Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly): 135956435
Help
Entry
135956435 CDS
T10781
Symbol
shtd
Name
(RefSeq) anaphase-promoting complex subunit 1
KO
K03348
anaphase-promoting complex subunit 1
Organism
cvj Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly)
Pathway
cvj04120
Ubiquitin mediated proteolysis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cvj00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
135956435 (shtd)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
cvj04121
]
135956435 (shtd)
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
cvj03036
]
135956435 (shtd)
Ubiquitin system [BR:
cvj04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Multi subunit type E3
APC/C
Other subunits
135956435 (shtd)
Chromosome and associated proteins [BR:
cvj03036
]
Eukaryotic type
Sister chromatid separation proteins
APC/C complex
135956435 (shtd)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Apc1_MidN
ANAPC1
APC1_3rd
APC1_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
135956435
NCBI-ProteinID:
XP_065363005
LinkDB
All DBs
Position
4:21937201..21946516
Genome browser
AA seq
1965 aa
AA seq
DB search
MIAVSEPPLEYIPRGRPAVDEHPGPAETKPHPHLPSENILLQRLQNVNISAKEEHNEFWC
IREIYEECKREEKPNKFEVKTKPSVKKNTKNGSANKNSKDDNLNYLKAPQEYVSEYLMNS
EEELYVKKHTAVWTRGLADERSISPRLCFTCETPIKFAFFCNKSFTQSSLQYNKNDEEYP
DEGKQTSICLIDQTSLRVYCSNGEDFLSNLEFPISNVWPTRFGILLEKVASNTVIQNHTI
SMPRLFSLSHPLDEICPVLNKSATNVISYLIESDYNIIFSDENSDLLLLYDTKIGKHFIS
KLRKASADEIQYIGAQNETVLGSTVHQFSMHKGGSTIGQHAAGQCSFSQSSMKFPGVAPK
NSTHLGRTSLGTSNYSTHISKFLNCAHSLSGAFGNFNRSTAASPLSNLQSTIGQHSISVQ
DIRKCGQSQPSKPIVPELCLEHVWTENTYGNNRDFCEISTKAFIHTDLVGQTFLCYLLPR
SCKLQMVRINNFENKELQISTIPMTVVAKDAVALERMNMIAVLDPSGTLILYTGNVLVSK
VHIPLTNNTPTSKVNINLTPATQNKSPNTSFPRRSSLLPSAQKPGDTTFEDELHLLSPVH
PLQPQFSNRSSNICLGLRDPAVNRLTLVYSSGKMLRISLPLINETKFVTRCIKVLKQVLK
KDQYIQFITKWYGARNPPGSRDYSIEQEWDIFYTVLLDLMGYSAVMHDCSSNTATSFSAE
EPKKRKKNDEVHSGTEEDWQFMLSILEGTAADKTETKDNNSQCNNIDTTACLFNTIPAIF
YSFHLLYEDFKLDDTMHAHLLSLAKFLHQLAFDMQLQSYTFHYSLDFPLLVKNCSKTCIL
TEQHGAQMSHKELLQVQAPSVFKQLEFIIQNKDTLPYNYVEGLNDLSRNVLQVVSLVMHG
TNKIKHWIKPLEFPDSVQSFFSKKPKRFISTNITRSEQVIQMLINMKISRKDIEHLPVAV
HLIISECLEYSRLEPPIGCSPATYELILRSDLVAHAKLQNCDFATLNKNSNYLQNMNIDT
EDSLSARCPPAKSGISQMEGALDDGMDNIDTKLLSLRYPDDMRITEVRRLLTSSEPVIID
ITQSPGTSDHEFIEEQEKQLFTLCTRTMTLPLGRGMFTLRTSIPTPTESMPIPKLCLTGK
EPIKGATVEMQQIEFPANMSLWPTFHNGVAAGLKISPNARDVDSTWIVYNKPKGQTEIST
EHAGFLMALGLNNHLKTLSFMSIYEYLVKCDEMTSVGLLLGISATHRGTMNNTTTKLLSV
HIEALLPATALELDIPQNIQVASLMGIGLLYQGTAKRHIAEVLLQEVGRPPGPEMENCLE
RESYALTAGLALGLVTLGQGESPAGLRDLQLPDTLHYYMVGGNKRLLTGSQKEKYKLPSF
QVREGDQVNIDVTAPGATLALGLMFYNTDNKAVAEWMNPPNTRYLLDLVRPDLLLLRTIA
HGLIMWSEVQPDEDWLHNQFPINLRFDVDKGSQVNENEDIDHEAITQAYCNIIAGAAFCI
GLKYAGSENPIAFKTLRRAIKLFLGFSGKYVGEFAGRTTIENSLMVILLAISLVFAGSGD
LEILRIIRYLRSRIGTQNPHVTYGSHMAIHMALGFLFLGAGRFTIAKTPEAVAALVCALF
PKFPTHSNDNRYHLQAFRHLYVLAVEPRLFLPRDIDTRKLCLCNISVLEIGSKELRRLPM
APCMLPQLSNLQKVVVDDPNYWPVSFEKDRNWNQLVKALENSACIEIKKRSGCLSHLEDP
DRLKSLFSLTLTTEQSLCWEIDPRTLERFSNEPYVIGFTDRLLHLDESETSSVELALKQH
LTMLFYNAVVKDKMHVLPIYLATYNHVLRLKTQQLSFNDIWQLKLISSYLLHYPQSHILF
SKELILAYIEQFQTFIDNCRQQLSLPLRQFISSRDFEPHIIANLSKPDVARLVAVIIFYQ
