Gloeothece citriformis: PCC7424_0447
Help
Entry
PCC7424_0447 CDS
T00808
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF490
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
cyc
Gloeothece citriformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cyc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cyc02000
]
PCC7424_0447
Transporters [BR:
cyc02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PCC7424_0447
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACK68913
UniProt:
B7KD93
LinkDB
All DBs
Position
488798..494461
Genome browser
AA seq
1887 aa
AA seq
DB search
MTSNSPDPGNSPPNPLKRLLQTAKQPKAIAIGITSLTLIIGSSVGFRIVMTQTLPQTIEK
TLSDALNREVKLGKVENYSLTHLKIGFSSIPETPKHLNQLTIENIDAQFNPLLILLQGRL
PVKITLSNLNGYIKQDQQGNWTIDRIEKIKLPIDLDASFEIKNADLQLQPSGKAKPVTVE
LDGKGNYLELNQQQQLGYDFTVALLNSQIHLKGNTRLPTGKTEAELKIEKLALPEIASLI
PHFPLQINQGQLNTNVNIEVPSLTNIENSQGQGNISLNNLTATNNQLKQPIKIVANFALQ
DTQLIIQKFQINWSEIKANIQGNLDWKKGLDLAVNLQSFNLSDISKTFSVSMPFLVGGNL
QSQIRIKGELSNPIVTGTVKNTQNLLIDKVLIKDFKTVFQANLNELILKSLTIKPVVGGE
IQGQGTIKTQFKEYLNQPKKFDWTKLPIKFTVNTNLPTQKIVNLYYPIPSEVQLGNLKAK
GELSGTLKRPQALLQWQLSDTNLASTNPIYGGGELLVLNQTINLRNTELTTGEGKITLTG
RGNLDKNLWQTEAVINSFNLPVIFPSNPTVTLESGKVTLLGTFDKLNINNVTGLANLFIK
VNEGTVILNSQLKNGQITGSANLSQLALNPFLPKTINTPVKLTQTQANFSGSMAEILAND
TDKFSSLNATANLSIAVNDNPISIQTTLDKGIVNADIKTGKIPLSPLLPNLTIPINLTQS
QVNVSGKIGSLLSFLESSETQENDVLKDIKLTADAQINIDDNIIKAQAFINNNQWQSEIY
GSNISHPSLCPPLQKNCPPINTKINLSGNIDPLFQQNPTLSIQAKTILLEIKGQTLEAQG
DIIVENIDTIPDARLNLGVEYRSDLKSILPLDEFISQIPIQQGLLLDETQITGETYFKGQ
LVGTNLLTTSNPLENIQLTGNAQLTNLSINKRVFEPIMRGIVNVSIQQEITVNLRGKQDI
FAFTLERCSRNSCLTPYLPNSFQVLQSYNAQIPIQLKATRQGEILSADLENFPLELLQIT
PIRTLGFPTRVTGNVDANLQINLFTLAGTGNLTIDKPGIGNITAESFETELVYDNRLAKL
QSANLQIGQSRYQLDGSFDIKTQELQGKLQINEGEIQDLLEVTNVASLINPSTTKIPQTT
TANQLQPYSIGGANTPISEQLNQIRESEQKIRQQANQIESGLIAPILDLQGKYRAEIDLG
GTLENPEISLQFEGKKWQWFPKPQYVNFLDPLGLIIQEPETIPLEKISLQGHLEKGELKI
NYQSEIGRANLALNANLVKENNRWNFQDSSFNIENLSLDLLRYFFESPIDINGEINAQGK
LQGNPLKPEIITNFAFTDGTLNGRPLNIPVEGNLTYINDKITLKTLEDSKIKIYANVPYP
IEPQKNDRLELDLKLTTEVFTVIDLFSQGKLNWVGGEGEINLKANGRINLAETFKLYDLN
TEGQVTLNNATLQASNLERPLIFNGQLMFNNQHLEANQLKGNILDTQVAITGILPLFEPI
ANNQNPLTISLINGQIDSPGRYRGEIDTNLIIKGSVFNPIIGGNIRIYNGQILLSRLKED
NQIVSPVYQQWYGTLTPQKPLIKPPQLNNFQVALENIELIQDDRLPQYKFDVSGELNLNG
DLLNLESLQPRGKIRLNQGKVYILTTDVFLANQYENTLTFFPEEGLFNPYLDLQLKAFLW
DIAIIANNNNEIPDDIVKSGRQKSVELTVTIQGEAEQLYAAAPVIEKACQFPEEDSPINP
NLVPELSQQLTDCLRVASFADNQSDLQLLKSPVVSISSNPPLTQNEINVLFDRKIDDISD
PVQQQNTAQLVEIGIPQVAVTVLPFLQQEVFELNEAVSLWAKSTFGLERFQIVPVVQTGY
KLNNGAFVRISYDYFFNEMTVRYETRW
NT seq
5664 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacatctaactcaccagatccgggaaactctccccctaaccccttaaagcgtctctta
cagacagccaaacagccaaaagcgatcgccataggcataacatcccttaccctcattatc
ggtagtagcgtcgggtttagaattgtcatgacacaaaccctaccccaaacgatcgaaaaa
acccttagcgatgcacttaaccgagaagtcaaactcggaaaagtagaaaattactcactc
