Candida tropicalis: CTRG_02196
Help
Entry
CTRG_02196 CDS
T01115
Name
(RefSeq) conserved hypothetical protein
KO
K14772
U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
ctp
Candida tropicalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ctp03009
]
CTRG_02196
Ribosome biogenesis [BR:
ctp03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
CTRG_02196
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UTP20_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8296897
NCBI-ProteinID:
XP_002547899
UniProt:
C5M9N4
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1014 aa
AA seq
DB search
MLFTSYQTKKEKIMKIFNLTIDQEAVTISPHLPIHTMSKPRTKTTESSRRHAFSSFRERV
DSIRIEPSKKLTKRVYDYIDTEDQTDSYFLTTLEHWKETNLSGVFTEFLNQVEQHCQSLP
QLIYHKDLIYQALNEAIAKNDVHSIQPLLELLSQFIHDLGSDFLPYYTQTLKLLTELVME
VNPNDYQNNRNSSNVLEWAFNTLAFSFKYLSRDLIKDLKPTFIELLPFLKLTKKTYISRF
CAEALSFLIRKSSSDSLVEIINFSLFDQLDEVLNNDSYCESLTILYSEAMKNTKGTFHSK
SQSIFSKLMEISLYKIDEKAHPKLISIISDITLEILNHGTAESCDKFYVMVTDYLNELLE
KNTNELELLTSCQILSTLSFAESGKKINNWDVVLNVVDTLVSKFPQETSQELMESFLYLM
VIVFRNADIQSLTIRHKKYLDAAYKTNGFLTFAEGSLSVCTAKVTNFGIYKYIQNYINNC
TNDEAESLTFFLETINTTTKFVIPDSLASDISKKVNSDIKSGSFESIYWKLLLLSYSNTF
KEIELKLLKDLLFKLRSSSLDRELAAIVLNIITQKLNETPDSKLQSEITTFLETNFNKFD
KSSKFLSSLRDYILVTKSGNFLNKAIQCLHYPTHELRTNAIELVITLQEEPEPSSILSQI
RLIEQIPLNISTGRDITLRIRNLAIEYSKEIKPSNIDKQLIVNYLFGLLSNRFQPCWTAV
YEALPIIASSCKPEIWEIAYKLLTLDYNQQSSDVIDESFGVESSLIDWQPRNSRLLNNFE
TFDRNYLEPFRNITNSLVKLSSNKDGKFEEMVRSHVLAALKTVPSVAEYNVTKLIPIVIN
QPTSSDDGDTDELQSWSRKDRNDLLELFTKFKKISKVPEADELYDYLLNLLTSKFLKVQQ
LALDVLFNWNNPSIVKYRDNLKNLLDDTIFSDEISKFLTSNSIIEDQDKPILMPYVIRIL
FGRVQGSPKINIKHGKKFAVITVLPSLKDSDIISFIELGANKTGYKEFFQNNLP
NT seq
3045 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcttcacaagttaccaaacaaaaaaagaaaaaattatgaaaatttttaatctaact
atagatcaagaagctgtcactatatctccacacttaccgattcataccatgctgaaacct
agaactaagactacggaatctagtaggagacatgctttttcatcattccgtgaaagagtc
gactcaataagaatcgaaccaagtaaaaaattaacgaaaagagtttatgattatatcgat
acagaagatcaaaccgattcatatttcttaactacattagaacattggaaagaaacaaac
ttatcaggagtcttcactgagtttttaaatcaagttgaacaacattgtcaatcattacct
caattaatataccataaagatttaatttatcaagctttaaatgaagcgattgctaaaaat
gatgttcattcaattcaaccattattagaattattgtcccaattcattcatgatttagga
tcggatttcttgccttactatactcaaactttaaaattgttaactgaattagtaatggaa
gtcaatccaaatgattatcaaaataatagaaacagttcaaatgttttggagtgggctttc
aacacattggcattttcatttaaatatttatcaagagatttaattaaagatttaaaacct
acatttattgaattattacctttcttgaaattaactaagaaaacttatatttcaagattt
