Crocosphaera watsonii: CwatDRAFT_2066
Help
Entry
CwatDRAFT_2066 CDS
T05097
Name
(GenBank) TPR repeat
Organism
cwa
Crocosphaera watsonii
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_1
TPR_2
TPR_8
TPR_11
TPR_9
TPR_12
TPR_14
TPR_17
TPR_16
TPR_19
TPR_BSK1_C
RMD1-3
TPR_6
ARM_TT21_N
TPR_CcmH_CycH
TPR_10
ANAPC3
CFAP70_TPR_C
TPR_Slam
ARM_TT21_C
ETO1_C
TPR_15
CFAP70_mid_TPR
TPR-S
PRP6_TPR
FAT
TAFII55_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EAM49515
UniProt:
Q4C026
LinkDB
All DBs
Position
16957..18927
AA seq
656 aa
AA seq
DB search
MAIADFVRNSGKVIALEPENDEHYFERQNLYFLNGQYKLALEDVRQAIKLNPKEAEYYQQ
SGILRNSLADTQGALEDYNKAIKFNPNYAQAYYTRGSLYSTAFSDYGKAMADFTKAIELN
PKFGEAYISRGLLQAVLSDFQGALEDFNQAILLSKDPDPKMNLLWNGTPVEDYESLGMYR
RIADNLLEGVEENDQNSRTAGIHKYRGDIRLQLKDTEGALQDYNEAIKLAPKQADAYVAR
GDYYTQMQQAEKAKADYNKAITIYSESIENPTIKASLFIHYSDRAEVYSKIKNYQATIAD
YTQVIDIGGPNLFLSYESRAVIYQQVKDYEAAIKDFSKAIAIQPEFIRIYGRRAIVYLEM
KNYEAALTDLSKIIELGKNSQETEEFVVVFAYLQRGKLYQQAKNYQGAIEDFSSLIKLQP
NSPESVEVYGRRGLSYAQLKNYPAAIEDFSSLIKSQPKNHQGYTYRCRVYIELKDYNQAM
KDCNQAVAIAPNNPEVYFARAGVHSGLKNYSAAIKDADKIIEIAPDFPVGYWVRGAMYFA
QNNPSKALSDYELALSKNDKFAPAISSIAYVKYKQGDKQKAIELWQKALTIQDDLTGTKL
ALAVALYQEGQPEKALSLAKEAIKIDERFKDINHLQDNLWGKQLIQDTKPLLNKVK
NT seq
1971 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggcgatcgcagattttgtgagaaattcgggtaaagtcatagcgttagagcctgagaat
gatgagcattattttgagagacaaaatttatactttttaaatggtcaatacaaactagca
ctagaagatgttcgacaagccattaaactgaaccctaaagaggcagaatactatcaacaa
agtggaattttaagaaatagtcttgcagatactcaaggtgctttagaagattacaataaa
gccattaaatttaatccgaattatgcccaggcttattatactagagggtcattatatagc
acagcattctcagattatggcaaagcaatggcagactttacaaaagccattgaacttaat
cctaagtttggggaggcttatattagcagaggtttattgcaggcagtattatcagatttt
caaggggcattagaagattttaatcaggctattctattaagcaaagatcctgatcctaag
atgaatttgctatggaatggaacacctgtagaagactatgaatctttagggatgtacaga
cggattgccgataatcttctcgaaggtgtggaagaaaatgatcagaattctaggactgct
ggtattcacaaatataggggtgatattcgtctacaattaaaggatacagaaggagcatta
caagattataatgaagccattaaacttgctccaaaacaagcagatgcttacgtcgcaaga
ggagattattatactcaaatgcaacaagcagaaaaagccaaagctgattataataaggca
attacaatttattcagaatctatcgaaaatccgacaattaaggctagtttgttcatacat
tatagcgatcgtgcagaagtttatagcaaaattaagaactatcaagctaccattgctgac
tacactcaagttattgatattggtggacctaatctctttctaagctatgaatcaagagca
gtaatttatcaacaagtcaaagactacgaagctgctattaaagacttttctaaagcgatt
gcaatccaaccagaatttatacgtatttatggacgcagagccatcgtttatttggagatg
aaaaactatgaggctgctcttacagacttgtctaagatcattgaattaggtaaaaatagt
caagaaactgaggaatttgtggttgttttcgcttatttacaaagaggaaaattatatcaa
caagcaaaaaattatcaaggggcaattgaagacttttctagtttaattaaattacaacct
aactcacctgaatcagtggaagtttatggaagaagaggtttaagttatgctcaattgaaa
aattatccagcagccattgaagatttttctagtttaattaaatcacaacctaaaaatcat
caaggttatacctatcgttgtcgtgtttatatcgagttgaaagattataatcaagctatg
aaagattgtaatcaagcagttgcaattgctcccaataacccagaagtttatttcgcccgt
gctggtgttcatagtggtttaaagaattactcagcagccattaaagatgctgataaaatc
attgaaattgccccagattttcctgttggttattgggtaagaggagctatgtattttgca
caaaataacccaagtaaagccttatctgattatgaattagcattgagtaagaatgataaa
tttgcccctgcaatatcgagtattgcttacgttaaatataaacagggagacaaacaaaaa
gccattgaattatggcaaaaagctcttactattcaagacgatttgacagggactaaatta
gccttagctgtggcattataccaggaaggacaaccagaaaaagcattatctttagccaaa
gaagctattaaaatagatgaacggttcaaagatattaatcatcttcaagacaatttatgg
ggtaaacaattgatacaagatacaaaacccctcttgaataaggttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