actcaccttaaaattgggttttcctccatacccgaaacccctaaacatttaaatcaatta
accattgaaaacattgacgctcaatttaaccccttattaattctattacaaggtcgttta
cccgtaaaaattaccctaagtaacctcaatggttatattaaacaagatcaacaaggaaat
tggacaatcgatcgcattgaaaaaatcaaacttcctatagacttagatgcaagctttgag
attaaaaacgcagatcttcagttgcaaccatcggggaaagctaaacccgtcaccgtagaa
ttagatggaaaaggcaactatctcgaactaaatcaacaacaacaattaggctatgatttt
accgttgctttactcaatagtcaaattcatctcaaaggaaatacccgacttcccacagga
aaaaccgaagcagaattaaaaattgaaaaattagctttaccagaaatagcgtcattaatt
cctcatttccccctacaaattaatcaaggtcaactgaataccaatgttaatattgaagtg
ccttctttgacaaatattgaaaatagccaaggacaaggaaatatcagccttaataattta
acagccacgaataatcaattaaaacagccgataaaaatagtcgctaattttgccttacaa
gacactcaactcattattcaaaaatttcaaattaactggagtgaaattaaagccaatatt
caaggtaatttagactggaaaaaaggattagatttagccgttaaccttcaatcgtttaac
ctttctgatataagcaaaaccttttctgtatcaatgccttttttagtggggggaaattta
caaagtcagatcagaataaaaggagaattatctaatcctatcgtaaccggaacagtcaaa
aacactcaaaatttattaatcgataaagtattaattaaagattttaagacagtttttcaa
gccaatttaaatgaattgattcttaaaagtctaactataaaacccgttgtcggaggagaa
atacaaggtcaaggaacaattaaaactcaattcaaagaatatttaaatcaacctaaaaag
tttgactggactaaacttcctataaaattcaccgtaaatactaatttacccactcaaaaa
attgtcaatctttattatccgattccttcagaggttcaattaggaaatttaaaagccaaa
ggagagttaagcggaactttgaaacgtcctcaagctctactccaatggcaactctctgat
accaatttagcctcaacaaatcctatttatggtgggggagaattattagttttaaatcaa
actataaacctgcgtaacacagaattaaccacaggagaaggaaaaatcactttaactggg
agaggtaatctagacaaaaatttatggcaaaccgaggcggtaatcaattcatttaattta
cctgtaatattcccctcaaacccaacagtaaccctagagagcggaaaagtaacattatta
ggaacattcgacaaactcaatattaataatgtaacgggtttagctaatttatttatcaaa
gtaaatgaaggaacagttattttaaatagccaattaaaaaacggacaaataaccggcagt
gctaacctttctcaacttgccttaaatccctttttacctaaaaccattaatactcccgtt
aaacttacacaaacccaagctaatttttctggttcaatggctgaaattttagccaatgat
actgataaatttagttctctaaatgcaacggctaatctgagtatagcggttaatgataat
ccgatttcgattcaaactactttagataagggaattgtaaacgctgatatcaagactggt
aaaatccctctatctcctctacttcctaatttaaccattcccattaatttaactcaaagt
caagtcaacgtatcgggtaaaataggatctttattatcctttttagaatcaagcgaaacc
caagaaaatgatgtattaaaagatattaaactgacggctgatgctcaaattaatattgac
gataacatcattaaagctcaagcttttattaataataatcaatggcaaagtgaaatttat
ggatctaatatttctcatccttccttatgtcctcctctgcaaaaaaactgtcctcctatt
aataccaaaatcaatctttcaggaaatatagaccctcttttccaacaaaatcctactctt
tccatacaagctaaaactatcttacttgaaatcaaaggacaaaccctggaagctcaagga
gatataatagtagaaaatatagacactatccccgatgctagacttaacttaggggtagaa
tatcgttctgatttaaaaagtatattaccgttagatgaatttatttctcaaattcccatc
caacaaggattattacttgatgaaactcaaataacaggagaaacttattttaaaggtcaa
ttagtaggaacaaatttactgacaacatccaacccattagaaaacatacaactgaccgga
aatgcccaattaaccaatttaagcataaataagcgggtttttgaacccattatgagagga
atagtaaatgtttctattcagcaagaaataactgttaacttgcgaggaaaacaagatata
tttgcttttaccttagaacggtgttctagaaactcttgtcttaccccctatcttcccaac
