Cyprinodon variegatus (sheepshead minnow): 107083079
Help
Entry
107083079 CDS
T06110
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 2-like
KO
K20995
Notch 3
Organism
cvg
Cyprinodon variegatus (sheepshead minnow)
Pathway
cvg04330
Notch signaling pathway
cvg04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cvg00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
107083079
04371 Apelin signaling pathway
107083079
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
EGF_3
Notch
NODP
NOD
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_Teneurin
cEGF
EGF_DL_JAG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107083079
NCBI-ProteinID:
XP_015227523
Ensembl:
ENSCVAG00000012928
UniProt:
A0A3Q2FUD3
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2466 aa
AA seq
DB search
MEGNMQWIILFFLLCMHIGEGFRCVDKYKPCENGGTCIDSPSRCICRPGFIGPFCKQLDP
CHRSPCLNGAACKSDVVNGIPQYKCVCQRGFRGQDCSLIDACATSPCANGARCVNWNNHY
NCSCPPGFQGKNCRNDIDECRKPGVCLNGGLCHNTVGSFRCQCPPGYSGRTCEVSTLPCA
PSQCLNGGTCRQIGDHSYECACLPGFEGHNCENNVDDCPGHKCMNGGKCVDGVNTYNCQC
PPEWTGQYCAEDVNECLMQPNACHNGGTCFNTIGGHTCVCVNGWTGDDCSENIDDCAIAV
CFNGATCHDRVASFFCECPVGKTGLLCHLDDACVSNPCNEGAVCDTNPLNGRAICTCPAG
FVGGACNQDMDECSIGANPCEHFGKCVNTEGSFQCQCGRGYAGPRCEIDINECLSMPCQN
DATCLDRIGEFTCICMPGYMGTFCEIDIDDCESNPCVNDGICRDMVNGFTCTCQPGFTGT
MCQIDIDECASTPCQNGAKCYDRPNGFECRCAEGYEGRLCESNINNCQPDPCHHGTCIDG
IASYTCNCDPGYTGYRCENQLNECHSNPCQNGGKCVDRVNKYICQCQHGTSGTNCEINFD
DCASNPCDYGICKDGINRYDCVCKPGFTGPKCDVEIDECASSPCRNGGTCVDEENGFHCQ
CPEGFKPPYCYSQVDECGSSPCVHGSCREDINGYRCDCEPGWVGKNCDLDRNDCLPSPCQ
NAGTCIDQLNGFTCKCRQGFKGNLCQVNINECASSPCLNKGTCVDGVASFTCLCELPYSG
PTCAEVLTPCFPNPCANHAVCTHTPDYLGYQCNCQPGWQGQLCNIDVNECMSNPCKNRGT
CTNTLGGFVCSCRAGFTGLTCETDINDCIPNPCLNGGSCTDDVNSFHCSCLPGFTGPRCA
VEINECQSSPCKNGGTCTDYVNSYTCTCPPGFTGIYCETNIPDCTESSCFNGGTCTDKIN
GYTCTCRSGFTGSHCQYEVNECDSQPCLNGGICQDALESFRCSCPKGFTGNRCQTPVDWC
RRSSLCQNGGRCRQKDSSFICDCPSGWSGRYCDVPRVSCERAARQRGIQTDELCHHGGHC
VNTGNTHFCKCPADYTGSYCEIQVDQCEDKPCLNGATCRSYVGGYQCDCMPGYTGQNCEI
EINECQSHPCQNGGTCIDLVGHYICSCPPGTLGVLCEINEDDCAPPLRLRGAPPKCLNNG
TCVDRVGGYRCNCPPGFTGDRCEGDINECLSNPCSPSNSLDCIQLPNDYLCVCKPGFTGR
RCQNRFGVCESQPCHNGGACSVTSSSPLGYTCTCQLGYTGPNCERSMSCRELSCYNGGSC
ALTTRGARCTCLPGFGGPQCQHHSNDGCSSKPCRNGGLCTEETSFPFFHCQCPSGFMGKR
CEQSTKSELPALSCPRADCQGKANDGVCDKECNTLPCRWDGGDCSLAMNPWAHCTDPRCW
RAFNNSQCDEFCNNAECLYDNFDCRSKEKVCNPIYANYCYDHYADGRCDQGCNTEECGWD
GLDCAQKVPEDLADGVLVLVVLLPPDKLLRTGKTFLQKLSAILHTSVRFRLDQNGDAMIR
PYTRREARLKRELEHQHEVVGSIVYLEIDNRLCSQDVEDCFPSADSAAEYLGALSVTDML
DFPYPLREVRGEKIPVPPTWDKLMPAWAGLAAIIVLVIIIIGMLITRRKREHSTLWFPEG
FFLKKEPSSNKNRREPVGQDALGLKHMPKTVEESLLGDHSDPWMDSDCPEAKRLKVEEPS
VLSDSEDAVDCRQWTQHHLAAADIRVPPTMALTPPQGEFESDCMDVNVRGPDGFTPLMLA
SFCGGGLEPEVTEEEESEECSANIISDLIYQGASLAAQTDRTGETALHLAARYARADAAK
RLLDAGADANAQDNTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDSRMYDGSTALILAARL
AVEGMVEELITCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVDATIALLKNGANKDMQDLKEETPL
FLAAREGSCEAVKVLLAHFANREITDHMDRLPRDIALERMHHDIVQLLDEYNTVRSPQSH
GAAGHQLTGGHTLSPLMCPPSAFLPSLKNTPQGKKNRRPGAKGSGLGGQHAASLKESVKA
RNKKLTLDMQSALLDSSVTLSPVDSLDSPHGGASNAGYITNPTSPVAMQSPALFHSSMSV
PNTPMVHSSMLEGGGPFAVSLAQINDIGAGGMSLQGRVSMASDVNHSYVLSSGQLGVNMG
MVSPVSVPFDWHSHMPPSSQCSQQVVNIVQSSQAGMHVQSPAMQQQNMLMHQQQLYRSPM
LQPTPVTSTPTISPVKLPSIAEQQQLINHNITNQPSMAPMGTSTPPTPQTSQPPPSFFQQ
QQQQLPQQSSQPPPQPTQGAAPPAQPAQALSSQPSGSAAGNEDYPTPPSQHSYSSTLDAT
PKHFHNLPSEHPYLTPSPESPEHWSSPSPHCVSDWSDSTPSPAVAVPNQTQITQIPEANG
KMQVFA
NT seq
7401 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagggaatatgcaatggattattttgttctttttattgtgcatgcatattggtgaa
gggttccgctgtgtggataaatacaagccctgtgaaaatggaggaacatgcatagattcc
ccatctcgatgcatctgtcgccctggattcatcggccctttctgtaagcaactggatccc
tgtcatcgctcaccatgtctgaacggggcagcttgcaagagtgatgtggttaatggtatc
ccgcagtacaaatgtgtgtgccaaagagggtttagaggtcaagactgctccctaatcgat
gcttgtgccacaagtccatgtgcaaatggagcccgttgtgtcaattggaataaccattac
aactgttcctgcccccctggtttccagggaaagaactgtcgcaatgacattgacgagtgt
cgcaaacctggtgtttgtctcaatgggggtctctgtcacaacacggttgggtccttccga
tgccagtgtccgccagggtacagcggccgtacgtgtgaggtgtccaccctgccctgtgcc
ccgtctcagtgtctcaatggtggcacatgtcgccagataggcgatcattcctatgaatgt
gcttgccttccaggctttgagggacacaactgtgagaataatgtggacgactgtccaggt
cacaagtgtatgaacggagggaaatgtgtggacggcgtgaatacatacaactgccagtgc
ccaccagaatggacaggacaatattgtgctgaagatgtcaatgagtgtctcatgcaaccc
aatgcatgccacaatggaggcacttgcttcaacactataggtggtcatacctgtgtctgt
gtcaatggttggactggagatgactgtagtgagaacattgatgactgtgcaatagctgtt
tgtttcaatggtgccacatgccatgaccgtgtggcatcctttttctgcgagtgtccagtt
gggaagacaggactgctttgtcatctggatgatgcatgtgtgagtaacccttgcaacgag
ggggccgtgtgtgacaccaacccccttaatggccgtgccatttgcacctgtcctgctggc
tttgtcggcggtgcctgcaaccaggacatggatgaatgttctattggtgcaaacccatgt
gagcattttggaaaatgtgtaaacactgagggatctttccagtgtcagtgtggtcgcggc
tatgctggcccacgttgtgaaatcgacatcaatgaatgcctttccatgccctgtcagaat
gatgccacctgtttggaccgcattggagagttcacatgcatttgcatgccaggctacatg
gggactttctgtgaaattgatattgatgactgtgagagcaacccatgtgtaaatgatggc
atctgtcgggacatggtcaatggcttcacatgcacctgccagccagggtttactggcacc
atgtgtcaaattgacatagatgagtgtgctagcactccctgccagaatggagcaaaatgc
tatgaccggcctaatgggtttgagtgccgatgcgctgaaggttatgaagggagactctgt
gagagtaatatcaacaactgtcaacctgacccctgccaccatggtacctgcattgatggc
attgctagctacacgtgtaattgtgatcctggatacacaggctatcgctgtgagaaccag
cttaatgagtgccacagcaatccttgtcagaatgggggcaagtgtgtggacagggtcaat
aagtacatctgtcagtgccagcatggaacttcaggtaccaactgcgagataaactttgat
gattgtgccagcaacccatgtgattatgggatctgcaaagatggaatcaaccgttatgac
tgtgtttgcaaacctggctttacaggtcctaaatgtgatgtggagattgatgagtgtgca
tctagcccctgtagaaatgggggaacgtgtgttgatgaagaaaatggatttcactgccag
tgtcctgaaggctttaagcccccttactgttactcccaggtggatgagtgtggcagcagc
