDTPSVVAGMPLTWQKDFSVTGSTAGQ
LKPPLWYAAKWGGFDDMNGNDLPDLPSEWDKDGNGIPDTYFYVVNPLKLESQLNKAFAEI
LRRASSGATVATLTSRKGFSSLVLQPLFYPSYQSGEIEVNWIGMLKAFWTDFKANLREDT
NLDKWLNIKNIVDKIFQLVVKEDEEPHAWYISNESTCSYDPTKIEALNLKPVFDAGCQLA
NRDPFSRKILVHIGNTTIKSIDDTDAKTFLKNLWNGVAVSESLGISVDDTFTNCLIEYLK
GNPSVPCLSNATIKDYFSRNLTFDVGSLCSASGISGNHTWKLGDIIFSTPSIISNEPLNI
YHVRYFDFTYRAFIANETYAKRTTYAFVGANDGMLHAFRLGYLKSAGDQDRPVRLINAFN
SEAIDLIGKEEWAFIPQNALPYLIWYAHKDYCHIPTVDYRTYVFDASIGGGPEETKTSDS
WRTLLLGVMGFGGKEICIKKQGNNCIESYSSSIFVLDLTDWLKGTTSEPKVLWERALPDK
TLTLSFPAIVRLGERDKNGKWYVVIGSGPKDPQGTNFVNQAKIYFFDLRTGSLIKELNVA
NNVSIGDIWPADVDNDYQDDVLYFGTYDANSGKFYRLSLRNDSITLSFNPNAPVFSAPTF
TKDKSGRFWVFFGTGRYLRSEDKNFNYSNYLIGFIDDCWSGNCMSTYNFNDLYNATGALA
NIVVTRTTQVCKCDWDGCNSTEVAIDGYYNGTVPPAIIRGWFHQLEKGETYNELINSQPF
VFGGNLDALVFRTYNEICKIGGETWLMALCYDTGIPCGKPSALIHTAAVGETITIRSKYL
VSPGAPPLGQPFQVATFKSQTGQYEKIAQASYGTIIRLTQQAQESARGRFILWLEK
NT seq
4851 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctgaaaaagcccctctcctctggataaaaagaattctttttgtcataagtgtgatt
tttctatcctttattttcagggatacaaagcctgttaccggaggcatgagtgattactgc
tacgcccccccaattataagcgaaaccgttccgcccttagttatgcttgtttctggaaaa
gaccataaattatattatgaagcttataatgatgcctccgatttggatgaagatggaaaa
atagatgtaggctataagcacagtatcgattactatggatactttgatccatataagtgt
tataaatatgaagggtcttctgcaaagtttgttcctgtaagatacacaagcaataaatat
tgtggtggggcagatgaatggagtggcaactttcttaactggctaaccatggctcgtatt
gatgttttaagaaaggtgctttatggtggatataggtctacagattcagcatctgaaaca
gtgcttgaggcaacctttataccccaagatgcccacagctggggcaaagaatacagcgga
agcgatacaagacaattaactcccttcgatcctccaggtagcgggcaaagacacctattt
tgtattaccagccttagcaatggagaaacaaggcgtatcagagttttactgaataaaact
aatagaatctgggagtgggcatcaaaggaaagacccgtatgtgataatagtttgggcact
cctaattatgaatattatgtaagagtaaaagtatgcgacccagcggtaggtcttgaacca
aactgtaaaagatatccagctggagctgaaacatataaacccataggtctacttcaaaaa
tatggagatggtgatggcactaaatggtgttccaaatcattaaaaccctgtaatactgat
agtgattgtaatcctgcagccacacatgggctttgtgtagataaagcaaagatgtatttt
ggtttaattacaggctcttatgagaaaaattttagtggtggtgtattaaggaaaaatata
tggtcttttttagatgagataaattctaatacaggtatctttcaaacatcggagaataca
ccaggaaatattgtgctaacttttgataggttaagaataattgattttagatatagtgat
tattcatacgaacctggatggcagggtgcctgggtgaccacgcgtcctcctaatgaaggt
gaatttaaaaactggggaaatcccatcgcagaaatgatgtatgaagccattagatatttt
gcaggaaaaacaagtccaacaggtgattttacatattcgaaaagtcaagatggtggctta
aatttgcccaaacctgaatggggtaaatttaaaagtgggagatctacttatagactttat
gatgtatttcctatatgtgctaaaccatttattgtagtattaagcgatatttacaatagt
tatgattccgataaagttcccgggtcttcatttggtagtttctcaggagatatttctggt
ttgaatgtgtctacacttgcggatcttatatcctcaattgagtttattcctggaagttat
tttataggccaatctggaacaaattatgattttatatgttcagctaaagatatatcttcc
tttagtaatataaggggtctttgcccagaagagccaaccaaacagggaagttattatcca
gcttccattgcttattatggaaataagaaaagtggtggctggagagacaatttttcagat
caaaaaccttacacaattaaaacccttgctgtagctctttcttcacctgttccagatata
gtttttaaagtaggggataaaactgtccggatcacacccttaggaaagagtgtaagtggt
gaacttaatgtatatcagtattgttaccaaaaatgcacttttcaaagagacgcaaacggt
aatctaaggatatcaaattgtcaagatggctcatactgtcctaccaatcaaatagtagat
