Candida tropicalis: CTRG_01486
Help
Entry
CTRG_01486 CDS
T01115
Name
(RefSeq) conserved hypothetical protein
KO
K14300
nuclear pore complex protein Nup133
Organism
ctp
Candida tropicalis
Pathway
ctp03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
CTRG_01486
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ctp03019
]
CTRG_01486
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ctp03036
]
CTRG_01486
Messenger RNA biogenesis [BR:
ctp03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
CTRG_01486
Chromosome and associated proteins [BR:
ctp03036
]
Eukaryotic type
Centrosome formation proteins
Spindle formation proteins
CTRG_01486
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleoporin_N
DUF7222
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8301374
NCBI-ProteinID:
XP_002547180
UniProt:
C5M6K5
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1110 aa
AA seq
DB search
MSIFKPRNSGIDKKQATAEPEDNLSYSSIAKQHTISTTQELTKNEHYCVSSLPALPSVFK
THSTSFINGYSDCESNYSLVINEDSIFVWSYKLTDSIPLSIEFPIDKSRFKLPMAILTRP
SSGTGQDPGLIIIDGISGLVKFYESVQHAPSLGLINDKSLELNLPLKKNECIVVAENIEP
SGIVIATNFNRCLLISLRDFKSKPQLGYLELLNNQSFLQKLFNNSSSNGETFDNDIVAIR
SGKISNHGTCQEIIVLDSSGGFHLYTYNLFSANGSPYIDKKKSFKQYISIDVNEYPGMLL
DQQLEFLDIWPIDQTTTNSTNDEEEDDDEAEEGERYYLALVNIQDDLYLITLKINRSGSL
PIGSHKLKTAPSYDNTINKPRLYLPKPEKTAFVIIDNSIILTDLNISYLTESLSTKRSNS
YYYYKPRWEDIIRFKSSVEFIGNGYENQSANSNPAIVLITKNFGVIRVEKFPESQDIDNE
VVTDPLTVVKSHIEQAIFYSDIEEIDFDLIQRFDSEIITKAIQSIIQEILDSTSAYLPKT
LPSISDLTSLKVKLYKTLIEYVERNGFNQSVIPQIVENLEKSDVAYQLWTIIDETDSLKQ
VLQKQVGDLREFFTHKISNINQVLTQFIEELGKENLPVLQLIVNTLYQGVYLNDVKYIKN
EIVKSWIFETHLIVRTQEIFTREFVVDSIGIDNTKSKDALKLVEVLYYFVNEAISYMKVT
SSSTEDNKQLEDYQKWYNEIKYYWIEVLLQFDLIQESIEIGEKYQDFASLARILDYQKTI
KNIPLEELNYIKYFEKFGYEFASCVYDYYLKNNQIQSLLLDFIDYKSYLLKYFNEKPIKT
SNVSWIRYLLDSQFNQASDALITSAQKQPPLKLQDQQIKYSLAKLCAIAANDDKDNLNDI
NNQLLVIKYQKLTNNEIGRIEAIPKGTFIKSYINAKITKEYQNSSLIDQYYEKLVKNLQL
SSIELINLLTTIKPSLLNKESFGYAFKTAQSIINQSLSDYYSALVLIRLLTIGDEDDDNI
KDMNSSSDAKLREMATDSILFKTLTSDPNAISKLDQLLINPSLIQNDNDQYQDDLVIRQF
NESLIMKLIERLNDNKFKLWVESVKEQARL
NT seq
3333 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgatatttaaaccacgtaacagtggaatagacaagaaacaagcaacagcagaacca
gaagataacttaagttattcttcaattgcaaaacaacatactataagtacaacgcaagaa
cttaccaagaatgaacattattgtgtatcaagtttacctgcattaccatcagtttttaaa
acccattcaacatctttcatcaatggttattcagattgtgaatcaaattattcattagtt
atcaatgaagattcgatatttgtgtggagttataaattaactgattcaatcccgttgtcg
attgaatttccaattgataaatcaagatttaaattgccaatggctattttaacaagacct
tcaagtggtactggacaagatcctggattgattataattgatggaatttctggattggtc
aaattttatgaaagtgtacaacatgctccttcattgggattaattaatgataaatcatta
gaattaaatttacctttaaagaaaaatgaatgtattgttgtagccgaaaatattgaacct
tcaggaattgttattgctactaattttaatagatgtttattgatttctttaagagatttt
aaaagtaaaccacaattgggatatttggaattattaaataatcaaagttttttacaaaaa
