KEGG   Candida tropicalis: CTRG_02197
Entry
CTRG_02197        CDS       T01115                                 
Name
(RefSeq) conserved hypothetical protein
  KO
K14772  U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
ctp  Candida tropicalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ctp00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ctp03009]
    CTRG_02197
Ribosome biogenesis [BR:ctp03009]
 Eukaryotic type
  90S particles
   U3 small nucleolar RNA-associated proteins
    CTRG_02197
SSDB
Motif
Pfam: UTP20_N UTP20 UTP20_C HEAT_EF3_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 8296898
NCBI-ProteinID: XP_002547900
UniProt: C5M9N5
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1405 aa
MAKNIRSNGMRCLTELFKIIGDKFDWSDYYDLIYTNLLNPRMNNFADQNLQQPSAMLKLI
GFWITQSNNLPFLYMDEFAPVRAILSLLGRTEAKESVMNTVLDFTINSLERKDEMDERFF
TLLAFVVDSLLQNLPQIIANIYSKEMGARAIKCLLLLISGNYIEDQETKASLIGSLTLAL
EKNNAQIDLDNKANILVSLSSLIDGYDCTFEEILPLYKVISKLFKMFVAKNVRETLVIVI
NSMGNKFKEIEPISGVISGLNSYTERMNEYDFEKRLESYRLVNEELYKSLTPIQWLPLLY
CALFFINDKDELAIRVNAGYMLKRFVDCYSASEHPNEYIRLLKDIILPNLRIGIRKENED
VQTEFILLLEYIIEHSNHYTDLEDMKVLVGHEDDEDNFFQSINNIQLHRRQKAIRKLCDY
KNDLKEGSISHYILPIIEGYVTSKEDKYRNIGLEALETIGVLLRSITWNQYKAIVKRYIA
NLKSQDGLKQKVNLIVSVSFALSESIKQGTNKNLPDQEELDRFILFEVSPPLLKILQVRD
DDTIVARAPLAEALTNFMLCITKDKIDGELPGILTSTCQVMRSRSEELRDAIRKTLGKIA
ISLGPEYMTFILKELKTALSRGSQIHVLSFTVHYLLTCINSVLKHGDLDECIQIIIDIVM
EDIFGAAGQEKDAEGYTSKMKEVKFKKSFDTAEIISSNVSLNKFGNIIEPIKLLLQETIA
HKTQVKLDELLRRLSLGLNHNEQASHIEILHLCYEIYMMSKENDEVQEAKVSEKEQHFLT
TLERKTKKHVDKSLFKQTMQRLSFELLRTAISRHDNLLTVGNLQGFVPLLEEGVKSENDT
VITASLKILNMIIRLPFPDQSIFKACARRSLVLIKDSPSTNSDVCQAALKFLATTIRHNP
EVTMKQSAISYVLTRIQPDLEEPNRQGLAFNFLKAVVAQHIMIPEIYDLMDNVAKLMIVN
HSKEIRDMSRSVYFQFLMEYDQGKGKLEKQFKYLVSNLSYPTEEGRQSIMELIHLIIMKA
GLELLTKLASSFFVALSSILISDVSSRCREMASALITSILKKLDNIDNIEKYCISWLKQS
SNSLLKRCGFSVYKLIINVYGMGKNKELDKIASDNILRIIESAKNDADDENTKSEDVEWE
LLYSSLSTFSSIASNIKEKIFEYGKIWQGIIDVLLFPHSWIRLISCRLVTILLSSEDAYE
DYDLPIIANRLIHQLRAPSISEDLGTQITKNLVLIAMKWEDQQTKWDEEIANDVMLSKIC
GIIRSEQVHSLVSKKSCIKLTAMFIQFTKEDRILKISEMIISALYNYTDSQYATPDDELT
NLSTEALDLVKEKIGTTEYTKLYSQVKRNVNIRRQERRAKRSQLAVSAPDIAAKRKLKKH
ERVREKRKHEKDANGYYKAKKKRMI
NT seq 4218 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggccaagaatataagactgaatggtatgagatgtttaacggaattgttcaaaatcatt
ggtgataaatttgattggtcagattattatgacttgatctatactaatttgttgaatcca
agaatgaacaattttgctgatcaaaatttacaacaaccatcagcaatgttgaaattgatt
ggattttggatcactcaatcaaacaatttaccattcttgtacatggatgaatttgcccca
gtaagagctattttatctttattgggcagaacagaagctaaagaatcagttatgaatact
gttttagatttcacaattaattcattagaaagaaaagatgaaatggatgaaagattcttc
accttattggcatttgttgttgattctttgttacaaaacttgccacaaattattgcaaat
atctattctaaagaaatgggtgcacgtgcaatcaaatgtttgttgttgttaatttctggt
aattatattgaagatcaagaaactaaagcttcattaattggctcattaacattagctctc
gaaaagaataatgcgcaaattgatcttgataacaaagcaaatattcttgtttctttatca
tctttgattgatggttatgattgtacatttgaagaaattttaccattgtacaaagtcatt
tctaaattattcaagatgtttgtcgctaaaaatgttcgtgaaactttggttattgtcatt
aattcaatgggtaataaattcaaagaaattgaacctatttcaggagttatttccggcttg
aattcatatactgaaagaatgaatgagtatgattttgaaaaaagacttgaatcttataga
ttggtcaatgaggaattatataagtcattaactccaatccaatggttaccacttttatat
tgtgctttgtttttcattaatgataaagatgaattagcaatcagagtcaatgcaggttat
atgttgaagagatttgttgattgttattctgcatcagaacatccaaatgaatacattaga
