Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly): 135955861
Help
Entry
135955861 CDS
T10781
Symbol
LanB2
Name
(RefSeq) laminin subunit gamma-1
KO
K05635
laminin, gamma 1
Organism
cvj Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly)
Pathway
cvj04512
ECM-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cvj00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
135955861 (LanB2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_laminin
Laminin_N
Laminin_B
EGF_LMN_ATRN
JAG1-like_EGF2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
135955861
NCBI-ProteinID:
XP_065362306
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(68802099..68818861)
Genome browser
AA seq
1630 aa
AA seq
DB search
MKRSKWSLSSSQHSILSWSLMTILLLNNGPQLSYGHGPTTFMPALECYDKYNKPQKCMPE
FINAAYQLQIEATNTCGEQGENHFCVQTMNSNYKNCEFCRWEDHNPSYLTDLHDPQNPSW
WQSETMYEGIQHPNHVNLTLHLRKSFDITYVRLLYRSPRPESFAIYKRTCETCPWIPYQY
YSATCRDTYALPDSRAIRKGEGEAHALCTSEYSDISPLRDGEIAFSTLEGRPSGINFERS
TELQEWVTATDIRITLDRLNTFGDELFGDAQVLRSYFYAISDIAVGARCKCNGHASKCVP
STGMNGERRLVCECRHNTDGPDCDKCLPLYNDVKWKRATSTEVNECKACNCNGYADKCFF
DAHLYNMTGHGGHCLDCRDNRDGPNCERCKENFYMREDSYCIHCGCDPVGSRSLQCNSQG
KCQCKPGVTGDKCDRCEANYYQFGPHGCQPCGCDPRGSFGNMPSCDAETGICHCKDNVEG
KRCNECKPGFFNLDMTNRFGCTPCFCYGHTSECQTAPGYSVVSTTSNFNKHKERWSAVDL
YTQDIDIKYNQYSHSIGTTAHGNEYVYFQAPERFLGDQRASYNRDLKFKLQLVGQIAPST
SASDIILEGAGTKISLPIFAQGNGMPDNDVKEYTFRLHEHRDYQWQPSQSARGFLSILSN
LTAIKIRGTYSKQGEAILDDVELQTAHRGAAGHPATWIEQCTCPEGYLGQFCESCAPGYR
HSPARGGPFMPCIPCDCNGHAEICDSETGRCICQHNTTGDNCDQCAKGYYGNALGSTPYD
CKRCPCPNDGACMQINGDTVICTECPVGYFGARCEQCSDGFYGDPTGLYGEVQTCKSCDC
NGNVDPNAVGNCNRTSGECLKCIHNTAGKYCDECLPGHFGDPLALPHGQCDRCSCYPPGT
EQNNDGISQCDQVTGQCHCKPSVIGRDCGECQPGYFNIMSGNGCENCMCDPIGSYNSTCD
RSTGQCFCKPGVVGLHCDQCDVYHYGFSSEGCKTCECDESGSKGFQCDQNGQCPCNDNVE
GRRCDRCKENKYDRHLGCIDCPDCYNLVQDAANEHRAKLKNLSSTLDEIARTPVTNDGEF
EAKLKTVQEKVDILLNDAKYGAGDSGKTYVEVLNELHKRLESINRHLDGADTLQDSANDE
IEKAKHNHTIAQDIIQAAKTDLKNALDLLHDEGEQALAKAQNKSVEFGVQSDQISDISRE
ARALADRLESEAQFDLKNAKDANDAVEKAYELAKSAINLQQKVSDELRTEVRLELETVKQ
GLGTATQTTKEALRKANEVYDAALSLLNDVSGLTVPEIDIKKFKEEASLANKQADELLQQ
VNDISNSNGELFGDFEEEISLADIMLERANQQKLDDIDLLKRAQDAFDKATKAVEQGDNT
LKEANNTYHTLAGFQSDVQRSSEKADLALQTVPSIEQEIEKAENLIRQAEEALDGANKNA
KEAKMNAQEAQQKYAEQASKDAEFIRKRANETKVSARKLRDEADQLNHRVKVTEIDIGKL
EESSSKDDNLVDDAKRKVGQAKADTEEAKKQIDKAVNELDDIKEELINLKDINTADLDKL
EKRLDAVELDVSRANLTGRIEKFREMRNIQKKTVEKYEKELIDLQQEVLNVRLISEALPA
NCFSRSRLEP
NT seq
4893 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacgcagtaagtggagcttaagctcctctcaacattctatactctcatggtctctt
