KEGG   Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly): 135951172
Entry
135951172         CDS       T10781                                 
Symbol
Col4a1
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(IV) chain
  KO
K06237  collagen type IV alpha
Organism
cvj  Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly)
Pathway
cvj04382  Cornified envelope formation
cvj04512  ECM-receptor interaction
cvj04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cvj00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    135951172 (Col4a1)
 09140 Cellular Processes
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    135951172 (Col4a1)
 09150 Organismal Systems
  09158 Development and regeneration
   04382 Cornified envelope formation
    135951172 (Col4a1)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome [BR:cvj04147]
    135951172 (Col4a1)
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:cvj00536]
    135951172 (Col4a1)
Exosome [BR:cvj04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of other cancer cells
   135951172 (Col4a1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:cvj00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   135951172 (Col4a1)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen C4
Other DBs
NCBI-GeneID: 135951172
NCBI-ProteinID: XP_065356837
LinkDB
Position
2:complement(20015638..20027492)
AA seq 1780 aa
MEPLWKRLLFAAVLAGALVGINAQFWKTADTGAIYNSAKHYRPEVEAPRNPIDDSYAVID
SATTTRTGQVPSNCTGSTPGCIPKCFAEKGNRGLQGAIGAPGPKGMPGYAGPEGPPGDKG
QKGDPGPEGPRGLKGERGTAGIPGMAGVPGIQGIAGNPGAPGIPGKDGCDGEKGLPGVTG
LSGMTGPRGYPGQPGTKGEKGEPAKENGDYAKGEKGEPGFAGRSGNPGPEGPSGSKGDRG
DTGPYGPPGQRGDRGQKGDKGAPCFARPQPGKKGEKGTKGEPAGKHKLTGKETFSGERGD
KGDKGDTGPAGVKGEIGFPGEPGRDGMKGEKGLPGGSGDRGRQGSYGPPGPAGQKGDRGD
TGLNGLAGKPGQKGEPGRPGQPGERGLVGPPGPPGGGRGSPGAPGPKGPRGYTGPPGPKG
LDGFDGPPGPQGLPGAKGGPGVPGHNGVEGPPGEKGDKGNPGREGSMGPHGPTGHTGPPG
PEGQKGEPGLDGYGERGIKGDDGIPGTPGSKGQKGERGFPGNVGAPGDSKLGRPGTPGRI
GAPGQKGDSGRPGTPGQKGDMGPKGDAGGKCSSCPYGQKGDKGGRGADGSPGQPGLRGPP
GERGYPGERGADGIAGPPGAPGDKGKDGLPGAPGPYGAPGKDALIDLNQIEAEKGDKGER
GYPGPAGLKGERGERGEAGRNGEKGEMGNKGDKGFMGPPGSDGTPGTPGRDGLDGIPGQS
IKGDTGRAGFDGAKGDKGFSGPQGGKGEPGSCDVDMLQVPAKGNKGDRGLQGNPGPQGVQ
GIKGDAGRNGEKGERGPQGPIGPTGARGLTGPRGEKGNQGPIGAPGNPGKDGLNGLPGRT
GAPGLKGEMGIAGIGPRGPQGRPGVPGEKGERGPTGNYGPPGKDGPPGYPGDKGDSGYPG
APGMPGLDGAKGDMGPLGPSGPQGPPGIPGVDGVQGRDGAKGEPGNPGLVGMPGLKGERG
AAGNDGPKGFPGVTGQPGKRGPPGPAGIPGGKGDRGERGLTGRDGLAGPRGPPGPPGLMG
VKGDLGPVGPPGADGIPGIDGEKGDRGFTGETGPRGEAGDASEKGQKGEPGAPGLRGEDG
MPGAPGLQGEKGVAGIAMHGRPGISGEKGDRGRDGVNGRDGATGLKGDQGMPGLLGAKGS
KGEMGLPGVPGAPGMDGKPGEVGAPGPVGYMGVKGDKGERGYPGSNGAKGERGEQGLTGF
VGAPGAKGERGLTGPAGLDAKPFTIKGDKGEMGEAGLIGLPGPMGLKGNQGVQGFTGSKG
DRGMTGPPGAPGLNGLPGLKGDMGARGDVGAPGLTIKGEKGLPGRTGKNGREGAPGPAGL
KGDKGLPGLSGTPGAMGPPGIPGPQGPKGDRGQMGQPGRDGHDGMPGVQGIKGDMGYPGP
KGEMGPPGFQGQKGDKGELGFTGAPGLPGRAGLKGDMGMSGLDGLPGPIGAPGEKGYPGP
AGINGRDGKSGTKGDKGEPGMVPPPGPKGEPGYPGRDGLKGERGLPGPRGLIGLQGERGE
