KEGG   Crassostrea virginica (eastern oyster): 111108706
Entry
111108706         CDS       T09197                                 
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like
  KO
K20994  Notch 2
Organism
cvn  Crassostrea virginica (eastern oyster)
Pathway
cvn04330  Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cvn00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04330 Notch signaling pathway
    111108706
SSDB
Motif
Pfam: EGF EGF_TEN hEGF EGF_CA EGF_2 EGF_Teneurin EGF_3 EGF_DL_JAG JAG1-like_EGF2 EGF_MSP1_1 GPR128_N EGF_C8A_B_C6
Other DBs
NCBI-GeneID: 111108706
NCBI-ProteinID: XP_022300455
UniProt: A0A8B8BAK4
LinkDB
Position
8:complement(47102234..47111528)
AA seq 1479 aa
MSGSKLIYFLLFTTFAYKLANGKITFFIHIDEVQSYKRLHGGACCQGVTGTLCTKLCKPV
VTICLKDRQLACVSSFTSTLDISREYVVYGSEIGNTTNPQYLEVDYWNKHSNMIEIVVRD
LQITATPLIYQKEFNDYNLKIGDNILSQHWGQKTLLSSFLGDGNSFSIKITYKAYCSEGY
YGASCTDHCPDNPKKCVVNGHTYCKMGWQGHNCDQDVNECSARGFCSHGNCTNTVGSFNC
TCPPSVYGLKCQLDEDECLLNPCNGGECVNTVGNYNCICKSGTTGKNCESLTSISCSGVT
CSHHGHCATSNHKPVCNCDKGFFGTDCSVTSVTDFCLNNQCKHGSACVLGNSNYTCYCAK
GYYGQFCENYDHCLGSPCDISTVCSNTDFGYECSCRNSRVGINCTQLNYCTNQTCTTRGL
CDLNDTSLECNCLEGFIGELCENIDHCVNHNCSINEQCISIKSGYSCICKDGFEGVNCEV
KIPCFGQLCSGHGICHEIRESGVNDFFCKCEIGWSGSVCQTYDYCHNITCSNHGTCFASN
MGFVCVCQSGYSGLYCEAEQHCKPTSCNVPYVCIETLSGFKCVCPYDLGGQNCDRVNHCI
RNPCGNHGSCVDTAVGFNCSCFDGWMGSLCSEIDHCANSSCQNGAICYNNNTGYTCTCKE
GFIGSFCQNIDYCSANPCLNNGSCLNHGTNFTCLCQKEWVGQHCEYENVCFTSSPCGKHG
HCYQIGTEARCVCQEGWTEKTCAQKDYCHYYPCGNMGTCHNLNETYTCSCDPQWTGKNCE
TFACENNTCIHGHCRASVSTVFECKCNDSWIGHDCDIVDPCQFIFCENGGKCEPYLYPDS
TSANLTLNDFAFNATGVCKCVQGWEGTMCNIDVDECHSQNTCHGNGICKNSLGGFSCICN
GGYTGRECETNINECSSNPCHNNGTCLDAVGGFNCICSKFFDGDTCDKDVNECQYYICGA
HGSCNNSFGNYKCACEPGWMGRHCDHHLSSCSLHPCKNNATCFNVEDTFFCSCDESFSGR
YCEIDVDECKTQSLCKNGATCMNTYGSYHCACPIGWTGEFCDSDINECASNPCASNTLCV
NKVNGYECQDCSSYTCSNGGMCQDTDNGPICNCTREWVGSDCTHKNFCKDDPCGSLQICI
NKERTFICEYHPCNSSPCQNYGTCIESGAEYQCKCTSGWKGAYCEEIDYCAEITCENNGT
CESRNTSFHCGCSGYWFGERCEIYNYCHSSPCRNNGICQNALGDYVCICEQGWEGKNCAT
FNYCFSLPCMNDGICTNLNTTYECTCKDHWKGKNCAEYNYCFDLPCQNNGTCVNEINTYS
CICSTGFLDKDCNVVDQCLSGPCQNNGTCILNQTSGSYECRCHGGYIGKHCEKDQNECAM
NLCPGQSTCYNEDGGYRCIWQRKRRREAILKQSRSGVIELPKSNTRQETLENIFIAQHSV
EMSSCQSQPSIFEPKSLTLESNGRLLLHFLIWCSTEDED
NT seq 4440 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtccgggtctaaactaatttactttttactgttcacaacattcgcatataagcttgca
