Clostridium tyrobutyricum: CTK_C03880
Help
Entry
CTK_C03880 CDS
T04331
Name
(GenBank) antimicrobial peptide ABC transporter permease
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
ctyk
Clostridium tyrobutyricum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctyk00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ctyk02000
]
CTK_C03880
Transporters [BR:
ctyk02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
CTK_C03880
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
MacB_PCD
DUF6507
APG6_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AND83658
LinkDB
All DBs
Position
complement(384558..387605)
Genome browser
AA seq
1015 aa
AA seq
DB search
MLFKNTLIKIKKSFGRYISLFIIVMVGIGFFLGLKSSSPDIINSVDKYYKAHNLMDFKVV
STMGLTDNDVKSIKSLKGIKNVAPSYSLDVLDKSKAIKVQGLETSINTVKLINGRMPKSD
KECIADIKKYKVGDKITIDSTTGKNLKNKEFTVVGTVESPLYMDTDYGSTTIGDGKLTSF
IFVNKDNFNMDAYTEIYITAANTKNVTSYSQKYDSISKQINNELVKLKPERENARYQEIY
NKAMDKINANQIKLNTEKKNNQKKLSDVKAALDMNKAKLENAKKVLDENESELNKKASNQ
ESEFQKAKNKITSGRNQINTVLINKGISEKELSAKITKLGSAISSMKEQQSKLSPNSQKY
VQINTQLNQYSASYKGLLQLQKSINALNTQESKLSQGIAIFNTQINSARDKIKKGRTQII
QSEKKLNYGYSEYNKNLSTFNTKMTDAQKKIDNAKKDVSSIEKAKWYIYDREDTVLGYSN
LKSATDTITSVAAVFPLFFILIVMLMTSNTMARMIMEERGELGTLTSLGFKNTSIISTYL
FYVLSATILGTITGFFIFTNVIPNIIYSTLNKFILPPLSIKYDIISLLVVLAVITALMTG
VTVFFCNKALKQYPAILMRPVPPQNGQRILLEKIGFIWKHLSFNSKVTIRNIFRYKQRVL
MTIVGVAGCTALLVTGFGIRDSINGVAEKQYGEIFKYNTLIVLKNETKSIGGSLKGLLAK
ENIESPLLIKQTSFKAESGNQSLDTYLIVPENENLFRKYYNARNPSTGNDIKINNNGVVI
TQKLAEILKIGKGDTIKIKDMDNNLYSLKVSDVAENYMQNYIYINKNLYSKTFGKDISYN
MIVSNCSQNKNITAKHLLKSDSIINVTFKDDILSQAANGNKSLNNVVVLLVVVAAMLVII
VLYNLTSINMSERKREIATLKVLGFNDGETNQYIYREAFLLTLVSIVVGLILGIPFHSFV
IDVIEDTGNVYFKNIHAGSFVWSALIIILVSIIMQIVTYFKMKKINMIESLKSVE
NT seq
3048 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttatttaaaaatactctaattaagataaaaaaatcttttggaagatatatatcactg
tttataattgttatggtaggaattgggttctttttaggcttaaagtcgagctccccggat
attatcaattctgttgacaaatattataaagcacataatttaatggacttcaaggtagta
agtacaatgggattgacggataatgacgtaaaatcaattaaatcattgaaaggtataaaa
aatgttgctccaagctattccctggatgttcttgataaaagtaaggctataaaagtacaa
ggactagaaacttcaataaatactgttaaattaataaatggacgaatgcctaaatcggac
aaggaatgtattgcagatattaaaaaatataaagtcggtgataaaatcacaattgacagt
actacaggcaagaatttaaaaaataaagaattcactgtcgtaggtacagtagaatctcca
ttatatatggatactgattatggcagtactacaattggcgatggaaaactgacatcattt
atatttgtaaacaaggataatttcaatatggatgcctatacggaaatttatattactgcc
gcaaatactaaaaatgtcacatcatattcgcaaaaatatgacagtatatcaaaacagatt
