KEGG   Candida tropicalis: CTRG_04208
Entry
CTRG_04208        CDS       T01115                                 
Name
(RefSeq) conserved hypothetical protein
  KO
K14829  pre-rRNA-processing protein IPI3
Organism
ctp  Candida tropicalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ctp00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ctp03009]
    CTRG_04208
Ribosome biogenesis [BR:ctp03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
   5-FMC complex
    CTRG_04208
SSDB
Motif
Pfam: Beta-prop_EML_2 WD40 WD40_CDC20-Fz WD40_Prp19 WD40_WDHD1_1st Beta-prop_WDR90_POC16_2nd Beta-prop_EML Beta-prop_IFT140_1st WD40_MABP1-WDR62_2nd EIF3I ANAPC4_WD40 WD40_RFWD3 WDR55 Beta-prop_CAF1B_HIR1 Beta-prop_TEP1_C Beta-prop_Vps41 Beta-prop_HPS5 NBCH_WD40 Beta-prop_TEP1_2nd Beta-prop_WDR75_1st WDR54
Other DBs
NCBI-GeneID: 8299478
NCBI-ProteinID: XP_002549911
UniProt: C5MDA7
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 522 aa
MDEVVFYIGEGDPNDKHSQESYGYITSIHTSKQYSTFRQANSFKNGTVLTGIGSGERIFC
CVPNKALINVYSFGKESIDQRIPVPEALTCLNLINHPISSINNNNDDELYNKSNYRVPWL
LVGGSKSGKLYIWELNSGNLLCVKEAHYQGITVIKSSKCGTFLITGGEDARCIIWNLHEL
ISIYNDKSDKNDSNNNNIVKPYWQITDNTLPLTDLILNDVEILNDLKLYTTSKDNTVRIY
DIMTKSLLTTFILPDSVECITKDPSNRALYVGLSNGLIRTIPLYQINPHTSVLESIGGMN
KIITLDQDPNLKNTFVPHQQQQQQNEGKQILVTKLEISLDGTNIISGDSQGRVFVSDIVT
KQVVKSFNACNSSISFIAVDTVPNGFDLSINDTTTTTTKNNNNKDKKHRMIPNFKRVLAS
TNPEDHQLMLDIPGKIQTSNNKKNDDDFENWLNNKQMEELEFKNLSNINSTVKKVENGSS
SNNNDNNKELEDKLQKVSQAYTELRSKHEELIKEHAKLLDKL
NT seq 1569 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatgaagtagtattttatattggagaaggggatccaaatgataaacatagtcaagaa
tcctatggatatattacatcaattcatacatcaaaacaatattcaacatttcgtcaagca
aattcatttaaaaatggtactgttttaactggtattggatcaggtgaaagaatattttgt
tgtgttcctaataaagcattaattaatgtttattcatttggtaaagaaagtattgatcaa
cgtatacctgtacctgaagcattaacttgtttgaatttaattaatcatcctatatcatca
attaataataataatgatgatgaattgtataataaaagtaattatagagttccttggtta
ttagtaggtggatcaaaaagtgggaaattatatatatgggaattaaattcaggtaattta
ttatgtgttaaagaagctcattatcaaggaataaccgttattaaaagttctaaatgtgga
acatttttaattactggtggtgaagatgcaagatgtataatttggaatttacatgaatta
atttcaatttataatgataaatctgataagaatgatagtaataataataatattgttaaa
ccatattggcaaattactgataatacattaccattaactgatttaattttaaatgatgtt
gaaattttaaatgatttaaaattatatactacttcaaaagataacactgttagaatttat
gatattatgactaaatctttattaactacatttattttacctgattctgttgaatgtata
actaaagatccttcaaatagagcattgtatgttggtttatcaaatggtttgattagaaca
ataccattatatcaaataaatcctcatacttcggttttagaaagtattggaggtatgaat
aaaattataactttagatcaagatccaaatttgaaaaacacttttgttcctcatcaacaa
caacaacaacaaaatgaaggtaaacaaatattagttactaaattggaaatttcattagat
ggtactaatataatatctggagattctcaaggtagagtatttgtttcagatattgttact
aaacaagttgttaaatcatttaatgcttgtaattcttcaatttctttcattgcagtagat
acagtaccaaatggatttgatttatcaattaatgataccacaacaacaacaactaaaaat
aataataataaagataaaaaacatagaatgattcctaattttaaaagagtattagctagt
acaaatccagaagatcatcaattaatgttagatattccaggtaaaattcaaacatctaat
aataaaaagaatgatgatgattttgaaaattggttaaataataaacaaatggaagaatta
gaatttaaaaatctttcaaatataaattcaacagttaaaaaagttgaaaatggatcatct
tctaataataatgataataataaagaacttgaagataaattacaaaaagtatctcaagct
tatactgaattaagatctaaacatgaagaattaattaaagaacatgctaaattattagat
aaattataa

DBGET integrated database retrieval system