aatggaaaaattactttctttatccacatcgacgaagtgcaaagttataaaaggctccat
ggcggggcctgttgccaaggtgttacaggaaccttatgtaccaagctttgtaaacccgtc
gtcacaatatgtcttaaagacagacaacttgcatgtgtatccagttttacttccacttta
gacattagtcgtgaatatgttgtgtacggatctgaaattggcaacacaacaaatcctcaa
tacctagaagttgattattggaataaacacagcaacatgatagagatagtggtacgggac
ttgcaaattactgccacacctctcatttaccagaaagaatttaacgattacaacttgaaa
atcggagacaacatactctctcaacattggggacagaaaacactcttatctagcttttta
ggtgatggaaacagttttagcattaagatcacctataaggcgtactgttcagaaggttac
tatggagcaagttgcacagaccactgcccagacaatccaaagaaatgtgttgtgaatggt
catacatactgtaaaatgggatggcagggtcacaactgtgaccaggatgtcaatgaatgc
agtgctagaggtttctgtagtcacggtaattgtacaaacaccgtcggaagtttcaattgt
acctgtccgccgtctgtctatggtctgaagtgtcagctggacgaggatgagtgtttgctg
aatccatgtaatggaggagagtgcgtcaatacagtgggaaattataattgtatctgtaag
agtggtacaacaggtaaaaactgtgaatccctgacaagtattagttgtagtggagtcaca
tgtagtcaccacggacattgtgcgaccagcaatcataaaccagtttgtaactgtgacaaa
ggattctttggaacggattgctctgtaacctctgtaacagatttttgtttgaataatcaa
tgtaaacatggatcagcatgtgttttaggaaattctaactatacctgctactgtgccaaa
ggatattatggtcaattttgcgaaaattatgaccattgtcttggtagtccttgcgacatt
tcaacagtttgtagtaacactgattttggttatgagtgttcttgcaggaattccagagtt
ggaattaattgtacacaactaaattattgcaccaatcagacctgtactacgagaggactc
tgtgatttgaatgatacatcattggaatgtaattgcctggagggtttcataggggagcta
tgtgagaatattgaccactgcgtcaatcacaactgctccatcaacgaacaatgtataagt
atcaaaagtggttattcttgcatttgcaaagatggttttgaaggtgtaaattgtgaggtc
aagatcccttgctttggtcaactttgtagtggtcatggtatatgtcacgaaattagagag
tctggtgtaaatgatttcttttgtaaatgtgagattggctggtcgggctcagtttgtcag
acctacgattactgccacaacattacatgttccaaccatggtacatgctttgctagtaat
atgggttttgtctgtgtgtgccaatcgggttatagtggattatactgtgaagctgaacag
cattgcaaaccaacgtcctgcaacgtgccgtatgtttgtatagaaactttaagtggtttt
aaatgtgtatgtccttatgacttgggtggtcagaattgtgatcgagtgaatcactgtatc
agaaatccatgtggaaaccatggttcgtgcgtagacacggccgtcggattcaattgttcg
tgctttgatggttggatgggttctctctgttctgaaatcgatcattgcgctaatagttca
tgtcaaaatggggctatctgttacaacaataatactggttacacgtgtacatgtaaagaa
ggtttcattggttccttttgtcaaaacatcgactattgctcagcgaacccttgtcttaat
aatggatcttgtttgaatcatggcacaaattttacgtgcttatgtcaaaaggaatgggta
ggacaacactgcgaatatgaaaacgtttgtttcacgtcttctccttgcgggaagcatggg
cattgctaccaaattggtacagaagcacgttgcgtttgtcaggaagggtggactgaaaag