KGEQGLIGLTGPTGRPGPKGDQGVPGPIGREGAPGILGPKGEPGVACSAAQDYLTGILLV
KHSQSEEIPRCEPGHIELWSGYSLMYIDGNDYAHNQDLGSPGSCVRRFSTLPVLSCGANN
ICNYASRNDKSFWLTTSAALPMMPVPAHDVSNYISRCTVCEAPSNVISIHSQSLDIPSCP
NGWEGLWIGYSFMMHTAAGNGGGGQDMSSPGSCLQDFRTTPFIECNGGKGHCHFYETMSS
FWMVTMEEYQQFQRPAMETLKAGNLLQKVSRCQVCIKNSS
NT seq 5343 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggagcccctctggaagcggctactttttgccgctgtattagctggagcgttagtggga
attaatgctcaattttggaaaactgccgatactggagctatttataactccgccaaacat
tatagacctgaagtcgaagctcccagaaatcccattgatgatagttatgctgtaattgat
agtgccacaaccacacgtactggtcaagtgccctcgaattgtactggcagtacacctggt
tgcataccgaaatgttttgctgaaaaaggtaatcgtggtcttcaaggtgccattggtgcc
cccggtcccaagggtatgcccggttatgccggtcctgaaggtccacctggcgacaaaggt
cagaagggtgatcccggtccagaaggtcctcgtggtctgaaaggtgaacgtggtacagct
ggtattcccggtatggctggtgttcctggtattcagggtattgctggtaatcccggcgcc
cctggtattcccggtaaagatggttgtgatggtgaaaaaggtttacctggtgtaactggt
ctcagcggtatgaccggtcctcgcggttatcctggtcagcccggtactaagggtgagaaa
ggtgagccggctaaagaaaatggtgattatgccaagggtgaaaaaggtgaacctggtttt
gctggtcgttctggaaatcctggtcctgagggccctagtggttctaagggtgatcgtggt
gatactggtccatatggtcctcctggtcaacgtggtgaccgtggtcaaaagggtgacaag
ggtgccccatgttttgctcgtcctcaacccggcaagaaaggtgaaaagggtacaaagggt
gaacctgctggcaagcataaattaactggaaaggaaacgtttagcggtgaacgtggtgac
aagggtgacaaaggtgatactggtcctgctggcgtaaaaggtgaaattggtttccctggt
gagcctggtcgtgatggtatgaaaggtgaaaagggtcttcctggtggttccggtgataga
ggtcgtcaaggtagttatggtcctcctggtcctgccggccaaaagggtgatcgtggtgat
actggtttgaatggtttggctggtaaacctggtcaaaaaggtgaacctggccgtcccggt
cagcctggtgaacgtggtcttgttggtcctcctggtccccctggtggtggtcgtggttcc
cctggtgctcctggtccaaaaggtcctcgcggttatactggtcctcctggtcccaaaggt
ttggatggttttgatggtcctcccggtccccaaggtttgcctggtgctaaaggcggtccc
ggtgttcctggtcacaatggtgttgaaggtcctcctggtgaaaagggtgacaaaggtaat
ccaggtcgtgaaggttcgatgggtccacatggtcctactggccatactggtcccccaggc
cccgaaggtcaaaagggtgagcccggtcttgatggatatggcgaaagaggcattaagggt
gatgatggtattcctggaacgcctggctcaaagggccaaaaaggtgaacgcggtttccct
ggtaatgtcggtgctcctggtgactccaaattgggtcgtcctggtacccctggtcgcatt
ggtgctcctggacaaaaaggtgattccggtcgtcctggtactcccggtcaaaagggtgat
atgggtcctaaaggtgatgctggtggtaaatgttcaagctgtccttatggacaaaagggt
gacaaaggtggtcgtggtgctgatggctctcctggtcaacctggtcttcgtggtcctcct
ggtgaacgtggatatcctggtgaacgtggtgcagatggtattgctggtcctcccggtgct
cccggtgataagggtaaagacggtctccccggtgcccctggtccatatggtgcccctggc
aaagacgctcttattgatttgaaccaaatagaagctgagaaaggtgacaaaggcgagcgt
ggttatcccggacctgcaggtcttaagggtgaacgtggcgaaagaggtgaagctggcaga
aacggcgaaaaaggtgaaatgggcaacaagggcgacaaaggttttatgggtcctcccggc
tctgacggtactcctggaactcccggtagagatggtcttgatggcattcccggtcaaagc
attaagggtgacactggtcgtgctggtttcgatggtgctaagggtgacaaaggtttctcc
ggaccccaaggtggcaagggtgaacctggctcctgtgatgttgatatgctccaagtaccc
gctaaaggcaacaagggtgatcgcggtcttcaaggcaatcctggaccacaaggtgttcag
ggaataaagggtgatgctggcagaaatggcgagaaaggtgaacgcggtcctcaaggtccc
ataggtccaacgggagctcgtggtttgactggtcctcgtggtgaaaagggtaaccaaggt
ccaattggcgcccctggtaatcccggcaaggatggtttgaatggtcttccaggtagaact