ttattaaaagatattattcttccaaacttgagaattggtattagaaaagaaaatgaagat
gttcaaactgaatttatcttgttgttagaatatatcattgaacattctaatcattacact
gatttagaagatatgaaagtattagttggtcatgaagatgatgaagataatttctttcaa
agtattaacaacattcaattgcatcgtcgtcaaaaagccattagaaaattatgtgactat
aagaatgacttgaaagaaggtagtatttcccattacattttgcctataattgaaggttat
gttacttcaaaggaagataaatacagaaatattggtttagaagcattggaaactattggt
gttttattaagatcaatcacttggaatcaatacaaagcaattgttaaaagatatattgcc
aatttgaaatctcaagatggcttgaaacaaaaggtcaatttaattgtatctgtctcattt
gcattatcagaatctattaaacaaggtaccaataagaaccttcctgatcaagaagaactt
gatcgatttatcttgtttgaagtttctccaccattattaaagatcttacaagtacgtgat
gatgacactattgttgctagagcaccattagcagaagctttaactaatttcatgttgtgt
attaccaaagataaaatcgatggtgaattaccaggtattttaacaagtacttgtcaagtt
atgagatcaagatctgaagaattaagagatgcgattagaaaaactttgggtaagattgct
atttcattgggtccagaatatatgacttttattcttaaagaattgaaaactgctttgtct
agaggttcacaaattcacgttttgagtttcactgttcattatttgttaacttgtattaat
tccgttttgaagcatggtgatttagatgaatgtattcaaattatcattgacattgttatg
gaagatatctttggtgccgctggtcaagaaaaagatgctgaaggttataccagtaagatg
aaggaagttaaatttaaaaagagttttgatactgctgaaattatatcctcaaatgtttca
ttaaataaatttggaaacattattgaaccaattaaattattgttacaagaaacaattgca
cacaagactcaagttaaattggatgaattgttgagaagattatctcttggtttgaatcat
aatgaacaagcttcccatattgaaatcttgcatctttgttatgaaatctatatgatgtca
aaggaaaatgatgaagttcaagaagctaaagtttcagaaaaagaacaacatttcttgact
acattggaaagaaagaccaagaaacatgttgataaatcgctttttaaacaaaccatgcaa
agactttcatttgaattgttaagaactgccatttctcgtcatgataatttattaactgtg
ggtaatttacaaggatttgttccattattagaagaaggtgtcaaatcagaaaatgatact
gttattactgcctcgttgaaaatcttaaacatgattattcgtttaccattccctgatcaa
tctatattcaaggcttgtgcaagaagatcattagttttgattaaagattctccatccaca
aacctggatgtttgtcaagcagctttgaaattcttggctactacaatcagacataatcca
gaagtcactatgaaacaatcagctattagttatgtattaacaagaattcaacctgattta
gaagaaccaaatcgtcaaggtttggcattcaattttttgaaagctgttgttgctcaacat
ataatgattccagaaatctatgatttaatggataatgtcgctaaacttatgattgttaat
cattctaaagaaattagagatatgtcaagaagtgtttatttccaattcttaatggaatat
gatcaaggtaaaggtaaattggaaaagcaatttaaatatttggttagcaatttatcttat
cctactgaagaaggtagacaatcaattatggaattgattcatttgattattatgaaagct
gggttggaattattgactaaattagccagttctttctttgttgctctttccagtatttta
atttctgatgtctcaagtagatgtcgtgaaatggcaagtgctttgattacttcaatccta
aagaaattggataacattgataacattgaaaaatattgtatttcatggttaaaacaatct
tcaaacagtttattaaaaagatgtggttttagtgtttacaaattaatcatcaatgtttat
ggaatgggtaagaataaagaattggataaaatcgctagtgataacatcttaagaatcatt
gaaagtgcaaagaatgatgcagatgatgagaataccaaaagtgaagatgttgaatgggaa
ttgctttattcatctctttcaacattcagttccattgcttctaacattaaagaaaagatt
tttgaatatggtaaaatctggcaaggtattattgatgttttattattcccacattcatgg
ataagattaatttcatgtcgattggtaactatattactttcaagtgaagatgcatatgaa
gattatgatttaccaataatcgccaatagattaattcatcaattaagagctccttcaatt
tcagaagacttgggtactcaaataaccaagaatttagtattgattgctatgaaatgggaa
gatcaacaaactaaatgggatgaagaaattgctaatgatgttatgttatcaaaaatatgt
ggtatcattagactggaacaagttcattcattggtatctaagaaatcatgtattaaattg
actgctatgtttattcaatttactaaagaggatagaattctcaagatttctgagatgatt
atttctgcattatacaattataccgattcacaatatgcaactccagatgatgaattgact
aatttgagtacagaagcattggatttggttaaagaaaagattggtactacagaatatacc
aaattgtactcacaagttaaacgtaatgttaacattagaagacaagaaagaagggcaaag
aggtcacaacttgcggtgtctgctccagatattgctgctaagagaaagttaaagaaacat
gaaagagttagagaaaagagaaagcatgaaaaggatgctaatggttattataaagcaaaa
aagaagagaatgatttaa

DBGET integrated database retrieval system