Cyprinodon variegatus (sheepshead minnow): 107084005
Help
Entry
107084005 CDS
T06110
Name
(RefSeq) fibrillin-1-like
Organism
cvg
Cyprinodon variegatus (sheepshead minnow)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
EGF_3
cEGF
EGF
hEGF
FXa_inhibition
EGF_MSP1_1
NIDO
Plasmod_Pvs28
NIDO_rel
Mid2
He_PIG
EGF_Mua-3
Big_9
ADGRF3_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107084005
NCBI-ProteinID:
XP_015229117
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2590 aa
AA seq
DB search
MADSNRQGNMRFSILWLFTLFAFLMYCSAVVVDKSECEAQGLQCHNQADCMRIRNNFTCV
CRVGYQGDGLQCSDINECISAMHSCHSKARCINSQGSFDCICLDGYVGDGKICQDINECE
TNNGGCDPNALCTNLDGGRRCQCYIGFTGNGFQCTDINECTNQRICHWNATCINNPGSYG
CTCNAGYKGNGNYLCMDIDECSENPRLCPSSLGYQGCVNTPGSFRCTCSNGFQTAGQNCV
DINECANNICSSFANCENSIGSFKCTCKSGFVGNGITCADANECITGNECHSQALCINRL
GSYECSCLEGFVGDGRRCEDVDECEQPNICPSFTTCVNNPGSYKCDCGSGYILNNSTCND
IDECKTGRCSPFANCTNSPGSFSCQCLLGYEGDGFTCEDINECSLNSKCHSKAICSNFPG
SYNCTCMAGFTGDGVLQCNDINECLVNNGGCNNNAMCVNNQGSFSCQCESGFSLINKTIC
QDINECKERSNTCGVNEECKNTEGSYECPCQTGYYRPAIGMTCADLDECKDKPCHVNATC
LNTIGSYTCTCKRGFTGNGSHCWDKDECAVDRTCHPRATCTNVIGDFFCSCEPGFTGDGF
SCQDVNECSLPNTNCPHFSQCVNSPGFYVCSCLNGTVAFNDTCVPPVSLCDPPCHSKGLC
HLSPSGYQCVCDIGFVGNGVTCADINECQTGNVCPETETECLNTPGSFSCVCKQGYTRNG
QQCVDLNECDTGQHDCSEVAQCINTVGNYSCFCRNGYTGDGKNCSDIDECQHQNGGCHPV
ANCTNIPGSFSCLCPWGMEGDGFYCQDVDECEHNSTLSNNCSSLAMCLNTNGSYLCQCNN
GYQGDGFICDDVDECEMATPCSKNMTCTNMPGSYSCSCVLGSVYNQGTCITEETCLNASS
ECHPLAKCNLYQGSFYCQCAEGYEGNSTHCQDINECDQLKDQVCPPFSYCSNTNGSYFCD
CWEGFQDNGTHCQDIDECEMGNFSCTANSSCTNTEGSYNCTCDPGFSGNNSLCLDIDECF
LGLIQCPNFSRCLNTIGSGFCECWEGYQGNATDCEDIDECLDNSTCPDHSTCVNTEGGYQ
CLCETGFSKNTDLCEDIDECSENKVGEICTNGTCVNALGSFYCDCFMGFESNGTDCVDVD
ECSKPINSSVCQPFSTCVNTPGSYLCPCIQGFILNGTHCLDVDECLDPVGAGCPENSLCI
NTEGSFLCQCSPGYKTFDSGCEDIDECKHNNTCRSDQVCTNLPGAYNCSCPLGYHEEREA
CVDNNECENPPCHPMARCWNTPGSFSCHCHTGFAGNGSWCKDVDECAALTDPCHPISQCH
NAPGSFVCMCKPGFMSLGSLCVDINECLQGNGQCHAAATCKNYVGGFRCICNQGWEETKD
NSGGCVDLNECVSSSTCHQPSSCTNFPGSYTCSCPENNPVCKNIMRMEGTLYPYGAEAGD
KEVKIETEDGNSPYITPPAGFPFMGKLYDRIYFSDNGLVQFQTLAENEQYLLPSPSADGF
PEDMKMPLLAAFWDDADLTLGDGKLHYKEYSKLDASDIYSQVVFNRTADEVTKFEDLKQR
PSFTPTWILKITWDNVMPVSYQKIDFSETNTFQCILTTDGVRSFALLRYGDMKWGPGFRK
HHDALIGYTDGRTSFKETTVPPDNLFGPAGRYRPNEVRGTLGNLGQLVYDLTGPEGSDVD
