Clostridium tyrobutyricum: CTK_C24880
Help
Entry
CTK_C24880 CDS
T04331
Name
(GenBank) activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase-related protein
Organism
ctyk
Clostridium tyrobutyricum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF2229
BcrAD_BadFG
FGGY_N
DEDD_Tnp_IS110
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AND85734
LinkDB
All DBs
Position
complement(2462040..2466338)
Genome browser
AA seq
1432 aa
AA seq
DB search
MRNLFHVGLDVGSTTVKIVVSDIKDSIVYNKYQRHFSDIKSTIAKVVKDAYDKLKDSDIT
IMVTGSGGLSVSKWLDIPFIQEVVACTNTIEKTIPETDVAIELGGEDAKITFFDDGIDQR
MNGSCAGGTGAFIDQMASLLQTDAKGLNEMAKNYKVIYPIAARCGVFAKTDVQPLLNEGA
AKEDIAVSIFQSVVNQTISGLACGKPIRGNVAFLGGPLYFLSELRKRFIDTLGLADNQII
FPENSQLFVAQGAALSSKDEEVISFKGLIESLSHLNEFLIDDVQTLDPLFNSEHELVEFK
QRHAKSVVKRGNLNTYTGNCYLGIDAGSTTTKAVLIDNQGRLLYSFYGSNHGNPLKSSIE
ILKDIYEKMPSTVKIANSAVTGYGEGLIKAALSVDVGEVETVSHYKAAEFFQPGVDFILD
IGGQDMKCLKVKNGVIDSIMLNEACSSGCGSFIETFANSLNMKIQDFAKVAESSKRPVDL
GSRCTVFMNSKVKQAQKEGLSVGDISAGLSYSVIKNALFKVIKIRDPKELGKKIIVQGGT
FYNDAVLRAFELISGREVIRPDIAGLMGAFGAAIIAKEKFSSLHETTLLKPEDINSFNTE
VSMRRCGKCANNCLLTINKFSDGKKFVSGNRCERGIGAESTKNNIPNLFEYKYNKIFNYI
PLKKEQAPRGQVGIPRVLNLYENYPFWFTFFTKLGFRVEISPRSTKNLYSLGIETIPSES
VCYPAKLVHGHIMSLINRGIKFIFYPSIPYEQKEQEKADNHYNCPIVTSYPEVIKKNMDI
IAEKNVNFKNPFLPLDNKKRLIKRLIEELAEFHIKEGEIQDAVELAYKEDEKVKSDIRNK
GKEVVEYLNKTGKKGIVLAGRPYHVDPEINHGIPNIITSYGMAVLTEDSVAHLGVIERPL
RVVDQWVYHSRLYAAASFVATQKNLELIQLNSFGCGLDAVTTDQAQEILNRYEKIYTVLK
IDEVSNLGAIKIRIRSLKAALEERDKAGFEPHKIEENNKRIVFTKEMRKNHTILCPQMSP
IHFQFIQEGFNASGYKLEILPSVDKKAVDEGLKYVNNDACYPSIIVVGQIIEALKSGKYD
LDNTSVLISQTGGGCRATNYIAFLRKALKEANMENIPVISLNVVGMEKNPGFKISPGLVN
KGLMGLMYGDLFMKVLYKVRPYERISGSANLLYNNWVEKCKANVRNGKHGEFKRNIYQIV
NDFDNLEIKNIKKPKVGVVGEILVKFHPTANNNIVELLENEGAEAVVPDLTDFLLYCAYD
AKFKREKLSGTLMDEMSKGVAIKFIEHFRKHMRNALRKSKRFSPPSTISELAEGASKVLS
LGHQTGEGWFLTAEMIELIKSGTKNIVCMQPFACLPNHVTGKGMIKELRRKYPGSNIAAI
DYDPGASEVNQLNRLKLMLSVAFKSFKKEEKKVHNENRQFVAEKVLMNNINK
NT seq
4299 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaatttatttcatgtaggtcttgatgttgggtcgactacagtaaaaatagttgta
tctgatataaaagacagtatagtttataataaatatcaaagacatttttcagatattaaa
agtactatagccaaagttgtcaaagatgcttatgataaattaaaggattcagatataact
ataatggtaacaggatctggaggattatcagtatctaaatggcttgatataccatttatt
caggaagtagtagcatgtactaatactatagaaaaaactattcctgaaacagatgtggct
atagaacttggtggggaagatgcaaaaataacattttttgatgacgggatagatcagaga
atgaatggatcttgtgctggaggtacaggtgcttttatagatcagatggcatctctactt
cagactgatgcaaaaggtctaaatgaaatggctaaaaactataaggtcatatatcctata
gcagcgcgatgtggtgtatttgcaaaaactgatgttcaaccacttttaaatgaaggtgcg
gctaaagaagatattgctgtatccatatttcaatcggtagtaaatcagactattagtgga
cttgcatgtggcaaacctattagagggaatgtagcatttttaggtggaccactatatttt
ttgtctgaacttagaaagaggtttatagataccttgggacttgcggataatcaaattatt
tttcctgaaaattctcaattatttgttgctcagggagccgctctttcctctaaagatgaa
gaagttatttcttttaaaggtttgatagaaagcctttcacatttaaatgagtttttaatt
gatgatgtacagactttggatccactttttaatagtgaacatgaattagttgaatttaaa
caaagacatgccaagagtgtagtaaaaagaggaaatttgaatacttatactggaaattgt
tatcttggtatagatgctggttcgactactacaaaagcagtactcatagataatcaggga
aggcttttatactctttttatggaagtaatcatggtaatccattaaagtcatctattgaa
atactaaaagatatttatgaaaaaatgccatcaactgttaaaatagctaattcagcagtt
acaggatatggtgagggacttataaaagcggctctttctgttgatgtaggagaagttgaa