acatgcgcacaaaaggattattgccattattatccatgtggcaatatgggaacttgccac
aacctaaatgaaacctatacctgctcgtgcgatccacagtggacgggtaagaattgcgaa
acatttgcttgtgagaacaacacttgcatacatggacactgccgggcttctgtaagtact
gtttttgaatgcaagtgtaatgacagttggataggtcatgattgtgatatagtagatccg
tgtcaatttatattctgtgaaaacggaggaaaatgtgaaccatatctttatccagacagt
acatcagctaatttgactttgaatgattttgctttcaatgcgacaggagtttgtaaatgt
gtacaaggttgggaaggtactatgtgtaatattgatgttgatgaatgtcatagtcaaaat
acttgtcatggtaatggtatttgtaagaacagtctcggtgggttttcctgtatctgtaat
ggtgggtatactggcagagaatgtgaaacgaacattaatgagtgttcatctaatccttgt
cataacaacggcacatgtttggatgctgttggtggtttcaactgtatatgttccaaattc
tttgacggagatacatgcgacaaagatgtcaacgaatgtcagtattatatctgcggtgcc
catggatcatgtaataattcattcggtaattacaagtgtgcgtgtgaaccaggctggatg
ggtcgacactgtgaccatcacctgagttcttgctctctccatccgtgtaagaacaacgct
acttgttttaatgttgaggatacatttttttgttcatgtgacgaaagcttttctggcaga
tattgtgagatcgatgtggacgaatgcaaaacacaatcattatgcaaaaatggcgcaact
tgtatgaatacgtatggttcttaccactgcgcatgcccaataggatggacaggggaattc
tgtgattctgacattaatgaatgtgcgagtaacccatgcgcatcaaatactctttgtgta
aacaaagtaaatgggtatgaatgccaagattgctcatcatatacctgtagcaatggaggg
atgtgtcaagatacagacaatgggccgatttgtaactgcaccagagaatgggtaggctcc
gattgcactcataaaaacttttgcaaggatgatccatgcgggtctctgcagatctgtatc
aataaagaacgcactttcatatgtgaataccatccatgtaatagttctccgtgtcaaaat
tatggaacatgtattgaatctggggctgaatatcaatgtaaatgtacctctggatggaaa
ggagcgtactgtgaggaaattgattactgtgccgaaattacatgtgaaaacaatggaacg
tgtgagagtagaaatacttcttttcattgtggatgctccggttattggtttggagaacga
tgtgaaatatacaactattgccatagcagcccatgtagaaataacgggatatgccaaaat
gctttaggtgactacgtttgtatttgtgaacaaggttgggaaggtaaaaactgtgccact
ttcaactactgttttagcttaccttgtatgaatgatggcatttgtaccaatctgaataca
acgtatgagtgtacttgtaaggaccattggaaaggaaaaaactgtgctgaatacaactac
tgctttgatttgccctgtcaaaacaacgggacctgcgttaatgagataaacacgtattct
tgtatttgctcaacaggtttcttggataaggactgcaacgttgtcgatcaatgtttatca
ggaccttgtcaaaataacggaacttgtattctgaaccaaacttcaggtagttacgaatgt
cggtgccatggcggttacattgggaaacactgcgaaaaagaccaaaatgaatgcgcaatg
aatctttgtccgggacagtcaacttgttataatgaagacggtggatataggtgcatatgg
cagaggaagcgaagacgtgaggcaatattaaaacaatccaggagtggtgttatagagtta
cccaaatccaatacaagacaagaaacacttgaaaacattttcattgctcaacattcagtt
gaaatgtcgtcgtgccaatctcaaccatcaatatttgaacctaagtcattgacattagaa
agtaatggcagacttttgctgcatttcttaatatggtgcagtacagaagacgaagactaa

DBGET integrated database retrieval system