atgacaatattgctgctaaataatggaccacaattgtcgtatggtcatggtcccaccaca
tttatgccagccttggaatgttacgataaatataataaacctcagaaatgtatgccggaa
ttcataaatgctgcttaccaattgcaaatcgaagcgacaaatacttgcggcgagcaggga
gaaaatcacttttgtgttcaaacaatgaattccaactacaagaactgcgaattttgcaga
tgggaagatcacaatccatcatatttaacagatttgcatgatccacaaaatccatcatgg
tggcaatcggagaccatgtatgaaggcatacaacatcccaatcatgtgaatttaacactg
catttacgcaaatcttttgatattacttacgtgcgtctattgtaccgttctcccaggcca
gagtcgtttgccatttacaaacgtacttgtgagacctgtccctggataccctatcaatat
tacagtgccacttgtagagatacttacgccttacccgactccagagccatacgcaagggt
gagggtgaagcccatgctttgtgtaccagtgagtacagtgacatttcacccttgagagac
ggtgaaattgccttctccacattggaaggtcgtcctagtggtattaattttgaacgcagt
actgaactgcaggaatgggtaactgctactgatattcgtattactcttgatcgtcttaat
actttcggtgatgaactgttcggtgatgctcaagtcttgagatcatatttttatgccatt
tctgatattgctgttggtgcccgctgcaagtgtaatggccacgctagtaaatgtgtgccc
agtactggcatgaatggtgaacgcagactggtctgtgaatgtcgtcacaatacggatggt
ccagattgtgacaaatgtctgccattgtacaatgacgtcaaatggaaaagggcaacttct
acggaagtcaacgaatgcaaagcctgtaattgtaacggttatgccgacaaatgtttcttc
gatgctcatctctacaatatgaccggtcatggtggtcactgtttggattgtcgtgacaat
cgtgatggtcccaattgtgaacgttgtaaggagaatttctatatgcgcgaagacagttat
tgtatccattgtggttgtgatcctgtgggttcacgatctttgcagtgcaatagccagggc
aagtgtcaatgtaaacctggtgttactggtgacaagtgtgatcgttgtgaagctaattac
tatcagtttggtccacatggttgtcaaccttgtggttgtgatcctcgtggctcatttggt
aatatgccatcttgtgatgccgagactggtatttgtcattgcaaagacaatgtggaggga
aaacgttgtaatgaatgtaaacctggcttctttaatctagatatgacaaatcgttttggt
tgtacaccctgtttctgttatggccacacctccgagtgtcaaacagctcctggttattcc
gtagtttcaacaacttccaatttcaataagcacaaagaacgctggagtgctgtggatttg
tacacacaagatatcgacatcaagtataaccaatatagtcatagtattggcactacggcc
catggcaatgagtatgtgtacttccaagctcccgaacgtttcttgggtgatcaaagagct
tcttataatcgtgatttgaagttcaaattacaattggtgggtcagattgcacccagcact
agtgccagtgatattattctggaaggtgctggcactaaaatttcattgcccatatttgcc
caaggcaatggtatgcccgataatgatgttaaggaatataccttccgcctgcatgaacat
cgtgactaccaatggcaacctagtcaatcggccagaggtttcctttctatactctccaat
ctgacggccattaagattcgtggtacttactctaaacaaggagaggccattttggatgat
gtggaattgcaaacggcccacagaggtgctgctggtcatcctgctacctggattgagcaa
tgtacttgtcccgaaggttacttgggtcaattctgtgagtcttgtgctcctggttatcgc
cacagtccggccagaggtggtccatttatgccctgcattccttgtgattgcaacggtcat
gctgaaatttgtgattccgaaactggtcgttgtatttgtcaacacaataccaccggcgat
aattgtgaccagtgtgccaagggctattatggcaatgctttgggtagtactccctatgac
tgcaaacgttgcccctgtcccaatgatggtgcctgtatgcaaatcaatggcgatactgtc
atctgtaccgagtgtcctgtgggttacttcggagcccgttgtgaacaatgttcagatggc
ttttatggcgatccaaccggtttatatggcgaagtacaaacctgcaagtcttgcgattgt