ggtgctcctggtcttaagggtgaaatgggtattgctggtattggtcctcgtggtcctcaa
ggtcgtcccggtgtgcctggtgagaaaggtgaacgtggtcccactggtaattatggtcct
cccggtaaagatggtcctcctggttatcctggcgacaaaggtgattctggttacccaggt
gctcctggtatgcctggtcttgatggagccaagggtgatatgggacctctcggtccctca
ggtcctcaaggtcctcccggtatacctggtgttgacggtgtccaaggtcgcgatggtgct
aagggtgaacctggtaatcctggtttggttggtatgcctggtttgaagggtgaacgcggt
gctgctggtaatgatggtcccaagggtttccctggtgttactggtcaacctggtaaacgt
ggtcctcctggaccagctggtattcccggtggaaagggtgacagaggtgaacgtggttta
actggcagggatggtttggctggtcctagaggtcctcccggccctcctggtttgatgggc
gttaaaggtgatttgggtccagttggtcctcccggtgctgatggcattcccggtattgat
ggtgaaaagggtgatcgtggtttcactggtgaaacgggtccccgtggtgaagctggtgat
gcttctgagaagggtcaaaagggtgaacctggtgcacctggtttacgtggtgaagatggt
atgcccggagctcctggtcttcaaggtgaaaagggtgttgctggtattgctatgcatgga
cgtcccggtatttccggcgagaaaggtgatcgcggtcgtgatggtgttaatggacgtgat
ggtgccaccggtcttaagggtgatcaaggcatgcctggtcttttgggagctaagggttct
aaaggtgaaatgggtcttcctggtgtacccggagctcctggtatggatggcaaacccggt
gaagttggcgctcctggtccagttggttacatgggtgttaagggtgataagggcgaacgt
ggttatcctggcagcaacggcgcaaagggcgaaagaggagagcaaggtttaactggtttt
gttggcgctccaggtgctaagggtgaacgtggtttgaccggtcccgctggtttagacgct
aaaccatttactatcaagggtgacaagggtgaaatgggtgaagctggcttaattggtttg
cctggtcctatgggtctaaagggtaaccaaggtgtacaaggtttcactggttctaaaggt
gatcgcggtatgactggtcctcctggcgctcctggtttgaatggtcttcctggcttgaag
ggtgatatgggtgctagaggtgatgttggcgctcctggtttgacaattaagggtgaaaag
ggtttgcctggacgcactggtaaaaacggacgtgaaggtgctcccggtcctgctggtctt
aagggtgacaaaggcttgcctggtctttcgggtactcctggtgccatgggacctcccggt
atacctggtcctcagggtcctaaaggtgatcgcggtcagatgggtcaacctggtagagat
ggtcatgacggtatgcctggcgtacaaggtattaagggtgatatgggttatcctggtcct
aagggtgaaatgggtcctcctggcttccaaggtcaaaagggtgataagggtgaattaggt
tttactggtgctcctggtctacctggccgtgctggtcttaagggtgatatgggtatgagt
ggtctcgatggcttgcctggtccaattggtgctcctggtgagaagggttaccccggtccc
gctggtattaacggtcgcgatggaaaatctggcactaagggtgacaagggtgaacctggt
atggtacctccacctggtcctaagggtgaacctggttatcctggtagagacggtcttaag
ggtgaacgtggacttccgggtcctcgtggcttaattggcttgcaaggtgaacgcggtgaa
aagggtgaacaaggtttgattggtttaactggtccaactggccgtcccggtccgaagggt
gatcaaggtgttcccggtcccattggtcgtgaaggtgctcccggtattctcggtcccaaa
ggtgaacctggtgtggcttgttctgctgcccaagactatctcaccggtattttattggtc
aaacacagtcaatctgaagaaattccacgctgcgaacctggtcacattgaattgtggagt
ggttactccctcatgtacatcgatggtaacgattatgcacacaaccaagatttaggttct
cctggctcttgcgtacgtcgcttctccacactgcccgtactatcatgcggtgccaacaac
atttgcaactatgcctccagaaacgacaaatcattctggttgaccacatctgcagcattg
ccaatgatgcccgttccagctcatgatgtcagcaattacatttcacgttgtaccgtgtgt
gaggctccctcaaatgtcatttccattcacagtcaatctttagacattccaagctgtccc
aatggttgggaaggtctctggatcggttacagtttcatgatgcacactgccgcgggtaac
ggaggtggtggtcaagatatgtcctcacccggttcctgcttacaagatttccgcaccact
cccttcattgagtgtaacggcggcaaaggtcattgccacttctacgagacaatgtccagt
ttctggatggtcactatggaagaatatcaacaattccaaagacccgcaatggagaccctt
aaggctggcaatctgctacaaaaggtctcaagatgtcaagtctgtattaagaactcatcg
tag

DBGET integrated database retrieval system