actgtatcccactataaggctgcagaattttttcagccaggagtggatttcatattggat
attggtggacaagacatgaaatgcttaaaggttaaaaatggtgttattgacagtataatg
ttaaatgaagcatgttcctcaggatgtggatcttttattgaaacttttgccaattcatta
aatatgaaaatacaggattttgcaaaagttgctgaatcatcaaaaagacctgtggatttg
ggatctagatgcacagtgtttatgaattcaaaagttaaacaagctcaaaaagaaggatta
tcagtaggtgatatatctgctggactttcatattcagtaataaaaaatgctttgtttaag
gttataaaaataagggatccaaaggaacttggaaaaaagataatagttcaaggcggcact
ttctacaacgacgcagttttaagagcttttgaacttatatcaggcagagaagttataaga
ccggatatagccggtcttatgggggcttttggagcagctattattgccaaggaaaaattc
agcagtttacatgaaaccactcttttgaagccagaagatataaatagtttcaatacagaa
gtttctatgagaagatgcgggaagtgtgcaaacaattgtcttcttacaataaacaaattt
tcagatggaaagaaatttgtttcaggtaacagatgtgaaaggggaataggagctgaaagt
acgaaaaataatattcctaatctttttgagtacaaatataataaaatattcaattatata
cctttgaaaaaagaacaagctcctagaggacaggtaggaatacctagagtgttgaattta
tatgaaaactatccattttggtttacgtttttcacaaaattaggatttagggtggagatt
tcacctcgttctacaaaaaatctatactctcttggaatagaaactataccatctgaatcc
gtttgttatccagctaaacttgtacatggacatataatgagtttgataaatagaggaatt
aaatttatattttatccatctattccctatgagcaaaaagagcaggaaaaggcggataac
cattataactgcccgatagtaacttcatatcctgaagttataaagaaaaatatggatatt
atagccgaaaaaaatgtaaattttaaaaatccgtttttaccattggataataaaaagagg
cttataaaaagacttatagaagaacttgctgaatttcacataaaagaaggcgaaattcaa
gatgcagtagaattagcttataaagaagatgaaaaggtaaaaagtgatataagaaacaag
ggtaaggaagtagtagaatatctcaacaagactggtaaaaagggcatagttttagctggg
agaccatatcatgtggatcctgagataaatcatggtatacctaatataataacttcatat
ggcatggctgtattgacagaggattctgtagcacatcttggagtaatagaaaggccactt
agagttgtagatcaatgggtatatcattcaagattgtatgcagctgctagttttgtagca
actcagaaaaatttagaattaatacagttgaattcatttggatgtggattggatgctgtt
actacagatcaagcacaggaaatactaaataggtatgaaaaaatatatactgtattaaaa
atagatgaagttagtaatttaggtgctataaaaataagaataagatcattaaaagctgca
cttgaggaaagagacaaggctggatttgaacctcataaaattgaagaaaataacaagagg
atagtttttactaaagagatgagaaaaaatcatactatactttgtcctcaaatgtcacca
atacactttcaatttatacaagaaggatttaatgcatcaggttataaattggaaatactt
ccttctgtagataaaaaggcagtagatgagggacttaaatatgtaaacaatgatgcatgt
tatccttctataatagttgtaggacagataatagaggctcttaaatctggaaaatatgat
ttggataatacatctgttctaatatcacaaactggaggaggctgtagagctacaaattat
atagcatttttgagaaaagctctaaaagaagctaatatggagaatatacctgtaatatct
ttaaatgtagtaggtatggaaaaaaatccaggatttaaaatttctccagggcttgttaat
aaaggattaatgggacttatgtatggtgatctgtttatgaaggtactctataaagttaga
ccttatgagagaatatctggttctgcaaatttactttataataactgggttgaaaagtgc
aaggcaaatgttagaaatggaaagcatggagaattcaagagaaacatatatcagatagta
aatgactttgacaaccttgagataaaaaatataaagaaacctaaagtaggagttgtaggt
gaaatacttgttaaatttcatccaacagctaataataatattgtagagcttcttgaaaat
gagggagcggaagcagtagtcccagacttgacggattttcttctatactgtgcttatgat
gctaaatttaaacgtgaaaaattatctggaacacttatggatgaaatgtcaaaaggtgtg
gcaataaagtttattgaacattttagaaagcatatgaggaatgcacttagaaagagcaaa
aggttctcacctccatctacaatatcagaattggcagaaggagcttccaaggtattatct
cttggccatcagactggtgaaggttggttcctgacagcagaaatgatagaacttataaaa
agtggtactaaaaatatagtatgtatgcagccttttgcatgtcttccaaaccatgtaaca
ggaaagggaatgattaaggaattgcgcaggaaatatccaggcagtaatatagctgctatt
gactatgatccaggtgcaagtgaggtaaatcagctaaatagattgaaacttatgctttct
gtggcatttaagtcttttaaaaaagaagagaaaaaagttcacaatgaaaatagacaattt
gtggcagaaaaagtgttgatgaataatattaataaatag
DBGET
integrated database retrieval system