ccatgtgtccacggctcctgtagagaggacataaatggataccgttgtgactgtgaacct
ggttgggttggaaagaactgtgacttagacagaaatgactgtttaccaagtccttgtcaa
aatgctggaacatgcattgatcagctcaatggatttacctgcaagtgtcgtcaagggttc
aaaggtaatctctgccaggttaacatcaatgaatgtgcttccagtccatgcctgaataag
ggaacttgtgtggatggtgtcgcaagtttcacatgtctgtgtgagcttccctatagcgga
cctacttgtgctgaggtcctcacaccttgcttccctaacccctgtgccaatcatgcagtg
tgcacccacaccccagactacctgggttatcagtgcaactgtcaaccaggctggcaaggc
cagttgtgtaacatagatgtcaatgaatgcatgtcaaacccctgcaaaaaccgtgggacc
tgcactaacacgcttggaggctttgtgtgttcctgtagagcaggatttactgggctcact
tgtgagacagatatcaatgactgtattcccaacccatgtttaaatggaggttcctgtaca
gatgatgtgaactccttccattgtagttgcttgccaggcttcacagggccccgatgtgct
gtagagatcaatgaatgtcaaagttccccctgtaaaaatggaggaacttgtacagactat
gttaactcttacacatgcacctgcccacctggcttcactggcatctactgtgaaaccaac
atccctgattgtactgaaagctcttgcttcaatggagggacctgcacagacaaaatcaat
ggttatacatgcacttgtcgctctggcttcactggctcccactgccagtatgaagtgaat
gagtgtgactctcagccctgcctaaatggaggcatctgtcaagatgccttagagtctttt
cgctgctcctgccctaagggatttacaggcaacaggtgtcagacaccagttgactggtgc
cgacgctcgtctctgtgccagaatggaggacgctgtcgtcaaaaagattcgtcttttatc
tgtgattgtcctagtggttggtctgggcgatactgcgatgtcccaagagtctcctgtgaa
agagcagctcgccagcggggaatccaaacagatgagctctgccaccacggtggtcactgt
gttaacactgggaacacacacttttgtaaatgccctgctgactacactgggagctattgt
gaaattcaagtcgaccaatgtgaagacaaaccttgtctcaatggtgccacctgcaggtca
tatgtcggcgggtaccagtgcgattgcatgccgggctatactggacagaactgtgagata
gaaatcaatgagtgccagtcccatccttgccagaatggaggcacttgtattgatctagta
ggacattatatctgctcctgtccccccggcacactgggtgttctgtgtgagattaatgag
gacgactgtgctccaccgctgaggttgcgcggtgctcccccaaagtgcctcaacaacgga
acctgtgtggacagagttggtggttatcgctgtaattgtcctcctggtttcacaggagac
agatgtgaaggagacataaatgagtgtctctcaaacccctgtagtcccagcaacagtctt
gactgcatccagttacccaatgactacctgtgcgtctgcaagcctggattcacaggtcgc
aggtgtcaaaacaggttcggtgtgtgtgaatctcagccttgtcacaacgggggtgcctgt
tctgtaaccagcagctctcctctgggatacacctgtacatgtcaacttggttatactggc
ccaaattgtgagaggagcatgtcctgtcgtgagctgtcctgctacaacggcggaagctgt
gctcttaccacaaggggggcgcgctgcacatgcttaccaggctttggtgggccacagtgt
cagcatcacagtaatgatgggtgttcctctaagccatgtcggaatggaggcctctgtact
gaagagaccagtttcccatttttccactgccagtgtccaagtggatttatggggaaacgt
tgtgagcaaagcactaaatctgagcttcctgctctctcctgtccaagagcagactgccaa
ggcaaagccaatgatggtgtttgtgacaaggaatgtaacacactcccttgtcgttgggat
ggtggcgactgttccctggcaatgaatccctgggctcattgcacagatcctcgctgttgg
cgtgcctttaacaatagccaatgtgatgaattctgtaacaacgctgaatgtctgtatgac
aacttcgactgcagaagcaaagagaaagtctgcaatccaatatatgccaactactgctat
gaccattatgctgacggtcggtgcgatcagggttgcaacacagaggagtgtggttgggat
ggcttagactgtgcacagaaggttccagaagatcttgccgatggtgttttggttttggtt
gtcctgcttcctccggacaagcttctccgcaccgggaaaacatttttgcagaaattgagt
gccatcctgcacacttcagtacgcttcaggttggaccaaaacggagatgcaatgatccgt
ccctacacccgtcgagaggcacgccttaagagagaactcgaacatcaacatgaagttgtt
