Chryseobacterium sp. C-71: LNP04_09205
Help
Entry
LNP04_09205 CDS
T08775
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
ctur
Chryseobacterium sp. C-71
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5122
Por_Secre_tail
LBP_M
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UFH33858
LinkDB
All DBs
Position
complement(2013966..2015381)
Genome browser
AA seq
471 aa
AA seq
DB search
MKKSFLSLGILLGIQFGFAQSIDTNFGSNGTVTHAEKGSFFQTTLLPDGKMILSGSYEST
TSKKAVILRLNTDGSLDQTFATAGIFTMDLQASTDYYEAFSKVLVQSDGKLFFAYGNQLD
NGIDPESLTLNLMRLNANGTPDTTFTNPWSTTTTDIDNAPIDFKLLSSGKYLTYGPNYIM
RFNSNGSLDTTYGTNGIRTITFEINELFVSGDNVYIDGYPTSNSNNRTLYKLLNETTGIS
GSNNYVMGRVYQNNSSFYIDQNNFNVHELLKLDANLAPAAGFGTNGKVSLSSQLYTSEML
FQSGGSIIIYANDNSGSQTNHTFTRLNFNGAVNTGFGQGGTFTMTIPNSAGFQPYAENLV
HPNGSIYNLFYGNNNTNNIFLKKILLPNEVLALKDNLKPNDKITILENPVENILKLSDDL
KSATIYDASGKLIMNNLKGREHVVGSLPKGVYIINDKSDNGQGSNLKFIKK
NT seq
1416 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatctttcctttctttaggaattttattaggaattcaatttggttttgcacag
tctattgatactaattttggaagtaatggtactgtaacacatgccgaaaaaggttctttt
ttccagaccactcttttgccggatgggaaaatgattttaagtggaagctatgaaagcact
acttccaaaaaagcagtaattttaagattaaatactgacggatctttagatcaaactttt
gcaacagcgggtatttttacgatggatcttcaggcaagtactgactattatgaagctttt
tcgaaggttttggttcagagtgatggcaaattattctttgcgtatggaaaccaactcgat
aatggtattgatccagaatctcttacattaaatcttatgagacttaatgctaatggcaca
ccagatactacgttcacgaacccatggtctactaccactactgatattgataatgctcct
attgatttcaaactgctttcatcaggaaaatatcttacctatggtccaaattacatcatg
aggtttaattcaaatggaagtcttgatacaacttatggtacaaatggaatcagaacaatt
acatttgagattaatgagcttttcgtaagtggagataatgtttatattgacggataccca
acaagcaactctaataacagaactttatataaattgctaaacgaaactaccggtatttcg
ggttctaataactatgtaatgggaagagtttatcaaaataattcatctttttacatcgat
caaaataattttaatgttcacgaattgctaaaattggatgctaatcttgctccggctgct
ggatttggaactaatgggaaagtttcattatcatctcagctttacacctctgaaatgcta
tttcagtcaggggggagtattataatttatgctaatgataattctggttcacaaactaac
catacttttacaagattgaattttaatggtgctgtcaatacaggatttggacaaggggga
actttcacaatgacaatccctaattcagctggttttcagccttatgctgagaatctcgta
catccaaacgggagtatttataatttgttttatggaaataataatactaataatattttt
ctaaaaaaaattctccttccaaatgaagttcttgctctaaaagacaatcttaagccaaat
gataagataactattttagaaaatccggtagaaaatatactaaaactttctgatgattta
aaaagtgccactatttatgatgcatctggaaaacttattatgaataacctgaagggacgt
gagcatgtagtaggttcactacctaaaggcgtttacattattaatgataaatctgataat
gggcaaggtagtaatcttaagtttataaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