ARIKCQTWWKKEPDPSEWALGLPSCPCTWTQALEDLAFLQDLTDPGETVQKLRAQRWGSA
SGHIFRSLLSNQYGAGKRCVYEPDGALLAGYSELYFHGHNTQKHIDEDLLPFQWCCIDSS
LCHHYLSRRPLDRCQGYSFSNHSSSSPSNWGTQGIAMVYGSLHFITFDGSEYSFNALGEF
VILRLSSARGSNIFTLQGQIEKLHTAAQGIVEVPVVVRMAAFHQGLGKIEWRCSDRDSGL
QIFVNEVEASVRIGVVYDNKRDFAVRCLSVNRCAAVYASSLRVVVWRTEGYRQLAAMVEV
PQNFYRRTVGLLGLWSSNRSDDFLMSDGKILQSKGLSPPEEESLKLFCLSWAVPGPESLL
FSSPPTVPLALEPTSLLLESLSPAELNMQMRKCKESMQCVQDSVASGISDLGQQTLDAQA
QLKRLALTFGNMPPIVKEPAVIHSRVNSQVNVQIVAEDPNRDPITYSLLFPRPPEAFVDR
GGGFLTWTPLSTQPVQLTVKVSDKETSSLFTPILRVCNCLNGGTCLYDSVAENHLKGMFQ
VVGCLCPKGFSGKFCGNTTNVCRGKPCFRGLQCQPKSVPDQFTCEKCPDNTVSNGKEGYK
CFDYDMCSPPFPFPCHKDAECLAVEHSYSCTCKSGFSGDGYNCTDIDECADLMACENAKY
ECMNRPGSFECLCRYKNSKNADGCGNSPNPPGHNRFNVSMSWRNRGADGLKQLDDILAKG
FTNKFYNISRKDASEPSKEEYRVSVSSDTPHWYIQDYLSRVSPHYEIKAVEVDDLDECKA
KEAGCVPHAMCINTYGGYRCVCNGTADVDGSQSCIIEERSEESDSNLDLILGLVLGIGIP
LLLLLLLLAALACFCCRRKTVTGDLPHLMPDHIQQQYNPPPFNYADPALQYMSHCSPRVL
DDVMPRQRLR
NT seq
7773 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagactccaacagacagggaaacatgaggttttctatcttgtggctgtttactctg
tttgcgttcctgatgtactgttctgcagttgttgttgacaagagcgaatgtgaggcacaa
ggccttcagtgccataatcaggcagactgcatgaggattagaaacaacttcacctgtgtc
tgccgtgtgggttaccagggtgatggtctgcagtgcagtgacatcaatgaatgtataagt
gccatgcacagttgtcactcaaaggcccgctgcatcaactcccaaggcagttttgactgc
atctgtcttgatggatatgttggtgatggtaaaatctgccaggacatcaatgaatgtgaa
acgaacaatgggggttgtgaccccaacgcactctgtactaacttggatggtggacgaagg
tgtcagtgttatatcgggtttacaggtaatggcttccagtgcacagacattaatgaatgc
acaaaccaaaggatctgccattggaatgctacctgcatcaataaccctggctcttatggg
tgcacatgtaatgctggctataaaggaaatggaaactacttgtgcatggacatagatgaa
tgttcagagaatcctcgtttgtgtccatcttcattaggataccaaggctgcgtaaataca
cctggatcttttcgttgtacatgcagcaatggctttcaaactgctggacagaactgtgtt
gacatcaatgagtgtgctaacaatatctgcagttcttttgcaaattgcgaaaactccatt
gggtcattcaaatgtacctgcaaaagtgggtttgttggaaatggaattacatgtgcagat
gcaaatgaatgcattacaggcaatgaatgccactcccaagctctttgcatcaaccggtta
ggcagttatgaatgctcatgcctagaaggttttgttggagatggacgacgttgtgaagat
gtcgacgagtgtgaacagccaaacatttgcccatcttttactacctgtgtgaacaaccct
gggtcatataaatgtgactgtggcagtggctacatattaaacaattccacatgcaatgac
attgatgaatgcaaaacagggcgctgtagcccctttgcaaactgcactaattcccctggt
tccttttcttgtcagtgcttgttgggctatgagggagatggttttacctgtgaggatata
aacgagtgttctctgaattcaaagtgccactctaaggccatttgctctaactttcctggt
