KEGG   Candida tropicalis: CTRG_01486
Entry
CTRG_01486        CDS       T01115                                 
Name
(RefSeq) conserved hypothetical protein
  KO
K14300  nuclear pore complex protein Nup133
Organism
ctp  Candida tropicalis
Pathway
ctp03013  Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ctp00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03013 Nucleocytoplasmic transport
    CTRG_01486
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:ctp03019]
    CTRG_01486
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:ctp03036]
    CTRG_01486
Messenger RNA biogenesis [BR:ctp03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Nuclear pore complex
     CTRG_01486
Chromosome and associated proteins [BR:ctp03036]
 Eukaryotic type
  Centrosome formation proteins
   Spindle formation proteins
    CTRG_01486
SSDB
Motif
Pfam: Nucleoporin_N DUF7222
Other DBs
NCBI-GeneID: 8301374
NCBI-ProteinID: XP_002547180
UniProt: C5M6K5
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1110 aa
MSIFKPRNSGIDKKQATAEPEDNLSYSSIAKQHTISTTQELTKNEHYCVSSLPALPSVFK
THSTSFINGYSDCESNYSLVINEDSIFVWSYKLTDSIPLSIEFPIDKSRFKLPMAILTRP
SSGTGQDPGLIIIDGISGLVKFYESVQHAPSLGLINDKSLELNLPLKKNECIVVAENIEP
SGIVIATNFNRCLLISLRDFKSKPQLGYLELLNNQSFLQKLFNNSSSNGETFDNDIVAIR
SGKISNHGTCQEIIVLDSSGGFHLYTYNLFSANGSPYIDKKKSFKQYISIDVNEYPGMLL
DQQLEFLDIWPIDQTTTNSTNDEEEDDDEAEEGERYYLALVNIQDDLYLITLKINRSGSL
PIGSHKLKTAPSYDNTINKPRLYLPKPEKTAFVIIDNSIILTDLNISYLTESLSTKRSNS
YYYYKPRWEDIIRFKSSVEFIGNGYENQSANSNPAIVLITKNFGVIRVEKFPESQDIDNE
VVTDPLTVVKSHIEQAIFYSDIEEIDFDLIQRFDSEIITKAIQSIIQEILDSTSAYLPKT
LPSISDLTSLKVKLYKTLIEYVERNGFNQSVIPQIVENLEKSDVAYQLWTIIDETDSLKQ
VLQKQVGDLREFFTHKISNINQVLTQFIEELGKENLPVLQLIVNTLYQGVYLNDVKYIKN
EIVKSWIFETHLIVRTQEIFTREFVVDSIGIDNTKSKDALKLVEVLYYFVNEAISYMKVT
SSSTEDNKQLEDYQKWYNEIKYYWIEVLLQFDLIQESIEIGEKYQDFASLARILDYQKTI
KNIPLEELNYIKYFEKFGYEFASCVYDYYLKNNQIQSLLLDFIDYKSYLLKYFNEKPIKT
SNVSWIRYLLDSQFNQASDALITSAQKQPPLKLQDQQIKYSLAKLCAIAANDDKDNLNDI
NNQLLVIKYQKLTNNEIGRIEAIPKGTFIKSYINAKITKEYQNSSLIDQYYEKLVKNLQL
SSIELINLLTTIKPSLLNKESFGYAFKTAQSIINQSLSDYYSALVLIRLLTIGDEDDDNI
KDMNSSSDAKLREMATDSILFKTLTSDPNAISKLDQLLINPSLIQNDNDQYQDDLVIRQF
NESLIMKLIERLNDNKFKLWVESVKEQARL
NT seq 3333 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcgatatttaaaccacgtaacagtggaatagacaagaaacaagcaacagcagaacca
gaagataacttaagttattcttcaattgcaaaacaacatactataagtacaacgcaagaa
cttaccaagaatgaacattattgtgtatcaagtttacctgcattaccatcagtttttaaa
acccattcaacatctttcatcaatggttattcagattgtgaatcaaattattcattagtt
atcaatgaagattcgatatttgtgtggagttataaattaactgattcaatcccgttgtcg
attgaatttccaattgataaatcaagatttaaattgccaatggctattttaacaagacct
tcaagtggtactggacaagatcctggattgattataattgatggaatttctggattggtc
aaattttatgaaagtgtacaacatgctccttcattgggattaattaatgataaatcatta
gaattaaatttacctttaaagaaaaatgaatgtattgttgtagccgaaaatattgaacct
tcaggaattgttattgctactaattttaatagatgtttattgatttctttaagagatttt