ttttatgttgatacgattaattacgatgcaagtggtaatcttgtctatgcaaagtttaga
attaactttgaggatgtggaacagggtgcagaccacgatatggacgctattgtagaatat
gagatacaacctattagttccaatcaaataagagtgaaactaacatcaaattatgctgct
ggaggtattgaccaggtgcttggctttaccatttccggaacaacagaagatggcacctgg
cttgtggtaaaagataaagatgtgccagacactgctgacggtgatacaccttccgttgta
gcaggcatgcctcttacctggcaaaaggacttttctgttactggttcaactgctgggcag
ttaaagccacctctttggtatgctgcaaaatggggtggttttgatgatatgaatggaaat
gatttgcctgatttgccttctgagtgggacaaagatggaaatggcattcctgatacctat
ttttatgtagtaaatcctttaaagcttgagtctcagcttaacaaagcctttgctgaaatc
cttcgcagggcttcttctggggcaacggttgcaactttgacttcaagaaagggattttcc
tctcttgttctccagccccttttttatccaagctatcaatctggagaaatagaagttaac
tggattggaatgcttaaagccttctggacggattttaaagcaaatttaagggaagatacc
aatttagataaatggcttaatataaaaaatattgttgataaaatttttcaacttgtggta
aaagaggacgaggaacctcatgcctggtatatctcaaatgaaagcacctgttcttatgac
cctaccaagattgaagctcttaacttaaagcctgtttttgacgcaggctgtcaattagcc
aatagagaccccttcagtagaaaaatcttggttcatataggtaacaccactatcaaatct
attgatgataccgatgcaaaaaccttcctcaaaaacctttggaatggtgttgctgtaagt
gaaagccttggaatttctgttgatgatacctttactaattgccttattgaatacttaaaa
ggtaatccttcagttccttgtctttcaaatgccactataaaggactatttttcccgcaac
ctaacctttgatgtaggaagcctttgttcagcctcaggtataagcggaaatcacacctgg
aagctcggagatattattttttctacaccaagcattatatctaatgagcctcttaatatt
tatcatgtgagatattttgattttacatacagagctttcattgctaatgaaacttatgca
aaaaggaccacttatgcctttgtaggggcaaatgatggtatgcttcatgcttttaggttg
ggttatttgaaatcagctggagatcaggatagacctgtcagattaattaatgcctttaac
agcgaagctattgatttaataggaaaggaggaatgggccttcattcctcagaatgccctt
ccctatcttatctggtatgcccataaagattattgtcatattccaacagttgattacaga
acttatgtctttgatgcctcaattggtggaggtcctgaagaaacgaaaacttccgattcc
tggagaacccttttattaggggtaatggggtttggaggaaaggagatctgtatcaaaaaa
caggggaataattgtatagaatcctacagttcatccatctttgttttagatttaacagat
tggttaaaaggaaccacctctgagccaaaggttttatgggagagggccctgccggataaa
actttaaccctatcttttcctgccattgtcagacttggagaaagggataaaaatggaaag
tggtatgtggtgatcggctcgggacctaaggatccccaaggaaccaattttgttaatcaa
gccaaaatatatttctttgatctaaggacaggaagtttaataaaggaactcaatgtggct
aataatgtttctataggcgatatctggcctgcagatgtagataatgattatcaagatgat
gttctttatttcggaacatatgatgctaattccgggaagttttataggttgagccttaga
aatgattctattaccctttcttttaatcccaatgcacctgttttttcagcacccactttt
accaaagataaatcaggaaggttctgggtcttttttgggacaggaagatatttaagaagc
gaagataaaaatttcaattactccaattatctaattggttttattgatgactgttggtca
ggcaattgcatgtctacttataattttaacgacctttataatgcaacaggagcattagct
aatattgtggttacaagaacaactcaagtttgcaaatgtgactgggatggttgtaactca
acagaagtagctatagatggctattataacggaactgtccctcctgctataatacgaggt
tggtttcatcaacttgaaaagggagaaacttataatgaactaattaattctcaacctttc
gtatttggtggtaatttggatgcccttgtttttagaacctataatgaaatctgcaaaatc
ggtggagagacttggcttatggctttatgttatgatactggaattccctgtggaaagcct
tctgctcttattcatactgcagcagtgggtgaaactattactattagatcaaaatattta
gttagccctggagccccaccccttggtcagccctttcaggtagctacttttaaatctcaa
acagggcaatatgaaaagattgctcaggcctcttatggaacaattataagacttactcag
caagcgcaagagtcagcaagaggaagatttatcctgtggttagaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system