tcttacaactgcacttgtatggctgggttcaccggggacggtgttcttcagtgcaatgac
atcaatgagtgcctagtgaataacggaggttgcaataacaatgctatgtgtgtcaataac
caaggttctttttcttgccaatgtgagtcaggtttcagcttgattaataagactatatgc
caagacatcaatgagtgcaaggaaaggagcaatacatgtggagtgaacgaagagtgcaaa
aacactgaagggtcatatgagtgcccctgccagacgggatactaccgtcctgccatcggc
atgacctgtgctgacctggatgagtgtaaagacaaaccatgccatgtcaatgctacatgt
ctcaacaccattggctcatacacctgcacttgtaagagaggctttacagggaatggctcc
cattgttgggacaaagatgaatgtgccgtggaccgtacgtgccaccccagagccacatgc
accaacgttataggggatttcttctgctcttgtgagccagggttcactggtgatggattt
tcctgccaagatgtaaatgagtgctccctccccaacacaaactgtcctcatttctcacaa
tgtgtcaactctcctggtttttatgtgtgttcatgtttgaatggtactgtggcctttaat
gacacctgtgtgccacccgtttccctgtgtgatcctccttgccatagtaaaggactgtgc
cacctctcgccctctggatatcagtgtgtttgtgacattggttttgtaggcaacggagtg
acttgtgctgacatcaatgaatgccagacgggaaatgtttgtcctgaaactgaaactgag
tgtttgaatacccctggatcattttcctgtgtctgcaaacaaggctacacgcggaacggg
cagcagtgtgttgatttgaatgagtgtgacactgggcagcacgactgcagtgaggttgcg
caatgcatcaatacagtgggcaactactcctgcttttgccgaaatggttacactggtgac
gggaagaactgctctgacattgatgaatgccaacaccaaaatggaggatgccacccagtt
gccaactgcactaacatcccaggatctttctcatgtctctgcccctggggcatggagggg
gatggcttttactgccaggatgtggatgaatgtgaacacaactctaccctatcaaacaac
tgcagctcactggccatgtgcctcaacaccaatggttcctacctctgccagtgcaacaat
ggataccaaggggacggtttcatttgtgatgatgttgatgaatgtgagatggccacacct
tgcagtaaaaacatgacatgcaccaatatgccggggtcctacagctgctcctgtgtattg
ggaagtgtgtacaatcagggaacatgcataactgaagagacctgcttaaatgctagcagt
gaatgccacccgcttgccaagtgcaacctgtaccagggctctttttactgtcaatgcgca
gagggatatgaaggaaacagtactcactgccaggacataaatgaatgtgaccagttaaaa
gatcaagtctgtcctcctttttcatactgcagcaatacaaatggctcttacttctgtgat
tgttgggaagggtttcaagataatgggacacattgtcaggatatagatgaatgtgagatg
ggaaacttcagctgcacggccaacagtagctgtactaacacagaggggagctacaattgc
acctgtgacccaggattctcaggcaacaattccctgtgtttggacattgatgagtgcttc
cttggtctaatccagtgtccaaatttttcccgctgccttaacactattggatctggcttc
tgtgagtgctgggaaggctaccaaggcaatgcaacagattgtgaggatattgatgaatgt
ctggacaactccacctgccctgatcatagcacatgtgttaacacagagggaggctaccag
tgtctctgtgagacggggttttctaagaacactgacttatgtgaggacattgatgaatgc
agtgaaaacaaggtgggagagatttgcaccaatgggacatgtgtgaatgctctgggttct
ttttactgtgattgttttatgggattcgagagcaatggaacagattgtgtcgacgtggat
