Crotalus tigris (Tiger rattlesnake): 120305615
Help
Entry
120305615 CDS
T08476
Symbol
NALCN
Name
(RefSeq) sodium leak channel non-selective protein isoform X1
KO
K21863
sodium leak channel non-selective protein
Organism
ctig
Crotalus tigris (Tiger rattlesnake)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctig00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
ctig04040
]
120305615 (NALCN)
Ion channels [BR:
ctig04040
]
Voltage-gated cation channels
Sodium leak channel, non-selective
120305615 (NALCN)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ion_trans
PKD_channel
PsaF
DUF5914
FAM165
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120305615
NCBI-ProteinID:
XP_039193673
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1758 aa
AA seq
DB search
MLKRKQSSRVEAQPVTDFGPDESLSDNADILWVNKPWVHSLLRICAIISVISVCMNTPKT
FEHYPPLQYVTFALDTLLMFLYTAEMIAKMHIRGIVKMELGKGWRLTTPQPFQMFKGDSS
YVKDRWCVFDGFMVFCLWVSLVLQVFEIAEIVDQMSPWGMLRIPRPLIMIRAFRIYFRFE
LPRTRITNILKRSGEQIWSVSIFLLFFLLLYGILGVQMFGPFTYHCVTNDTKPGNITWNN
LAIPDTHCSKASEEGYQCPPGFECLDLEELGLSRQELGYSGFNEIGTSIFTVYEAASQEG
WVFLMYRAIDSFPRWRSYFYFITLIFFLAWLVKNVFIAVIIETFAEIRVQFQQMWGSRSS
TTSTATTQMFHEDATGGWQLVDVDVNKPQGRAPACLQRMMRSSIFHMFILSMVAVDVIVA
ASNYYKGETFKSQYDEFYLAEVAFTLLFDLEALLKIWCLGFTGYISSSLHKFELLLVIGT
TLHIYPVLYHSQFTYFQVLRVVRLIKISPALEDFVYKIFGPGKKLGSLVVFTASLLIVMS
AISLQMFCFVEELDRFTTFPRAFMSMFQILTQEGWVDVMDQTLNAVGHMWAPVVAIYFIL
YHLFATLILLSLFVAVILDNLELDEDLKKLKQLKQSEANADTKEKLPLRLRIFEKFPNRP
QMVKISKLPSDFTVPKIRESFMKQFIDRQQQDTTCLLRRLPSASSSSCDHSKRLAIEDKY
IDQKLRKSVFSIKARNLLDKESAINKILRACTRQRMLSGSFEGQPAKERSILSVQHHIRQ
ERRSLRHGSNSQRISRGKSLETLTQDVSHSNTVRYRNAQREDSDIKMIQEKKEQAEMKRK
VQEEELRENHPYFDKPLFIVGREHRFRNFCRVVVRARFNASKTDPVTGAVKNTKYHQLYD
LLGLVTYLDWVMIIVTICSCISMMFESPFRRVMHAPTLQIAEYVFVIFMSIELNLKIMAD
GLFFTPTAVIRDFGGVMDIFIYLVSLMFLCWMPQNVPAKSGVQLLMVLRCLRPLRIFKLV
PQMRKVVRELFSGFKEIFLVSILLLTLMLVFASFGVQLFAGKLAKCNDPHITAREDCHGI
FRINVSVSKNLNLKLRPGEKKPGFWVPRVWANPRNFNFDNVGNAMLALFEVLSLKGWVEV
RDVIIHRVGPIHGIYIHVFVFLGCMIGLTLFVGVVIANFNENKGTALLTVDQRRWEDLKS
RLKIAQPLHLPPRPDNDGFRAKMYDITQHPFFKRTIAVLVLAQSVLLSVKWDDQDPVTGP
LAAMSVVFTFIFVLEVTMKIIAMSPAGFWQSRRNRYDLLVTSLGVIWVILHFAITNAYTY
MMGACVIVFRFFSICGKHVTLKMLLLTVVVSMYKSFFIIVGMFLLLLCYAFAGVVLFGTV
KYGENINRHANFSSAGKAITVLFRIVTGEDWNKIMHDCMVQPPFCTPDNRTYWKTDCGNY
AGALMYFCSFYVIIAYIMLNLLVAIIVENFSLFYSTEEDQLLSYNDLRHFQIIWNMVDDK
REGAIPTFRVKFLLRLLRGRLEVDLDKDKLLFKHMCYEMERLHNGGDVTFHDVLSMLSYR
SVDIRKSLQLEELLAREQLEYTIEEEVAKQTIRMWLKKCLKRIRAKQQQSCSIIHSLRES
QQQELSRFLNPPSIETTQPSEDMNANNQDNSAQPETSNEQQLLSPTLSDRGGYRQDSGEG
GKPQRKLGQWRLPSAPKPISHSVSSVNIRIGGRTTMKSVVCKMNPMSDMASCGSEVKKWW
TRQLTVESDESGEDLLEI
NT seq
5277 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgaaaaggaaacagagttctagggtagaagcccagcctgtaacagattttggtcct
