Candida tropicalis: CTRG_04239
Help
Entry
CTRG_04239 CDS
T01115
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K24781
beige protein homolog 1
Organism
ctp
Candida tropicalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ctp04131
]
CTRG_04239
Membrane trafficking [BR:
ctp04131
]
Endosome - Lysosome transport
Others
Others
CTRG_04239
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Beach
PH_BEACH
WD40_WDHD1_1st
Beta-prop_TEP1_2nd
WD40_CDC20-Fz
WD40_Prp19
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8298787
NCBI-ProteinID:
XP_002549942
UniProt:
C5MDD8
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1381 aa
AA seq
DB search
MPDFLILLNNMVLNSMYTLNLKSGKLLGSNPSTPDRRHIEENVTLSLNTLHLINQYIDSI
SLGFEIIKPLQVFYTSKDFLEGIVELLGYLRLSLHWDNIDVQKSMRSTYDKLIKVIANFY
IANLSNDNFLQSFDKLSDFTKKLLLDLVFPNLLEHINQFITISNFVFNEKKFFNNTIQLL
HHYNEELLRQKYYVSTENFDTFLVCAISISDIGIGHAMGYLRRILGDNIVIKFLRCAFDI
EISFEECSDNLNTILKELLYRQTTTMSKDVISNDQLMCIITLLLGLVLTTGPNDEVLNPE
LPFNFLRTFYLMRQDEIPGIINHMNYDKNLMLDFFNNLVTKNDSETLMRLQKYPPFVKSI
IKESNHLKEIYNKTDYQKVSSMITVTLHNGGKLGQMNNIYIKSFEKDCESMKNQIMNTEL
VKFNRLVQDNEENIKHAISTYHGLKTEISRLFNGNDIQHKNYVLDYIENVDRMRRRLVVE
DQIPESEKLTYNIDIPLKKIGSFTDVSFIREYDYAISATGIDTLSISNDDVHNGDETFEI
IDSNDETIEESEHNNVFEDKNRKVSRSLFFGDQIVTIWNISQVNGLVPAESLMILGSSHL
YLIENYILSKDGNVIDVDDAPDELRDPILQLVNSQSNNILKNENKLHRSKNWGLDKLSCI
SKRQFLLRDIALEMFFTDGASILITCMSTRDRDNIYSKLSSFASGKGVDYDLIQTLQSSS
ANAYYTGGSSSSSSSSSSFLSSKLVSALSQSGLSSSISFLEATKKWRQGEMSNFYYLMII
NTLAGRTFNDLSQYPVFPWVIADYTSETLDLSDPRTFRDLSKPMGAQTPNRANKFQERFE
ALDSLNDHDAPAFHYGTHYSSAMIVTSFLIRLKPYVQSYLLLQGGKFDHADRLFNSVEKA
WLSASRDNTTDVRELTPEFYYLPEFLVNSNNFEFGKLQSGESSNDVKLPPWANGDPKVFI
AKNREALESSYVSANLHLWIDLIFGYKQNGEEAVKALNVFHHLSYNGAINLDNISDETEK
RAVIGMINNFGQTPSKLFTKPHPMKDVLNLPNYYLTLFDSGATNLKTAFESKMKAPIVKL
EMSSKNAKRWVGRQNCISCEDDLLIRKSNKLKYESGSLLINDSLFLNLHSGNITALLQLG
HKLFVTGASDGIMNVWKCNLRPTTSLVSMAILRGHLTSILKIVFSKSFKFGASIDRDGYV
IIWDFIRFQFVRKWSPPLEYTSNSGKPSSLLAVSNDSGNFATVHFIENRVILRLFSVNGE
LIITKEIEYTEDNPITAISFANTNTTMVDTDRTLNHNRHIYWSNEIFSITRKKMVEIWEL
VHDNKDWAFRNMDQIDLTDKIAGDITAIELFKCSEVDHDDKLIRGELKLIIGDSVGKVYT
L
NT seq
4146 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccagattttttgattcttttgaataatatggtattaaactcgatgtataccttgaac
cttaaatcaggaaagttattaggtagcaacccgtctactccagatagacgtcatattgaa
gaaaatgttacattgtcattgaacacacttcatttgatcaatcaatatattgattcaatt
agtcttggatttgaaattataaaaccacttcaagtgttttatactagtaaagatttcttg
gaaggcattgttgagttattggggtatttgaggttatcattacactgggataatatagat
gtacagaaatcaatgcgatctacatatgacaagcttattaaagtcattgccaatttttac
attgccaacttatccaatgacaattttttgcaaagttttgacaagttaagtgatttcacc
aagaagttattactagaccttgtgtttccaaatttattagaacatatcaatcaattcata
accatttcaaattttgtatttaatgaaaaaaaattcttcaataatactattcaattatta
caccattacaatgaggaattattgagacagaagtattacgtttcaacggaaaattttgat
acatttttagtttgtgctatttcaattagtgatattggaattggccatgctatgggttac
cttagaagaatacttggtgataatatcgtaatcaagttccttcgttgtgcttttgatatt
gaaattctgtttgaagaatgtctggataatttgaatacgattttgaaagaactattgtac
cgacaaaccacaactatgagcaaagatgtgattagtaatgaccaattgatgtgcataatt
accttgttactcggacttgtgcttactactggacccaatgacgaagttctaaatcctgaa
ttgccttttaatttcttgagaacgttttatttgatgagacaggatgaaataccgggaatt
atcaatcatatgaactatgataagaacttgatgttagattttttcaacaatctagtcacc
aagaatgatagtgaaacattaatgagattgcaaaaatacccgccatttgtgaaaagtata