ttatttaacaattcttcatctaatggtgaaacatttgataatgacattgttgctattaga
tcagggaaaatatcaaatcatggaacttgtcaagaaattatcgttttggattcttctggt
ggtttccatttatatacttataacttattctcagctaatggatctccttatattgacaaa
aagaaatctttcaaacaatatattagtattgatgttaatgaatatccagggatgttatta
gatcaacagttggaattcttggatatttggccaatcgatcaaactaccactaatagtact
aacgatgaagaagaagatgatgatgaagcagaagaaggggaacgctattatttagcattg
gtgaatattcaagatgatttatatttgattactttaaaaattaatagatctggttcatta
ccaattggatctcataaattaaaaacagctccatcatatgataataccatcaataaacca
agactttatttaccaaaacctgagaaaacagcatttgtcattattgataattctataatt
ttaactgatttgaatatttcttatcttacagagtcattatccacaaagagatccaattcc
tactattattataaaccaagatgggaagatatcattcgatttaaatcatctgtggagttt
attggtaatggatacgagaatcaatcagcaaactcaaacccagctattgttttaataact
aaaaattttggtgttattagagttgaaaaattcccagaatctcaagatatcgacaatgag
gttgttactgatccattgacagtggttaaatctcatattgaacaagctattttctattca
gatattgaagaaattgatttcgatttaattcaaagatttgattcggagattataactaaa
gcaatccaatcaatcatccaagagattttagactcaacttcagcttatttacctaaaaca
ttaccatcaatttctgatttgactagtttgaaagtgaagttatacaaaacactcattgaa
tatgttgaaagaaatggatttaaccaatcagtcatcccacaaattgttgaaaatttggag
aaatcagatgttgcttatcaattgtggactattattgatgaaaccgattcattgaaacag
gtattacaaaaacaagttggtgatttaagagagtttttcactcataaaatatccaatata
aatcaagttttgacccaatttattgaagaattaggcaaagagaatttaccggttttacaa
ttaattgtcaatacattatatcaaggagtttatttaaatgacgtgaaatatatcaagaac
gaaattgttaaatcttggatatttgaaactcatttaattgttcgaactcaagaaatattc
actcgtgagtttgttgttgattcaattggaattgataacaccaaatcaaaagatgcattg
aaattggttgaagttttatattattttgtcaatgaagcaatcagttatatgaaagtaact
tcatcatcgacagaagacaataaacaacttgaagattatcaaaaatggtataatgaaatc
aaatactattggattgaagtattattacagtttgatcttattcaagaatcaattgaaatt
ggtgaaaaatatcaagattttgcatcattagcaagaatattggattaccaaaaaaccatc
aagaatatcccacttgaagaattgaattatattaaatattttgaaaagtttggctatgaa
tttgctagttgtgtttatgattattatttaaagaataatcaaattcaatcattattatta
gatttcattgattataaatcttatctattgaaatatttcaatgaaaaaccaattaaaact
tcaaatgtttcatggattagatatttattggatagtcaattcaatcaagcttctgatgca
ttgatcacatctgctcaaaaacaaccaccattgaagttacaagatcaacagattaaatat
tcattggctaaattgtgtgcaattgctgcaaatgatgacaaggataatttaaatgatatt
aataatcaattattggttattaaatatcaaaaattaaccaacaatgaaattggaagaatt
gaagctataccaaagggaacatttattaagagttatatcaatgcaaagatcactaaagaa
tatcaaaattcttcattaattgatcaatattatgagaaacttgttaagaatttgcaatta
tcatcaattgaattaattaatttattaacaactataaaaccatcactacttaataaagaa
tcctttggatatgcatttaaaacagcccaatcaataattaatcaaagtttatctgattat
tattcagctttagtattgattcgtttgttaaccataggtgatgaggatgatgataacatc
aaggatatgaattcttcatccgatgctaaacttagggaaatggccactgattctattctt
ttcaagactttaacactggatcctaatgcaatttcaaaactagatcaattattgatcaat
ccaagtttgatccagaatgataatgatcaatatcaagatgatcttgttattagacaattt
aatgaatctttaatcatgaaattaattgaaagactcaacgataataaattcaaattatgg
gttgaatcagttaaagaacaagctagactataa
DBGET
integrated database retrieval system