KEGG   Candida tropicalis: CTRG_02196
Entry
CTRG_02196        CDS       T01115                                 
Name
(RefSeq) conserved hypothetical protein
  KO
K14772  U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
ctp  Candida tropicalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ctp00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ctp03009]
    CTRG_02196
Ribosome biogenesis [BR:ctp03009]
 Eukaryotic type
  90S particles
   U3 small nucleolar RNA-associated proteins
    CTRG_02196
SSDB
Motif
Pfam: UTP20_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 8296897
NCBI-ProteinID: XP_002547899
UniProt: C5M9N4
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1014 aa
MLFTSYQTKKEKIMKIFNLTIDQEAVTISPHLPIHTMSKPRTKTTESSRRHAFSSFRERV
DSIRIEPSKKLTKRVYDYIDTEDQTDSYFLTTLEHWKETNLSGVFTEFLNQVEQHCQSLP
QLIYHKDLIYQALNEAIAKNDVHSIQPLLELLSQFIHDLGSDFLPYYTQTLKLLTELVME
VNPNDYQNNRNSSNVLEWAFNTLAFSFKYLSRDLIKDLKPTFIELLPFLKLTKKTYISRF
CAEALSFLIRKSSSDSLVEIINFSLFDQLDEVLNNDSYCESLTILYSEAMKNTKGTFHSK
SQSIFSKLMEISLYKIDEKAHPKLISIISDITLEILNHGTAESCDKFYVMVTDYLNELLE
KNTNELELLTSCQILSTLSFAESGKKINNWDVVLNVVDTLVSKFPQETSQELMESFLYLM
VIVFRNADIQSLTIRHKKYLDAAYKTNGFLTFAEGSLSVCTAKVTNFGIYKYIQNYINNC
TNDEAESLTFFLETINTTTKFVIPDSLASDISKKVNSDIKSGSFESIYWKLLLLSYSNTF
KEIELKLLKDLLFKLRSSSLDRELAAIVLNIITQKLNETPDSKLQSEITTFLETNFNKFD
KSSKFLSSLRDYILVTKSGNFLNKAIQCLHYPTHELRTNAIELVITLQEEPEPSSILSQI
RLIEQIPLNISTGRDITLRIRNLAIEYSKEIKPSNIDKQLIVNYLFGLLSNRFQPCWTAV
YEALPIIASSCKPEIWEIAYKLLTLDYNQQSSDVIDESFGVESSLIDWQPRNSRLLNNFE
TFDRNYLEPFRNITNSLVKLSSNKDGKFEEMVRSHVLAALKTVPSVAEYNVTKLIPIVIN
QPTSSDDGDTDELQSWSRKDRNDLLELFTKFKKISKVPEADELYDYLLNLLTSKFLKVQQ
LALDVLFNWNNPSIVKYRDNLKNLLDDTIFSDEISKFLTSNSIIEDQDKPILMPYVIRIL
FGRVQGSPKINIKHGKKFAVITVLPSLKDSDIISFIELGANKTGYKEFFQNNLP
NT seq 3045 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctcttcacaagttaccaaacaaaaaaagaaaaaattatgaaaatttttaatctaact
atagatcaagaagctgtcactatatctccacacttaccgattcataccatgctgaaacct
agaactaagactacggaatctagtaggagacatgctttttcatcattccgtgaaagagtc
gactcaataagaatcgaaccaagtaaaaaattaacgaaaagagtttatgattatatcgat
acagaagatcaaaccgattcatatttcttaactacattagaacattggaaagaaacaaac
ttatcaggagtcttcactgagtttttaaatcaagttgaacaacattgtcaatcattacct
caattaatataccataaagatttaatttatcaagctttaaatgaagcgattgctaaaaat
gatgttcattcaattcaaccattattagaattattgtcccaattcattcatgatttagga
tcggatttcttgccttactatactcaaactttaaaattgttaactgaattagtaatggaa
gtcaatccaaatgattatcaaaataatagaaacagttcaaatgttttggagtgggctttc
aacacattggcattttcatttaaatatttatcaagagatttaattaaagatttaaaacct