aaaagtaaaccacaattgggatatttggaattattaaataatcaaagttttttacaaaaa
ttatttaacaattcttcatctaatggtgaaacatttgataatgacattgttgctattaga
tcagggaaaatatcaaatcatggaacttgtcaagaaattatcgttttggattcttctggt
ggtttccatttatatacttataacttattctcagctaatggatctccttatattgacaaa
aagaaatctttcaaacaatatattagtattgatgttaatgaatatccagggatgttatta
gatcaacagttggaattcttggatatttggccaatcgatcaaactaccactaatagtact
aacgatgaagaagaagatgatgatgaagcagaagaaggggaacgctattatttagcattg
gtgaatattcaagatgatttatatttgattactttaaaaattaatagatctggttcatta
ccaattggatctcataaattaaaaacagctccatcatatgataataccatcaataaacca
agactttatttaccaaaacctgagaaaacagcatttgtcattattgataattctataatt
ttaactgatttgaatatttcttatcttacagagtcattatccacaaagagatccaattcc
tactattattataaaccaagatgggaagatatcattcgatttaaatcatctgtggagttt
attggtaatggatacgagaatcaatcagcaaactcaaacccagctattgttttaataact
aaaaattttggtgttattagagttgaaaaattcccagaatctcaagatatcgacaatgag
gttgttactgatccattgacagtggttaaatctcatattgaacaagctattttctattca
gatattgaagaaattgatttcgatttaattcaaagatttgattcggagattataactaaa
gcaatccaatcaatcatccaagagattttagactcaacttcagcttatttacctaaaaca
ttaccatcaatttctgatttgactagtttgaaagtgaagttatacaaaacactcattgaa
tatgttgaaagaaatggatttaaccaatcagtcatcccacaaattgttgaaaatttggag
aaatcagatgttgcttatcaattgtggactattattgatgaaaccgattcattgaaacag
gtattacaaaaacaagttggtgatttaagagagtttttcactcataaaatatccaatata
aatcaagttttgacccaatttattgaagaattaggcaaagagaatttaccggttttacaa
ttaattgtcaatacattatatcaaggagtttatttaaatgacgtgaaatatatcaagaac
gaaattgttaaatcttggatatttgaaactcatttaattgttcgaactcaagaaatattc
actcgtgagtttgttgttgattcaattggaattgataacaccaaatcaaaagatgcattg
aaattggttgaagttttatattattttgtcaatgaagcaatcagttatatgaaagtaact
tcatcatcgacagaagacaataaacaacttgaagattatcaaaaatggtataatgaaatc
aaatactattggattgaagtattattacagtttgatcttattcaagaatcaattgaaatt
ggtgaaaaatatcaagattttgcatcattagcaagaatattggattaccaaaaaaccatc
aagaatatcccacttgaagaattgaattatattaaatattttgaaaagtttggctatgaa
tttgctagttgtgtttatgattattatttaaagaataatcaaattcaatcattattatta
gatttcattgattataaatcttatctattgaaatatttcaatgaaaaaccaattaaaact
tcaaatgtttcatggattagatatttattggatagtcaattcaatcaagcttctgatgca
ttgatcacatctgctcaaaaacaaccaccattgaagttacaagatcaacagattaaatat
tcattggctaaattgtgtgcaattgctgcaaatgatgacaaggataatttaaatgatatt
aataatcaattattggttattaaatatcaaaaattaaccaacaatgaaattggaagaatt
gaagctataccaaagggaacatttattaagagttatatcaatgcaaagatcactaaagaa
tatcaaaattcttcattaattgatcaatattatgagaaacttgttaagaatttgcaatta
tcatcaattgaattaattaatttattaacaactataaaaccatcactacttaataaagaa
tcctttggatatgcatttaaaacagcccaatcaataattaatcaaagtttatctgattat
tattcagctttagtattgattcgtttgttaaccataggtgatgaggatgatgataacatc
aaggatatgaattcttcatccgatgctaaacttagggaaatggccactgattctattctt
ttcaagactttaacactggatcctaatgcaatttcaaaactagatcaattattgatcaat
ccaagtttgatccagaatgataatgatcaatatcaagatgatcttgttattagacaattt
aatgaatctttaatcatgaaattaattgaaagactcaacgataataaattcaaattatgg
gttgaatcagttaaagaacaagctagactataa

DBGET integrated database retrieval system