gaatgctcaaaacctatcaactcctctgtgtgccagcctttctcaacatgtgttaacact
ccaggttcatacctgtgtccctgtatccaaggctttattttgaatggtacccactgtcta
gatgtggatgaatgccttgacccagttggtgcaggatgtccagagaactctttatgcatc
aacacagaggggtcttttctttgtcagtgctctcctggatacaaaacctttgactccggc
tgtgaggatattgacgaatgtaaacacaacaacacctgtcgctctgaccaagtgtgcaca
aacctgccgggagcatacaattgctcttgcccactaggatatcatgaggagagggaggca
tgtgttgacaacaatgaatgtgagaatccaccttgccatccgatggcacgctgttggaat
acacctggctctttctcctgtcactgtcacacaggcttcgctggaaatggctcctggtgc
aaagatgtggatgagtgtgctgccttaacagatccttgccatcccatctctcaatgccat
aatgccccagggtcatttgtttgcatgtgtaagccaggcttcatgagccttggttcccta
tgtgtggacattaatgaatgcctccaaggaaatgggcagtgtcacgccgctgctacctgt
aaaaactatgtaggaggattcagatgtatatgcaaccaaggctgggaagaaaccaaggat
aatagtggtggatgtgttgacttgaatgagtgtgtgtccagctctacatgtcatcaacca
tcatcctgtaccaacttcccagggagctacacctgttcctgtccagaaaacaaccctgtt
tgcaaaaacataatgagaatggagggcactctgtacccatatggagcagaggctggagat
aaagaagtgaaaatagaaacagaagatggaaattctccctacatcacacctccggcaggg
tttcctttcatggggaaactgtatgacagaatatatttttcagataatggcctggttcag
tttcagacgttggcagaaaatgaacaatacctgctcccttctccttctgctgatggtttc
cctgaggacatgaagatgcctttattggcagcattttgggatgatgcagacctcacccta
ggggatgggaagctgcactataaggaatattctaaactggatgcatcagatatttactcc
caagtggtttttaatcgcacagcagatgaagtgacaaagtttgaggatctgaaacagagg
ccttcgtttacgcccacctggatcctaaagatcacatgggacaacgtgatgccggtctcc
taccagaagatcgacttttctgagacaaacactttccagtgcatcttgactacagatgga
gttcgctcctttgccctcctgcgttatggggatatgaaatggggacctgggttcaggaag
catcatgatgctcttattggctacacagatggaagaaccagtttcaaggagaccaccgtc
cccccagataacctttttggtcctgcaggcagatatagacccaatgaagttagaggaaca
cttgggaatcttggccagctagtgtatgatttgactgggccagaagggtcggatgttgat
gcccgtattaaatgtcagacatggtggaagaaagagcctgaccccagtgagtgggcgttg
gggctgccatcctgtccctgcacctggacacaggctctggaggacctggccttcttacag
gatctcacagatccaggagaaacagttcagaagctgagggctcagcgctggggtagtgcc
tcaggacacatctttaggtcactcctgtccaaccagtatggagctgggaagaggtgtgtg
tatgaaccagatggtgccttgttggctgggtacagtgagctctacttccacggacacaac
acacagaaacatatcgatgaggatcttcttccctttcagtggtgttgcatcgactcctcc
ctgtgccatcattacctaagcaggagacccttggatcgttgccaaggttatagctttagc
aatcacagcagctcttccccgtccaattgggggactcagggcattgcaatggtgtacggg
agcctgcatttcatcacctttgatgggtcagagtactcctttaatgccctgggggagttt
gtgatactacgtctctcatctgcaagaggctccaatatcttcaccctacaaggacagatt