aacggcaatgtagatcctaatgctgtgggtaattgcaaccgcacgtccggtgaatgtctc
aagtgtattcacaatacagctggcaaatattgtgatgaatgtctgccaggacatttcggt
gatcctctggctttacctcatggccaatgcgatcgttgcagttgttatcctcctggtacc
gaacaaaacaatgatggtatttcacagtgtgaccaagtcactggccagtgtcattgtaaa
ccaagtgttattggccgtgattgtggggaatgtcaaccaggctatttcaatattatgtct
ggtaatggttgtgaaaactgtatgtgtgatcctattggatcgtataattccacctgcgac
cgttcgactggccaatgtttctgtaaacctggtgttgtgggcttgcactgtgatcaatgt
gatgtgtatcattatggcttctcctccgaaggctgcaaaacttgtgaatgtgatgagagt
ggttcaaagggcttccagtgcgaccaaaatggtcagtgtccctgtaatgacaatgtggaa
ggcagacgttgtgatcgttgcaaggagaacaaatacgatcgtcatttgggctgtatcgat
tgtcccgattgctacaatcttgtgcaagatgccgctaatgagcacagagctaaattgaag
aacttaagctcaactttggatgaaattgctcgcactcctgtaaccaacgatggcgaattt
gaggctaagttgaagacggtacaagagaaggttgatattttgttgaacgatgccaaatat
ggagctggtgatagtggcaaaacgtatgtcgaagtattaaatgagctgcacaaacgtttg
gaaagcattaatagacatttagatggcgctgatactttgcaagactccgccaacgatgag
attgaaaaggctaaacataatcatactattgctcaagatataatacaggcggccaaaacg
gatctgaaaaacgctttggacttgctgcacgatgaaggtgagcaggctttggctaaggct
caaaataaatcagttgaattcggtgtgcagtctgatcaaatttcggatatctcacgcgaa
gccagagctttggctgaccgcttggaatcggaagcccaatttgatttgaaaaatgccaag
gatgctaatgatgcggtagaaaaggcttatgaattggccaagagtgccattaatttgcaa
cagaaggttagcgatgaattgagaacagaggtacgtttggaattggagacggttaaacaa
ggtttgggtactgccacccaaactaccaaggaagctttgcgcaaggccaatgaggtttat
gatgcggccttgagtttattgaatgatgtttctggtttgactgtacccgaaatcgatatt
aagaaattcaaggaagaagcttcgctggccaacaaacaagccgatgagctgttgcaacaa
gtcaatgatatttccaatagtaatggtgaacttttcggagactttgaagaagaaattagt
ttggctgatataatgttagaaagagctaaccaacaaaaattggatgatattgatttgttg
aagagagctcaagatgctttcgacaaggctactaaggccgtagaacaaggtgacaatacc
ttgaaggaggctaataacacctatcacactttggctggtttccaatcggatgtgcaaaga
tcttccgaaaaagcagatttggctttacaaacagtgcccagtatagagcaagaaattgaa
aaggcagagaatttaattagacaagccgaggaagctttggatggagccaataaaaatgcc
aaagaagccaaaatgaatgcccaggaagcacaacaaaagtatgccgaacaagcatcaaag
gatgccgaatttatacgcaaacgtgccaatgagacaaaagtcagtgctcgcaaattaaga
gacgaagccgatcaattaaaccatcgtgttaaagtcactgaaatcgatattggtaaactg
gaggaatcctccagtaaagacgacaatttggtagatgatgccaaacgaaaggtgggtcaa
gccaaggccgataccgaagaagctaaaaaacaaatcgataaagctgtcaatgagcttgat
gatattaaggaagaattaattaatcttaaagacattaacacagccgatttggataaactg
gaaaaacgtttggatgcagttgaattggatgtgagtcgtgccaatttaactggtcgcatt
gagaaattccgcgaaatgcgcaatatccaaaagaaaactgtagaaaaatacgaaaaagaa
ctaatagatctgcaacaggaagttcttaatgttcgtctaatatcggaagctttgcctgcc
aactgtttctccagaagtagactggaaccctaa
DBGET
integrated database retrieval system