tcatttcaagttctccaaagctataatgctcaaattcccatacaattgaaagcaacaagg
cagggagaaatcttaagcgccgacttagaaaattttcccttagaactattgcaaattacc
ccgattagaaccctaggatttcccacaagagtaacgggaaatgttgatgctaacttacaa
attaacctatttactttagccggaaccggcaacctaaccattgacaaaccgggaatagga
aatattacagcagaatcttttgagacagaattagtttatgataatcggttagctaaatta
caatctgctaaccttcaaataggtcaaagtcgttatcaactagatggaagcttcgatatt
aaaacccaagaacttcaaggtaaactccaaattaatgaaggagaaatacaagaccttctt
gaagttaccaatgtagcgagtttaattaatccatccacaacaaaaatacctcaaaccact
accgcaaaccaacttcaaccttattcaattggtggtgctaatactcccatatcagaacaa
ctcaatcaaattcgagaaagtgaacaaaaaatccgtcaacaagctaatcaaatagaatcg
ggtttaattgcacctattttagacttacaaggaaaatatcgagcagaaattgacctaggg
ggaacattagaaaacccagaaattagcttacagtttgagggaaaaaaatggcaatggttt
cctaaacctcaatatgttaattttcttgaccctttaggactcattattcaagaacctgaa
actattcctcttgaaaaaatatcccttcaaggtcatttagaaaagggtgaacttaaaatt
aattatcaatccgaaattggcagagccaacctagcattaaatgctaacttagtcaaggaa
aataaccgatggaatttccaagattcaagctttaatattgaaaacttgtctttagattta
ctaagatacttctttgaatctcctattgatattaatggagaaattaacgctcaaggaaag
ctccaaggaaatcctttaaaacccgaaataatcactaattttgcttttactgatggaact
ttaaatggtcgtcctctcaatattcctgtggaaggtaatttaacttatattaacgataaa
atcacgttaaaaactcttgaggattctaaaattaaaatttatgctaatgttccttatcct
atcgaaccccagaaaaatgatcgtttagaattagaccttaaactgacgacagaagtattt
actgtaattgatctttttagtcaaggaaaattaaattgggtgggaggagaaggagaaatt
aatttaaaagccaatggccggataaatttggcagaaacttttaaactttatgatttaaat
accgagggtcaagttactcttaataacgccactcttcaagcttctaatctagaacgtccc
ttgatttttaatggtcaactgatgtttaataatcaacacttagaagccaaccaactaaaa
ggaaatattttagatactcaagtggcgattacaggaatcttacctttatttgaaccaatt
gctaataatcaaaatcctttgactattagtttaatcaatggtcaaattgactctccagga
cgttatcggggagaaattgatactaatttaattattaagggttcggtgtttaatcccatt
attgggggaaatattcggatttataatggtcaaattctgttgagtagattgaaagaagat
aatcagattgtttcccccgtctatcagcaatggtacggaacactaacccctcaaaaacct
ttaattaaacctccacaattaaataattttcaagtcgcccttgagaatatagaattgatc
caagatgaccgcttacctcaatataaatttgatgtcagtggagagttaaatttaaacgga
gatttactgaatttagaaagtcttcaacccaggggaaaaattcgccttaatcaaggaaaa
gtttatattctgactactgatgtgtttttagcaaatcaatatgaaaacactttaactttt
ttccccgaagagggattatttaatccttatttagacctacaactgaaagcttttctctgg
gatattgcgattattgccaataataataatgaaattcctgatgatattgttaaaagtgga
agacaaaaatctgttgaattaacagttactattcaaggagaggccgaacaactttatgca
gcagcacccgtgatagaaaaagcctgtcaatttcctgaagaagattcccccattaatccc
aatcttgtaccagaattgagtcaacaattaacagattgtcttcgggttgctagctttgca
gataatcagtcagatcttcaattacttaaatcgccagtagtctctatttctagcaatcct
cctttaacccaaaatgaaattaatgttttatttgatcgtaaaatagatgatatttctgac
cccgtacaacaacaaaatacagcccaattagtagaaataggaattcctcaagtggctgtt
actgttcttccttttttacagcaagaagtctttgaattaaatgaagctgtatccttatgg
gctaaatcaacttttgggttagaacgctttcaaattgtgccggttgtccaaaccggttat
aaattaaataatggggctttcgtccgaatttcctatgattatttctttaatgaaatgacg
gttagatatgaaacccgatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