gagaagctgcacactgctgcacaggggatcgttgaggtcccagtggtggtgcgcatggct
gccttccaccaaggcctcggcaagattgagtggaggtgctctgatagagacagtggactg
cagatttttgtgaatgaggttgaagcctcagtcagaatcggtgtggtgtacgataacaag
agggactttgcggtgcgttgtctctcagtgaatcgttgtgcagcggtttatgccagcagt
ctcagggtggttgtgtggcgaactgaaggctaccgtcagctggcagccatggtggaggtc
cctcagaacttctacagacgcactgtgggcctcttaggcctctggagctccaaccggtcg
gatgatttcctcatgtcagatggaaagatcctccagtctaaggggctcagcccccctgaa
gaggagagtctgaagctcttttgcttgtcctgggcggtcccaggccctgaaagcctgctg
ttctcctcgccaccaacggtccccctggctttagaaccaaccagtcttctgctggaaagc
ctgagtcctgctgagctgaatatgcagatgagaaagtgtaaggagagcatgcagtgcgta
caggacagcgtagcatctggcatctccgacctgggccaacagactctggatgcccaggca
cagttaaagaggctggctctcacttttggcaacatgccgcctatagtgaaagagcctgca
gtgatacacagcagggtcaactctcaggtcaatgttcagattgttgctgaggatccaaac
agagaccccatcacctactcattgcttttccccaggcctccagaggcttttgttgacagg
ggtggtggcttcctgacatggacacccctcagcactcagcctgtccagctgactgtcaag
gtcagcgacaaagagacaagctctttgttcaccccgatcctgcgtgtctgcaactgtctt
aacggaggaacctgcctgtatgacagcgttgctgaaaatcacttaaagggaatgttccag
gtggtggggtgtttgtgcccgaagggattcagtggaaaattctgtgggaatacaacaaac
gtatgtcgaggcaagccgtgtttcagggggcttcagtgtcagccaaagtcagtccctgac
cagtttacctgtgaaaagtgtccagacaataccgtctccaatggcaaagagggatacaaa
tgctttgattatgacatgtgcagtcccccgtttcccttcccttgccataaggatgcagaa
tgcctagccgtggagcacagctactcctgcacatgcaaatctggcttcagtggagatgga
tacaactgcacagatatcgatgaatgtgctgacctcatggcatgtgaaaatgcaaaatat
gagtgtatgaacaggcctggatcttttgaatgcctctgcagatataaaaactccaagaat
gctgatggatgtggtaactctccgaaccctccaggacacaataggtttaacgtttccatg
agctggaggaacagaggagcggatggactcaaacagctagatgacattctggccaaaggt
ttcacaaacaagttctacaacatcagtagaaaagatgcatctgaaccaagcaaggaggag
tatcgagtgtctgtgtccagtgacacgccccactggtacatccaagactacctgtccaga
gtcagcccccactatgagataaaggctgtggaagttgatgatttagatgagtgtaaggcc
aaggaggcgggatgtgtcccccacgccatgtgcatcaacacctacggaggctaccgctgc
gtttgcaacggtacagctgatgttgatggaagccagtcctgtataattgaagagagatca
gaggagtctgactcgaacttggacctgattctgggtttggttctgggtatcggcataccg
ctcctcctgctgctgctgcttctggctgcactggcctgcttctgctgccgcaggaagact
gttactggagacctccctcatttgatgccagaccacatccaacagcagtacaacccccca
cccttcaactacgctgacccggccctgcagtacatgagtcactgcagccctcgagtccta
gacgatgtcatgccccggcagcggctcagatag
DBGET
integrated database retrieval system