LTPNLMNLIVQRPANYIGYIKEFQKLQLDTSTTQCLLKVLQATSA
NT seq
5898 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcgccgtatcagagcctccattggaatatattccacgaggtagaccggcggtcgat
gagcatcctggtcccgcggagactaaaccacatccacatttgccctcggagaatatattg
ctgcagcgtctacaaaatgtaaatatttccgccaaagaagaacacaatgaattctggtgt
atacgtgaaatctatgaggaatgtaaacgcgaagaaaaacccaataagttcgaagttaaa
actaaaccctctgtgaaaaagaacactaaaaatggttcggccaataagaatagtaaagat
gataacttgaattatttgaaagcacctcaggagtatgtaagcgaatatttaatgaactcg
gaagaagagttgtatgtaaaaaagcacactgctgtatggactagaggtttagccgatgaa
cgcagcatttcaccacgtttatgcttcacctgtgagacacccattaaatttgctttcttc
tgtaataaatcatttactcagtcttcattgcaatacaacaaaaacgatgaggagtatcct
gatgaaggcaaacaaacatcgatatgtctaattgatcaaacctcattacgtgtttattgt
agcaatggcgaagattttctatccaatttagaatttcccatatctaatgtttggcctaca
cgttttggcatacttttagagaaggttgcctctaatactgtaatacaaaatcatacaatt
tcaatgccacgtttattttcattgtcacatcccttggatgaaatttgtccggtcttaaac
aaatctgcaactaatgtaatttcataccttattgaatccgattacaatatcatattttcc
gatgaaaattctgatcttttgctgttgtacgacacaaaaattggtaaacattttatatcg
aaattgcgtaaagcctcagctgatgagatacagtatattggtgcacaaaacgaaaccgtt
ttaggtagtacagttcatcagttcagtatgcataaaggtggcagtactataggacaacat
gcggctgggcaatgtagtttctcacaaagtagtatgaaatttccaggagtggcaccaaaa
aatagcacccatttgggacgcactagtttgggaacatcgaattattccacacatataagt
aaattcctcaattgtgctcattctttaagtggagcttttggaaattttaatcgttcgact
gccgcttctcctctaagtaatttacaatcaaccataggccaacattctatatcagtgcag
gatatacgtaaatgcggtcaatcacaaccctcaaaacctattgtacccgaactatgtttg
gaacatgtttggacagaaaatacctacggaaacaatcgtgatttttgtgaaatatctaca
aaagcctttatacacaccgatttagtgggtcaaacatttctatgttatcttttgccacgt
tcatgtaaactgcaaatggtgcgtataaataattttgaaaacaaggagctacaaatatct
accatacccatgacggtagtagcaaaggatgctgtggcattagagcgcatgaatatgatt
gccgttcttgatccatccggaactttaatactatacaccggcaatgttttggtatctaaa
gtccatatacctctgaccaacaatacaccaacctcaaaagttaatataaatttaactcca
gctacacaaaataaatctccaaacacctcatttcctcgtcgcagcagtcttttaccatcg
gcacagaaacctggagacactacttttgaggatgagttgcatttgttatcaccagtgcat
cctctgcaaccacagttttctaatagatctagcaacatttgtttgggtctccgtgatccc
gctgtaaatcgtctcactttagtgtatagttctggaaaaatgttacgtatttcgttgccg
ctgataaatgaaacaaaatttgttacacgctgtatcaaagtattaaaacaggtgctcaaa
aaagatcaatacatacaattcattacaaaatggtatggagcacgcaatccgcccggatcg
cgagattattctattgaacaagagtgggacatattttatactgtattattagatctaatg
ggctattcagcggtaatgcatgattgtagcagcaataccgctacatcgtttagtgctgaa
gagccaaagaaaagaaagaaaaatgatgaagtacattcgggaacagaagaagattggcaa
tttatgttgtctattttagagggtacagcagcagataagacggaaacaaaagacaacaat
tcacagtgtaataatatcgataccacagcttgtttattcaatactataccggccatattt
tatagttttcatttactctatgaagattttaaattggatgatactatgcatgcacatttg
ttgtcattagcaaagtttctacatcaactggccttcgatatgcaattacaatcttataca
tttcactattctttggactttcctttgctggtgaaaaattgttcaaaaacttgcatttta
accgagcaacatggtgcacaaatgtcacataaggaacttttacaggtgcaagcacctagt
gtttttaagcaacttgaatttataatacaaaataaggatactttaccctacaattatgtg
gaaggtttaaatgatttaagtcgcaatgttttacaggttgtctcactcgttatgcatggt
acgaataaaatcaaacattggataaaaccattggagtttcccgactctgtacaatcattc
tttagcaagaaaccaaaaaggtttatatctaccaatatcacacgatctgaacaagttata
caaatgttaatcaatatgaaaataagtcgtaaggatatagaacatttgccagttgctgtg
