Campylobacter volucris: CVOL_1170
Help
Entry
CVOL_1170 CDS
T03558
Symbol
pheT
Name
(GenBank) phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit
KO
K01890
phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain [EC:
6.1.1.20
]
Organism
cvo
Campylobacter volucris
Pathway
cvo00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cvo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
CVOL_1170 (pheT)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
cvo01007
]
CVOL_1170 (pheT)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
cvo03016
]
CVOL_1170 (pheT)
Enzymes [BR:
cvo01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.20 phenylalanine---tRNA ligase
CVOL_1170 (pheT)
Amino acid related enzymes [BR:
cvo01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class II (U)
CVOL_1170 (pheT)
Transfer RNA biogenesis [BR:
cvo03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
CVOL_1170 (pheT)
Prokaryotic type
CVOL_1170 (pheT)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA_synthFbeta
FDX-ACB
tRNA_bind
B5
B3_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJC94472
LinkDB
All DBs
Position
complement(1132570..1134900)
Genome browser
AA seq
776 aa
AA seq
DB search
MIISKNWLNEWIDLSDISTNTIVQTLNSIGLEVDNFKSVKAPDKVVIGKVLEKIKHENSD
KLNICKVDVGSEILQIVCGAKNVDKDQIVAVALVGAILPNDLKIKPVKLRGVDSMGMICS
SSELGFGKSNEGIMVLDESMGELILGKALNEYDLFNDELIEIDLTPNRGDCLSLYGVARD
LSAALDLNLKELPSVKESENSVGIGRILSVKNHTELNGFFAYKALEVKDNFKLNIVVQIR
LALIQEYKNNNIENLLSYTMHATGVVFFAYDFHKLCQECQIDEKIILEINSLEHGEYGVY
YKNNLIALAGIEQKDDFKINEDSKVIVIEASYTHPQIIANAMAVHKKKNDISYRSLRGSE
PKLSLGMDYLLKECLKIDNLAVFSGTQQVFSQIEDKIIGIFTADIDKIIGMPIDKNVLVK
ILKKLGFDIIVVNDEQINVKIPLHRSDINNIADISEEILRIIGIDNIPSKALEFKEKNRL
NQVYFDYQELKNLRFKASCNGYFESIHYVLDNEEELNALGFKCIKNKLINPITKELDTLR
STLINHLLNAAKLNLRNSKKKVKLVECGSVFDEFSNEHTKFAMIFSGFKEEPKISNKAKP
TLVDFYTFLAELKSIIGEFSMQKSNHTFLSPYEQANVYKNGKRIGFVGRVHLAIENQKDL
TKTYICELDISGLKQEFKTAKHYSKFPSMSRDLSIMIPKGFEYEKIKNSIIKLDIDILES
FRVVDLYTDESLGEFYSLTINFIFRDFEKTLEDSVVIEQTDKILKTLNEEFGLKLR
NT seq
2331 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattattagtaaaaattggttaaatgagtggattgatttaagtgatatttctacaaat
actattgttcaaactttaaattccataggtttagaagttgataattttaaaagtgttaaa
gctcctgataaggttgtaattggaaaagtattagaaaaaattaagcatgaaaattcagac
aaattaaatatttgtaaagtagatgtaggtagtgaaattttacaaattgtatgtggtgct
aaaaatgtagataaagatcaaattgtagctgttgcattagtaggtgcaattttacctaat
gatttaaaaataaaaccagtaaaacttagaggtgtggattctatgggtatgatttgttct
tctagtgagcttggttttggtaaaagtaacgaaggcattatggttttagatgaaagtatg
ggagagttgattcttggaaaagctcttaatgaatatgatttatttaatgatgagcttatt
gagatagatttaacaccaaatcgtggagattgtttaagtttatacggagttgcaagagat
ttaagtgcagctttggatttaaatttaaaagaacttcctagcgtaaaagaaagtgaaaat
agtgttggcataggaagaattttaagtgttaaaaatcatacagaattaaacggatttttc
gcatataaagccttagaagttaaagataattttaaattaaatatagtcgtacaaattcgt
ttagcgctaatccaagagtataaaaataataacatagaaaatcttttatcttataccatg
catgcaaccggtgtagtattttttgcttatgattttcataaactttgtcaagaatgtcaa
attgatgaaaaaattattttagagataaattctttagagcatggtgaatatggagtgtat
tataaaaacaatttgattgctctagcaggaattgaacaaaaagatgattttaaaataaat
gaagatagtaaagttattgtaattgaagcaagttatactcatccacaaattatagctaat
gctatggcggtgcataaaaagaaaaatgatattagttatcgcagtttaagagggagtgag
cctaaactttctttgggaatggattatttgctaaaagaatgtttaaaaatagataattta
gcagtattttcaggaactcagcaagtatttagtcaaatagaagacaaaatcataggaatt
tttaccgcagatatagataaaatcattggtatgcctatagataaaaatgttttggtgaaa
attttaaaaaaactagggtttgatattattgtagtaaatgatgagcaaattaatgtaaaa
attcctttacatcgtagcgatatcaacaatattgctgatataagcgaggaaattttaagg
attataggtattgataatataccttcaaaagctttagaatttaaagaaaaaaatcgttta
aatcaagtatattttgactatcaagagcttaaaaatttaagatttaaagctagttgtaat
gggtattttgaaagtattcattatgttttagataatgaagaagagttaaatgctttaggt
tttaaatgtattaaaaataaattgattaatccaatcaccaaagaacttgacactttaaga
agcactttgatcaatcatcttttaaatgcagcaaaattaaatttaagaaattccaagaaa
aaagtaaaacttgttgagtgtggtagtgtttttgatgaattttcaaatgaacatactaaa
tttgcaatgatttttagcggttttaaagaagagccaaaaatttctaacaaggcaaaacca
actttggttgatttttatacttttttagccgaacttaaaagcattataggcgaatttagc
atgcaaaaatctaatcacacttttttaagtccatatgaacaagcaaatgtttataaaaat
ggtaagcgtataggttttgtaggtagagttcatttggctattgaaaatcaaaaagatttg
acaaaaacttatatttgtgagcttgatataagcggattaaaacaagaatttaaaaccgca
aagcattattctaaatttccttctatgagtagagatttgagtattatgattcctaaggga
tttgagtatgaaaaaattaaaaattcaattatcaagctagatattgatatcttagaaagc
tttagagttgtagatttatatactgatgaatctttaggagaattttatagtttgactatt
aattttatttttagagattttgaaaagactttagaagatagcgttgttatagagcaaaca
gataaaattttaaaaactttaaatgaagaatttggactaaagcttcgatga
DBGET
integrated database retrieval system