aacaatgaactcgtaaagttaaaacctgaaagggaaaatgcccgttatcaggaaatttat
aacaaggcaatggataaaataaatgctaatcagatcaagcttaatacagaaaagaaaaac
aatcagaaaaaattatctgatgtcaaagctgcacttgatatgaataaagccaaactggaa
aatgcaaaaaaggtgcttgatgaaaatgagtctgaattaaacaaaaaagcttcaaatcag
gaatccgagtttcaaaaagcaaaaaataaaattaccagcggccgaaatcaaattaatact
gtattaattaacaagggtatttcagaaaaagaattaagcgcaaagattactaagttgggt
tccgctatcagctccatgaaagaacaacagagcaagctatctcccaacagccaaaaatat
gtacaaattaatacacaactcaatcagtactccgcttcttataaaggattgctgcaacta
caaaaatcaataaatgcactaaatactcaggaaagcaagttaagtcagggaattgcaata
ttcaacacgcaaataaacagcgcaagggacaaaattaaaaaaggtagaacacagatcata
caaagtgaaaaaaaactaaactatggatatagtgaatacaataaaaatctatctactttt
aatactaaaatgactgatgctcaaaaaaagattgataatgctaaaaaggatgtttcttca
atagaaaaagccaaatggtatatttatgacagagaagataccgtattgggatacagcaat
ctaaaaagtgctacagacactattacttccgtagcagctgtctttccactgttcttcata
ttaatcgtaatgcttatgacatcaaatacaatggcaagaatgattatggaagagcgtgga
gagcttggaacacttacttcactgggatttaaaaatacaagtattatttcaacatatttg
ttttatgtactgtctgctacgatattgggaactataacaggattttttatatttacaaat
gttattcccaacattatatactcaactttaaataaatttattttaccaccactgtccatt
aagtacgacataataagtttattagtggtattagcagttattacagcccttatgactggt
gtaacagtctttttctgcaacaaggcattaaaacagtaccctgctatcttaatgcgccct
gtcccaccacaaaatgggcaaagaatccttcttgaaaaaataggatttatctggaagcat
ctttcatttaatagtaaagttacaatacgtaacatattccgttataagcaaagagttctt
atgactatagttggagtggccggatgtacagctctgctggtaaccggttttggaataagg
gacagtattaatggtgttgcagaaaaacaatatggtgaaatttttaaatataatacattg
attgtacttaaaaatgaaactaaaagtattggtggaagcttaaagggtctgctggcaaaa
gaaaatattgagagccctcttttaattaaacagacatcttttaaagctgaatcaggtaat
cagtcactggatacctatttaatagtgccggaaaatgaaaatttgttcaggaaatattat
aatgcaaggaatccctcaaccgggaatgacattaaaataaataataatggtgttgtaatt
actcaaaaacttgctgaaattttaaaaataggcaaaggtgatacaatcaaaataaaggat
atggacaataatttatattccctaaaagtatctgatgttgcagaaaactatatgcaaaac
tatatttatatcaataaaaacttatacagtaaaacatttggaaaagacatttcctataat
atgattgtatccaattgcagccaaaataaaaatataacagccaagcatttactgaaaagc
gattctattataaatgtaactttcaaagatgatattctgagtcaagctgctaatggaaat
aaaagcttgaataatgtagttgttttactggtcgtcgttgcagcaatgctggtaattatt
gttctttataatttaacatcaatcaatatgagtgaaagaaagcgggaaattgccacattg
aaggttcttggatttaacgatggagaaacaaatcaatatatttaccgtgaagcattttta
ttgacactggttagtatcgtagtaggcctgatactgggtattccctttcatagttttgta
attgatgttatagaagatactggaaatgtatacttcaagaatatacatgctggcagtttt
gtatggtcagctttgattattatactggtttcaattattatgcagatagttacgtacttc
aaaatgaagaaaatcaatatgattgaatccttgaagtctgtcgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