gggtccatagtctatctggagatagacaaccgtttgtgttctcaggatgtagaggactgt
ttcccttcagcagacagcgcagcagagtatttgggcgccctatcagtgacagatatgctg
gatttcccttatccccttcgagaagttcgaggggaaaagattcctgtaccaccaacttgg
gacaagttgatgcctgcatgggcaggactagcggctattatcgttttggtcatcattatt
atcggcatgttaataactcgtcgaaagcgtgaacacagcaccctctggttccctgaaggc
ttctttctcaagaaggaaccaagcagtaacaaaaaccgcagggaacctgtgggtcaggat
gctcttggattaaaacacatgccaaaaactgttgaggaatctctccttggagatcacagt
gatccatggatggactcagattgcccagaggcaaaacggcttaaggttgaggagccaagt
gtgctctcagacagtgaagatgcagttgactgtagacagtggacacagcaccatcttgca
gctgcagacattcgtgtaccgcccactatggccctcacaccacctcaaggagaatttgaa
agtgactgcatggatgttaatgttcgaggcccagatggtttcacacctctgatgctggca
tcattttgtggaggcggcctagaacctgaggtgacagaagaggaggaaagtgaagagtgt
tctgccaacattatctcagacttaatctaccagggtgcatcactggctgcacaaacagac
cgcaccggtgagacagcactccacttggctgctcgctatgcacgcgccgatgctgctaag
cgtctgctggatgccggggcagacgctaatgctcaagacaacacagggcgcacaccactt
catgctgctgtggctgcagatgcgcagggcgtctttcagattctgatcagaaatcgagcc
actgatctggactcccgtatgtacgatggctctactgcactgatcctggctgcacggctg
gcagtggaggggatggttgaggagcttattacttgtcatgcagatgtaaatgcagttgat
gaactgggtaaatctgctctgcactgggctgcagctgtcaacaatgttgatgcaactatt
gctctgctgaaaaatggagccaacaaagatatgcaagatcttaaggaggagacccctctg
ttccttgccgcccgcgaaggcagctgtgaggctgtcaaggtgttgctcgctcactttgcc
aacagggaaatcacagatcacatggacagattgcccagagacattgctcttgagcgtatg
catcacgacattgtacagcttcttgatgaatacaacacagtaaggagtccacagagccat
ggagcagctggtcaccaactcacagggggacacactctgtccccactcatgtgtcctcca
agcgccttcctccccagtctgaagaacaccccgcagggaaagaagaatcgccgacctggg
gccaaaggttctggcctgggaggccagcatgctgcaagtctgaaggagtctgtaaaggct
cgcaacaagaagctgaccctggacatgcagagtgctttattagatagctccgttactctg
tccccggtggactctctggactcaccccacgggggagctagcaatgctggctacattacc
aatccgacgtcacctgtggccatgcagtcaccagctcttttccattcctcaatgtctgtc
ccaaacactccaatggtacacagtagcatgttggaaggagggggcccgtttgcagtatcg
cttgcccaaattaatgacattggagctggaggaatgtcattgcagggtcgtgtctctatg
gcttcagatgtcaaccatagctatgtgctgagctctggccagcttggggtcaatatgggc
atggtcagtcctgtcagtgtgccattcgattggcacagccatatgcctccatcctctcag
tgcagtcagcaggttgtgaatatcgtgcagagtagccaagcaggtatgcatgtccagagc
cctgccatgcagcagcagaacatgctgatgcaccaacagcagctctaccgcagtccaatg
ctgcagcccacacctgttacctccacacccaccatcagcccagtaaagctgccttccatt
gcagaacaacagcagcttattaatcacaacatcaccaaccagccaagcatggctcccatg
ggcacctcaactccaccaacaccacagacctcgcagcctccaccatcattcttccagcag
caacagcagcagctgccccagcagtcctctcagcctcctcctcagcccacccaaggagca
gcgccaccagcccagccagctcaggccctttcctcccagccaagtggcagcgctgcagga
aatgaggattatccaacccctccttcccaacacagctattcatccacgttagatgcaaca
cccaagcatttccacaatttgcccagtgaacacccgtatctcaccccttctccagagtct
ccagagcactggtccagtccttctccccactgtgtctctgattggtccgattccacacca
agtccagccgttgctgtccctaaccagacccaaattactcaaatcccagaggccaatggc
aagatgcaggtgtttgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
