Clostridium tyrobutyricum: CTK_C01220
Help
Entry
CTK_C01220 CDS
T04331
Name
(GenBank) spore germination protein-like protein
Organism
ctyk
Clostridium tyrobutyricum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Spore_permease
Spore_GerAC_N
Spore_GerAC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AND83392
LinkDB
All DBs
Position
140922..143177
Genome browser
AA seq
751 aa
AA seq
DB search
MKYKKFITSFGLFSTIIVTVIGVGIFSYPQEISSIVGTDGWIVTIFAGLIAYLLLYIAYL
AVKRNGYNKLYIILNNNFGKIFGGILALIFIAYNIISISFGMRIFTEVVKMYLLEKTPTE
FIFIVTILTGMYLITGGLGSLVKFNEISFWIMFVPVIIMMIFTLNNVDFSNILPVFNNNP
IKYAEAFKTCIYSFSGIEIIYLMIPFIKSRFSLIKTTSKSIVFITVFYAVIVILSLSVFS
KHQTNILLWPTMTMMKSINIQGAFIERWEGVAMAMWVMFYFTTFSNLYYLSSDIVKDMFK
LKSITIPSIVLGVIVYIIALYPKNIATLYDMGNKFIPPLFIFNVVILPMIILLFRKLKKK
SIIKKVMPLILICVLLTGCWDKVEIENKQLVSIIGVDTGEDIDKQKYLKNVKPEDPLTSI
DLKKIHLTFGSPDLSQLGPDKGAQAEDKYIDADGYSFQDAVSKARLKSSRSIRFSHTSLL
VFSDGIMEHPYVLKEILDYLQREPSLNRNMYIVVVQGKAERYIKLKTNMEKNMESYIIGL
INNDSSNTEIIPVSLNDFLVQMNENGNSLLPKIGMDENNKDVKVLGSLAIKNFKAKGILN
PTETANIEFLKGKLKGSKRMIYLDNHPVDIDINNTNRKISVGEVKGKLQFNIHLRMEAQI
KNYYLDKNLFSVNTLKFIQDNFNKSIKIECEEALKKIQQELVIDPIGLGKYLEEYHPGIW
NRVKDNWDTEYKDSTINVNIDTQIRRIGVVK
NT seq
2256 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatataaaaagtttattactagttttggattatttagtactattattgtaactgtt
ataggagtaggaatattttcatatccacaagaaatatcctctattgtaggtacagacgga
tggattgtaaccatttttgcaggacttatagcgtatcttttactgtatatagcatatttg
gcggtaaagagaaatgggtataataaattatacattatattaaataataattttggaaaa
atatttggggggattttagctttaatttttatagcatataatataatttcaatatctttt
ggtatgagaatatttactgaagtagtaaaaatgtatcttttagaaaagacccccactgaa
tttatatttattgtaactatacttacaggaatgtatttaataactggaggtttggggagt
ttagtaaaatttaatgaaatatccttttggataatgtttgtaccagttataatcatgatg
atttttacattgaataatgttgacttcagtaatatattacccgtattcaacaataaccct
attaagtatgcagaagcgtttaaaacttgtatatatagtttttcaggaatagagataata
tatttaatgattccttttataaaatctagattttctttaattaagacaactagtaaaagt
atagtatttataacagtattttatgctgtaattgtgatactatccttgtccgtattttca
aaacaccagaccaatatattactctggccaactatgactatgatgaaatctataaatatc
cagggggcatttatagaaagatgggaaggtgtagctatggcaatgtgggttatgttttat
tttaccacgttttctaatctatattatctatcttcggatatagtaaaggatatgtttaag
ttaaaaagtattactattccatctatagttttaggagtcatagtctatattatagctctt
tatccaaagaatatagccactttgtatgatatggggaataaatttatacctccattattt
atatttaatgttgttatacttccaatgattatacttcttttcagaaagttaaaaaaaaaa
tcaattataaaaaaggttatgccattaattctcatatgtgttctacttacgggatgctgg
gataaggtggaaattgagaataagcagttggtttcaataattggagtggatacaggagag
gacatagataaacagaagtatctaaagaatgtaaaacctgaagacccactaacttccata
gatttgaaaaaaattcatcttacatttggttcaccggatttatctcaattagggccggat
aaaggtgcacaggcagaggataaatatatagatgcagatggatactcttttcaagatgca
gttagtaaagcaagacttaaaagcagcagatctataagatttagtcacacgagcttgttg
gtatttagtgatggtattatggaacacccatatgtattaaaagaaattttggattatcta
caaagagagccgtcattaaaccgaaatatgtatatagttgtagttcaaggcaaagcagag
aggtatataaaactaaaaaccaatatggaaaaaaatatggaaagttatattataggatta
ataaataacgattctagcaatacagaaataattcctgttagtttaaatgattttttagtt
caaatgaatgaaaatggtaatagtcttctacctaaaataggaatggatgaaaataataaa
gatgtaaaagtattgggatctttagctattaaaaattttaaagctaaaggaattctaaat
cctacagaaactgcaaatatagaatttttaaaaggtaaattaaagggaagtaagaggatg
atatatctagataatcatcctgttgatatagatattaacaataccaatagaaaaataagt
gtaggtgaagttaaaggaaaattgcaatttaatatacacttaaggatggaagctcaaata
aaaaattattatttggataagaatctgttttcagtaaatacactaaagttcattcaagac
aattttaataaatctataaagatagagtgtgaagaagcattaaaaaaaatacagcaagag
ttagtaatagatccgataggacttggaaaatatttagaagaatatcacccaggtatatgg
aatagagtcaaggataactgggatactgaatataaagattcaactataaatgttaatata
gacactcaaataagaagaattggagtagtaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system