acatttattgaattattacctttcttgaaattaactaagaaaacttatatttcaagattt
tgtgcagaagcattatcatttttaattagaaaactgagttctgattcattagttgaaatc
ataaacttttccctatttgatcaattagatgaagtattgaataatgattcatattgtgaa
tctttgactatcttgtacagtgaagccatgaaaaacacaaagggtacattccattcaaaa
tctcaatccatctttctgaagttaatggagatttcattatacaaaattgacgagaaagca
caccctaagcttataagtataatttcagatataacccttgaaatcctaaaccatggtact
gctgaatcctgtgataagttttacgttatggtcactgattacttgaatgagttgttggag
aagaatactaatgaattggaattattaacttcatgtcaaatattatctacattatcgttt
gctgaatcaggtaaaaaaatcaacaattgggacgttgttcttaatgtagttgacacatta
gtttctaaatttccacaagaaacttcacaagaattaatggaatcattcttatatcttatg
gtcattgtatttagaaatgctgatattcaatccttgacaattcgtcacaagaaatacttg
gatgccgcttacaagactaatggatttttgacttttgctgaagggagtttatctgtctgt
actgcaaaagtcaccaattttggaatttacaagtatattcaaaattatattaataattgt
accaatgatgaagcggagtctttgacatttttcttagaaactatcaataccaccactaaa
tttgtcattccagattcattagcatctgatatcagtaagaaagtcaattccgatatcaaa
tcagggtcatttgagtcaatctattggaaattattattgttgagttattccaatacattc
aaagaaattgaattgaaattattgaaagatttattattcaaacttcgaagttcatcactt
gatagagagttggcagctattgtattgaatattattactcaaaaattaaatgaaactcca
gattcaaaattacaatcagaaatcactacattcttggaaacaaatttcaataaatttgac
aaatcatcaaaatttttatcttcattaagagactatattttagttactaaatctggaaat
ttcttgaacaaagctatccagtgtttacattatcctactcatgaattacgtaccaatgcc
attgaattggttattacattacaagaagaaccagaaccatcaagcatattatcacaaatt
agattaattgaacaaattccattgaatattagtactggtagagatattacccttcgtatt
agaaatttagcaatcgaatatctgaaagaaattaaaccttctaatattgataaacaactt
attgtcaactacttatttgggttactttctaatagatttcaaccttgttggacagcggtt
tatgaagcattaccaattattgctagttcttgtaaacctgaaatttgggaaattgcatac
aaattacttacattggattataatcaacaatcttctgatgttatcgatgaatcttttggt
gttgaaagtagcttgattgattggcaacctagaaattctagattattgaacaattttgaa
acttttgatagaaactacttagaaccattcagaaacatcaccaattctttagtcaaatta
tcatctaataaagatgggaaatttgaagaaatggttagatcacatgttttagcagctttg
aaaaccgttccttcagtggctgaatataatgttactaaattgatcccaatagttattaat
caaccaacttcttctgatgatggagatacagatgaattacaatcctggtcaagaaaagat
agaaacgacttgcttgagttattcaccaaattcaaaaagattagtaaagttcctgaagca
gatgaattgtatgattatttgttgaatttattaacaagtaaattccttaaagttcaacaa
cttgcccttgatgttttatttaattggaataacccttctattgtcaaatacagagataat
cttaagaatctcttggatgatactattttcagtgatgaaatttctaaattcttgacttca
aattcaataattgaagatcaagataaaccaatccttatgccatatgtaattagaatttta
tttggtagagttcaaggttcgccaaaaattaatattaaacatggaaagaagtttgccgtt
atcaccgttttaccaagtttaaaagattcagatattatttcatttattgagttaggtgca
aacaaaaccggatacaaggaattctttcaaaacaatttaccctaa

DBGET integrated database retrieval system