Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly): 135956451
Help
Entry
135956451 CDS
T10781
Symbol
Ir8a
Name
(RefSeq) ionotropic receptor 25a
KO
K05313
glutamate receptor, ionotropic, invertebrate
Organism
cvj Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cvj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
cvj04040
]
135956451 (Ir8a)
Ion channels [BR:
cvj04040
]
Ligand-gated channels
Glutamate (ionotropic)
135956451 (Ir8a)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lig_chan
Lig_chan-Glu_bd
SBP_bac_3
Ion_trans_2
Serendipity_A
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
135956451
NCBI-ProteinID:
XP_065363023
LinkDB
All DBs
Position
4:52429679..52434864
Genome browser
AA seq
929 aa
AA seq
DB search
MSFIRGALVLWSFLTIVKCNDLNIVFWVEPVQKDIYSDINAALKEVDNLHLESEITDAVM
VVESPGGDNNDAEEVNNRNMKTFCDILSALEVSVILDFTYHPWHQGLDYVQSHNIPYLRV
DRMLKPFLHAFSEFLIQKGGNDVVLILQNEQDRMEALLQVVEGYPFRTLIMNAADNDVDI
VQRLKDLRPSPSYYAIFAKGTNMNTIYEKLSNGNVFLRNTEWHLIYLDTKDRVFKYKKQV
EKTNKFGLNPRSICRSMLMKDAYCLSGFTLQRALLLEIFRSLIDIRQSNLDWLKPLAAEC
NSTSEEADPFISNFEILDHFRLTNFMSFATTNANNQFDDEVEVIPPLTYNVNMTITFYSS
EHDAVTDLADWQNGELKKRIPTINPSKRFFRIGTTEAIPWSYYRRDPQTGEKILDSNGNP
TWEGFCIDFIETLSEKLNFEYELIDPVKGKFGKRDVETGKWDGIVGDLVSGETDLAVTAL
KMYSEREEVIDFIAPYFEQTGISIVMRNPVRQTSLFKFMTVLRLEVWLSIIAALVATAVM
IWVMDKYSPYSSRNNKDAYPYPCREFTLRESFWFALTSFTPQGGGEAPKAVSGRILVAAY
WLFVVLMLATFTANLAAFLTVERMQTPVQSLEQLARQSRINYTVVDGSDTHQYFINMKFA
EDTLYRMWKELALNASRDFHKFRIWDYPIKEQYGHILLAINSSMPVKDTQEGFRKVNEHE
NADFAFIHDSSEIKYEITKNCNLTEVGEVFAEQPYAIAVQQGSHLADELSFALLELQKDR
YFEELKAKYWNHTSANCPLSEEQEGITLESLGGVFIATLFGLGLAMVTLALEVFYYKKKL
PKTSIKGSITQVKPLDTPQKVIDVWHTVKEKKNPTPPPSFETATFRGRKIPDGITMGSEF
KPSRMGLQVRRRVDSTDTLKDSDLPAYVE
NT seq
2790 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttttataagaggagcgcttgttctttggagttttttaactatagtaaagtgcaat
gatttgaatatcgtattttgggtagaacctgttcaaaaggatatttactccgatattaat
gcagctttgaaagaagtcgataatttacatttagaatcggaaataaccgatgccgtaatg
gttgtggaatcgccgggaggagataacaatgatgccgaagaagttaataatagaaatatg
aaaactttttgtgatattttatctgctttggaagtttcggttatattggatttcacctat
catccctggcatcaaggtttggactatgtgcaatcccataatataccctatttgagagtg
gatcgtatgctgaaaccatttttacacgcctttagtgaatttctaatccagaaggggggc
aacgatgttgtattaattttacaaaatgaacaagatagaatggaggctttattacaagtg
gttgagggatatccatttcgtacattgataatgaatgcggccgataatgatgttgatatt
gtgcaacgtttgaaagatttacgacccagtccttcatactatgcaatatttgccaagggt
acaaatatgaatacaatttatgaaaagctctccaatggaaatgtatttttgcgcaatact
gaatggcatttgatatatttggataccaaggatagagtatttaagtacaaaaaacaggtg
gaaaagaccaataaatttggtttaaatcccagatccatttgccgatctatgctgatgaag
gatgcctattgtttaagtggtttcactttgcaacgagctttgttattggagattttccgc
agtttaattgatattagacaatcaaatttagattggttaaaacctttggcagccgagtgc
aatagcaccagcgaggaagctgatccatttatttcaaactttgaaattttagatcatttt
cgtttaacgaattttatgagttttgctacaacaaatgctaacaatcaatttgatgatgaa
gtggaagttataccacccctaacgtataatgtgaatatgaccataactttttattccagt
gagcatgatgccgtaaccgatttagctgattggcaaaatggtgaattaaaaaaacgtata
ccaactataaatccatccaaaagattttttcgtataggcacaacagaggccataccctgg
agctattatcgtcgagatcctcagaccggtgaaaagattttagactctaacggtaatccc
acatgggaggggttttgcattgatttcatagaaaccttatcggagaaactaaactttgag
tatgagttaatcgatccggtaaagggaaaatttggtaaacgtgatgttgaaaccggcaaa
tgggatggtattgttggtgatttggtaagtggtgaaacggatttagctgtaacagctttg
aaaatgtattcggaaagagaggaggttattgattttattgctccgtactttgaacaaact
ggcatatcgattgttatgcgcaatccggtgaggcaaacgtctctttttaaatttatgaca
gtgctcagattggaggtatggttgagtattatagctgccttggttgccaccgctgttatg
atctgggtaatggataaatattctccttacagttccagaaataataaagatgcttatcca
tatccatgcagagaatttaccttacgtgaaagtttctggtttgctttgacctcgtttaca
ccccagggtggtggtgaagctcctaaggctgtgtcaggacgtatattggtagcggcttat
tggctgtttgtggtcttaatgttggccacatttacagcaaatttggcagccttcttaacc
gttgaaagaatgcagactccggtgcaatctctggaacagctggctaggcagtctcgtata
aattacactgtggtggatggttcggatacccatcaatattttattaacatgaaatttgcc
gaggatacactctatcgcatgtggaaggaattggccctaaatgcctcaagagattttcac
aaatttcgcatttgggattatccaatcaaagagcaatatggtcatatattattagctatt
aatagctcgatgccagttaaggacactcaggagggttttcgtaaagtcaatgaacatgaa
aatgccgattttgcctttatacatgattcttcggaaattaaatatgaaataacaaaaaat
tgtaatctaaccgaagttggagaagtatttgctgagcaaccctacgctatagcagtgcaa
cagggatcacatttggctgacgaattaagttttgccttgttggaattgcaaaaggatcgt
tattttgaagagttgaaggcaaagtattggaatcatactagtgccaattgtcctttgtcc
gaggaacaagaaggcattactttggaaagtttgggtggtgtcttcattgccacactattt
ggcttgggtttggccatggtcaccttggctttggaagtattttactataagaaaaaatta
cccaaaacctctattaagggttcaattacacaagttaaacctttggatacaccacaaaaa
gttattgatgtttggcatacggttaaggaaaagaaaaatccaacaccgccgccttcgttt
gaaacggctacatttagaggacgcaaaataccggatggcataactatgggttcggaattt
aaaccaagtcgtatgggcctgcaagtacgtcgtcgtgtagatagtacagatactttaaag
gatagcgatttaccggcatatgtggaatag
DBGET
integrated database retrieval system