gatgaatccttatcagacaacgcagatatcctgtgggttaacaaaccatgggtgcattct
ttactgcgcatctgtgccatcatcagtgtcatttcggtgtgcatgaataccccaaagacc
tttgagcattatcctccccttcagtatgtgacatttgctcttgatacattgctgatgttt
ctctacacggcagagatgatagcaaaaatgcacatccgtggcatagtcaagatggagttg
ggaaaaggttggaggttaaccacaccacagccatttcagatgttcaagggggatagttct
tatgtgaaggaccgttggtgtgtatttgatggattcatggtattttgtctgtgggtgtcc
ttagttttacaggtttttgaaattgctgagatagttgatcaaatgtctccttggggcatg
ctgaggatcccacgaccacttattatgattcgagcattccgaatttatttccgctttgaa
ttaccaagaaccaggataaccaacattttaaagcgttcaggtgaacaaatttggagtgtt
tccattttccttctgttctttctgcttctgtatggaattttgggggtccagatgtttgga
cctttcacatatcattgtgtaacaaatgatacaaaaccaggaaacataacctggaacaat
ttggcaatcccagacacacattgttcaaaagcatcagaagaaggctaccagtgtccacca
ggatttgagtgtttggaccttgaagaattggggttaagcaggcaggagctgggctacagt
ggttttaatgaaataggaacaagcatatttactgtttatgaagctgcatctcaggaaggt
tgggtctttctgatgtatcgagcaattgacagttttccccgatggcgctcttatttctat
ttcatcaccttaattttcttccttgcctggcttgttaagaatgtatttattgctgtcatc
attgaaacatttgctgaaatccgtgtgcagtttcaacagatgtggggttccagaagcagt
acaacttcaacagcaactactcagatgtttcatgaagatgctacaggaggatggcagctg
gtggatgttgatgtgaataagcctcaaggcagagcaccagcatgtctgcagagaatgatg
agatcctcaattttccatatgtttatcctgagcatggtagcagtggatgtcattgttgct
gctagtaattattataagggagaaactttcaagagccaatatgatgagttctaccttgca
gaggtggcctttacactcctttttgatctggaagctctcctaaagatctggtgcctggga
tttactggatacatcagttcatctcttcataaatttgaactgctcctggttattggaact
actcttcacatttatccagtcctctatcattcacagtttacatactttcaggtacttaga
gttgttcgacttataaagatttctcctgctctggaagattttgtatacaagatttttgga
cctggaaaaaagcttgggagtttagttgtatttactgccagtctattaattgtaatgtca
gccattagtttgcaaatgttctgttttgtggaagaactagacagatttactacatttcca
agggctttcatgtcaatgtttcaaatcctgacacaggaaggatgggtggacgtcatggat
cagactctcaatgctgtgggtcacatgtgggcacctgttgttgctatttatttcatttta
tatcatctttttgctaccctgattctgctgagcttgtttgttgctgttattctagacaac
ctggaacttgatgaagatctaaagaaacttaaacaactgaaacaaagtgaagcaaatgca
gataccaaagaaaagctcccattacgcctacggatatttgaaaaattccctaacaggcct
cagatggtaaaaatctccaagctcccttcagatttcacagttcccaaaataagggaaagc
tttatgaaacagttcattgatcgacagcagcaagatacaacttgtttactgagaaggctt
ccatcagcttcttcctcctcctgtgatcactctaaaaggctggcaattgaagacaaatac
attgaccagaagcttcgcaaatctgttttcagcattaaggcaagaaatcttctggacaag
gagtctgcaatcaataaaattcttagagcctgtactcgtcagcgtatgcttagtggatct
tttgaggggcagcctgcaaaagaacgatctattcttagtgttcagcatcatatacgccaa
gaacgcaggtcactaaggcatggttccaacagtcagcgaatcagcagaggaaagtctctt
gaaacattaactcaggatgtaagtcattctaatacagtgaggtacagaaatgcacaaagg
gaagacagtgacattaaaatgatccaagaaaagaaagaacaagcagaaatgaaaagaaaa
gttcaggaagaagagttgcgggagaatcacccctattttgacaagcctctcttcatagtg
ggccgggaacacagatttaggaatttctgccgagttgtagttagagctcgctttaatgcc
tctaaaacagatcctgttactggagcagttaaaaacacaaaatatcatcaactttatgat