cacttaataatatcggaatgtttagaatactctagattagaacctcccattggttgttca
ccggctacatatgaattgattttgcgttccgatttagtggcccatgctaaattgcaaaac
tgcgattttgccacactaaataaaaactctaattatttgcaaaatatgaatatagatact
gaggactcattatctgctcgttgtccacccgctaaaagcggcatatctcagatggagggt
gctttggatgatggcatggataatatagataccaaactgttgagtctacgttatcctgat
gatatgcgcataacagaagttcgtaggctattgacgtcatcagaaccggttattatagat
attacccagtcgccaggcacatcggatcacgaatttattgaagaacaagaaaaacaatta
tttaccttgtgcaccagaacaatgacattacccctgggtaggggaatgtttacattaaga
acatctatacccacaccaacagaatcaatgcccataccgaaactatgcttaactggcaaa
gaacccattaaaggagccacagtagaaatgcaacagattgaatttccagccaatatgagt
ttatggccaacatttcataatggtgtagcagctgggctgaagatatcaccaaacgcccgt
gacgtggactccacatggattgtttacaacaagccgaaggggcaaacggaaatatctacc
gaacatgctggctttctaatggctctgggcttaaataaccacttgaaaactttgtcgttc
atgagtatttatgaatacttggtgaagtgtgatgaaatgactagtgtgggtttgctcttg
ggcatatcggccacacatagaggtactatgaataatactaccactaaactcttgagtgta
cacattgaggctttgttgccagccacagccctggaattagatataccacaaaatatacag
gtggcttctttaatgggcatcggtctgctatatcaaggtacagccaaacgacatatagcc
gaagttctattgcaagaagtgggacgaccacctggccctgaaatggaaaattgtcttgaa
agagaatcgtatgccttaacagctggtctggccttaggtttagttactctgggacagggt
gagtccccagctggcttaagagatctccagttgcccgatacattgcactattatatggtg
ggcggaaataaacgtttattgaccggttctcaaaaagaaaaatataaattaccctcattt
caagtgcgcgaaggtgatcaggttaatatagacgttacagcacctggagctactctggca
cttggtcttatgttctacaataccgataacaaggctgtggccgaatggatgaatcctcca
aatacacgttacttgttggatcttgtaagacccgatttattattgctacgcacaattgcc
catggtttaataatgtggagtgaggttcaaccggacgaggattggttgcacaatcaattc
ccgatcaacctaaggtttgatgtagataagggatcgcaagttaacgagaatgaggacatc
gaccatgaagctataactcaagcttactgcaatataattgctggagcggccttttgtatt
ggcctaaaatatgctggttccgaaaatcccatagcctttaagaccctaagaagagcgata
aaactatttttaggtttttctgggaaatatgtgggagaatttgctggacgcacaactata
gagaacagtctgatggtaattttgttagccatatcattagtctttgccggatcgggtgac
ttagagatactgcgcattatacgctacctacgttctaggattggaacacaaaatcctcat
gttacatatggttcccatatggcaatacatatggctttgggatttctgtttttgggtgcc
gggcggtttaccatcgccaaaactccggaagcagtggcagctttagtatgtgctctattt
ccaaaattcccaacgcacagtaatgacaacagatatcatttgcaagcttttcgccatctg
tatgttttggctgtggaacctcgtctgtttttaccccgtgacatagatacacggaaattg
tgtctgtgtaatatatcagtattggaaattggttccaaggagttaaggcgtttacctatg
gctccctgtatgttgccccaattaagtaatttacaaaaagtagtggttgatgatcccaac
tattggccagtatcatttgaaaaggatcgtaattggaatcagttagttaaagctttggaa
aattcagcctgcattgagattaagaaacgttcgggctgtttatcacatcttgaggatcca
gatcgtctaaagagtcttttctctctgaccttaactactgagcaaagcttatgctgggaa
atagatcccagaactttggaaagattttcgaatgaaccatatgttataggatttaccgat
cgcttgttgcatttagatgaatccgaaacgtcttcagtggaattagctttaaaacagcat
ttaacaatgttattttacaatgccgttgttaaggataaaatgcatgttttacccatttat
ttggccacatataatcacgttttacgcttgaaaacgcaacaactaagcttcaatgacatt
tggcaattgaaattaataagctcctatttactgcattatccgcaatctcatatactattc
tctaaagagttgatattggcctacattgaacagtttcagacatttattgacaactgtcgt
caacaattgtctttgcccttaagacagtttataagttcacgtgattttgaacctcatatt
attgccaatctttcgaagccagatgtggcgcgtttggtggccgtcataattttctatcaa
ctcacacccaacttaatgaatttaattgttcagcgtcctgcaaattacattggctacata
aaagaatttcaaaaacttcaattggatacatcaactacacaatgtttattaaaagtgttg
caagcaacaagtgcctaa
DBGET
integrated database retrieval system