Candida tropicalis: CTRG_00511
Help
Entry
CTRG_00511 CDS
T01115
Name
(RefSeq) conserved hypothetical protein
KO
K14289
exportin-5
Organism
ctp
Candida tropicalis
Pathway
ctp03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
CTRG_00511
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
ctp03016
]
CTRG_00511
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ctp03036
]
CTRG_00511
Transfer RNA biogenesis [BR:
ctp03016
]
Eukaryotic type
tRNA transport factors
tRNA export factors
CTRG_00511
Chromosome and associated proteins [BR:
ctp03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
microRNA pathway
Other miRNA pathway proteins
CTRG_00511
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Exportin-5
IBN_N
Xpo1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8296103
NCBI-ProteinID:
XP_002545730
UniProt:
C5M372
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1238 aa
AA seq
DB search
MTMDSGGVQQIISALQVVYDRQSTNDQRREAQKFLDEIKTNDESPFWGYQLALPENNGDK
YIVRYFGLTLLQQSINTRFHTFDSTKTNAIKNWIIELSNKIEPTDPHYIKEKTALIWVAI
AKRIWGSHLVKSRDKVALENEASSSDKSSTVTPQEANDGWVSMDSDLLTLWNNNITCREV
SLIIIRTLFEDIYLLEDPIATKRSACLNQLSILIVTPQKVLETIYENNPNFTICKASSDG
WFVTWARYLVEVLSNNDFNDKICQTFVPKILSAFKTCLHWISPCVLKQENILQTLIQILT
LPDVKMKILAVDCLHILFTRNYNQHEDFDFFIGSVFTAEGISKLSEFYHSLSLDPDDIDE
VVYSLLKKTVEMIVSLSEYLNIASKNKISWEDSDVDSYLRLVLETTSHPSLIISGLSLQM
WITILRYDELSAKAPFLKLMPELREIASNRTINYTFDDEHISKKFLDVDFDSTPDASSFL
SNYRRFNEDITRITVCKSPEDGLRWLENRLEIFFGSELGIKAINEFKIGEKSEVYNYGSA
QLGIIDCSLRGITRWNEWYTEDDKKVIKDRLNKQVESLCEKLLVMNFASPLLVRKQVQTL
VHFAPLLKDVNPPLMFRALEKILTTATYPYPPNVSDEDMELIRDLRGSCGTELNRYAYMM
PEGLSIIFNDLENAISNILSAKKVSDHENVAFKSFLLVIAFRSSIPNKDELFSKIVDPDL
AAWSAPDTEKGLMDLHWFMERIGIVEIAKYFQSRGITANTNLLEAKMDDEGKVLKNKLKD
HWSSIFPIRATRIFIQYSIEKLNHSSPEFLHLLKLWKPRIQPIVPHVLQLLTQIQAYHNP
ANWKDLPVEVQAFVKDSCTERFWQQGVSIQSKETFMEENVKAALTLRDFADSVGHLIRYT
REYAFLTVGSIAQLEDVLYEIPNIGSMIWNAVAGDTVGVTLHSWKHMINSCLRVVIKCCP
VKYVEVFMSELLPRVFIDIDKLLVARWERVYGNGLQLKGNEDDETLSEEMMEEHMLRQLT
ATVVRLLMDIVGQYHSTPTTDIQFACKKLVIENKEVLAPFLEICCHIIMFKDTKCSFNTI
LVVRNILPEIVLKDDEVDKYLSDHLIKALVHVLMEDYFTETHNEAAMALTTLYCALRSKN
DYPARAMMTYLSNVTSHDVANFESSLINSKSLRHQRSALLELIKVNKNPNSIENGDEMSK
RKKQLEEAINNRKKPTGIDVMNDPYTENGALGNLFGEE
NT seq
3717 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccatggatagtggtggagttcaacaaattatatctgctttacaggttgtttatgat
cgacaatcaaccaatgatcaaagaagagaagcccaaaagttcttggatgaaattaagaca
aatgatgaaagtccattctggggttatcaattggcattacctgagaacaacggagataaa
tacattgttagatactttgggttaacattgttacaacaatccatcaacacaagattccac
acatttgacctgacaaaaactaatgccatcaagaactggatcattgaattgtcaaataaa
attgaacccacagacccacattatatcaaagagaagactgcgttaatttgggtggctata
gcgaagagaatttggggcagccacttggtcaaatcccgtgataaggttgccctcgagaat
gaagcatcaagtctggataaaagctcaactgtcaccccgcaagaagcaaacgatggatgg
gtctccatggattcggacttgttgaccttgtggaataataacatcacatgtcgagaagtc
tcgttaattatcatcagaacattattcgaagatatataccttttggaggatccaattgcc
actaaaagaagtgcttgtttgaaccagttgtctatattgattgttacccctcaaaaagtg
ttggaaacaatttacgagaataatcctaattttaccatatgcaaggcactgagtgatggt
tggtttgtgacatgggcaagatatttagttgaagtattgtccaataatgatttcaatgat