ttgctgggattagttacttatctagattgggtaatgatcattgtcaccatatgttcctgt
atttcaatgatgtttgaatccccttttcgaagagtaatgcatgcacctacattacagatt
gctgaatatgtttttgtaatatttatgagtattgaacttaacttgaagattatggctgat
ggcttgttttttacaccaacggcagtcatcagagattttggaggtgtcatggatattttt
atttaccttgtaagcctgatgtttctctgctggatgccccagaatgttcctgctaaatca
ggagttcagctgctaatggttctacggtgtcttcggcctcttcgtatttttaaactggtg
cctcagatgagaaaagttgttcgggaactatttagtggtttcaaagaaatctttctagtt
tcaatccttttattgacattaatgcttgtttttgcaagctttggagttcaactttttgct
gggaaactggctaagtgcaatgatccccatataactgcaagagaagattgccatggtata
ttccgaataaatgtaagtgtttcgaaaaatctgaatttgaagctaagacctggtgaaaaa
aagcctggattttgggtgcctcgagtctgggctaaccctcgaaactttaactttgacaat
gttggtaatgcaatgttggcattatttgaagtcctgtcattaaaggggtgggtagaagtc
agagacgtcatcattcatcgtgtgggtccaattcatggcatctacattcatgtttttgta
ttcctgggctgcatgattggacttaccctttttgttggagttgtcattgctaatttcaat
gaaaataagggaacagctctactaacagttgaccagaggcgatgggaagatctgaagagc
agattaaagatagcacagcctcttcacctcccaccacgcccagataatgatggattccga
gctaaaatgtatgacataacccagcacccatttttcaagagaaccattgcagttcttgta
ttggcccaatctgtgctattatctgttaagtgggatgatcaagatccagtaactggtcca
ttagctgcaatgtcagtggtcttcaccttcatatttgttctagaggttacaatgaaaatt
attgccatgtcacctgctggattttggcagagcagaagaaatcgttatgatctcttggtg
acatcattaggtgtcatatgggtgattctccactttgccataactaatgcctatacgtat
atgatgggggcatgcgttattgtgttcaggtttttttcaatctgtggaaagcacgtgact
ctgaagatgctgctgctgacagtagttgtcagcatgtacaaaagctttttcatcattgta
ggaatgttcctactgttgctttgctatgcttttgctggagtagttttgtttggaactgtg
aaatatggagagaacattaacaggcatgccaacttttcatcagctggtaaggccattact
gtactcttcagaatcgtcactggagaagactggaacaagataatgcatgactgcatggtt
caacctcctttttgtactccagataacagaacatactggaaaacagactgtgggaattat
gccggtgctcttatgtatttctgttcattttatgtcatcattgcatacataatgctgaat
ttacttgtggctataattgtggaaaacttctctttattttattccactgaagaagaccag
ctcttaagttataatgatcttagacattttcagattatatggaatatggttgatgacaaa
agggagggagcaattcctactttccgagtcaagtttttgttgaggctattgcgtggaaga
cttgaggtagatctggataaggacaaacttctgttcaagcatatgtgctatgaaatggag
agattgcataatggtggagatgtaacattccatgatgtattaagcatgctgtcatataga
tcggttgacatcagaaaaagtcttcagctggaagaactccttgctagggaacaactagag
tacaccatcgaggaagaagttgccaagcagacaatacgcatgtggttgaaaaaatgcttg
aagcgcattagagcaaaacaacagcagtcatgcagtattatccacagcctccgagagagt
caacagcaggagttaagccgtttcctaaatccaccaagcattgagacaacgcagccaagt
gaagatatgaatgctaataaccaggataacagtgcacagcctgagacaagtaatgaacag
cagctgcttagccccacgctttctgacagaggtggatatcgacaagattctggtgagggg
ggtaaacctcagcgaaagcttggacaatggcgtttgccatctgccccaaaaccaataagc
cattcagtgtcttcagtcaatataagaattggtggtcggacaactatgaaatctgttgtg
tgcaaaatgaatcctatgtcagacatggcttcatgtggatcagaagttaagaagtggtgg
acaaggcaacttactgtagagagtgacgagagtggagaagacctgcttgagatctga
DBGET
integrated database retrieval system
