Candida tropicalis: CTRG_01462
Help
Entry
CTRG_01462 CDS
T01115
Name
(RefSeq) peroxisomal biogenesis factor 6
KO
K13339
peroxin-6 [EC:3.6.4.-]
Organism
ctp
Candida tropicalis
Pathway
ctp04146
Peroxisome
ctp04149
Peroxisome - yeast
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctp00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04146 Peroxisome
CTRG_01462
04149 Peroxisome - yeast
CTRG_01462
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ctp04131
]
CTRG_01462
Membrane trafficking [BR:
ctp04131
]
Autophagy
Pexophagy
Other pexophagy associated proteins
CTRG_01462
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA
PEX6_4th
AAA_lid_3
AAA_16
Parvo_NS1
AAA_14
RuvB_N
nSTAND3
TsaE
AAA_2
RNA_helicase
AAA_28
Vps4_C
AAA_7
AAA_24
TIP49
AAA_5
NPHP3_N
ATPase
AAA_22
Mg_chelatase
DUF7217
AAA_25
PhoH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8301350
NCBI-ProteinID:
XP_002547156
UniProt:
C5M6I1
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1150 aa
AA seq
DB search
MPSVASSKDTEESTHIHDSISSIANVSIINDPTLNDFDVLEISEDLFNEIFPNEQSGIDD
DRFILIKLLGAPDYFNTFKIMKITKIVTKQSQSICLINNSTLVKFKNDQLTIHKALIKSI
NYKDIPKLNQIFVSIPNEIYHLLHDKSQYSIKEKFITQFLKSCGGVINQGDYIRLINGKI
NLCEPLTQGKVDFDTEIVLINQNDQHVESEEDEEDIYEELEEEEEEYDVNDLDLSSYLSS
SLQFGKFNSNNDVENSVKFKVGPLPERFILDDLPSSWSKDDNELFVFINNDDFIKLGFPI
FNGDLVKLDTGSQSIIVRLFTFIEPQSNFQKGIAYLSPILLINLELNENSKIKFVPLNDK
SNDALSSVIPIAESVTISRVSSQITMDKTFQTNFFSSLKTILSNKLKCVKPGDYFPVVID
TVLSKTMFDYVNDENNDSSNNDDSAAGVGGGAGAGGYDNFDVIPIGNPDAVAWFKIAEVK
GVNEIGTNQFLIDPNKTMLVSSGVESIRLPKNAFAKWYQYLNLPPLFNYQEGNFKYAQEF
KKTLSTCLSSRINLKTSILLTSMSRGIGKTTLVRDSCIEMGLNLIELDCFDLLNPGQELK
TIGMLTGKIDKLIANASNENNSSSSSSSSFHVIYLKHIENLCPKTDENDQNSSIFTSLTL
KIISTLHDYLKNYSNLVIVMSCNDYDKLNDNLKSIIKFTIEFTVPTENERLEIFKFLINN
EKLKSKTTTPNKDINSYPFIIRKDINFKNLALQSAGFNTKRFNFNYLKIQKLAYKRLTKL
SKSSGINLSNVLDIGNGGVINWIPEDFNLAINEARNQFSDSIGAPRIPNVKWEDIGGLDL
VKDEILDTIDMPLKHPELFNNGLKKRSGILFYGPPGTGKTLLAKAIATNFSLNFFSVKGP
ELLNMYIGESEANVRRVFQRARDAKPCVIFFDELDSVAPKRGNQGDSGGVMDRIVSQLLA
ELDGMSSEGGDGVFVVGATNRPDLLDEALLRPGRFDKMLYLGISDTDEKQTKILEALTRK
FKLDDDVNLEEIAHNCSFTFTGADFYALCSDSMLNAMTRVANEVDEKIKNYNQNLINQGK
EEVNTRWWFDNVASDQDITVLVKMEDFIKAQNELIPSVSAEELQHYLRVRENFEGGKEKA
KQDLINENGH
NT seq
3453 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgtcagttgcaagttctaaggataccgaggaatcaactcatattcatgattcaata
tcatctattgcaaatgtatctattatcaatgatccaactttaaatgattttgacgtattg
gagatttctgaagatttattcaatgaaatattccctaatgagcaatctggtattgacgat
gacagattcattttgattaaattattaggagctcctgattatttcaatacttttaaaatt
atgaaaattaccaagattgttacaaaacaatcccaatcaatttgtttaatcaataattca
acattagtcaagtttaaaaatgatcaattaacaattcataaagcattgattaaatctatc
aattataaagatattcctaaattaaatcaaattttcgtatctatcccaaatgaaatatat
catttattacatgataaatcacaatattcaattaaagaaaaattcataactcaattttta
aaatcttgtggcggtgttattaatcaaggtgattatattagattaattaatgggaaaatt
aacttatgtgaaccattaactcaaggtaaagttgattttgacacggagattgttttaatt
aatcaaaatgatcaacacgtggaactggaagaagatgaagaagatatctacgaggaatta