atcaaagaatcaaatcacttaaaggaaatttacaataaaactgattatcaaaaagtgtca
agtatgataacagtaacactacacaatggcggtaagttaggacaaatgaataacatctac
ataaaaagttttgaaaaagattgtgaactgatgaaaaaccagattatgaatactgagttg
gtaaagtttaacagattggtgcaagataatgaagaaaacattaaacatgcaatttcaaca
tatcatgggttaaaaactgagatttccagattgtttaatggaaatgacattcagcataag
aattatgtgcttgattatattgaaaatgttgatcgtatgagaagaagattggtggttgaa
gatcagataccagaatctgaaaagctaacatataacattgatattccattgaagaaaatt
ggttcttttacagatgtaagttttattcgtgagtatgattatgcgataagtgcaactggg
attgatactttgagtatttctaacgatgacgttcacaatggtgatgaaacgtttgagata
attgacagtaacgacgaaacaattgaagaatctgagcataataatgtgtttgaggataag
aatagaaaggttagtcgaagcttgttttttggtgatcagattgttacaatttggaatatc
agtcaggtcaatggattagtacctgctgaaagtttgatgatacttggttcgagtcatttg
tatttgattgagaactacattcttagcaaagacggcaatgttattgacgttgatgatgca
ccagatgagttaagagatcctattttacagttagttaactcccaatcgaataatatcttg
aagaatgagaacaaattacacagaagtaagaattggggattagacaagttaagctgtatt
tccaagagacaatttttattgagagacattgcgttagagatgttttttacggacggtgca
agtattttaatcacttgtatgtcaactagagatagagataatatttattctaaattgtct
tcgtttgcttcgggaaaaggtgtggattatgatttaattcagacactacaatcatccagt
gcaaatgcatattatactggtggatcatcatcgtcatcatcatcatcctcttcattcctt
tcatccaaattggtatctgctctttctcagagtggactttcaagcagtatatcatttctt
gaagcgaccaagaaatggaggcagggtgaaatgtctaatttctattatttgatgattata
aatacattagcaggaaggacgtttaatgatttatcgcagtatccagttttcccttgggtt
attgctgattacaccagtgaaacattagatttatcagatccaagaacttttagagactta
tctaagccaatgggcgcacaaactccgaatagagcgaataaatttcaagaacgatttgag
gctttggatagtttgaatgatcacgatgcacctgcattccattatggtacgcattattcg
tcggcaatgattgtcacttcgtttttaattagacttaaaccatatgttcagtcttatttg
ttgttacaaggtggtaaatttgatcatgctgatcgattatttaattcggtagagaaggct
tggttatcagcttcaagagataatactactgatgtaagagaattgactcctgaattttat
tatcttcctgaatttttagtaaactcaaacaattttgaatttggtaaattgcaaagtgga
gagtcttcaaatgatgtgaaattaccaccatgggccaatggtgatcctaaggttttcata
gccaaaaatagagaagctttggagagttcttatgtgtcagccaacttgcatttatggatt
gatttgatatttggatacaaacagaatggtgaagaagctgtcaaggcattgaatgttttc
catcacttgtcttacaacggagctattaatttggataatattagtgatgaaacagaaaaa
cgtgctgtcattggtatgattaacaattttggacaaactccaagtaaattattcaccaag
ccacatccaatgaaagatgtacttaacttgccgaattattacttgacattgtttgattcg
ggagcaactaatttaaaaacagcatttgaatcgaaaatgaaagccccaattgtaaaattg
gagatgagttcaaaaaatgccaaaagatgggttggtagacaaaactgtatttcatgtgaa
gatgatttattgattagaaaatctaataaattgaaatatgaaagtggttcattgttgatc
aatgatctgttatttttgaatttacacagcggtaatataactgcattattgcaattgggt
cataaattgtttgtcactggtgcttctgatggaataatgaatgtttggaaatgtaatctc
cgaccaacgacaagtttagttagcatggctatattaagaggacatttgacaagtatcttg
aagattgtttttagcaagagcttcaaatttggtgcaagtatagatagagatggttatgtt
ataatatgggatttcattaggtttcaatttgttcgaaagtggtcacctccattagaatat
acttctaacctgggcaagccatcgtctttgttggctgtttcaaatgattccggaaatttt
gcaactgtgcattttattgaaaacagggttatattacggttatttagtgttaatggagaa
ttgataatcacaaaagaaattgagtatactgaagacaatccaattacagcaatttcattt
gcaaataccaacaccactatggttgatacagacagaacacttaatcataatagacatatt
tactggtcaaatgaaattttttcaattactagaaagaaaatggttgaaatttgggagttg
gttcatgataataaagattgggcattcagaaatatggatcaaattgatttgacagataaa
attgctggcgatatcacggccattgaactattcaaatgttctgaagttgatcatgatgat
aaattgatcagaggtgaattgaaattgattatcggtgattctgtagggaaagtatatact
ttataa
DBGET
integrated database retrieval system