Candida tropicalis: CTRG_02197
Help
Entry
CTRG_02197 CDS
T01115
Name
(RefSeq) conserved hypothetical protein
KO
K14772
U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
ctp
Candida tropicalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ctp03009
]
CTRG_02197
Ribosome biogenesis [BR:
ctp03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
CTRG_02197
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UTP20_N
UTP20
UTP20_C
HEAT_EF3_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8296898
NCBI-ProteinID:
XP_002547900
UniProt:
C5M9N5
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1405 aa
AA seq
DB search
MAKNIRSNGMRCLTELFKIIGDKFDWSDYYDLIYTNLLNPRMNNFADQNLQQPSAMLKLI
GFWITQSNNLPFLYMDEFAPVRAILSLLGRTEAKESVMNTVLDFTINSLERKDEMDERFF
TLLAFVVDSLLQNLPQIIANIYSKEMGARAIKCLLLLISGNYIEDQETKASLIGSLTLAL
EKNNAQIDLDNKANILVSLSSLIDGYDCTFEEILPLYKVISKLFKMFVAKNVRETLVIVI
NSMGNKFKEIEPISGVISGLNSYTERMNEYDFEKRLESYRLVNEELYKSLTPIQWLPLLY
CALFFINDKDELAIRVNAGYMLKRFVDCYSASEHPNEYIRLLKDIILPNLRIGIRKENED
VQTEFILLLEYIIEHSNHYTDLEDMKVLVGHEDDEDNFFQSINNIQLHRRQKAIRKLCDY
KNDLKEGSISHYILPIIEGYVTSKEDKYRNIGLEALETIGVLLRSITWNQYKAIVKRYIA
NLKSQDGLKQKVNLIVSVSFALSESIKQGTNKNLPDQEELDRFILFEVSPPLLKILQVRD
DDTIVARAPLAEALTNFMLCITKDKIDGELPGILTSTCQVMRSRSEELRDAIRKTLGKIA
ISLGPEYMTFILKELKTALSRGSQIHVLSFTVHYLLTCINSVLKHGDLDECIQIIIDIVM
EDIFGAAGQEKDAEGYTSKMKEVKFKKSFDTAEIISSNVSLNKFGNIIEPIKLLLQETIA
HKTQVKLDELLRRLSLGLNHNEQASHIEILHLCYEIYMMSKENDEVQEAKVSEKEQHFLT
TLERKTKKHVDKSLFKQTMQRLSFELLRTAISRHDNLLTVGNLQGFVPLLEEGVKSENDT
VITASLKILNMIIRLPFPDQSIFKACARRSLVLIKDSPSTNSDVCQAALKFLATTIRHNP
EVTMKQSAISYVLTRIQPDLEEPNRQGLAFNFLKAVVAQHIMIPEIYDLMDNVAKLMIVN
HSKEIRDMSRSVYFQFLMEYDQGKGKLEKQFKYLVSNLSYPTEEGRQSIMELIHLIIMKA
GLELLTKLASSFFVALSSILISDVSSRCREMASALITSILKKLDNIDNIEKYCISWLKQS
SNSLLKRCGFSVYKLIINVYGMGKNKELDKIASDNILRIIESAKNDADDENTKSEDVEWE
LLYSSLSTFSSIASNIKEKIFEYGKIWQGIIDVLLFPHSWIRLISCRLVTILLSSEDAYE
DYDLPIIANRLIHQLRAPSISEDLGTQITKNLVLIAMKWEDQQTKWDEEIANDVMLSKIC
GIIRSEQVHSLVSKKSCIKLTAMFIQFTKEDRILKISEMIISALYNYTDSQYATPDDELT
NLSTEALDLVKEKIGTTEYTKLYSQVKRNVNIRRQERRAKRSQLAVSAPDIAAKRKLKKH
ERVREKRKHEKDANGYYKAKKKRMI
NT seq
4218 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccaagaatataagactgaatggtatgagatgtttaacggaattgttcaaaatcatt
ggtgataaatttgattggtcagattattatgacttgatctatactaatttgttgaatcca
agaatgaacaattttgctgatcaaaatttacaacaaccatcagcaatgttgaaattgatt
ggattttggatcactcaatcaaacaatttaccattcttgtacatggatgaatttgcccca
gtaagagctattttatctttattgggcagaacagaagctaaagaatcagttatgaatact
gttttagatttcacaattaattcattagaaagaaaagatgaaatggatgaaagattcttc
accttattggcatttgttgttgattctttgttacaaaacttgccacaaattattgcaaat
atctattctaaagaaatgggtgcacgtgcaatcaaatgtttgttgttgttaatttctggt
aattatattgaagatcaagaaactaaagcttcattaattggctcattaacattagctctc
gaaaagaataatgcgcaaattgatcttgataacaaagcaaatattcttgtttctttatca
tctttgattgatggttatgattgtacatttgaagaaattttaccattgtacaaagtcatt
tctaaattattcaagatgtttgtcgctaaaaatgttcgtgaaactttggttattgtcatt
aattcaatgggtaataaattcaaagaaattgaacctatttcaggagttatttccggcttg
aattcatatactgaaagaatgaatgagtatgattttgaaaaaagacttgaatcttataga
ttggtcaatgaggaattatataagtcattaactccaatccaatggttaccacttttatat
tgtgctttgtttttcattaatgataaagatgaattagcaatcagagtcaatgcaggttat
atgttgaagagatttgttgattgttattctgcatcagaacatccaaatgaatacattaga
ttattaaaagatattattcttccaaacttgagaattggtattagaaaagaaaatgaagat