tgtgcagaagcattatcatttttaattagaaaactgagttctgattcattagttgaaatc
ataaacttttccctatttgatcaattagatgaagtattgaataatgattcatattgtgaa
tctttgactatcttgtacagtgaagccatgaaaaacacaaagggtacattccattcaaaa
tctcaatccatctttctgaagttaatggagatttcattatacaaaattgacgagaaagca
caccctaagcttataagtataatttcagatataacccttgaaatcctaaaccatggtact
gctgaatcctgtgataagttttacgttatggtcactgattacttgaatgagttgttggag
aagaatactaatgaattggaattattaacttcatgtcaaatattatctacattatcgttt
gctgaatcaggtaaaaaaatcaacaattgggacgttgttcttaatgtagttgacacatta
gtttctaaatttccacaagaaacttcacaagaattaatggaatcattcttatatcttatg
gtcattgtatttagaaatgctgatattcaatccttgacaattcgtcacaagaaatacttg
gatgccgcttacaagactaatggatttttgacttttgctgaagggagtttatctgtctgt
actgcaaaagtcaccaattttggaatttacaagtatattcaaaattatattaataattgt
accaatgatgaagcggagtctttgacatttttcttagaaactatcaataccaccactaaa
tttgtcattccagattcattagcatctgatatcagtaagaaagtcaattccgatatcaaa
tcagggtcatttgagtcaatctattggaaattattattgttgagttattccaatacattc
aaagaaattgaattgaaattattgaaagatttattattcaaacttcgaagttcatcactt
gatagagagttggcagctattgtattgaatattattactcaaaaattaaatgaaactcca
gattcaaaattacaatcagaaatcactacattcttggaaacaaatttcaataaatttgac
aaatcatcaaaatttttatcttcattaagagactatattttagttactaaatctggaaat
ttcttgaacaaagctatccagtgtttacattatcctactcatgaattacgtaccaatgcc
attgaattggttattacattacaagaagaaccagaaccatcaagcatattatcacaaatt
agattaattgaacaaattccattgaatattagtactggtagagatattacccttcgtatt
agaaatttagcaatcgaatatctgaaagaaattaaaccttctaatattgataaacaactt
attgtcaactacttatttgggttactttctaatagatttcaaccttgttggacagcggtt
tatgaagcattaccaattattgctagttcttgtaaacctgaaatttgggaaattgcatac
aaattacttacattggattataatcaacaatcttctgatgttatcgatgaatcttttggt
gttgaaagtagcttgattgattggcaacctagaaattctagattattgaacaattttgaa
acttttgatagaaactacttagaaccattcagaaacatcaccaattctttagtcaaatta
tcatctaataaagatgggaaatttgaagaaatggttagatcacatgttttagcagctttg
aaaaccgttccttcagtggctgaatataatgttactaaattgatcccaatagttattaat
caaccaacttcttctgatgatggagatacagatgaattacaatcctggtcaagaaaagat
agaaacgacttgcttgagttattcaccaaattcaaaaagattagtaaagttcctgaagca
gatgaattgtatgattatttgttgaatttattaacaagtaaattccttaaagttcaacaa
cttgcccttgatgttttatttaattggaataacccttctattgtcaaatacagagataat
cttaagaatctcttggatgatactattttcagtgatgaaatttctaaattcttgacttca
aattcaataattgaagatcaagataaaccaatccttatgccatatgtaattagaatttta
tttggtagagttcaaggttcgccaaaaattaatattaaacatggaaagaagtttgccgtt
atcaccgttttaccaagtttaaaagattcagatattatttcatttattgagttaggtgca
aacaaaaccggatacaaggaattctttcaaaacaatttaccctaa
DBGET
integrated database retrieval system