Carboxydocella thermautotrophica: CFE_1472
Help
Entry
CFE_1472 CDS
T05389
Name
(GenBank) diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein
Organism
cthm
Carboxydocella thermautotrophica
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
GGDEF
HisKA
HATPase_c_5
HATPase_c_3
ESF2_C
Cas10-Cmr2_palm2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVX20661
UniProt:
A0A2R4N0Y9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1454197..1455732)
Genome browser
AA seq
511 aa
AA seq
DB search
MFYNQIIKLIKTAVYLLPVIILFISHYITINPILHILIWEMFALPVYFLLCENKSTLAIY
LIILSTAGIIIEIINYYKSLDIFSLCLILLIHILVVLINSIAALNYNQVLQNQIKLQERL
KRLAIIDPLTHLINGKYFLMKLDEEISRAKRENKKFTVAVYKIVNLNKLESGVRNGCLEW
NLTRIAEILRQTIRNFDTVARLKDDVFAVLLTNSDLEQAHEIKERFEKKLQENVNTRKWK
FSGYSQHDNLYVLAGYAVYPKDHNEGQGLLEVAEQNLEVSEKNYKYKVTQDWLKSERYAL
MEQMSASLAHEIKNPLTSVRGFIQLLQNREQDFHEKEHLRIILDELDRMNKLIHEFLSFS
TKKNTRKFFDINQLIDDIIFIMSSLVHDKNIKIEKRSELKNSLLYGQPEKIKQVFINLIR
NSIEAINCNGKITIILQEDGNYLLMSVKDNGCGIDRETIKNIFKPFYTTKETGTGLGLSI
SAQIIKEHQGEIWVDSERGIGTTFKIKLPRN
NT seq
1536 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttctataatcaaattattaagttaataaaaactgccgtatatttattgccggttata
atattatttatcagccattatattacaattaatccaatattacatatattaatttgggaa
atgttcgcattacctgtttattttcttttgtgtgaaaataaaagtaccctggctatttat
ttgataatattatcaacagcgggtataataatagaaatcattaattattataagtcttta
gatatattctctctttgtttaattttattaatacatatccttgttgttttaattaatagt
attgctgccttaaattataatcaggtattacagaatcagattaaactacaggagcgttta
aaacgattagctattattgatccattaacgcatttaataaatgggaaatattttttaatg
aaattggatgaggaaatatcgcgtgctaaaagagagaataaaaaatttactgttgcagta
tataaaatagttaatttaaacaaactggaatcgggtgttagaaatggttgtctggaatgg
aatctaactaggattgctgaaattttaagacaaaccatcagaaattttgatactgttgcg
cgtttgaaagatgatgtttttgcagttttattaaccaattctgatttggaacaagcccac
gagataaaagaaagatttgaaaaaaagttgcaggaaaatgtaaatacaagaaaatggaaa
tttagtgggtattcacaacatgataacctgtatgttctagctggttatgctgtttatcct
aaagatcataacgagggacaaggattattagaagtagctgaacaaaatcttgaagtgagc
gaaaaaaactataaatacaaagtaactcaggattggttgaaatcggaaagatatgcatta
atggagcagatgtctgccagcttggcccatgaaatcaaaaacccattaacctctgtacga
ggtttcattcaattactacagaaccgggaacaagactttcatgaaaaagaacacttgcga
attatcctggacgaactggatcgtatgaacaagttaattcatgaatttttatctttttca
acaaaaaaaaatacacgaaaattttttgatattaatcagcttattgatgatataatattt
attatgtctagtttagtccatgacaaaaatattaaaattgaaaaaaggagtgagttaaag
aattcattattgtatggacaacccgagaaaattaagcaggtgtttattaacttaataagg
aattccattgaagcaatcaattgcaatggcaagataacaattattttacaggaagatggg
aactatcttctaatgtccgttaaagacaatggttgtggaatagatagagaaacaataaaa
aatatttttaaaccattttatacgactaaagaaactggaacaggattaggactgagtata
tcagctcaaattataaaagaacatcaaggagaaatttgggtagacagcgaaagaggaata
ggtactacctttaaaataaaactgcccagaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system