gttcaaactgaatttatcttgttgttagaatatatcattgaacattctaatcattacact
gatttagaagatatgaaagtattagttggtcatgaagatgatgaagataatttctttcaa
agtattaacaacattcaattgcatcgtcgtcaaaaagccattagaaaattatgtgactat
aagaatgacttgaaagaaggtagtatttcccattacattttgcctataattgaaggttat
gttacttcaaaggaagataaatacagaaatattggtttagaagcattggaaactattggt
gttttattaagatcaatcacttggaatcaatacaaagcaattgttaaaagatatattgcc
aatttgaaatctcaagatggcttgaaacaaaaggtcaatttaattgtatctgtctcattt
gcattatcagaatctattaaacaaggtaccaataagaaccttcctgatcaagaagaactt
gatcgatttatcttgtttgaagtttctccaccattattaaagatcttacaagtacgtgat
gatgacactattgttgctagagcaccattagcagaagctttaactaatttcatgttgtgt
attaccaaagataaaatcgatggtgaattaccaggtattttaacaagtacttgtcaagtt
atgagatcaagatctgaagaattaagagatgcgattagaaaaactttgggtaagattgct
atttcattgggtccagaatatatgacttttattcttaaagaattgaaaactgctttgtct
agaggttcacaaattcacgttttgagtttcactgttcattatttgttaacttgtattaat
tccgttttgaagcatggtgatttagatgaatgtattcaaattatcattgacattgttatg
gaagatatctttggtgccgctggtcaagaaaaagatgctgaaggttataccagtaagatg
aaggaagttaaatttaaaaagagttttgatactgctgaaattatatcctcaaatgtttca
ttaaataaatttggaaacattattgaaccaattaaattattgttacaagaaacaattgca
cacaagactcaagttaaattggatgaattgttgagaagattatctcttggtttgaatcat
aatgaacaagcttcccatattgaaatcttgcatctttgttatgaaatctatatgatgtca
aaggaaaatgatgaagttcaagaagctaaagtttcagaaaaagaacaacatttcttgact
acattggaaagaaagaccaagaaacatgttgataaatcgctttttaaacaaaccatgcaa
agactttcatttgaattgttaagaactgccatttctcgtcatgataatttattaactgtg
ggtaatttacaaggatttgttccattattagaagaaggtgtcaaatcagaaaatgatact
gttattactgcctcgttgaaaatcttaaacatgattattcgtttaccattccctgatcaa
tctatattcaaggcttgtgcaagaagatcattagttttgattaaagattctccatccaca
aacctggatgtttgtcaagcagctttgaaattcttggctactacaatcagacataatcca
gaagtcactatgaaacaatcagctattagttatgtattaacaagaattcaacctgattta
gaagaaccaaatcgtcaaggtttggcattcaattttttgaaagctgttgttgctcaacat
ataatgattccagaaatctatgatttaatggataatgtcgctaaacttatgattgttaat
cattctaaagaaattagagatatgtcaagaagtgtttatttccaattcttaatggaatat
gatcaaggtaaaggtaaattggaaaagcaatttaaatatttggttagcaatttatcttat
cctactgaagaaggtagacaatcaattatggaattgattcatttgattattatgaaagct
gggttggaattattgactaaattagccagttctttctttgttgctctttccagtatttta
atttctgatgtctcaagtagatgtcgtgaaatggcaagtgctttgattacttcaatccta
aagaaattggataacattgataacattgaaaaatattgtatttcatggttaaaacaatct
tcaaacagtttattaaaaagatgtggttttagtgtttacaaattaatcatcaatgtttat
ggaatgggtaagaataaagaattggataaaatcgctagtgataacatcttaagaatcatt
gaaagtgcaaagaatgatgcagatgatgagaataccaaaagtgaagatgttgaatgggaa
ttgctttattcatctctttcaacattcagttccattgcttctaacattaaagaaaagatt
tttgaatatggtaaaatctggcaaggtattattgatgttttattattcccacattcatgg
ataagattaatttcatgtcgattggtaactatattactttcaagtgaagatgcatatgaa
gattatgatttaccaataatcgccaatagattaattcatcaattaagagctccttcaatt
tcagaagacttgggtactcaaataaccaagaatttagtattgattgctatgaaatgggaa
gatcaacaaactaaatgggatgaagaaattgctaatgatgttatgttatcaaaaatatgt
ggtatcattagactggaacaagttcattcattggtatctaagaaatcatgtattaaattg
actgctatgtttattcaatttactaaagaggatagaattctcaagatttctgagatgatt
atttctgcattatacaattataccgattcacaatatgcaactccagatgatgaattgact
aatttgagtacagaagcattggatttggttaaagaaaagattggtactacagaatatacc
aaattgtactcacaagttaaacgtaatgttaacattagaagacaagaaagaagggcaaag
aggtcacaacttgcggtgtctgctccagatattgctgctaagagaaagttaaagaaacat
gaaagagttagagaaaagagaaagcatgaaaaggatgctaatggttattataaagcaaaa
aagaagagaatgatttaa
DBGET
integrated database retrieval system