aaaatatgccagacatttgttcccaaaatcttgtcggcgttcaaaacttgtttacattgg
atcagcccctgtgtgttgaaacaagaaaatatattacaaacattaattcaaatattaacc
ttacctgatgttaagatgaagatattggcagttgactgtttacacattttatttacaaga
aactacaatcaacacgaagactttgatttctttattggctctgttttcactgctgaaggt
atttccaagttgagtgagttttaccactccttaagtttggatccagatgacattgatgaa
gttgtttattcccttttgaagaaaactgttgaaatgattgtctccctaagtgagtaccta
aatatcgcttcgaagaacaaaatttcttgggaagattcagatgttgatagttatttgcga
ttagtgttagagaccacaagtcacccaagtttaattatcagtggtttatctttacaaatg
tggattaccatattgagatatgacgagttgagtgctaaagcaccatttttgaaattaatg
cctgaattgagagaaattgcttccaacaggactataaactacacatttgatgacgaacac
atatctaagaagttccttgatgttgattttgattctaccccagatgcaagctcgtttttg
ctgaattatcgtagattcaatgaagatataacgcgtataacggtttgcaaaagccccgaa
gatggattacgttggctagagaatcgtttagaaatcttttttggatccgaacttggcata
aaggcaattaatgaattcaaaattggagaaaaatctgaggtatataattatggatcagct
caattgggaattatcgattgttccctccgtggtataactcgttggaacgaatggtataca
gaagatgataaaaaggtgatcaaagacaggctaaataagcaagttgagtcattgtgtgag
aagttattagtcatgaattttgccagtcctttgttggtacgaaaacaggttcagacttta
gttcattttgctccattacttaaagatgtcaatccacctctaatgttcagagctctagag
aaaattttgactacggctacttatccttatccaccaaatgtttctgatgaagatatggaa
ttgatccgagatttgcgtggaagctgtggaacagagttgaatagatatgcatacatgatg
ccagaaggattgagtatcattttcaacgatttggagaatgctatatccaatatattatca
gccaagaaagtcagtgatcatgaaaatgttgcattcaagtcgtttttattggtgattgca
tttagatcgtctatccctaacaaggacgaattgttctcaaagattgttgatccagattta
gcagcttggtctgctcctgacactgagaagggattgatggatttgcattggtttatggag
agaattggtatagttgaaattgccaagtattttcaaagtcgtgggattacagccaataca
aatttgttggaagccaagatggatgatgaaggcaaagtattaaagaacaaattgaaggac
cattggtcatcaatatttccaattagagccacaaggatatttattcagtatagtattgaa
aaattgaatcacagctctccagaatttttgcatttgttaaaactatggaagcctagaata
cagcctattgtgccacatgtcttgcaattattaacccaaattcaagcataccataatcct
gctaattggaaagatttgccagttgaagttcaggcgtttgttaaggatagttgtacggaa
agattttggcaacaaggtgtttcgatccaatcaaaggagacttttatggaagagaatgtt
aaagccgctttgactcttagagattttgctgattctgttggacatttgattagatacacc
agagaatatgcatttttaactgttggttccatagcacaattagaagatgtcttgtatgag
atcccgaatatcggtctgatgatttggaatgctgtggctggtgataccgtcggtgttaca
ttacacagttggaagcatatgattaatagctgccttagagtggtgattaaatgttgtcca
gttaagtatgttgaagtattcatgagtgaattattgccaagagtattcatagatattgat
aagttattggttgcaagatgggaaagagtctacggtaatggattgcaattaaaaggtaac
gaggatgacgaaacattgagtgaagaaatgatggaagaacatatgttgaggcagttgaca
gctactgttgttagattgttgatggatattgttggacaatatcattctactccaacaact
gacatacagtttgcgtgtaagaaattggttattgaaaacaaagaagttttagcgccattt
ttggaaatctgttgtcatattattatgtttaaggataccaaatgctccttcaatacaata
ttagttgtgagaaacatcttaccagaaattgtgttgaaagatgatgaagttgacaagtat
ttgtcggaccatttgattaaagctttggtgcatgttttgatggaagattattttacagaa
acccataacgaagctgctatggcattgactacgttgtattgtgcattaagatcaaagaat
gattatcctgccagagccatgatgacttatttgtccaatgttacttctcacgacgtggct
aactttgaatcaagtttgatcaattcaaaatcattaagacaccaaagaagtgcattattg
gaattgattaaagttaataaaaatccaaattcaattgaaaatggtgatgaaatgtccaag
agaaagaaacaattagaagaagccattaataatagaaaaaagccaactggtattgatgtc
atgaatgatccttatactgaaaatggtgctttgggtaatttgtttggcgaagagtaa
DBGET
integrated database retrieval system