gaagaagaagaggaggaatatgatgttaatgaccttgatttatcttcctatttgtcatca
agtttgcaatttgggaaatttaatagtaataacgatgttgagaattctgttaaattcaag
gttggtccattaccagaaagatttatccttgacgatttaccaagtagttggtccaaagat
gataatgagttgtttgtatttataaataatgatgattttattaaattgggatttcctata
ttcaatggtgatttggttaaacttgatactggttcacaatcaattattgttagattattt
acttttattgaaccccaatctaattttcaaaaaggaattgcttatttatcaccaatttta
ttgataaatcttgaattaaatgaaaattcaaagataaaatttgtaccattgaatgataaa
tcaaatgatgcattatcaagcgtaattccaattgcagaatcagttacaatttcaagagtt
agttctcaaattactatggataagactttccaaactaatttcttttcaagtttgaagacc
attttaagtaacaaattaaagtgtgttaaacctggtgattacttcccggtggttattgat
actgttttatccaaaaccatgtttgattatgtaaacgatgaaaataacgatagtagtaat
aatgacgactcagccgctggtgtcggaggaggagcaggagcaggaggctatgataatttt
gacgttattccaattgggaatccggatgcagttgcatggtttaaaattgctgaggtcaaa
ggtgttaatgaaattggaactaatcaatttcttattgatccaaataaaacaatgttggtt
tcatcaggagttgaaagtattagattacctaaaaatgcatttgccaaatggtatcaatat
ttgaatttaccaccgttgtttaattatcaagaaggaaattttaagtatgcacaagaattc
aaaaagacattatctacttgtttatcatcaaggattaatttgaaaacttcaattttattg
acttcaatgagtagaggaattgggaaaactactcttgttagagattcatgtattgaaatg
ggattgaacctaattgaattggattgttttgatttgttaaatccaggacaagaattaaaa
accattgggatgttaacaggtaaaattgataaattaattgctaatgcttctaatgagaat
aattcttcctcatcatcatcatcatcattccatgtaatttatcttaagcatattgaaaat
ttgtgtcctaaaacggatgaaaatgatcaaaattcaagtattttcacctcgttgacatta
aaaatcattctgactttacatgattatttgaaaaattattcaaatttggttattgtcatg
agttgtaatgattatgataaattgaatgataatttaaaatcgattattaaattcactatt
gaatttactgttcctactgaaaacgaacgtttggaaattttcaagtttttgataaacaat
gaaaaattgaaatctaaaaccaccacccctaataaagatataaattcatatccatttata
attagaaaagatattaatttcaagaatcttgcattacaatcagcagggtttaacaccaag
agatttaatttcaattatttaaaaatccaaaaattagcctataaaagattaaccaaatta
tctaaatcatcgggtattaatttgtccaatgttcttgatataggaaatggaggagttata
aattggataccagaagattttaatttggcaattaatgaagcccgtaatcaattcagtgat
tctattggagcaccacgtattccaaatgttaaatgggaagatattggagggttggattta
gttaaagatgaaattttagatactattgatatgccattaaaacatccagaactatttaat
aatggtttgaaaaaaagaagtggtattttattttatggacctccaggtactggtaaaaca
ttgttagctaaagctatagctactaatttttcattgaattttttttcagttaaagggcca
gaattattgaatatgtatattggtgaatcagaagcaaatgttcgtcgagttttccaaaga
gcaagagatgctaaaccttgtgttatattttttgatgaattagattcggttgctccaaag
agaggtaatcagggagattccggtggtgttatggatagaattgtatcacaattattagct
gaattagatggtatgagtagtgaaggaggagatggggtgtttgtagtaggagcaactaac
aggcctgatttattagatgaagcattattaagacctggtagatttgataaaatgttatat
ttgggtatttcagatactgatgaaaaacaaactaagattttagaagctttaactagaaag
tttaaattggatgatgatgttaatttagaagaaattgctcataattgttcctttacattt
actggtgctgatttttatgctttatgttctgattcgatgttaaatgcaatgactagagtt
gcaaatgaagttgatgaaaagattaaaaactataatcaaaacttaataaatcaaggtaaa
gaagaagttaatacaagatggtggtttgataatgttgcttccgatcaagatattacagta
ttggttaaaatggaagattttataaaagctcaaaatgaattgatcccatctgtttcagct
gaagaattacaacattatttgagagttagagagaattttgaaggtggtaaagagaaagca
aaacaagatttgattaatgaaaatggacattga
DBGET
integrated database retrieval system
